研究課題
若手研究(B)
長年に亘る研究にも関わらず、診療機関で使用されている癌バイオマーカーは殆ど無い。DNAメチル化は安定で長期的な調節に関与している為、異常なDNAメチル化によって引き起こされ通常とは異なって発現する遺伝子がバイオマーカーの有力な候補である事を提案する。我々は公的に利用可能なトランスクリプトームとエピゲノムデータを統合する計算分析を行い、プロモーターの低メチル化の為に肺癌で上方制御されるコアセット遺伝子を発見した。更に詳しく研究する為、正常な細胞を脱メチル化剤とHDAC阻害剤で処理する攪乱実験を行った。攪乱実験後、遺伝子発現解析(CAGE)、DNAメチル化アレイ、シングルセルCAGE実験を行った。
The results and data generated in the project help us to better understand the link between the aberrant epigenetic changes and the gene expression in cancer. This opens a way to uncover the theragnostic potential of epigenetically regulated genes in clinical cancer research.
すべて 2017
すべて 雑誌論文 (1件) (うち国際共著 1件、 査読あり 1件、 オープンアクセス 1件)
Mol Cancer Res.
巻: 15 号: 10 ページ: 1354-1365
10.1158/1541-7786.mcr-17-0191