メタボローム解析のための計測技術開発とそれを用いた代謝経路推定

• 研究課題/領域番号: 18016028
• 研究種目: 特定領域研究
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 生物系
• 研究機関: 慶應義塾大学
• 研究代表者: 冨田 勝 慶應義塾大学, 環境情報学部, 教授 (60227626)
• 研究分担者: 西岡 孝明 慶應義塾大学, 政策・メディア研究科, 教授 (80026559) ; 曽我 朋義 慶應義塾大学, 環境情報学部, 教授 (60338217) ; 金井 昭夫 慶應義塾大学, 環境情報学部, 教授 (60260329)
• 研究期間 (年度): 2006 – 2009
• 研究課題ステータス: 完了 (2009年度)
• 配分額: 47,700千円 (直接経費: 47,700千円); 2009年度: 12,100千円 (直接経費: 12,100千円); 2008年度: 12,000千円 (直接経費: 12,000千円); 2007年度: 11,900千円 (直接経費: 11,900千円); 2006年度: 11,700千円 (直接経費: 11,700千円)
• キーワード: メタボローム解析 / バイオインフォマティクス / 質量分析 / 代謝流束解析 / ケモインフォマティクス / MassBank / pH制御合成法 / プロテオーム解析 / emPAI法 / システムバイオロジー / メタボローム / 質量分析計 / キャピラリー電気泳動-質量分析計 / E-Cell / 赤血球 / 解糖系 / 大腸菌 / エネルギー代謝 / 頑強性

研究概要

代謝物質の種類と量を測定するメタボローム解析の高精度化、高感度化、ハイスループット化、バイオインフォマティクスツールの開発をおこなって、代謝物質の同定精度と検出感度の向上、大量データ比較の高速化・自動化を達成した。これらを大腸菌やイネ葉、唾液、ガン細胞などのメタボローム解析や代謝経路推定、代謝流速解析に応用することによって、omics解析基盤技術の1つとして実用的な技術であることを実証した。

研究成果

• [雑誌論文] Metabolite profiling reveals YihU as a novel hydroxybutyrate dehydrogenase for alternative succinic semialdehyde mtabolism in Eschericha coli (2009)
  • 著者名/発表者名: Saito, その他6名
  • 雑誌名: J. Biol. Chem. 284 ページ: 16442-51
  • 査読あり
• [雑誌論文] Quantitative metabolome profiling of colon and stomach cancer microenvironment by capillary electrophoresis time-of-flight mass spectrometry (2009)
  • 著者名/発表者名: Hirayama, A., その他10名
  • 雑誌名: Cancer Res 69 ページ: 4918-25
  • 査読あり
• [雑誌論文] Metabolomic Profiling of Anionic Metabolites by Capillary Electrophoresis Mass Spectrometry (2009)
  • 著者名/発表者名: Soga, T., その他5名
  • 雑誌名: Anal. Chem 81 ページ: 6165-74
  • 査読あり
• [雑誌論文] In silico modeling and metabolome analysis of long-stored erythrocytes to improve blood storage methods (2009)
  • 著者名/発表者名: Nishino, T., Yachie, A.K., Hirayama. A., Soga, T., Suematsu, T., Tomita, M.
  • 雑誌名: J. Biotech 144 ページ: 212-223
  • 査読あり
• [雑誌論文] Capillary electrophoresis mass spectrometry-based saliva metabolomics identified oral, breast and pancreatic cancer-specific profiles (2009)
  • 著者名/発表者名: Sugimoto, M., Wong, D.T., Hirayama, A., Soga, T., Tomita, M.
  • 雑誌名: Metabolomics 6 ページ: 78-95
  • 査読あり
• [雑誌論文] Differential Metabolomics Software for Capillary Electrophoresis-Mass Spectrometry Data Analysis (2009)
  • 著者名/発表者名: Sugimoto, M., Hirayama, A., Ishikawa, T., Baran, R., Robert, M., Uehara, K., Soga, T., Tomita, M.
  • 雑誌名: Metabolomics 6 ページ: 27-41
  • 査読あり
• [雑誌論文] Correlation between Sensory Evaluation Scores of Japanese Sakeand MetabolomeProfiles (2009)
  • 著者名/発表者名: Sugimoto, M., Koseki, T., Hirayama, A., Abe, S., Sano, T., Tomita, M., Soga, T.
  • 雑誌名: J. Agric. Food Chem 58 ページ: 374-383
  • 査読あり
• [雑誌論文] Tri-split tRNA: A transfer RNA made from three transcripts provides insight into the evolution of fragmented tRNAs in archaea" (2009)
  • 著者名/発表者名: Fujishima, K.
  • 雑誌名: Proc Natl Acad Sci USA. 106 ページ: 2683-2687
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genome Projector: zoomable genome map with multiple views (2009)
  • 著者名/発表者名: Arakawa, K.
  • 雑誌名: BMC Bioinformatics 10 ページ: 31-31
  • 査読あり
• [雑誌論文] Correlation between Sensory Evaluation Scores of Japanese Sakeand Metabolome Profiles (2009)
  • 著者名/発表者名: Sugimoto, M.
  • 雑誌名: J.Agric.FoodChem 58 ページ: 374-383
  • 査読あり
• [雑誌論文] Differential Metabolomics Software for Capillary Electrophoresis-Mass Spectrometry Data Analysis (2009)
  • 著者名/発表者名: Sugimoto, M.
  • 雑誌名: Metabolomics [Epub ahead of print] 6 ページ: 27-41
  • 査読あり
• [雑誌論文] Capillaryelectrophoresis mass spectrometry-based saliva metabolomics identified oral, breast and pancreatic cancer-specific profiles (2009)
  • 著者名/発表者名: Sugimoto, M.
  • 雑誌名: Metabolomlcs [Epub ahead of print] 6 ページ: 78-95
  • 査読あり
• [雑誌論文] In silico modeling and metabolome analysis of long-stored erythrocytes to improve blood storage methods (2009)
  • 著者名/発表者名: Nishino, T.
  • 雑誌名: Journal of Biotechnology 144 ページ: 212-223
  • 査読あり
• [雑誌論文] Metabolomic Profiling of Anionic Metabolites by Capillary Electrophoresis Mass Spectrometry (2009)
  • 著者名/発表者名: Soga, T.
  • 雑誌名: Analytical Chemistry 81 ページ: 6165-6174
  • 査読あり
• [雑誌論文] Quantitative metabolome profiling of colon and stomach cancer microenvironment by capillary electrophoresis time-of-flight mass spectrometry (2009)
  • 著者名/発表者名: Hirayama, A.
  • 雑誌名: Cancer Res 69 ページ: 4918-4925
  • 査読あり
• [雑誌論文] Metabolite profiling reveals YihU as a novel hydroxybutyrate dehydrogenase for alternative succinic semialdehyde mtabolism in Eschericha coli (2009)
  • 著者名/発表者名: Saito, N.
  • 雑誌名: J.Biol.Chem. 284 ページ: 16442-16451
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genome ProJector zoomable genome map with multiple views (2009)
  • 著者名/発表者名: Arakawa, K
  • 雑誌名: BMC Bioinformatics 10 ページ: 31-31
  • 査読あり
• [雑誌論文] Tri-split tRNA A transfer RNA made from three transcripts provides insight into the evolution of fragmented tRNAs in archaea (2009)
  • 著者名/発表者名: FuJishima, K
  • 雑誌名: Proc Natl Acad Sci USA 106 ページ: 2683-2687
  • 査読あり
• [雑誌論文] Automated Phosphoproteome Analysis for Cultured Cancer Cells by Two-Dimensional NanoLC-MS Using a Calcined Titania/C18 Biphasic Column (2008)
  • 著者名/発表者名: Imami, K.
  • 雑誌名: Innovations in Analytical Sciences 24 ページ: 161-161
  • 査読あり
• [雑誌論文] Depiction of metabolome changesin histidine-starved Escherichia coli by CE-TOFMS (2008)
  • 著者名/発表者名: Ohashi, Y.
  • 雑誌名: Mol. BioSyst 4 ページ: 135-147
  • 査読あり
• [雑誌論文] Large-scale phosphorylation mapping reveals the extent of tyrosine phosphorylation in Arabidopsis (2008)
  • 著者名/発表者名: Sugiyama, N.
  • 雑誌名: Mol Syst Biol. 4 ページ: 193-193
  • 査読あり
• [雑誌論文] Time-resolved metabolomics reveals metabolic modulation in rice foliage (2008)
  • 著者名/発表者名: Sato, S.
  • 雑誌名: BMC Systems Biology 2 ページ: 51-51
  • 査読あり
• [雑誌論文] Successive and Selective Release of Phosphorylated Peptides Captured by hydroxy Acid-Modified Metal Oxide Chromatography (2008)
  • 著者名/発表者名: Kyono, Y.
  • 雑誌名: J. Proteome Res ページ: 4585-4593
  • 査読あり
• [雑誌論文] Visualizing Complex Omics Information-Scientific Visualization for Genomics and Systems Biology (2008)
  • 著者名/発表者名: Arakawa, K.
  • 雑誌名: BIOforum Europe 6 ページ: 27-29
  • 査読あり
• [雑誌論文] Aligning LC Peaks by Converting Gradient Retention Times to Retention Index of Peptides in Proteomic Experiments (2008)
  • 著者名/発表者名: Shinoda, K.
  • 雑誌名: Bioinformatics 24 ページ: 1590-1595
  • 査読あり
• [雑誌論文] Depiction of metabolome changes in histidine-starved Esche richia coli by CE-TOFMS (2008)
  • 著者名/発表者名: Ohashi Y, Hirayama A, Ishikawa T, Nakamura S, Shimizu K, Ueno Y, Tomita M and Soga T
  • 雑誌名: Mol. BioSist 4 ページ: 135-147
  • 査読あり
• [雑誌論文] Aligning LC Peaks by Converting Gradient Retention Times to Retention Index of Peptides in Proteomic Experiments (2008)
  • 著者名/発表者名: Shinoda K, Tomita M, Ishihama. Y.
  • 雑誌名: Bioinformatics 24 ページ: 1590-1595
  • 査読あり
• [雑誌論文] Aligning LC Peaks by Converting Gradient Retention Times t o Retention Index of Peptides in Proteomic Experiments (2008)
  • 著者名/発表者名: Shinoda, K
  • 雑誌名: Bioinformatics 24 ページ: 1590-1595
  • 査読あり
• [雑誌論文] Visualizing Complex Omics Information-Scientific Visualiza tion for Genomics and Systems Biology (2008)
  • 著者名/発表者名: Arakawa, K
  • 雑誌名: BlOforum Europe 6 ページ: 27-29
  • 査読あり
• [雑誌論文] Successive and Selective Release of Phosphorylated Peptide s Captured by hydroxy Acid-Modified Metal Oxide Chromatography (2008)
  • 著者名/発表者名: Kyono, Y
  • 雑誌名: Journal of Proteome Research 7 ページ: 4585-4593
  • 査読あり
• [雑誌論文] Time-resolved metabolomics reveals metabolic modulation in rice foliage (2008)
  • 著者名/発表者名: Sato, S
  • 雑誌名: BMC Systems Biology 2 ページ: 51-51
  • 査読あり
• [雑誌論文] Large-scale phosphorylation mapping reveals the extent of tyrosine phosphorylation in Arabidopsis (2008)
  • 著者名/発表者名: Sugiyama, N
  • 雑誌名: Mol Syst Biol 4 ページ: 193-193
  • 査読あり
• [雑誌論文] Depiction of metabolome changes in histidine-starved Esche richia coli by CE-TOFMS (2008)
  • 著者名/発表者名: Ohashi, Y
  • 雑誌名: Mol BioSyst 4 ページ: 135-147
  • 査読あり
• [雑誌論文] Automated Phosphoproteome Analysis for Cultured Cancer Cel Is by Two-Dimensional NanoLC-MS Using a Calcined Titania/C18 Biphasic Column (2008)
  • 著者名/発表者名: Imami, K
  • 雑誌名: Innovations in Analytical. Sciences 24 ページ: 161-161
  • 査読あり
• [雑誌論文] トランスクリプトーム,プロテオーム,メタボローム,フラクソームの統合による大腸菌の代謝解明 (2008)
  • 著者名/発表者名: 石井伸佳
  • 雑誌名: 実験医学 26 ページ: 24-29
• [雑誌論文] Multiple High- Throughput Analyses Monitor the Response of E. coli to Perturbations (2007)
  • 著者名/発表者名: 石井伸佳, ほか28名
  • 雑誌名: Science 316 ページ: 593-597
  • 査読あり
• [雑誌論文] Multiple High-Throughput Analyses Monitor the Response of E.coli to Perturbations. (2007)
  • 著者名/発表者名: Ishii N, Nakahigashi K, Baba T, Robert M, Soga T, Kanai A, Hirasawa T, Naba M, Hirai K, Hoque A, Ho PY, Kakazu Y, Sugawara K, Igarashi S, Harada S, Masuda T, Sugiyama N, Togashi T, Hasegawa M, Takai Y, Yugi K, Arakawa K, Iwata N, Toya Y, Nakayama Y, Nishioka T, Shimizu K, Mori H, Tomita M
  • 雑誌名: Science 10.112(DOI:10.1126/science.1132067)
  • 査読あり
• [雑誌論文] CheA-CheYpの親和性と大腸菌化学走性における順応誤差の解析 (2007)
  • 著者名/発表者名: 松崎由理
  • 雑誌名: 情報処理学会論文誌:数理モデル化と応用 48 ページ: 91-97
  • 査読あり
• [雑誌論文] システムバイオロジーのためのモデリング・シミュレーション環境 (2007)
  • 著者名/発表者名: 櫻田剛史
  • 雑誌名: 情報処理 48 ページ: 1089-1095
• [雑誌論文] Multiple High-Throughput Analyses Monitor the Response of E. coli to Perturbations. (2007)
  • 著者名/発表者名: 石井 伸佳
  • 雑誌名: Science 10. 1126
• [雑誌論文] Differential metabolomics reveals ophthalmic acid as an oxidative stress biomarker indicating hepatic glutathione consumption (2006)
  • 著者名/発表者名: 曽我朋義, ほか10名
  • 雑誌名: J. Biol. Chem 281(24) ページ: 16768-16776
  • 査読あり
• [雑誌論文] A metabolomics approach for enzyme discovery (2006)
  • 著者名/発表者名: 斎藤菜摘, ほか7名
  • 雑誌名: J Proteome Research 5(8) ページ: 1979-1987
  • 査読あり
• [雑誌論文] MathDAMP: a package for differential analysis of metabolite profiles (2006)
  • 著者名/発表者名: Richard Baran, ほか7名
  • 雑誌名: BMC Bioinformatics 7 ページ: 530-538
  • 査読あり
• [雑誌論文] Prediction of liquid chromatographic retention times of peptides generated by protease digestion of the Escherichia coli proteome using artificial neural networks (2006)
  • 著者名/発表者名: 篠田幸作, ほか7名
  • 雑誌名: J. Proteome Research 5(12) ページ: 3312-3317
  • 査読あり
• [雑誌論文] HybGFS: hybrid method for genome-fingerprint scanning. (2006)
  • 著者名/発表者名: 篠田幸作, ほか6名
  • 雑誌名: BMC Bioinformatics 7 ページ: 479-486
  • 査読あり
• [雑誌論文] Differential metabolomics reveals ophthalmic acid as an oxidative stress biomarker indicating hepatic glutathione consumption. (2006)
  • 著者名/発表者名: Soga T, Baran R, Suematsu M, Ueno Y, Ikeda S, Sakurakawa T, Kakazu Y,Ishikawa T, Robert M, Nishioka T, Tomita M
  • 雑誌名: The Journalofbiologicalchemistry 281(24) ページ: 16768-16776
  • 査読あり
• [雑誌論文] HybGFS : a hybrid method for genome-fingerprint scanning. (2006)
  • 著者名/発表者名: 篠田 幸作
  • 雑誌名: BMC Bioinformatics 7・479
• [雑誌論文] Prediction of liquid chromatographic retention times of peptides generated by protease digestion of the Escherichia coli proteome using artificial neural networks (2006)
  • 著者名/発表者名: 篠田 幸作
  • 雑誌名: Journal of proteome research 15 (12) ページ: 3312-3317
• [雑誌論文] MathDAMP : a package for differential analysis of metabolite profiles. (2006)
  • 著者名/発表者名: Richard Baran
  • 雑誌名: BMC Bioinformatics 7・530
• [雑誌論文] A metabolomics approach for enzyme discovery (2006)
  • 著者名/発表者名: 斎藤 菜摘
  • 雑誌名: Journal of proteome research 5 (8) ページ: 1979-1987
• [雑誌論文] Differential metabolomics reveals ophthalmic acid as an oxidative stress biomarker indicating hepatic glutathione consumption. (2006)
  • 著者名/発表者名: 曽我 朋義
  • 雑誌名: The Journal of biological chemistry 281 (24) ページ: 16768-16776
• [学会発表] Metabolomes and data-driven systems biology (2009)
  • 著者名/発表者名: Tomita, M.
  • 学会等名: The 10th International Conference on Systems Biology
  • 発表場所: San Francisco, USA.
  • 年月日: 2009-09-03
• [学会発表] Metabolomes and data-driven systems biology (2009)
  • 著者名/発表者名: Masaru Tomita
  • 学会等名: The 10th International Conference on Systems Biology
  • 発表場所: San Francisco, U.S.A.
  • 年月日: 2009-09-03
• [学会発表] Metabolomics and Systems Biology (2009)
  • 著者名/発表者名: Tomita, M.
  • 学会等名: Foundations OF Systems Biology In Engineering
  • 発表場所: Denver, USA.
  • 年月日: 2009-08-10
• [学会発表] Metabolomics and Systems Biology (2009)
  • 著者名/発表者名: Masaru Tomita
  • 学会等名: Foundations OF Systems Biology In Engineering
  • 発表場所: Denver, U.S.A.
  • 年月日: 2009-08-10
• [学会発表] E-Cell 3D: 3-dimensional visulization of cellular simulation results (2009)
  • 著者名/発表者名: Nozomu Yachie
  • 学会等名: ISMB/ECCB2007
  • 発表場所: Wien, Austria
  • 年月日: 2009-07-26
• [学会発表] eXpanda: an integrated platform for network analysis and visualization (2009)
  • 著者名/発表者名: Hiroyuki Nakamura
  • 学会等名: ISMB/ECCB2007
  • 発表場所: Wien, Austria
  • 年月日: 2009-07-26
• [学会発表] MEGU: Pathway mapping web-service based on KEGG and SVG (2009)
  • 著者名/発表者名: Kazuharu Arakawa
  • 学会等名: ISMB/ECCB2007
  • 発表場所: Wien, Austria
  • 年月日: 2009-07-26
• [学会発表] Metabolome analysis and systems biology, Albany 2009 (2009)
  • 著者名/発表者名: Tomita, M.
  • 学会等名: The 16th Conversation
  • 発表場所: Albany, USA.
  • 年月日: 2009-06-18
• [学会発表] Metabolome analysis and systems biology (2009)
  • 著者名/発表者名: Masaru Tomita
  • 学会等名: Albany 2009, The 16th Conversation
  • 発表場所: Albany,U.S.A
  • 年月日: 2009-06-18
• [学会発表] High-throughput multi-omics systems biology and its applications (2008)
  • 著者名/発表者名: Tomita, M.
  • 学会等名: International Launch Conference Frontiers in Multi-Scale Systems Biology
  • 発表場所: Atlanta, USA.
  • 年月日: 2008-10-19
• [学会発表] High-throughput multi-omics systems biology and its applic ations (2008)
  • 著者名/発表者名: Masaru Tomita
  • 学会等名: International Launch Conference Frontiers in Multi-Scale Systems Biology
  • 発表場所: Georgian Terrace Hote I, Atlanta, U.S.A.
  • 年月日: 2008-10-19
• [学会発表] Metabolome analysis and systems biology (2008)
  • 著者名/発表者名: Tomita, M.
  • 学会等名: The 13thInternational Biotechnology Symposium (IBS) and Exhibition
  • 発表場所: Dalian World Expo CenterDalian, China
  • 年月日: 2008-10-16
• [学会発表] Metabolome analysis and systems biology (2008)
  • 著者名/発表者名: Masaru Tomita
  • 学会等名: The 13th International Biotechnology Symposium (IBS) and Exhibition
  • 発表場所: the Dalian World Expo CenterDalian, China
  • 年月日: 2008-10-16
• [学会発表] Metabolomics and Systems Biology (2008)
  • 著者名/発表者名: Tomita, M.
  • 学会等名: The Second q-bio Conference on Cellular Information Processing
  • 発表場所: Santa Fe, U.S.A.
  • 年月日: 2008-08-08
• [学会発表] Metabolomics and Systems Biology (2008)
  • 著者名/発表者名: Masaru Tomita
  • 学会等名: The Second q-bio Conference on Cellular In formation Processing
  • 発表場所: Santa Fe, U.S.A
  • 年月日: 2008-08-08
• [学会発表] Multi-omics analysis and integrative Systems Biology (2008)
  • 著者名/発表者名: 冨田勝
  • 学会等名: Genomes to Systems Conference
  • 発表場所: Manchester, UK
  • 年月日: 2008-03-19
• [学会発表] Multi-omics analysis and integrative Systems Biology (2008)
  • 著者名/発表者名: 冨田 勝
  • 学会等名: Genomes to Systems conference 2008
  • 発表場所: Manchester, UK
  • 年月日: 2008-03-19
• [学会発表] Metabolomics and its applications to integrative systems biology (2008)
  • 著者名/発表者名: 冨田勝
  • 学会等名: The 10th International Conference on Molecular Systems Biology
  • 発表場所: Manila, Philippines
  • 年月日: 2008-02-27
• [学会発表] Metabolomics and its applications to integrative systems biology (2008)
  • 著者名/発表者名: 冨田 勝
  • 学会等名: The 10th International Conference on Molecular Systems Biology (ICMSB 2008)
  • 発表場所: Manila, Philippines
  • 年月日: 2008-02-27
• [学会発表] メタボローム解析によるがん診断 (2008)
  • 著者名/発表者名: 冨田 勝
  • 学会等名: 静岡がん会議2007
  • 発表場所: 静岡
  • 年月日: 2008-02-16
• [学会発表] メタボローム解析と統合システムバイオロジー (2007)
  • 著者名/発表者名: 冨田 勝
  • 学会等名: 第30回日本分子生物学会念会・第80回日本生化学会大会 合同大会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2007-12-13
• [学会発表] 低酸素に応答したヒト赤血球代謝における解糖系活性化の役割と機構の解析:コンピュータシミュレーションによる予測とメタボロームによる実証 (2007)
  • 著者名/発表者名: 木下綾子,塚田孝祐,曽我朋義,菱木貴子,西野泰子,冨田勝,末松誠
  • 学会等名: 第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2007-12-11
• [学会発表] 網羅的ハイスループット解析による大腸菌の遺伝的・環境的変動への応答の観測 (2007)
  • 著者名/発表者名: 石井 伸佳
  • 学会等名: 第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会 合同大会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2007-12-11
• [学会発表] MEGU: KEGG に基づいたオミクスデータのパスウェイ可視化ウェブアブリケーシヨン (2007)
  • 著者名/発表者名: 河野 暢明
  • 学会等名: 第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会 合同大会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2007-12-11
• [学会発表] インタラクトーム統合解析プラットフォームeXpanda (2007)
  • 著者名/発表者名: 中村 浩之
  • 学会等名: 第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会 合同大会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2007-12-11
• [学会発表] E-Cell 3D: 細胞シミュレーションデータの三次元可視化 (2007)
  • 著者名/発表者名: 荒川 和晴
  • 学会等名: 第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会 合同大会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2007-12-11
• [学会発表] 哺乳類時計遺伝子発振ネットワークの定量的モデリングとシミュレーション (2007)
  • 著者名/発表者名: 小川 雪乃
  • 学会等名: 第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会 合同大会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2007-12-11
• [学会発表] 低酸素に応答したヒト赤血球代謝における解糖系活性化の役割と機構の解析:コンピュータシミュレーションによる予測とメタボロームによる実証 (2007)
  • 著者名/発表者名: 木下 綾子
  • 学会等名: 第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会 合同大会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2007-12-11
• [学会発表] ヒト赤血球代謝シミュレーションモデルを用いた低温保存血液における赤血球代謝動態の予測と解析 (2007)
  • 著者名/発表者名: 西野 泰子
  • 学会等名: 第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会 合同大会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2007-12-11
• [学会発表] 単細胞モデルに基づく多細胞組織モデル:肝小葉における組織内遺伝子発現調節のシミュレーション (2007)
  • 著者名/発表者名: 内藤 泰宏
  • 学会等名: 第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会 合同大会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2007-12-11
• [学会発表] メタボロームプロフアイリングを利用した酵素機能解析 (2007)
  • 著者名/発表者名: 斎藤 菜摘
  • 学会等名: 第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会 合同大会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2007-12-11
• [学会発表] 糸状仮足の数理モデルを用いた神経成長円錐の旋回シミュレーション (2007)
  • 著者名/発表者名: 藤本 顕士
  • 学会等名: 第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会 合同大会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2007-12-11
• [学会発表] Metabolome Science and Systems Biology (2007)
  • 著者名/発表者名: 冨田勝
  • 学会等名: The 7th International Workshop on Advanced Genomics
  • 発表場所: Tokyo, JAPAN
  • 年月日: 2007-11-27
• [学会発表] メタボロームとシステムズバイオロジーの医療への応用 (2007)
  • 著者名/発表者名: 冨田 勝
  • 学会等名: 第37回日本免疫学会総会・学術集会
  • 発表場所: 品川
  • 年月日: 2007-11-20
• [学会発表] メタボローム科学の発展とシステムバイオロジー (2007)
  • 著者名/発表者名: 冨田 勝
  • 学会等名: KAST 財団法人神奈川科学技術アカデミー 平成19年度教育講座
  • 発表場所: 溝の口
  • 年月日: 2007-11-15
• [学会発表] Multi-omics data-driven systems biology, International Society for Computational Biology (2007)
  • 著者名/発表者名: 冨田勝
  • 学会等名: Special Interest Group on Biosimulation
  • 発表場所: Long Beach, USA
  • 年月日: 2007-10-05
• [学会発表] Multi-omics data-driven systems biology (2007)
  • 著者名/発表者名: 冨田 勝
  • 学会等名: International Society for Computational Biology, Special Interest Group on Biosimulation
  • 発表場所: Long Beach, USA
  • 年月日: 2007-10-05
• [学会発表] メタボローム解析とシステムバイオロジーの医療への応用 (2007)
  • 著者名/発表者名: 冨田 勝
  • 学会等名: 第26回消化器病態生理勉強会
  • 発表場所: 新宿
  • 年月日: 2007-08-04
• [学会発表] 網羅的ハイスループット解析によって示唆される大腸菌の遺伝的・環境的変動に対する頑強性 (2007)
  • 著者名/発表者名: 戸谷 吉博
  • 学会等名: 第4回21世紀大腸菌研究会
  • 発表場所: 静岡国民年金健康センター藤枝エミナース
  • 年月日: 2007-07-17
• [学会発表] Large-scale multi-omics analyses for E. coli systems biology (2007)
  • 著者名/発表者名: 冨田勝
  • 学会等名: 3rd Metabolomics Society Annual Conference
  • 発表場所: Manchester, UK
  • 年月日: 2007-06-12
• [学会発表] Large・scale multi-omics analyses for E. coli systems biology (2007)
  • 著者名/発表者名: 冨田 勝
  • 学会等名: 3rd Metabolomics Society Annual Conference
  • 発表場所: Manchester, UK
  • 年月日: 2007-06-12
• [学会発表] Multi-omics analysis and data-driven systems biology, E cell (2007)
  • 著者名/発表者名: 冨田勝
  • 学会等名: The Steering Committee of the 2nd Annual Summit on Systems Biology
  • 発表場所: Richmond, USA
  • 年月日: 2007-06-05
• [学会発表] Multi-omics analysis and data-driven systems biology, E cell (2007)
  • 著者名/発表者名: 冨田 勝
  • 学会等名: The Steering Committee of the 2nd Annual Summit on Systems Biology
  • 発表場所: Richmond,USA
  • 年月日: 2007-06-05
• [学会発表] Metabolome analysis and cell simulation (2007)
  • 著者名/発表者名: 冨田勝
  • 学会等名: Systems Biology Workshop-2007
  • 発表場所: Melbourne, Australia.
  • 年月日: 2007-05-29
• [学会発表] Metabolome analysis and cell simulation (2007)
  • 著者名/発表者名: 冨田 勝
  • 学会等名: Systems Biology Workshop - 2007
  • 発表場所: Melbourne, Australia
  • 年月日: 2007-05-29
• [学会発表] MEGU: Pathway mapping web-service based on KEGG and SVG (2007)
  • 著者名/発表者名: Arakawa, K.
  • 学会等名: ISMB/ECCB2007
  • 発表場所: Wien, Austria.
• [学会発表] eXpanda: an integrated platform for network analysis and visualization (2007)
  • 著者名/発表者名: Nakamura, H.
  • 学会等名: ISMB/ECCB2007
  • 発表場所: Wien, Austria.
• [学会発表] E-Cell 3D: 3-dimensional visulization of cellular simulation results (2007)
  • 著者名/発表者名: Yachie, N.
  • 学会等名: ISMB/ECCB2007
  • 発表場所: Wien, Austria
• [図書] E coli metabolomics; capturing the complexity of a "simple" model(Metabolomics-A Powerful Tool in Systems Biology-, vol. 18) (2007)
  • 著者名/発表者名: Martin, R
• [図書] メタボロミクスの医学への応用 (2007)
  • 著者名/発表者名: 曽我朋義
  • 出版者: 最新医学社
• [図書] E coli metabolomics; capturing the complexity of a "simple" model (2007)
  • 著者名/発表者名: Martin, R
  • 出版者: Metabolomics-A Powerful Tool in Systems Biology-(vol. 18)