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ナノ開口基板を用いたシャペロニンGroELの1分子機能解析

研究課題

研究課題/領域番号 18031008
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 理工系
研究機関東京大学

研究代表者

上野 太郎  東京大学, 大学院・薬学系研究科, 助教 (80376590)

研究分担者 谷井 孝至  早稲田大学, 理工学術院, 准教授 (20339708)
島本 直伸  早稲田大学, 理工学術院, 准教授 (50386629)
研究期間 (年度) 2006 – 2007
研究課題ステータス 完了 (2007年度)
配分額 *注記
5,300千円 (直接経費: 5,300千円)
2007年度: 2,700千円 (直接経費: 2,700千円)
2006年度: 2,600千円 (直接経費: 2,600千円)
キーワードシャペロニン / ナノ開口基板 / 1分子蛍光イメージング / 協同性
研究概要

本研究では、シャペロニンGroELの両側に2個のGroESが同時に結合したFootball型複合体(FB)の有無を明らかにし、1分子解析を通じてそのタイミングを明らかにしようとしている。今年度、蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)を指標にすることで、蛍光分光器を用いてGroELとGroESの結合率の測定に成功し、1)FBは、反応サイクルの約40%で形成されている2)GroELへ2個目のGroESが結合できるのは、GroESが約300nM以上になったときである2)FBの形成率は、ADPにより著しく阻害される3)ATP加水分解が非常に遅い変異GroEL(D398A)はFBを形成する ことを明らかにし、従来の反応サイクルのモデルを大きく訂正する必要性を示した(Sameshima et.al.,投稿中)。さらにFBの形成過程を詳細に理解するため、昨年度開発したナノ開口基板を用いて、500nM蛍光標識GroESと4.5uM無標識GroES存在下でGroELとの結合解離反応を1分子解析した。蛍光分光器の実験結果から、大腸菌内の発現濃度と同じ約5μMのGroES存在下ではFBが形成されることが分かっている。事前の予想とは異なり、GroELとGroESの結合時間は、FBが形成されない20nM GroES存在下での1分子解析の結果と同じであった。そこで、FBが形成される様子を直接可視化するため、500nM Cy3-GroESと500nM Cy5-GroES存在下で、ナノ開口基板上に固定されたGroELへの相互作用を観察した。ほとんどの場合、両側のリングにGroESが交互に結合解離を繰り返していたが、同時にCy3-GroESとCy5-GroESが結合している状態も観察された。現在、その詳細を解析している。

報告書

(2件)
  • 2007 実績報告書
  • 2006 実績報告書
  • 研究成果

    (10件)

すべて 2008 2007

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (8件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Rapid Multi-reagents Exchange TIRFM Microfluidic system for a Single Biomolecular Imaging2007

    • 著者名/発表者名
      Takahiro Arakawa
    • 雑誌名

      Sensor and Actuator B 128

      ページ: 218-225

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 人工ホットスポットを用いたSAM膜のラマン検出2008

    • 著者名/発表者名
      柳沢雅広
    • 学会等名
      第55回応用物理学会
    • 発表場所
      日本大学船橋キャンパス
    • 年月日
      2008-03-29
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] ナノ開口基板を用いたシャペロニンの1分子機能解析2007

    • 著者名/発表者名
      上野太郎
    • 学会等名
      第45回日本生物物理学会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 年月日
      2007-12-23
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 古細菌型シャペロニンの1分子構造変化計測2007

    • 著者名/発表者名
      飯塚怜
    • 学会等名
      第45回日本生物物理学会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 年月日
      2007-12-22
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] GroELのC末端欠損変異はATP加水分解反応を遅くする2007

    • 著者名/発表者名
      鈴木深保子
    • 学会等名
      第45回日本生物物理学会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 年月日
      2007-12-21
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] ADPが対称型1:2GroEL-GroES複合体の形成を阻害する2007

    • 著者名/発表者名
      鮫島知哉
    • 学会等名
      第45回日本生物物理学会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 年月日
      2007-12-21
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 古細菌型シャペロニンの1分子構造変化計測2007

    • 著者名/発表者名
      飯塚怜
    • 学会等名
      第80回日本生化学会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 年月日
      2007-12-13
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] ADPがGroELのtransリングへのATPの結合を阻害することにより2個目のGroESが結合できなくなる2007

    • 著者名/発表者名
      鮫島知哉
    • 学会等名
      第80回日本生化学会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 年月日
      2007-12-13
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] GroELのC末端欠損変異はATP加水分解反応を遅くする2007

    • 著者名/発表者名
      鈴木深保子
    • 学会等名
      第80回日本生化学会
    • 発表場所
      パジフィコ横浜
    • 年月日
      2007-12-13
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [図書] ナノバイオ計測の実際(第12章担当)2007

    • 著者名/発表者名
      上野太郎
    • 総ページ数
      13
    • 出版者
      講談社サイエンティフィク
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書

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公開日: 2006-04-01   更新日: 2018-03-28  

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