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圧力軸実験を主とするアミロイド形成と解離メカニズムの研究

研究課題

研究課題/領域番号 18031040
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 理工系
研究機関近畿大学

研究代表者

赤坂 一之  近畿大学, 生物理工学部, 教授 (50025368)

研究分担者 橘 秀樹  神戸大学, 理学部, 准教授 (70126118)
研究期間 (年度) 2006 – 2007
研究課題ステータス 完了 (2007年度)
配分額 *注記
12,600千円 (直接経費: 12,600千円)
2007年度: 7,400千円 (直接経費: 7,400千円)
2006年度: 5,200千円 (直接経費: 5,200千円)
キーワードニワトリリゾチーム / アミロイド線維 / プロトフィブリル形成 / 熱変性 / シード / 部分モル体積変化 / アミロイド線維の成長機構 / SS結合欠損変異 / アミロイド / プロトフィブリル / 圧力解離 / 活性化体積 / 活性化圧縮率 / 水和
研究概要

野生型ニワトリリゾチーム(SS結合を4つもつ4SS体)及びそのモデル系としてSS結合欠損変異体(0SS,1SS)を対象に、アミロイド線維形成に必須のプロトフィブリル形成・解離の機構をCD,AFM,高圧蛍光、高圧NMRを用いて総合的に研究し、また圧力解離等の基本となる、プロトフィブリル形成に伴う蛋白質の部分モル体積変化を、密度計により直接測定した。これまでの研究で0SS体の自発的プロトフィブリル形成過程が、大きな部分モル体積の増大と大きな圧縮率の増大を伴うことを明らかにしている。この結果は、アミロイド線維を形成するプロトフィブリルが空隙の大きな、揺らぎの大きな構造状態であることを初めて明確に示した。平成19年度ほこれを野生型ニワトリリゾチーム(4SS体)にも拡張した。安定な4SS体おいては線維(β-oligomer)形成は室温付近では起こらないが、低いpHで加熱(57℃)すると、生じた"熱変性"蛋白質が溶液内の種(シード)と反応して、β-oligomerが形成されることを明らかにした(Native lysozyme 〓 Denatured lysozyme)+seed ⇒ β-oligomer)。さらに、生成したプロトフィブリルの線維長がほぼ単一の指数関数分布に従うことから、4SS体においてもプロトフィブリルの成長は、0SS体の場合と同様に、線維の成長端にモノマーが常に一定の親和力で脱着することによって起こると考えられる。結論として、野生型ニワトリリゾチームのアミロイド・プロトフィブリルの成長はおよそ次のような逐次反応スキームに従って起こる。
(Native lysozyme 〓 Denatured lysozyme)+β-oligomer ⇒キキキ⇒ protofibril.

報告書

(2件)
  • 2007 実績報告書
  • 2006 実績報告書
  • 研究成果

    (16件)

すべて 2008 2007 2006

すべて 雑誌論文 (9件) (うち査読あり 6件) 学会発表 (6件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Efficient conversion of intact hen lysozyme into amyloid fibrils by seeding.2008

    • 著者名/発表者名
      Ken Sasaki
    • 雑誌名

      Journal of Biological Macromolecules 8(印刷中)

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 体積および圧縮率から見たアミロイド線維2008

    • 著者名/発表者名
      橘 秀樹
    • 雑誌名

      高圧バイオサイエンスとバイオテクノロジー第15回生物関連高圧研究会20周年記念シンポジウム・プロシーディングス 2(印刷中)

    • NAID

      130004503878

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Basic folded and low-populated locally disordered conformers of SUMO-2characterized by NMR spectroscopy at varying pressures.2008

    • 著者名/発表者名
      Ryo Kitahara
    • 雑誌名

      Biochemistry 47

      ページ: 30-39

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Amyloid protofibril is highly voluminous and compressible.2007

    • 著者名/発表者名
      Kazuyuki Akasaka
    • 雑誌名

      Biochemistry 46

      ページ: 10444-10450

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Species-specific differences in the intermediate states of human and Syrian Hamster prion protein detected by high pressure NMR spectroscopy.2007

    • 著者名/発表者名
      Werner Kremer
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry 282

      ページ: 22689-22698

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Novel aspects of protein conformational fluctuations revealed by variable pressure NMR2007

    • 著者名/発表者名
      Kazuyuki Akasaka
    • 雑誌名

      High Pressure Bioscience and Biotechnology Proceedings of the 4th International Conference on High Pressure Bioscience and Biotechnology 1

      ページ: 8-12

    • NAID

      130004951208

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Pressure dissociation kinetics of amyloid protofibrils.2007

    • 著者名/発表者名
      赤坂一之, 橘 秀樹 (Abdul Raziq Abdul Latif)
    • 雑誌名

      Biophysical Journal 94

      ページ: 323-329

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Probing Conformational Fluctuation of Proteins by Pressure Perturbation.2006

    • 著者名/発表者名
      赤坂一之 (K.Akasaka)
    • 雑誌名

      Chemical Reviews Thematic Issue "Protein Dynamics and Folding" (Guest Editor : A. Joshua Wand) 108

      ページ: 1814-1835

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Conformational fluctuations of proteins revealed by variable pressure NMR.2006

    • 著者名/発表者名
      赤坂一之 (H. Li)
    • 雑誌名

      Biochimica et Biophysica Acta 1764

      ページ: 331-345

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [学会発表] Pressure and the Protein World2008

    • 著者名/発表者名
      Kazuyuki Akasaka
    • 学会等名
      Proteins Under Pressure
    • 発表場所
      Santa Fe, USA
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] アミロイド線維の初期会合過程における体積変化2007

    • 著者名/発表者名
      荒賀 麻里子
    • 学会等名
      近畿大学先端技術総合研究所公開シンポジウム
    • 発表場所
      海南市
    • 年月日
      2007-06-24
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Kinetic and Structural Variance in the Fibrillation among Lysozyme Single-Disulfide Variants2007

    • 著者名/発表者名
      Hideki Tachibana
    • 学会等名
      第45回日本生物物理学会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Peptide regions protected against hydrogen/deuterium-exchange in the fibril of a hen lysozyme disulfide-deficient variant2007

    • 著者名/発表者名
      Hideki Tachibana
    • 学会等名
      第45回日本生物物理学会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Activation volume and activation compressibility for dissociation of young amyloid protofibrils from disulfide-deficient hen lysozyme2007

    • 著者名/発表者名
      Ryohei Kono
    • 学会等名
      第45回日本生物物理学会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] アミロイドの分子間感染2007

    • 著者名/発表者名
      林 逸歩
    • 学会等名
      第45回日本生物物理学会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [図書] Protein Folding Protocols in Methods in Molecular Biology Vol.350 (edited by Yawen Bai and Ruth Nussinov) (Humana Press Inc.)2006

    • 著者名/発表者名
      赤坂一之 (M.Lassalle)
    • 出版者
      The Use of High pressure NMR to Study in Protein Folding
    • 関連する報告書
      2006 実績報告書

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公開日: 2006-04-01   更新日: 2018-03-28  

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