ゲノムブロック異常と精神神経疾患発症素因の解明

• 研究課題/領域番号: 18023031
• 研究種目: 特定領域研究
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 生物系
• 研究機関: 横浜市立大学
• 研究代表者: 松本 直通 横浜市立大学, 医学研究科, 教授 (80325638)
• 研究期間 (年度): 2006 – 2007
• 研究課題ステータス: 完了 (2007年度)
• 配分額: 8,800千円 (直接経費: 8,800千円); 2007年度: 4,400千円 (直接経費: 4,400千円); 2006年度: 4,400千円 (直接経費: 4,400千円)
• キーワード: 脳神経疾患 / ゲノム / マイクロアレー / 遺伝子

研究概要

4.2Kマイクロアレーを用いた統合失調症59例の解析:統合失調症59例の株化リンパ芽球を国立精神神経センター神経研究所疾病研究第三部の功刀浩部長・橋本亮太前室長(現大阪大学医学系研究科精神医学)並びに東京都精神医学総合研究所統合失調症プロジェクトの糸川昌成プロジェクトリーダーの協力のもと集積した。全症例をFISH検証済みBAC4219個を搭載した4.2Kアレーを用いて解析した。個々の症例において少なくとも4〜12箇所程度のコピー数異常を疑う領域を検出した。これら異常の疑われる部位のうち正常ゲノム多型と考えられるCopy Number Variation Database に登録されていない領域に焦点を絞りFISH・定量PCRで検証しコピー数異常の確定を行った。
同定された染色体微細構造異常:6症例(10%)のリンパ芽球において以下の染色体異常を同定した。(1)46,XY.ish del(17)(p12p12),(2)46,XY,der(13)t(12;13)(p12.1;Pp11).ish del(5)(p11p12),(3)46,XX.ish dup(11)(p13p13),(4)mos45,X[41]/46XX[59],(5)mos45,X[84]/46XX[16],(6)46,X,idic(Yp)(仮)である。この内,2例で認められたmos45,X/46XXを症例から得られた末梢血リンパ球からの染色体標本で追試したが,それぞれmos45,X[7]/46,XX[98]及び45,X[4]/46,XX[96]で,低頻度モザイクを認めた。
精神遅滞症候群における責任遺伝子単離:小児期に重度の精神遅滞を合併する1症候群において4.2Kアレーを用いてde novo微細欠失を同定した。この欠失内の候補遺伝子Aを同疾患症例でスクリーニングし複数の遺伝子変異を同定し,遺伝子Aを本症候群の責任遺伝子であると結論した。

研究成果

• [雑誌論文] Angelmasyndromecausedbyanidenticalfamilial1487-kbdeletion (2007)
  • 著者名/発表者名: Sato K, Matsumoto N.
  • 雑誌名: Am J Med Genet 143A ページ: 98-101
  • 査読あり
• [雑誌論文] Receent advance in genetics of Marfan syndrome and Marfa-associated disorders (2007)
  • 著者名/発表者名: Mizuguch T, Matsumoto N
  • 雑誌名: J Hum Genet 52 ページ: 1-12
  • 査読あり
• [雑誌論文] Role of DNA methylation and histone H3 Lysine 27 methylation in tissue-specific imprinting of mouse Grb10 (2007)
  • 著者名/発表者名: Yamaski-Ishizaki Y, others, Matsumoto N, others.
  • 雑誌名: Mol Cell Biol 27 ページ: 732-742
  • 査読あり
• [雑誌論文] RET oncogene amplification in thyroid cancer.correlations with cradiation-associated and high-gradc malignancy (2007)
  • 著者名/発表者名: Nakashima M, others, Matsumoto, N, others.
  • 雑誌名: Hum Pathol 38 ページ: 694-698
  • 査読あり
• [雑誌論文] Congenital Arhinia:Molecular-genetic Analysis of Five Patients (2007)
  • 著者名/発表者名: SatoK D, Matsumoto N, others
  • 雑誌名: Am J Med Genet 143A ページ: 546-552
  • 査読あり
• [雑誌論文] FBN2,FBN1,TGFBR1,and TGFBR2 analyses in congenital contractural arachnod actyly (2007)
  • 著者名/発表者名: Nishimura A, others, Matsumoto N
  • 雑誌名: Am J Med Genet 143A ページ: 694-698
  • 査読あり
• [雑誌論文] Less frequent NSD1-intragenic deletions in Japaese Sotos syndrome:Analysis of 30 patients by NSD1-exon array CGH,quantitative fluoresent duplex PCR,and fluoescence in situ hybridization (2007)
  • 著者名/発表者名: Sosonkina N others, Matsumoto N
  • 雑誌名: Acta Medica Nagasakiensia 52 ページ: 29-34
  • 査読あり
• [雑誌論文] A Japanes family of typical Loeys-Dietz syndrome with a TGFBR2 mutation (2007)
  • 著者名/発表者名: Togashi Y, others, Matsumoto N, others
  • 雑誌名: Internal Medicine 46 ページ: 1995-2000
  • 査読あり
• [雑誌論文] Nevo syndrome : a variant of Sotos syndrome? (2006)
  • 著者名/発表者名: Kanemoto N, others, Matsumoto N
  • 雑誌名: Am J Med Genet 140A(1) ページ: 70-73
• [雑誌論文] Analysis of the NSDI promoter region in patients with a Sotos syndrome phenotype. (2006)
  • 著者名/発表者名: Visser R, others, Matsumoto N
  • 雑誌名: J Hum Genet 51(1) ページ: 15-20
• [雑誌論文] A large interstitial deletion of 17p11.2-13.1 including the Smith-Magenis region in a patient with congenital multiple anomalies. (2006)
  • 著者名/発表者名: Yamomoto T, others, Harada N, Matsumoto N, Kurosawa K
  • 雑誌名: Am J Med Genet 140A(1) ページ: 88-91
• [雑誌論文] No causative genomic aberrations by BAC array CGH in Kabuki make-up syndrome. (2006)
  • 著者名/発表者名: Miyake N, Shimokawa O, Harada N, others, Matsumoto N
  • 雑誌名: Am J Med Genet 140A(3) ページ: 291-293
• [雑誌論文] BAC array CGH reveals genomic aberrations in idiopathic mental retardation. (2006)
  • 著者名/発表者名: Miyake N, Shimokawa O, Harada N, others, Matsumoto N
  • 雑誌名: Am J Med Genet 140A(3) ページ: 205-211
• [雑誌論文] Narrowing Candidate Region for Monosomy 9p Syndrome to a 4.7-Mb Segment at 9p22.2-p23. (2006)
  • 著者名/発表者名: Kawara H, Yamamoto T, Harada N, others, Matsumoto N
  • 雑誌名: Am J Med Genet 140A(4) ページ: 373-377
• [雑誌論文] The prevalent -16C>T change at the 5' UTR of the puratropin-1 gene in autosomal dominant cerebellar ataxia in Nagano. (2006)
  • 著者名/発表者名: Ohata T, others, Matsumoto N
  • 雑誌名: J Hum Genet 51(5) ページ: 461-466
• [雑誌論文] Microarray comparative genomic hybridization (CGH)-based prenatal diagnosis for chromosome abnormalities using cell-free fetal DNA in amniotic fluid. (2006)
  • 著者名/発表者名: Miura S, others, Harada N, others, Matsumoto N, others.
  • 雑誌名: J Hum Genet 51(5) ページ: 412-417
• [雑誌論文] Complete Hydatidiform Mole and Normal Live Birth after Intracytoplasmic Sperm Injection. (2006)
  • 著者名/発表者名: Hamanoue H, others, Harada H, others, Matsumoto N
  • 雑誌名: J Hum Genet 51(5) ページ: 477-479
• [雑誌論文] Germline KRAS and BRAF mutations in cardio-facio-cutaneous (CFC) syndrome. (2006)
  • 著者名/発表者名: Niihori T, others, Matsumoto N, others.
  • 雑誌名: Nat Genet 38(3) ページ: 294-296
• [雑誌論文] Polymorphic alleles of the human MEI1 gene are associated with human azoospermia by meiotic arrest. (2006)
  • 著者名/発表者名: Sato H, others, Matsumoto N, others.
  • 雑誌名: J Hum Genet 51(6) ページ: 533-540
• [雑誌論文] Comprehensive genetic analysis of relevant four genes in 49 patients with Marfan syndrome or Marfan related phenotypes. (2006)
  • 著者名/発表者名: Sakai H, others, Harada N, Mizuguchi T, Matsumoto N
  • 雑誌名: Am J Med Genet 140A(16) ページ: 1719-1725
• [雑誌論文] Array Comparative Genomic hybridization analysis in first-trimester spontaneous abortions with 'normal' karyotypes. (2006)
  • 著者名/発表者名: Shimokawa O, Harada N, others, Matsumoto N.
  • 雑誌名: Am J Med Genet 140A ページ: 1931-1935
• [雑誌論文] Mild craniosynostosis with 1p36.3 trisomy and 1p36.3 deletion syndrome caused by familial translocation t(Y;1). (2006)
  • 著者名/発表者名: Hiraki Y, others, Harada N, Mizuguchi T, Matsumoto N
  • 雑誌名: Am J Med Genet 140A(16) ページ: 1773-1777
• [雑誌論文] Trigonocephaly in a boy with paternally inherited deletion 22g11.2 syndrome. (2006)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto T, others, Matsumoto N, others
  • 雑誌名: Am J Med Genet 140A(12) ページ: 1302-1304
• [雑誌論文] Origin and mechanisms of formation of fetus-in-fetu : Two cases with genotype and methylation analyses. (2006)
  • 著者名/発表者名: Miura S, others, Harada N, Ishizaki-Yamasaki Y, Matsumoto M, others.
  • 雑誌名: Am J Med Genet 140A(16) ページ: 1737-1743
• [雑誌論文] Congenital neuroblastoma in a patient with partial trisomy of 2p. (2006)
  • 著者名/発表者名: Dowa Y, others, Harada N, Matsumoto N, Kurosawa K
  • 雑誌名: J Pediatr Hematol Oncol 28(6) ページ: 379-382
• [雑誌論文] A father and son with mental retardation, a characteristic face, inv(12), and insertion trisomy 12p12.3-p11.2. (2006)
  • 著者名/発表者名: Liang D, others, Harada N, others
  • 雑誌名: Am J Med Genet 140A(3) ページ: 238-244
• [雑誌論文] Clinical outcome of infants with confined placental mosaicism and intrauterine growth restriction of unknown cause. (2006)
  • 著者名/発表者名: Miura K, Yoshiura K, Miura S, Kondoh T, Harada N, others
  • 雑誌名: Am J Med Genet 140A(17) ページ: 1931-1935
• [学会発表] 染色体構造異常と疾患遺伝子(シンポジスト) (2007)
  • 著者名/発表者名: 松本 直通
  • 学会等名: 第30回日本分子生物学会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2007-12-15
• [学会発表] BAC array CGH:seven years experience.(invited lecture) (2007)
  • 著者名/発表者名: 松本 直通
  • 学会等名: 第5回サイトミク研究会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2007-11-02
• [学会発表] Chromosomal submicroscopic changes.(invited lecture) (2007)
  • 著者名/発表者名: Matsumoto N
  • 学会等名: The 1st National Summer program of Graduates in Med ical Genetics in China
  • 発表場所: 中国・長沙
  • 年月日: 2007-08-07
• [学会発表] Angelman syndrome caused by and identical familial 1487-kb deletion (2007)
  • 著者名/発表者名: Matsumoto N, Iwakoshi M
  • 学会等名: European Human Genetics Conference 2006
  • 発表場所: フランス・ニース
• [図書] Genomic disorders : The genomic basis of disease (Edited by Lupski JR and Stankiewicz PT) (2006)
  • 著者名/発表者名: Kurotaki N, Matsumoto N
  • 総ページ数: 426
  • 出版者: The Humana Press Inc, Totowa, NJ, USA