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部位特異的RNAメチル化効率定量法の確立

研究課題

研究課題/領域番号 17K19352
研究種目

挑戦的研究(萌芽)

配分区分基金
研究分野 分子生物学およびその関連分野
研究機関大阪大学

研究代表者

河原 行郎  大阪大学, 医学系研究科, 教授 (80542563)

研究期間 (年度) 2017-06-30 – 2019-03-31
研究課題ステータス 完了 (2018年度)
配分額 *注記
6,500千円 (直接経費: 5,000千円、間接経費: 1,500千円)
2018年度: 3,250千円 (直接経費: 2,500千円、間接経費: 750千円)
2017年度: 3,250千円 (直接経費: 2,500千円、間接経費: 750千円)
キーワードRNA修飾 / m6A / メチル化 / エピトランスクリプトーム / ガン / 肥満
研究成果の概要

RNAは転写後に多様な化学修飾を受けるが、その一つにアデノシンのN6位に生じるメチル化修飾 (m6A)がある。このメチル化修飾の異常は肥満やガン化とも関連しており、細胞の恒常性に極めて重要である。しかし、個別部位のメチル化効率を定量し、その動態を可視する良い方法がない。そこで本研究では、メチル化効率を精度高く定量するため、人工核酸BNAの高い結合能と塩基識別感度を用いて、BNAプローブ法を開発することに成功した。本手法では、m6Aを含むRNAと含まないRNAとの融解温度の差を従来のDNAプローブ法より広げることに成功し、この温度差を利用して未知のメチル化効率を測定できるようになった。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究で開発に成功したBNAプローブ法は、従来定量が不可能であった個別部位でのRNAメチル化効率の測定を可能にした。特に、リボソームRNAなどの豊富に発現しているRNA中のメチル化効率は、高感度で定量できることを示した。本研究の成果は、これまで知ることのできなかったRNAメチル化動態を計測することを可能にしただけでなく、同じ原理を利用すれば他のRNA化学修飾の定量にも応用できることを示唆している。また、その結果としてガンなどの疾患の発症病態の解明に貢献できるものと考える。

報告書

(3件)
  • 2018 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2017 実施状況報告書
  • 研究成果

    (15件)

すべて 2019 2018 2017 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (5件) (うち国際共著 2件、 査読あり 5件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (6件) (うち国際学会 4件、 招待講演 2件) 備考 (2件)

  • [国際共同研究] University of Melbourne(オーストラリア)

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [国際共同研究] Institute of Evolutionary Biology/Universitat Pompeu Fabra-CSIC(スペイン)

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Quantification of methylation efficiency at a specific N6-methyladenosine position in rRNA by using BNA probes2018

    • 著者名/発表者名
      Oshima Takuya、Ishiguro Kensuke、Suzuki Tsutomu、Kawahara Yukio
    • 雑誌名

      Chemical Communications

      巻: 54 号: 69 ページ: 9627-9630

    • DOI

      10.1039/c8cc03713b

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] ADAR1-mediated RNA editing is required for thymic self-tolerance and prevention of autoimmunity2018

    • 著者名/発表者名
      Taisuke Nakahama, Yuki Kato, Jung In Kim, Tuangtong Vongpipatana, Yutaka Suzuki, Carl Walkley and Yukio Kawahara
    • 雑誌名

      EMBO Reports

      巻: 19 号: 12

    • DOI

      10.15252/embr.201846303

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] RNA editing independently occurs at three mir-376a-1 sites and may compromise the stability of the microRNA hairpin.2017

    • 著者名/発表者名
      Gallego A, Hartasanchez DA, Braso-Vives M, Garcia-Ramallo E, Lopez-Valenzuela M, Baena N, Guitart M, Fernandez-Bellon H, Kondova I, Bontrop R, Kawahara Y, Espinosa-Parrilla Y
    • 雑誌名

      Gene

      巻: 628 ページ: 109-116

    • DOI

      10.1016/j.gene.2017.07.032

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Matrin3 binds directly to intronic pyrimidine-rich sequences and controls alternative splicing2017

    • 著者名/発表者名
      Uemura Y, Oshima T, Yamamoto M, Reyes CJ, Costa Cruz PH, Shibuya T, Kawahara Y
    • 雑誌名

      Genes to Cells

      巻: 22(9) 号: 9 ページ: 785-798

    • DOI

      10.1111/gtc.12512

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The RNA-binding protein MARF1 promotes cortical neurogenesis through its RNase activity domain2017

    • 著者名/発表者名
      Kanemitsu Y, Fujitani M, Fujita Y, Zhang S, Su YQ, Kawahara Y, Yamashita T
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 7(1) 号: 1 ページ: 1155-1155

    • DOI

      10.1038/s41598-017-01317-y

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] ADAR1-mediated RNA editing is required for thymic selftolerance and inhibition of autoimmunity2019

    • 著者名/発表者名
      Nakahama T, Kato Y, Kim JI, Vongpipatana T, Suzuki Y, Walkley CR, Kawahara Y
    • 学会等名
      Gordon Research Conference
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] ADAR1 regulates early T cell development via MDA5-dependent and -independent pathways2019

    • 著者名/発表者名
      Tuangtong Vogpipatana, Taisuke Nakahama, Yuki Kato, Carl Walkley and Yukio Kawahara
    • 学会等名
      Gordon Research Conference & Seminar
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Precise determination of responsible ADARs for each RNA editing site in vivo2019

    • 著者名/発表者名
      Pedro Herique Costa Cruz, Yuki Kato, Taisuke Nakahama, Toshiharu Shibuya, Yukio Kawahara
    • 学会等名
      Gordon Research Conference & Seminar
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] The role of ADAR1-mediated RNA editing in development2017

    • 著者名/発表者名
      Yukio Kawahara
    • 学会等名
      ConBio2017 (2017年度) 生命科学系学会合同年次大会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] The role of RNA editing in T cell development2017

    • 著者名/発表者名
      Yukio Kawahara
    • 学会等名
      第43回内藤カンファランス
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Matrin3 binds directly to intronic pyrimidine-rich sequences and controls alternative splicing2017

    • 著者名/発表者名
      Yuri Uemura, Takuya Oshima1, Munetaka Yamamoto, Charles Jourdan Reyes, Pedro Herique Costa Cruz, Toshiharu Shibuya, Yukio Kawahara
    • 学会等名
      RNA2017, The 22nd annual meeting of the RNA society
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.med.osaka-u.ac.jp/pub/rna/publications.html

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [備考] http://www.med.osaka-u.ac.jp/pub/rna/index.html

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2017-07-21   更新日: 2020-03-30  

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