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深層学習による疾患の超早期発見を可能にする病態発症前モデルの大規模スクリーニング

研究課題

研究課題/領域番号 17KT0049
研究種目

基盤研究(B)

配分区分基金
応募区分特設分野
研究分野 複雑系疾病論
研究機関東京大学

研究代表者

道上 達男  東京大学, 大学院総合文化研究科, 教授 (10282724)

研究分担者 越智 陽城  山形大学, 医学部, 准教授 (00505787)
研究期間 (年度) 2017-07-18 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
18,590千円 (直接経費: 14,300千円、間接経費: 4,290千円)
2019年度: 5,590千円 (直接経費: 4,300千円、間接経費: 1,290千円)
2018年度: 5,590千円 (直接経費: 4,300千円、間接経費: 1,290千円)
2017年度: 7,410千円 (直接経費: 5,700千円、間接経費: 1,710千円)
キーワード癌ドライバー遺伝子 / CRISPR-Cas9システム / ネッタイツメガエル / 腫瘍形成 / CRISPR-Cas9 / 癌形成 / 発ガンドライバー遺伝子 / 腫瘍化 / ツメガエル / スクリーニング / 深層学習
研究成果の概要

近年の研究から、腫瘍形成頻度は複数の遺伝子変異の蓄積により上昇することが分かってきたが、明らかになっている具体的な遺伝子セットはまだまだ少ない。本研究では、ネッタイツメガエルを用い、CRISPR-Cas9系による複数遺伝子同時ノックダウン、更には腫瘍形成個体における遺伝子発現プロファイルを解析することで、新規癌ドライバー遺伝子セットを網羅的に見出すことを目指した。その結果、腫瘍形成アッセイ系が確立され、腫瘍個体腫瘍特異的に発現の減少が見られる新規遺伝子群が明らかとなった。

研究成果の学術的意義や社会的意義

まだまだ理解が進んでいない癌ドライバー遺伝子セットを多数同定することができれば、癌の未発症状態が把握でき、疾病予測にもつながることが期待できる。また、実際に遺伝子セットの腫瘍形成能を調べる上で、飼育が容易で安価であるネッタイツメガエルを用いたアッセイ系が確立できれば、他の多くの腫瘍形成メカニズム解析にも貢献できると期待できる。

報告書

(6件)
  • 2021 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 2018 実施状況報告書
  • 2017 実施状況報告書
  • 研究成果

    (12件)

すべて 2020 2019 2018

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (8件) (うち招待講演 2件) 図書 (2件)

  • [雑誌論文] Spontaneous neoplasia in the western clawed frog Xenopus tropicalis.2020

    • 著者名/発表者名
      Suzuki M, Igawa T, Suzuki N, Ogino H, Ochi H.
    • 雑誌名

      MicroPubl Biol.

      巻: 10

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Latrophilin2 is involved in neural crest cell migration and placode patterning in Xenopus laevis.2019

    • 著者名/発表者名
      Yokote N., Suzuki-Kosaka Y. M., Michiue T., Hara T., Tanegashima K.
    • 雑誌名

      International Journal of Developmental Biology

      巻: 63 号: 1-2 ページ: 29-35

    • DOI

      10.1387/ijdb.180184kt

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] CRISPR-Cas9法を用いた、ツメガエル胚におけるがん形成に必要な遺伝子の組み合わせの探索2020

    • 著者名/発表者名
      北村和輝
    • 学会等名
      東京大学大学院総合文化研究科広域科学専攻・卓越コロキウム
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] CRISPR/Cas9法を用いた、ツメガエル胚におけるガン形成に必要な遺伝子の組み合わせの探索2019

    • 著者名/発表者名
      北村和輝、道上達男
    • 学会等名
      日本ツメガエル研究集会首都圏支部会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] CRISPR/Cas9法を用いた、ツメガエル胚におけるがん形成に必要な遺伝子の組み合わせの探索2019

    • 著者名/発表者名
      北村和輝、山元孝佳、越智陽城、道上達男
    • 学会等名
      第42回日本分子生物学会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] ツメガエル胚の領域規定における細胞張力・細胞形状の関与2019

    • 著者名/発表者名
      道上達男
    • 学会等名
      第五回幹細胞研究会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ツメガエル初期発生の外胚葉パターニングにおける物理的な力の関与2019

    • 著者名/発表者名
      道上達男、金島 時、中桐悠一郞、山元 孝佳
    • 学会等名
      第90回日本動物学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] ツメガエル外胚葉パターニングにおける物理的な力の関与2019

    • 著者名/発表者名
      道上達男
    • 学会等名
      第13回日本ツメガエル研究集会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] 胚パターニングにおけるFam46aのBMPシグナリング調節機構2018

    • 著者名/発表者名
      道上 達男,渡邊 朋子
    • 学会等名
      日本分子生物学会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] アクチン結合タンパク質Lima1を用いたFRET張力センサーの開発2018

    • 著者名/発表者名
      平野咲雪、山元孝佳、道上達男
    • 学会等名
      日本分子生物学会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [図書] 基礎からスタート 大学の生物学2019

    • 著者名/発表者名
      道上達男
    • 総ページ数
      180
    • 出版者
      裳華房
    • ISBN
      9784785352417
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [図書] 生物学入門 第三版2019

    • 著者名/発表者名
      嶋田正和、上村慎治、増田建、道上達男(編)
    • 総ページ数
      298
    • 出版者
      東京化学同人
    • ISBN
      9784807909520
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書

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公開日: 2017-07-21   更新日: 2023-01-30  

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