プロモーターメチル化アレイによる肺癌のゲノムワイドなエピジェネティク解析

• 研究課題/領域番号: 18012010
• 研究種目: 特定領域研究
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 生物系
• 研究機関: 群馬大学
• 研究代表者: 畑田 出穂 群馬大学, 生体調節研究所, 准教授 (50212147)
• 研究分担者: 堀居 拓郎 群馬大学, 生体調節研究所, 助教 (00361387) ; 堀井 明 東北大学, 医学研究科, 教授 (40249983)
• 研究期間 (年度): 2006 – 2007
• 研究課題ステータス: 完了 (2007年度)
• 配分額: 9,800千円 (直接経費: 9,800千円); 2007年度: 5,000千円 (直接経費: 5,000千円); 2006年度: 4,800千円 (直接経費: 4,800千円)
• キーワード: マイクロアレイ / メチル化 / エピジェネティクス / 癌遺伝子 / 癌抑制遺伝子

研究概要

DNAメチル化をはじめとするエピジェネティクな変化は癌抑制遺伝子の不活性化など癌化において重要な働きをしている。そこで癌におけるメチル化の変化を網羅的に調べることは重要である。我々はMIAMI法と呼ばれるマイクロアレイを用いたメチル化の網羅的解析法を開発してきた。この方法ではメチル化感受性制限酵素Hpa IIと、そのメチル化非感受性のアイソシゾマーのMsp Iを用いてメチル化を正確に検出する。我々は、この方法を用いて肺癌の網羅的解析をおこなった。その結果、未分化型の癌でよりメチル化している遺伝子の多いことや、マイクロRNAをコードする領域の近傍においてメチル化の変化がよくみられることがわかった。また予後不良に関連したメチル化も多数みいだすことができた。それらの中にはEpithelial-Mesenchymal Transition(EMT;上皮間葉移行)に関与するものもいくつか含まれていた。上皮間葉移行とは1980年代初めにElizabeth Hayらが提唱した、上皮細胞が間葉系様細胞に形態変化する現象であり、初期胚発生における原腸陥入、神経提細胞の運動や器官形成過程特に、心臓や腎臓また口蓋形成での重要性がこれまでに明らかとなっている。一方、EMTの獲得が運動性の充進や細胞外基質の蓄積をもたらすことから、癌細胞の浸潤や線維症との関連も示唆されている。今後、これらの遺伝子の肺癌におけるはたらきを明らかにすることにより、治療や診断への発展が期待される。

研究成果

• [雑誌論文] A comparative analysis of the transcriptome and signal pathways in hepatic differentiation of human adipose mesenchymal stem cells. (2008)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto Y, Banas A, Murata S, Ishikawa M, Lim CR, Teratani T, Hatada I, Matsubara K, Kato T, Ochiya T.
  • 雑誌名: FEBS J. 275 ページ: 1260-1273
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mecp-2 dependent repression of an imprinted miR-184 released by depol arization. (2008)
  • 著者名/発表者名: Nomura T, Kimura M, Horii T, Morita S, Soejima H, Kudo S & Hatada I^*
  • 雑誌名: Hum Mol Genet. 17 ページ: 1192-1199
  • 査読あり
• [雑誌論文] Loss of Genomic Imprinting in Mouse Parthenogenetic Embryonic Stem Cells. (2008)
  • 著者名/発表者名: Horii T, Kimura M, Morita S, Nagao Y & Hatada I.^*
  • 雑誌名: Stem cells 26 ページ: 79-88
  • 査読あり
• [雑誌論文] Geome-wide demethylation during neural differentiation of P19 embryonal carcinoma cells. (2008)
  • 著者名/発表者名: Hatada I^*, Morita S, Kimura M, Horii T, Yamashita R & Nakai K.
  • 雑誌名: J. Hum Genet. 53 ページ: 185-191
  • 査読あり
• [雑誌論文] Long-Term Effects of In Vitro Growth of Mouse Oocytes on Their Maturation and Development. (2007)
  • 著者名/発表者名: Obata Y, Maeda Y, Hatada I & Kono^* T.
  • 雑誌名: J Reprod Dev. 53 ページ: 1183-1190
  • NAID: 10020172629
  • 査読あり
• [雑誌論文] One Argonaute family member, Eif2c2 (Agog), is essential for development and appears not to be involved in DNA methylation. (2007)
  • 著者名/発表者名: Morita S, Horii T, Kimura M, Goto Y, Ochiya T & Hatada I^*.
  • 雑誌名: Genomics. 89 ページ: 687-696
  • 査読あり
• [雑誌論文] One Argonaute family member, Eif2c2 (Ago2), is essential for development and appears not to be involved in DNA methylation. (2007)
  • 著者名/発表者名: Morita S, Horii T, Kimura M, Goto Y, Ochiya T, Hatada I
  • 雑誌名: Genomics (in press)
• [雑誌論文] Emerging Technologies for Genome-wide DNA Methylation Profiling in Cancer. (2006)
  • 著者名/発表者名: Hatada I
  • 雑誌名: Crit Rev Oncog. 12(3-4) ページ: 205-223
• [雑誌論文] Genomic imprinting in Dicerl-hypomorphic mice. (2006)
  • 著者名/発表者名: Fukasawa M, Morita S, Kimura M, Horii T, Ochiya T, Hatada I
  • 雑誌名: Cytogenet Genome Res. 113(1-4) ページ: 138-143
• [雑誌論文] Microarray analysis of promoter methylation in lung cancers. (2006)
  • 著者名/発表者名: Fukasawa M, Kimura M, Morita S, Matsubara K, Yamanaka S, Endo C, Sakurada A, Sato M, Kondo T, Horii A, Sasaki H, Hatada I
  • 雑誌名: J Hum Genet. 51(4) ページ: 368-374
  • NAID: 10017479946
• [雑誌論文] Genome-wide profiling of promoter methylation in human. (2006)
  • 著者名/発表者名: Hatada I, Fukasawa M, Kimura M, Morita S, Yamada K, Yoshikawa T, Yamanaka S, Endo C, Sakurada A, Sato M, Kondo T, Horii A, Ushijima T, Sasaki H
  • 雑誌名: Oncogene 25(21) ページ: 3059-3064
  • NAID: 120000908395
• [学会発表] Genome-wide DNA methyaltion analysis by MIAMI. (2007)
  • 著者名/発表者名: Hatada I^*
  • 学会等名: Epigenomics, Technology, Products, and Obstacles
  • 発表場所: Osaka, Japan
  • 年月日: 2007-06-14
• [図書] Genomic-wide DNA Methylation Profiling Methods- From RLGS to Miami. In Progress in DNA Methylation Research (2007)
  • 著者名/発表者名: Hatada I
  • 出版者: Nova Publishers (in press)