メタゲノム解析を用いた菌血症における病原菌の患者内多様性の解明

• 研究課題/領域番号: 17K17933
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 病態検査学; 細菌学(含真菌学)
• 研究機関: 九州大学
• 研究代表者: 後藤 恭宏 九州大学, 医学研究院, 助教 (20558358)
• 研究期間 (年度): 2017-04-01 – 2019-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2018年度)
• 配分額: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円); 2018年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円); 2017年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
• キーワード: 遺伝的多様性 / 菌血症 / メタゲノム / 患者内多様性 / ヘテロサイト / ハプロタイプ / メタゲノム解析 / クローン / 細菌ゲノム

研究成果の概要

菌血症の診断は、血液培養による菌の分離と得られた単一コロニーを用いた菌種同定等によって行われている。しかし、患者内に存在する原因菌は必ずしも単一なクローンではなく、何らかの遺伝的多様性が存在し、治療や宿主免疫等によってさらに変化している可能性もある。菌血症例を対象として、集団遺伝学的視点とメタゲノム解析を組み合わせて、個別の患者内に存在する原因菌の遺伝的多様性とその変動を解析した結果、菌血症の発症・進展に係わる新たな知見が得られた。

研究成果の学術的意義や社会的意義

菌血症を発症した血液中の病原細菌を集団として捉えて、集団遺伝学的な視点から、その遺伝的多様性を解析するという新しい発想に基づく研究であり、特定の分離菌株のみを対象とする従来の解析では得られなかった菌血症の発症・進展に係わる新たな知見が得られた。

研究成果

• [雑誌論文] Genome sequencing verifies relapsed infection of Helicobacter cinaedi (2019)
  • 著者名/発表者名: Sawada Osamu、Gotoh Yasuhiro、Taniguchi Takako、Furukawa Shota、Yoshimura Dai、Sasaki Satomi、Shida Haruki、Kusunoki Yoshihiro、Yamamura Tsuyoshi、Furuya Ken、Itoh Takehiko、Horita Tetsuya、Hayashi Tetsuya、Misawa Naoaki
  • 雑誌名: Open Forum Infectious Diseases 巻: 印刷中 号: 5
  • DOI: 10.1093/ofid/ofz200
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Multi-step genomic dissection of a suspected intra-hospital Helicobacter cinaedi outbreak (2019)
  • 著者名/発表者名: Gotoh Yasuhiro、Taniguchi Takako、Yoshimura Dai、Katsura Keisuke、Saeki Yuji、Hirabara Yasutoshi、Fukuda Mayumi、Takajo Ichiro、Tomida Junko、Kawamura Yoshiaki、Ogura Yoshitoshi、Itoh Takehiko、Misawa Naoaki、Okayama Akihiko、Hayashi Tetsuya
  • 雑誌名: Microbial Genomics 巻: 5 号: 12 ページ: 1-11
  • DOI: 10.1099/mgen.0.000236
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Genomic Characterization of β-Glucuronidase?Positive Escherichia coli O157:H7 Producing Stx2a (2018)
  • 著者名/発表者名: Ogura Yoshitoshi、Seto Kazuko、Morimoto Yo、Nakamura Keiji、Sato Mitsuhiko P.、Gotoh Yasuhiro、Itoh Takehiko、Toyoda Atsushi、Ohnishi Makoto、Hayashi Tetsuya
  • 雑誌名: Emerging Infectious Diseases 巻: 24 号: 12 ページ: 2219-2227
  • DOI: 10.3201/eid2412.180404
  • 査読あり / オープンアクセス
• [学会発表] 院内感染疑い事例の全ゲノムシーケンスによる超高解像度分子疫学解析 (2019)
  • 著者名/発表者名: 後藤恭宏, 谷口喬子, 吉村大, 桂啓介, 佐伯裕二, 平原康寿, 福田真弓, 高城一郎, 小椋義俊, 伊藤武彦, 三澤尚明, 岡山昭彦, 林哲也
  • 学会等名: 第13回日本ゲノム微生物学会
• [学会発表] 院内感染疑い事例の全ゲノムシーケンスによる超高解像度分子疫学解析 (2018)
  • 著者名/発表者名: 後藤恭宏、谷口喬子、吉村大、桂啓介、佐伯裕二、平原康寿、福田真弓、高城一郎、小椋義俊、伊藤武彦、三澤尚明、岡山昭彦、林哲也
  • 学会等名: 第12回 日本ゲノム微生物学会
• [学会発表] サーベイランス・アウトブレイクの検出 (2018)
  • 著者名/発表者名: 後藤恭宏
  • 学会等名: 第278回 ICD講習会
  • 招待講演
• [図書] 院内感染の高精度分子疫学解析 (2017)
  • 著者名/発表者名: 後藤恭宏
  • 総ページ数: 216
  • 出版者: 医薬ジャーナル社
  • ISBN: 9784753281275