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高温適応進化大腸菌ゲノムネットワーク解析による高温適応進化戦略の解明

研究課題

研究課題/領域番号 17K19360
研究種目

挑戦的研究(萌芽)

配分区分基金
研究分野 分子生物学およびその関連分野
研究機関東邦大学

研究代表者

岸本 利彦  東邦大学, 理学部, 教授 (90339200)

研究期間 (年度) 2017-06-30 – 2020-03-31
研究課題ステータス 完了 (2019年度)
配分額 *注記
6,370千円 (直接経費: 4,900千円、間接経費: 1,470千円)
2019年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
2018年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
2017年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
キーワード高温適応進化 / 大腸菌 / ゲノム解析 / 必須遺伝子 / プロテオスタシス / シャペロニン / 高温菌 / 適応度 / RNA解析 / ゲノムネットワーク / 適応進化 / 高温 / 高温適応進化ネットワーク / genome network / evolution / E. coli / experimental evolution
研究成果の概要

実験室高温適応進化により最小培地で48℃以上で安定増殖(世界最高温度での安定増殖)する、至適増殖温度45℃の高温菌の特性を持つ2系統の大腸菌の構築に成功した。
この進化過程の大腸菌をゲノム解析した結果、変異率は進化と共に上昇し進化後半で頭打ちになり、GC含量は進化に伴い漸減していた。プロテオスタシスネットワーク因子遺伝子領域は、その他の領域に比べて塩基置換の変異率が3倍程度高かった。高温適応進化で必須遺伝子の一部は、高温菌と同じアミノ酸に変化する変異が固定され、groL変異は大腸菌進化系統での先祖返り変異であった。高温適応進化ではプロテオスタシスネットワークの変化の重要性が示唆された。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究成果により、細菌の高温適応進化戦略の一端が明らかになる。また、本研究で得られた高温適応進化大腸菌と、好熱菌・超好熱菌のゲノム情報と比較解析することで、進化の普遍性、可逆性、多様性に関する知見が得られる。今回明らかとなった大腸菌高温適応戦略をもちいて、更なる高温で安定増殖し、遺伝子操作可能な物質生産宿主等としての高温適応大腸菌の創出が可能となる。本研究成果に、他のストレス適応進化させた大腸菌の情報を統合することで、様々な外部ストレスへの適応戦略が考察可能となり、新しい抗生物質ターゲットの探索等が可能となる。

報告書

(4件)
  • 2019 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2018 実施状況報告書
  • 2017 実施状況報告書
  • 研究成果

    (13件)

すべて 2019 2018 2017

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (12件)

  • [雑誌論文] Identification of genes and critical control proteins associated with inflammatory breast cancer using network controllability2017

    • 著者名/発表者名
      Wakai, R., Ishitsuka, M., Kishimoto, T., Ochiai, T., Nacher, J. C.
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 12 号: 11 ページ: e0186353-e0186353

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0186353

    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 高温適応進化大腸菌を用いた進化の発散・収束性の解析2019

    • 著者名/発表者名
      小西 隆介、菅野 暢、鎌田 萌、古倉 健嗣、山内 長承、岸本 利彦
    • 学会等名
      第42回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 実験進化による大腸菌の高温適応進化メカニズム解析2019

    • 著者名/発表者名
      菅野 暢、小西 隆介、鎌田 萌、西広 翔、古倉 健嗣、山内 長承、岸本 利彦
    • 学会等名
      第42回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 大腸菌の高温適応進化に伴う増殖速度の温度依存性の変化とその要因解析2019

    • 著者名/発表者名
      小西隆介,菅野暢,松尾萌 , 古倉健嗣 , 山内長承 , 岸本利彦
    • 学会等名
      日本進化学会第21回大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 実験進化による大腸菌の高温適応進化メカニズム解析2019

    • 著者名/発表者名
      菅野暢 , 小西隆介 , 松尾萌 , 古倉健嗣 , 山内長承 , 岸本利彦
    • 学会等名
      日本進化学会第21回大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 高温適応進化大腸菌を用いた適応進化と変異率,ロバストネスの相関2019

    • 著者名/発表者名
      松尾萌,菅野暢,小西隆介,古倉健嗣,岸本利彦
    • 学会等名
      日本進化学会第21回大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 大腸菌高温適応進化における進化能力と変異率、ロバストネスの相関2018

    • 著者名/発表者名
      岸本利彦、大村真優子、廣瀬文音、松尾萌
    • 学会等名
      第20回日本進化学会大会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] 大腸菌高温適応進化における進化能力の解析2017

    • 著者名/発表者名
      大村真優子、寺井亮平、郡駿介、成澤大、四方哲也、岸本利彦
    • 学会等名
      第19回日本進化学会大会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] 高温適応大腸菌における変異率と進化速度の相関解析2017

    • 著者名/発表者名
      郡駿介、大村真優子、寺井亮平、成澤大、四方哲也、岸本利彦
    • 学会等名
      第19回日本進化学会大会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] 変異型シャペロニンが進化能力に与える影響2017

    • 著者名/発表者名
      寺井亮平、成澤大、四方哲也、岸本利彦
    • 学会等名
      第19回日本進化学会大会
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] 大腸菌高温適応進化における進化能力の解析2017

    • 著者名/発表者名
      大村真優子、寺井亮平、郡駿介、成澤大、四方哲也、岸本利彦
    • 学会等名
      ConBio 2017
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] 変異型シャペロニンが進化能力に与える影響2017

    • 著者名/発表者名
      寺井亮平、成澤大、四方哲也、岸本利彦
    • 学会等名
      ConBio 2017
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書
  • [学会発表] 高温適応大腸菌における変異率と進化速度の相関解析2017

    • 著者名/発表者名
      郡駿介、大村真優子、寺井亮平、成澤大、四方哲也、岸本利彦
    • 学会等名
      ConBio 2017
    • 関連する報告書
      2017 実施状況報告書

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公開日: 2017-07-21   更新日: 2021-02-19  

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