大規模全ゲノム関連解析によるアトピー性喘息疾患遺伝子の探索

• 研究課題/領域番号: 18018003
• 研究種目: 特定領域研究
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 生物系
• 研究機関: 筑波大学
• 研究代表者: 野口 恵美子 筑波大学, 大学院・人間総合科学研究科, 講師 (40344882)
• 研究期間 (年度): 2006 – 2007
• 研究課題ステータス: 完了 (2007年度)
• 配分額: 8,500千円 (直接経費: 8,500千円); 2007年度: 4,300千円 (直接経費: 4,300千円); 2006年度: 4,200千円 (直接経費: 4,200千円)
• キーワード: 喘息 / 全ゲノム関連解析

研究概要

本研究では一塩基置換多型(SNP)よる喘息全ゲノム関連解析の結果から陽性となったSNP(一次解析)をさらに家系およびケースコントロールのサンプルを用いて関連解析(二次解析、三次解析)を行うことにより疾患感受性遺伝子を探索することを目的とする。本年度は気管支喘息のSNPの全ゲノム解析により気管支喘息発症と関連するSNPとして同定されたPEX19-1073C/A(rs2820421)の機能解析実験およびin silico analysisを行った。疾患との関連が認められたrs2820421は50kbにまたがる大きな連鎖不平衡ブロックの中にありこのブロック内には4遺伝子が存在する。SNP発現解析ソフトウェアであるmRNA by SNPソフトウェアによるin silico analysisではrs2820421はWDR42R およびPEX19遺伝子の発現を調節しているという結果が示唆された。ルシフェラーゼアッセイによる転写解析ではrs2820421のCアレルの転写活性はAアレルと比較して有意に高く、さらにゲルシフトアッセイでは、Aアレルを含むオリゴヌクレオチドはCアレルを含むものよりも結合能が高いことが観察された。以上の結果から、rs2820421領域になんらかの転写因子が結合し、下流の遺伝子発現を調節することにより喘息の疾患感受性に関わっている可能性が示唆された(Fujimotoら、論文投稿中)。

研究成果

• [雑誌論文] Genetic polymorphism regulating ORM1-like 3 (Saccharomyces cerevisiae) expression is associated with childhood atopic asthma in a Japanese population (2008)
  • 著者名/発表者名: Hirota T, Harada M, Sakashita M, Doi S, Miyatake A, Fujita K, Enomoto T, Ebisawa M, Yoshihara S, Noguchi E, et. al.
  • 雑誌名: J Allergy Clin Immunol 121 ページ: 769-770
  • 査読あり
• [雑誌論文] Alpha-1-antitrypsin and complement component C7 are involved in asthma exacerbation. (2008)
  • 著者名/発表者名: Nishioka T, Uchida K, Meno K, Ishii T, Aoki T, Imada Y, Makino Y, Hirata K, Matsumoto Y, Arinami T, Noguchi E
  • 雑誌名: Proteomics Clin Appl 2 ページ: 46-54
  • 査読あり
• [雑誌論文] Single nucleotide polymorphism-based genome-wide linkage analysis in Japanese atopic dermatitis families (2007)
  • 著者名/発表者名: Enomoto H, Noguchi E, Iijima S, Takahashi T, Hayakawa K, Ito M, Kano T, Aoki T, Suzuki Y, Koga M, Noguchi E
  • 雑誌名: BMC Dermatology 7 ページ: 5-8
  • NAID: 120007138747
  • 査読あり
• [雑誌論文] 喘息の薬理遺伝学 (2007)
  • 著者名/発表者名: 野口恵美子
  • 雑誌名: International Review of Asthma 9 ページ: 56-65
• [雑誌論文] アレルギー疾患の遺伝要因 (2007)
  • 著者名/発表者名: 野口恵美子
  • 雑誌名: 日本小児アレルギー学会雑誌 21 ページ: 69-74
  • NAID: 10024133293
• [雑誌論文] Determination of structure and transcriptional regulation of CYSLTR1 and an association study with asthma and rhinitis (2006)
  • 著者名/発表者名: Zhang J, Migita O, Koga M, Shibasaki M, Arinami T, Noguchi E
  • 雑誌名: Pediatr Allergy Immunol 17 ページ: 242-249
• [雑誌論文] ADAM33 polymorphisms are associated with asthma susceptibility in a Japanese population. (2006)
  • 著者名/発表者名: Noguchi E, Ohtsuki Y, Tokunaga K, Yamaoka-Sageshima M, Ichikawa K, Aoki T, Shibasaki M, Arinami T
  • 雑誌名: Clin Exp Allergy 36 ページ: 602-608
• [雑誌論文] Failure to find an association between CD14-159C/T polymorphism and asthma : a family-based association test and meta-analysis (2006)
  • 著者名/発表者名: Nishimura F, Shibasaki M, Ichikawa K, Arinami T, Noguchi E
  • 雑誌名: Allergol Int 55 ページ: 55-58
  • NAID: 10020557549
• [雑誌論文] Monoallelic and unequal allelic expression of the HTR2A gene in human brain and peripheral lymphocytes. (2006)
  • 著者名/発表者名: Fukuda Y, Koga M, Arai M, Noguchi E, Ohtsuki T, Horiuchi Y, Ishiguro H, Niizato K, Iritani S, Itokawa M, Arinami T
  • 雑誌名: Biol Psychiatry 60 ページ: 1331-1335
• [雑誌論文] An association between asthma and TNF-308G/A polymorphism : meta-analysis (2006)
  • 著者名/発表者名: Aoki T, Hirota T, Tamari M, Ichikawa K, Takeda K, Arinami T, Shibasaki M, Noguchi E
  • 雑誌名: J Hum Genet 51 ページ: 677-685
  • NAID: 10019285915
• [学会発表] アレルギー疾患の遺伝子配列解析研究の進歩と現状 (2007)
  • 著者名/発表者名: 野口恵美子
  • 学会等名: 第44回日本小児アレルギー学会総会
  • 発表場所: 名古屋
  • 年月日: 2007-12-08
• [学会発表] 全ゲノム関連解析による気管支喘息疾患感受性遺伝子の同定 (2007)
  • 著者名/発表者名: 藤本正弥・野口恵美子, ら
  • 学会等名: 第57回日本アレルギー学会秋季学術集会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2007-11-02
• [学会発表] 網羅的遺伝子発現解析による喘息関連遺伝子の同定 (2007)
  • 著者名/発表者名: 青木健・野口恵美子, ら
  • 学会等名: 第57回H本アレルギー一学会秋季学術集会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2007-11-01