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伝染病から社会を守るための知的な伝染病追跡システム

研究課題

研究課題/領域番号 18049071
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 理工系
研究機関国立情報学研究所

研究代表者

NIGEL Collier  国立情報学研究所, 情報学プリンシプル研究系, 助教授 (60333275)

研究期間 (年度) 2006
研究課題ステータス 完了 (2006年度)
配分額 *注記
6,000千円 (直接経費: 6,000千円)
2006年度: 6,000千円 (直接経費: 6,000千円)
キーワードテキストマイニング / 伝染病追跡
研究概要

初年度は、自然言語処理ツールを基にしたテキストマイニングシステムをバックエンドに持つ、BioCaster Webポータルのプロトタイプを完成した。概要を以下に記す。
1)人手による生物医学用語アノテーションスキーマの開発
疫学者は主に、疾病の発生する環境や、疾病の蔓延、社会の認識、抑制活動に影響する諸要因に関心を持っている。研究の初期段階で、国立感染症研究所の専門家との意見交換により、Web上のニュースからの情報収集におけるいくつかの共通シナリオの存在が明らかになった。薬品、疾病、ウイルス等の概念カテゴリのリストからオントロジーを構築し、これらのカテゴリを基にニュース記事の用語をアノテーションするためのガイドラインを開発した。博士課程の学生を2人雇用し、500のニュース記事をアノテーションした。このコーパスをもとに、SVMを用いて専門用語の認識学習を行い、SVMおよびCRFによる10分割交差検定による実験を行った。
2)英語、日本語、タイ語、ベトナム語による専門用語認識システムの開発
日本語、タイ語、ベトナム語のテキストマイニングモジュールの開発においては、専門用語認識やコーパス構築に焦点をあてた。岡山大学(竹内講師)、カセサート大学(カートラクル教授)、ベトナム国立大学ホーチミン校(ディエン教授)のグループと共同で、ニュース記事の4ヶ国語並列コーパスに対する評価を行った。この研究のためにディエン教授をNIIに招聘し、共同開発を行った。
SVMとCRFでの10分割交差検定の後、言語内および言語間でのタグ付け結果の比較を行った。この結果は主要な生物情報学術誌に投稿中である。
3)記事検索のためのプロトタイプWebポータルの開発
Apache、PHP、MySQLを使用してWebポータルを実装し、国立感染症研究所の疫学の専門家がタグ付け・分類済みのニュース記事にアクセスできるようにした。

報告書

(1件)
  • 2006 実績報告書
  • 研究成果

    (4件)

すべて 2007 2006

すべて 雑誌論文 (4件)

  • [雑誌論文] リスク管理 : ネットから感染症情報収集2007

    • 著者名/発表者名
      Nigel Collier
    • 雑誌名

      日刊工業新聞 (2月8日版)

      ページ: 29-29

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] 感染症発見/監視システムBioCasterにおける専門用語アノテーションスキーマの構築2006

    • 著者名/発表者名
      Kawazoe, A., Jin, L., Shigematsu, M., Barrero, R., Taniguchi, K., Collier, N
    • 雑誌名

      Proc. SIG-SWO-A601-02

    • NAID

      130008089479

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] The development of a schema for the annotation of terms in the BioCaster disease detection/tracking system2006

    • 著者名/発表者名
      Kawazoe, A., Jin, L., Shigematsu, M., Barrero, R., Taniguchi, K., Collier, N.
    • 雑誌名

      Proc. KR-MED

      ページ: 77-85

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Automatic Classification of Verbs in Biomedical Texts2006

    • 著者名/発表者名
      Anna Korhonen, Yuval Krymolowski, Nigel Collier
    • 雑誌名

      Proc. 21st ACL

      ページ: 345-352

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書

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公開日: 2006-04-01   更新日: 2018-03-28  

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