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生体分子のパスウェイ・ネットワークの光制御法の確立

研究課題

研究課題/領域番号 18016029
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関東邦大学

研究代表者

古田 寿昭  東邦大学, 理学部, 教授 (90231571)

研究分担者 渡辺 直子  東邦大学, 理学部, 教授 (80230978)
研究期間 (年度) 2006 – 2007
研究課題ステータス 完了 (2007年度)
配分額 *注記
7,400千円 (直接経費: 7,400千円)
2007年度: 3,600千円 (直接経費: 3,600千円)
2006年度: 3,800千円 (直接経費: 3,800千円)
キーワードナノバイオ / 光スイッチ / 合成化学 / 生体分子 / 可視化 / ケージド化合物 / 遺伝子の機能制御 / 遺伝子 / 発現制御 / ゲージド化合物 / 光化学 / シグナル伝達
研究概要

遺伝子の発現を時空間的に制御する手法は生命現象を理解する上で非常に有用である。遺伝子発現関連分子を光分解性保護基によって機能的にマスキングし,光照射によって回復する技術によって高い時空間分解能で実現できると期待される。Caging試薬であるBhc-diazoはDNAのリン酸と反応して、Bhc基により修飾されたcaged DNAを形成する。caged DNAはUV照射によるBhc基の切断によって初めて転写の鋳型となると予想される。しかしcaged DNAを用いた光による発現制御は再現性に乏しく、このことはin vitroにおいてDNAのcagingの程度を示す有効な指標がないことに一因がある。そこで,DNAのcagingの指標を得ること,およびcaged pDNAを用いて哺乳類培養細胞において遺伝子発現を光制御することを目指した。
caged pDNAはpDNAをBhc-diazo溶液と混和し遮光条件下で反応させることで得た。通常DNAは熱に対して安定であり94℃で加熱しても電気泳動パターンにはほとんど影響が見られないが、caged pDNAでは加熱により泳動バンドがスメアになることから、高温により断片化すると考えられる。それに対しUV照射によるuncaged DNAでは加熱後もバンドが観察された。そこでこの熱不安定性をcagingの指標として条件設定を行い,再現性よくプラスミドDNAを合成する条件を確立することができた。得られたcaged pDNAを用いて,in vitroおよびin vivoにおける遺伝子発現の光誘導を試みた。その結果,in vitroの系でも,HeLa細胞内においても,UV照射により用いたレポータ遺伝子の発現を数倍以上増大させることに成功した。またcaged DNAの熱不安定性がcagingの指標として有効であることも示された。

報告書

(2件)
  • 2007 実績報告書
  • 2006 実績報告書
  • 研究成果

    (21件)

すべて 2008 2007 2006

すべて 雑誌論文 (8件) (うち査読あり 4件) 学会発表 (10件) 図書 (3件)

  • [雑誌論文] Synthesis and Photochemical Properties of a Light-activated Fluorophore to label His-tagged Proteins2008

    • 著者名/発表者名
      C. Orang, et. al.
    • 雑誌名

      Chem. Commun.

      ページ: 1217-1219

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A Caged Phosphopeptide-Based Approach for Photochemical Activation of Kinases in Living Cells2008

    • 著者名/発表者名
      T. Kawakami, et. al.
    • 雑誌名

      ChemBioChem (in press)

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallographic Evidence for Water-assisted Photo-induced Peptide Cleavage in the Stony Coral Fluorescent Protein Kaede2007

    • 著者名/発表者名
      I. Hayashi, et. al.
    • 雑誌名

      J. Mol. Biol. 372

      ページ: 918-926

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Phototriggers for Nucleobases with Improved Photochemicasl Properties2007

    • 著者名/発表者名
      T. Furuta, et. al.
    • 雑誌名

      Org. Lett. 9

      ページ: 4717-4720

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 生理機能を光制御するケージド化合物-Problem Oriented Researchを目指そう-2007

    • 著者名/発表者名
      古田寿昭
    • 雑誌名

      Peptide Newsletter Japan

      ページ: 2-4

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [雑誌論文] New Photoremovable Protecting Groups for Carboxylic Acids with High Photolytic Efficiencies at Near-UV Irradiation. Application to the Photocontrolled Release of L-Glutamate.2006

    • 著者名/発表者名
      A.Specht et al.
    • 雑誌名

      ChemBioChem 7

      ページ: 1690-1695

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] 細胞のリモートコントロール2006

    • 著者名/発表者名
      古田寿昭
    • 雑誌名

      ファルマシア 42

      ページ: 446-450

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] 細胞のリモートコントロール2006

    • 著者名/発表者名
      古田寿昭
    • 雑誌名

      バイオインダストリー 23

      ページ: 58-64

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [学会発表] 核酸塩基のケージド化合物の合成と光反応性2008

    • 著者名/発表者名
      佐京 隼, 秋山真吾, 古田寿昭
    • 学会等名
      日本化学会第88春季年会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2008-03-28
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 哺乳動物培養細胞における遺伝子発現の光誘導2008

    • 著者名/発表者名
      大室純子, 古田寿昭
    • 学会等名
      日本化学会第88春季年会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2008-03-28
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 機能モジュールを付加したケージドヌクレオチドの合成2008

    • 著者名/発表者名
      村越加奈子, 大坪亜衣, 古田寿昭
    • 学会等名
      日本化学会第88春季年会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2008-03-28
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Application of caged compounds and high speed fluorescence imaging to the study of sperm motility regulation2008

    • 著者名/発表者名
      T. Nishigaki, et. al.
    • 学会等名
      The 85th Annual Meeting of the Physiological Society of Japan
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 生理活性を光で操るケージド化合物2007

    • 著者名/発表者名
      古田寿昭
    • 学会等名
      日本分光学会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2007-12-14
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 哺乳動物培養細胞における遺伝子発現の光制御2007

    • 著者名/発表者名
      大室純子, 古田寿昭
    • 学会等名
      BMB2007(第30回日本分子生物学会年会, 第80回日本生化学会大会 合同大会)
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2007-12-13
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 大腸菌のファルネシル二リン酸合成酵素遺伝子破壊株におけるファルネシル二リン酸の生成2007

    • 著者名/発表者名
      高橋 洋, 古田寿昭, 藤崎真吾
    • 学会等名
      BMB2007(第30回日本分子生物学会年会, 第80回日本生化学会大会 合同大会)
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2007-12-13
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 生理機能を光制御するケージド化合物の開発2007

    • 著者名/発表者名
      古田寿昭
    • 学会等名
      岡田学術創成シンポジウム
    • 発表場所
      岡崎
    • 年月日
      2007-11-01
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 機能性ケージド化合物の設計と合成2007

    • 著者名/発表者名
      村越加奈子, 古田寿昭
    • 学会等名
      日本化学会第1回関東支部大会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] ケージドペプチド核酸の合成と光反応性2007

    • 著者名/発表者名
      佐京 隼, 古田寿昭
    • 学会等名
      日本化学会第1回関東支部大会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [図書] 光機能性高分子材料の新たな潮流-最新技術とその展望-2008

    • 著者名/発表者名
      古田寿昭(分担)
    • 総ページ数
      357
    • 出版者
      シーエムシー出版
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [図書] 別冊化学 分子イメージング2007

    • 著者名/発表者名
      古田寿昭(分担)
    • 総ページ数
      98
    • 出版者
      化学同人
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [図書] 実験医学別冊 染色・バイオイメージング実験ハンドブック2006

    • 著者名/発表者名
      高田邦昭ほか(編集)
    • 総ページ数
      334
    • 出版者
      羊土社
    • 関連する報告書
      2006 実績報告書

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公開日: 2006-04-01   更新日: 2018-03-28  

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