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NMRを用いた紫外線損傷DNA修復機構の構造生物学的解析

研究課題

研究課題/領域番号 18011001
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関熊本大学

研究代表者

寺沢 宏明  熊本大学, 大学院・医学薬学研究部, 教授 (10300956)

研究分担者 嶋田 一夫  東京大学, 大学院・薬学系研究科, 教授 (70196476)
研究期間 (年度) 2006 – 2007
研究課題ステータス 完了 (2007年度)
配分額 *注記
11,900千円 (直接経費: 11,900千円)
2007年度: 6,000千円 (直接経費: 6,000千円)
2006年度: 5,900千円 (直接経費: 5,900千円)
キーワード紫外線損傷DNA / 光修復酵素 / CPD / CPD-photolyase / (6-4) photolyase / NMR / 高熱菌 / 第二補酵素 / (6-4)photolyase
研究概要

生体に紫外線を照射すると、細胞内のDNAが損傷を受ける。損傷塩基は複製・転写時に変異を誘発し、細胞死やがん化の原因になる。生体には光を用いて紫外線損傷DNAを修復する酵素が存在する。その修復機構を解明し、修復効率を飛躍的に高めることが出来れば、損傷DNA治療によるがん化の予防という実用的な応用も可能となる。本研究は、代表的な紫外線損傷DNAであるシクロブタンピリミジンダイマー(CPD)の光修復酵素であるCPD-photolyaseによる認識・修復機構を原子レベルで解明し、さらに、高い修復効率を有する分子を創製すること、および、もう1つの代表的な光損傷DNAである(6-4)photoproductとその修復酵素である(6-4)photolyaseについても、認識・修復機構を明らかにすることを目的とする。平成19年度は、(6-4)photolyaseの分子内運動と修復活性の相関を、NMR法を用いて解析した。異なる化学シフトを持つ複数の状態をマイクロ秒〜ミリ秒の時定数で交換している原子のNMRシグナルは、交換により横緩和速度が増大する。この交換による横緩和速度の増大は、スピンエコー実験により選択的に観測することが可能である。そこで、(6-4)photolyaseの反応部位に存在する原子のNMRシグナルのスピンエコー実験を行うことにより、(6-4)photoproductとoxetane中間体の交換を検出することを試みた。その結果、活性に重要と考えられるヒスチジン残基近傍において部位特異的な分子内運動が検出された。このことは、(6-4)photoproduct修復に必須である中間体の生成に寄与することが示唆される。

報告書

(2件)
  • 2007 実績報告書
  • 2006 実績報告書
  • 研究成果

    (9件)

すべて 2007 2006

すべて 雑誌論文 (9件) (うち査読あり 3件)

  • [雑誌論文] Mechanism of mRNA deadenylation: evidence for a molecular interplay betweentranslation termination factor eRF3 and mRNA deadenylases.2007

    • 著者名/発表者名
      Funakoshi Y., et. al.
    • 雑誌名

      Genes Dev. 21

      ページ: 3135-3148

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural basis of the collagen-binding mode of discoidin domain receptor 2.2007

    • 著者名/発表者名
      Ichikawa O., et. al.
    • 雑誌名

      EMBO J. 26

      ページ: 4168-4176

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] NMR analysis of ligand molecules that weakly bind to target molecules2007

    • 著者名/発表者名
      Takahashi H., et. al.
    • 雑誌名

      Tanpakushitsu Kakusan Koso. 52

      ページ: 959-965

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Pairwise NMR experiments for the determination of protein backbone dihedral angle Phi based on cross-correlated spin relaxation.2007

    • 著者名/発表者名
      Takahashi H. et al.
    • 雑誌名

      J.Biomol.NMR 37

      ページ: 179-185

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Structural Basis of the Transition-state Stabilization in Antibody-catalyzed Hydrolysis.2007

    • 著者名/発表者名
      Sakakura M. et al.
    • 雑誌名

      J. Mol. Biol. 367

      ページ: 133-147

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Identification and characterization of the slow-exchanging pH-dependent conformational rearrangement in KcsA.2007

    • 著者名/発表者名
      Takeuchi K. et al.
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem. (in press)

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Ligand-induced structural changes of the CD44 hyaluronan-binding domain revealed by NMR.2006

    • 著者名/発表者名
      Takeda M. et al.
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem. 281

      ページ: 40089-40095

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Rapid preparation of stable isotope labeled peptides that bind to target proteins by a phage library system.2006

    • 著者名/発表者名
      Mizukoshi Y. et al.
    • 雑誌名

      J. Biomol. NMR 34

      ページ: 23-30

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Utilization of methyl proton resonances in cross- saturation measurement for determining the interfaces of large protein-protein complexes.2006

    • 著者名/発表者名
      Takahashi H. et al.
    • 雑誌名

      J Biomol. NMR 34

      ページ: 167-177

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書

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公開日: 2006-04-01   更新日: 2018-03-28  

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