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オミクス解析によるジャガイモそうか病抵抗性機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 17K15213
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 遺伝育種科学
研究機関国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構

研究代表者

浅野 賢治  国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 北海道農業研究センター, 主任研究員 (80547034)

研究期間 (年度) 2017-04-01 – 2021-03-31
研究課題ステータス 完了 (2020年度)
配分額 *注記
4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2020年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2019年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2018年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2017年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円)
キーワードばれいしょ / そうか病 / 病害虫抵抗性 / オミクス解析 / 育種 / 選抜マーカー / バレイショ / 抵抗性 / 遺伝解析 / ジャガイモそうか病 / オミクス
研究成果の概要

バレイショの重要病害であるそうか病抵抗性が“極強”のユキラシャと“弱”のながさき黄金の雑種集団から選抜した抵抗性強系統群と弱系統群各20系統について、ゲノムワイドな遺伝子型を取得した。取得した遺伝子型と抵抗性との相関を確認した結果、4本の染色体上に座乗する26個のSNPがそうか病抵抗性と相関があることを明らかにした。また、塊茎表皮の共生微生物相解析からは、抵抗性強系統群の方が微生物の多様性が高いことが明らかとなった。葉におけるメタボローム解析からは、2種類の代謝物含量が抵抗性強系統群と弱系統群との間で有意に異なることを明らかにした。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究でそうか病抵抗性と相関があることを見出したSNPは過去に報告のないものであり、新たな抵抗性遺伝子座である可能性があり学術的に新規性が高い。また、雑種集団から選抜した遺伝的背景の近い系統群において、共生微生物相の多様性とそうか病抵抗性の相関を示した報告はこれまでに無い。同様に地上部の代謝物とそうか病抵抗性の関係を明らかにした報告はなく、これらの結果はそうか病抵抗性機構の解明に新たな知見をもたらす。また、特定したSNPや代謝物はバレイショ育種において、抵抗性個体の効率的選抜に利用できる可能性があり、抵抗性品種の開発を加速化させられる可能性があり社会的にも有用である。

報告書

(5件)
  • 2020 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2019 実施状況報告書
  • 2018 実施状況報告書
  • 2017 実施状況報告書
  • 研究成果

    (12件)

すべて 2021 2020 2019 2018 2017

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (4件) (うち招待講演 1件) 図書 (2件)

  • [雑誌論文] Association of Genome-Wide SNP Markers with Resistance to Common Scab of Potato2021

    • 著者名/発表者名
      Koizumi Emiko、Igarashi Toshiya、Tsuyama Mutsuo、Ogawa Keiichi、Asano Kenji、Kobayashi Akira、Sanetomo Rena、Hosaka Kazuyoshi
    • 雑誌名

      American Journal of Potato Research

      巻: 98 号: 2 ページ: 149-156

    • DOI

      10.1007/s12230-021-09827-2

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] NMRによる農業メタボロミクスの活用と展望?農業現場と分析現場のスムーズな連携に向けて2020

    • 著者名/発表者名
      関山 恭代、池田 成志、浅野 賢治、岡崎 和之
    • 雑誌名

      日本土壌肥料学雑誌

      巻: 91 ページ: 272-279

    • NAID

      130007888587

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 有機物を活用したジャガイモそうか病防除研究2018

    • 著者名/発表者名
      池田 成志、浅野 賢治
    • 雑誌名

      土づくりとエコ農業

      巻: 50 ページ: 5-9

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [雑誌論文] 有機物を活用したジャガイモそうか病防除研究2018

    • 著者名/発表者名
      池田 成志、浅野 賢治、森 清文
    • 雑誌名

      ニューカントリー

      巻: 776 ページ: 14-16

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [雑誌論文] ジャガイモそうか病防除のための有機物活用研究2018

    • 著者名/発表者名
      池田 成志、浅野 賢治、森 清文
    • 雑誌名

      農業ビジネスベジ

      巻: 23 ページ: 86-90

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [雑誌論文] ジャガイモそうか病防除に向けた取り組み2017

    • 著者名/発表者名
      浅野賢治
    • 雑誌名

      いも類振興情報

      巻: 133 ページ: 33-34

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] 気候変動がバレイショ病害に 及ぼす影響と育種的対応2019

    • 著者名/発表者名
      浅野賢治
    • 学会等名
      日本植物病理学会北海道部会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 北海道におけるジャガイモそうか病低減に向けた取り組み2018

    • 著者名/発表者名
      浅野賢治
    • 学会等名
      持続的農業研究セミナー2018
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] 北海道でのそうか病抑制栽培技術 体系確立に向けた取り組み2017

    • 著者名/発表者名
      浅野賢治
    • 学会等名
      2017年度次世代バレイショセミナー
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] 北海道におけるジャガイモそうか病防除のための新規資材の探索2017

    • 著者名/発表者名
      浅野賢治
    • 学会等名
      2017年自然共生型農業研究シンポジウム
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [図書] 農業技術大系 土壌施肥編 第5-1巻 (追録の一部を執筆)2020

    • 著者名/発表者名
      池田成志、浅野賢治、森清文
    • 総ページ数
      256
    • 出版者
      農山漁村文化協会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [図書] 農業技術大系 作物編 第5巻 (追録の一部を執筆)2020

    • 著者名/発表者名
      浅野賢治
    • 総ページ数
      113
    • 出版者
      農山漁村文化協会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書

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公開日: 2017-04-28   更新日: 2024-01-30  

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