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miRNA生合成の調節機構とその影響のゲノムワイド解析

研究課題

研究課題/領域番号 17K20145
研究種目

国際共同研究加速基金(帰国発展研究)

配分区分基金
審査区分 生物系
研究機関奈良先端科学技術大学院大学

研究代表者

岡村 勝友  奈良先端科学技術大学院大学, 先端科学技術研究科, 教授 (70817733)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
58,500千円 (直接経費: 45,000千円、間接経費: 13,500千円)
キーワードmiRNA / トランスクリプトーム / 転写後制御 / microRNA / 遺伝子発現制御 / RNA結合蛋白質 / RNAプロセシング / 遺伝子発現調節 / バイオインフォマティクス
研究成果の概要

遺伝子発現は厳密に制御される必要があり、その破綻は疾患の原因にもなる。厳密な制御のため、遺伝子は様々な機構で制御されている。遺伝子の活性がオンになる場合、まず遺伝子配列がRNAに読み換えられコピーされる(転写)。コピーされたRNAに対して起こる調節を転写後調節と呼ぶ。我々はmicroRNA (miRNA)と呼ばれる小分子RNAをコードする遺伝子群の発現量が転写後にどのように調節されているかを解析した。疾患組織由来の網羅的遺伝子発現データを解析し、新規miRNA転写後調節機構の候補を見出した。さらに新規の手法を開発してこれら新規分子機構候補を生化学的および細胞生物学的に解析した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

今回の研究から様々な蛋白質がmiRNA遺伝子の発現制御に関わることが明らかになった。今回見つかった機構の多くは以前から蛋白質をコードする遺伝子のmRNAの生合成制御に関わることが知られている機構であり、miRNAとmRNAの生合成が共通の機構で制御されている可能性を示唆している。このような協調的機構が正常な細胞分化、発生過程でどのように機能しているのか、その破綻がどのようにして疾患につながるのか、今後の解析が必要である。本研究で開発された手法や実験材料は今後の本分野での研究に貢献できると期待される。

報告書

(4件)
  • 2021 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 研究成果

    (21件)

すべて 2021 2020 2019 その他

すべて 国際共同研究 (9件) 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 3件、 オープンアクセス 2件、 査読あり 1件) 学会発表 (8件) (うち国際学会 2件、 招待講演 2件) 図書 (1件)

  • [国際共同研究] Temasek Life Sciences Laboratory/National University of Singapore/National Neuroscience Institute(シンガポール)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [国際共同研究] King's College London(英国)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [国際共同研究] Memorial Sloan-Kettering Cancer Center(米国)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [国際共同研究] シンガポール国立大/南洋工科大(シンガポール)

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [国際共同研究] スローンケタリング癌センター(米国)

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [国際共同研究] King's College, London(英国)

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [国際共同研究] シンガポール国立大/南洋工科大(シンガポール)

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [国際共同研究] スローンケタリング癌センター(アメリカ合衆国)

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [国際共同研究] King's College, London(イギリス)

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [雑誌論文] RNA-dependent RNA polymerases in the black-legged tick produce Argonaute-dependent small RNAs and regulate genes2021

    • 著者名/発表者名
      Feng, Canran; Torimaru, Kyosuke; Lim, Mandy Yu Theng; Chak, Li-Ling; Tsuji, Kosuke; Tanaka, Tetsuya; Iida, Junko; Okamura, Katsutomo
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: -

    • DOI

      10.1101/2021.09.19.460923

    • NAID

      120007186859

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] microRNA-150-5p: A Novel Blood-Based Biomarker for Alzheimer’s Dementia with Good Correlation to Cognition, Cerebrospinal Fluid Amyloid-β, and Cerebral Atrophy2021

    • 著者名/発表者名
      Sook-Yoong Chia Ashwati Vipin Kok-Pin Ng Haitao Tu Ananth Bommakanti Brian Zhiyang Wang Yi Jayne Tan Fatin Zahra Zailan Adeline Su-Lyn Ng Shuo-Chian Ling3 Katsutomo Okamura Eng-King Tan Nagaendran Kandiah Li Zeng
    • 雑誌名

      Research Square

      巻: -

    • DOI

      10.21203/rs.3.rs-942370/v1

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Incorporating 2-Thiouracil into Short Double-Stranded RNA-Binding Peptide Nucleic Acids for Enhanced Recognition of A-U Pairs and for Targeting a MicroRNA Hairpin Precursor.2019

    • 著者名/発表者名
      Ong A. L., Toh D. K., Krishna M. S., Patil K. M., Okamura K. and Chen G.
    • 雑誌名

      Biochemistry

      巻: 58 号: 32 ページ: 3444-3453

    • DOI

      10.1021/acs.biochem.9b00521

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] Novel tick RdRP-dependent small RNA pathways have roles in gene regulation2021

    • 著者名/発表者名
      Canran Feng Mandy Yu Theng Lim Li-Ling Chak Junko Iida Katsutomo Okamura
    • 学会等名
      RNA meeting 2021 in Tsuruoka
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Improvement of intronic knock-in system by using NHEJ (non-homologous end joining) for in vivo characterization of RNA-binding proteins2021

    • 著者名/発表者名
      Yuma Hanai Yae Toda Katsutomo Okamura
    • 学会等名
      RNA meeting 2021 in Tsuruoka
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Global prediction of regulators of miRNA processing using cancer cell line gene expression data.2021

    • 著者名/発表者名
      Ryosuke Hirota Junko Iida Katsutomo Okamura
    • 学会等名
      RNA society meeting
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Argonauteによる成熟miRNA産生の選択的促進の生物学的役割2021

    • 著者名/発表者名
      Yun Sungsik, Lee Li Ming , 島本 廉, Wan Yun Ho, Shuo-Chien Ling, Eugene V. Makeyev, 岡村 勝友
    • 学会等名
      日本分子生物学会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] miRNA生合成の制御2021

    • 著者名/発表者名
      岡村 勝友
    • 学会等名
      東名産学官・医連携研究会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Regulation of miRNA biogenesis2020

    • 著者名/発表者名
      Katsutomo Okamura
    • 学会等名
      AMSI BIOINFOSUMMER 2020
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] A potential role for an alternative rRNA processing mechanism in gene regulation via the production of a miRNA.2019

    • 著者名/発表者名
      Ananth Bommakanti and Katsutomo Okamura
    • 学会等名
      日本RNA学会 年会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] Biological roles for selective promotion of miRNA dicing by Argonautes2019

    • 著者名/発表者名
      Li Ming Lee, Ren Shimamoto, Wan Yun Ho, Shuo-Chien Ling, Eugene V. Makeyev and Katsutomo Okamura
    • 学会等名
      日本分子生物学会 年会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [図書] 核酸科学ハンドブック 杉本 直己編(第11章-3、小分子RNA)2020

    • 著者名/発表者名
      島本 廉、岡村 勝友
    • ページ
      339-349
    • 総ページ数
      565
    • 出版者
      講談社サイエンティフィク
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書

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公開日: 2018-03-28   更新日: 2025-11-20  

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