研究課題
基盤研究(C)
転写は、細胞運命を規定する重要なメカニズムである。本研究では、シングルセルRNAシークエンスのデータを用いて転写の最小単位である１アリルレベルで遺伝子発現解析を行い、細胞集団を対象とした従来法で観察できなかった現象に迫ることを目的とした。X染色体上のアリル特異的遺伝子発現を解析した結果、多能性幹細胞における分化度の詳細を示した。さらには、神経疾患特異的なゲノム変異を対象としたシングルアリル特異的解析によって、疾患の原因遺伝子の発現制御が細胞ごとに異なっていることが明らかとなった。
本研究では、転写の最小の構成単位であるアリルレベルでの解析方法を提供した。従来の細胞集団を対象とした遺伝子発現解析ではできなかったX染色体のアリル転写制御を解析したことで、多能性幹細胞における分化能を判定することが可能となった。また、疾患モデル細胞における変異アリルから転写される遺伝子の解析では、疾患細胞の不均質性が示された。これらの結果は、シングルアリルレベルでの転写解析が細胞運命の理解や疾患の発症の基本原理の理解へとつながる可能性を示している。
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