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球状ウイルスにおける粒子の多様性発現機構と粒子形成の階層性の解明

研究課題

研究課題/領域番号 18054016
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関大阪大学

研究代表者

福山 恵一  大阪大学, 大学院・理学研究科, 教授 (80032283)

研究期間 (年度) 2006 – 2007
研究課題ステータス 完了 (2007年度)
配分額 *注記
5,900千円 (直接経費: 5,900千円)
2007年度: 2,900千円 (直接経費: 2,900千円)
2006年度: 3,000千円 (直接経費: 3,000千円)
キーワード球状ウイルス / 粒子形成 / X線結晶構造解析 / γ-グルタミルトランスペプチダーゼ / アシビシン / 酵素阻害 / アザセリン / タバコネクロシスウイルス / γ-グルタミルトランスペプチターゼ / γ-グルタミル酵素中間体 / プロセッシング
研究概要

富栄養域の海水中には高密度でウイルス粒子が浮遊している。その一部は、赤潮原因プランクトンに対して感染性を持ち、赤潮の動態・終息に重要な影響をおよぼしていることが知られている。ここで、ウイルスは感染を成立させる方向に、宿主はウイルス感染から逃れる方向にそれぞれ変異を繰り返す。本研究では、赤潮原因藻ヘテロカプサ・サーキュラリスカーマを宿主とする球状RNAウイルス(HcRNAV)の構造生物学的解析から、この粒子表面の構造と性状を明らかにする。この第一歩として、HcRNAVの幾つかの株のRNAからcDNAを調製した。
Y-グルタミルトランスペプチターゼ(GGT)はバクテリアから哺乳類まで幅広い生物が持つ酵素であり、グルタチオン(GSH)などのY-グルタミル基を他のアミノ酸やペプチドに転移する反応とy-グルタミル基の加水分解反応を触媒する。これまでに大腸菌由来GGTについて、この酵素の立体構造だけでなく、基質認識や触媒機構、プロセッシングによる成熟化機構を明らかにした。本年度は、2種類の阻害剤(アシビシンとアザセリン)の各々によるGGTの阻害機構を解析した。これら2種類の複合体の1.65Å分解能結晶構造から、両阻害剤ともGGTの活性残基Thr391と共有結合し、注目すべきことに四面体中間体で酵素に捉えられていることを明らかにした。さらにアシビシンでは、単にこれが酵素に結合したのではなく、アシビシン内で結合の再配置が起っていた。

報告書

(2件)
  • 2007 実績報告書
  • 2006 実績報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて 2007 2006

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (1件)

  • [雑誌論文] Alternative cyanide-binding modes to the haem iron in haem oxygenase2007

    • 著者名/発表者名
      M., Sugishima
    • 雑誌名

      Acta Crystallographica F63

      ページ: 471-474

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Characterization and Crystallization of an IscU-type Scaffold Protein with Bound [2Fe-2S] Cluster from the Hyperthermophile,Aquifex aeolicus2007

    • 著者名/発表者名
      Y., Shimomura
    • 雑誌名

      Journal of Biochemistry 142

      ページ: 577-586

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal Structure of the γ-Glutamyltranspeptidase Precursor Protein from Escherichia coli2007

    • 著者名/発表者名
      T.Okada, H.Suzuki, K.Wada, H.Kumagai, K.Fukuyama
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry 282・4

      ページ: 2433-2439

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] X-ray Crystallographic and Biochemical Characterization of the Inhibitory Action of an Imidazole-Dioxolane Compound on Heme Oxygenase2007

    • 著者名/発表者名
      M.Sugishima, Y.Higashimoto, T.Oishi, H.Takahashi, H.Sakamoto, M.Noguchi, K.Fukuyama
    • 雑誌名

      Biochemistry 46・7

      ページ: 1860-1867

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Crystal structures of γ-glutamyltranspeptidase from E. coli, a key enzyme in glutathione metabolism, and its reaction intermediate2006

    • 著者名/発表者名
      T.Okada, H.Suzuki, K.Wada, H.Kumagai, K.Fukuyama
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences of USA 103・17

      ページ: 6471-6476

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [学会発表] Crystal Structures of γ-glutamyltranspeptidase in complexes with inhibitors and an analog mimicking the transition state2007

    • 著者名/発表者名
      K., Wada
    • 学会等名
      The 2nd International Symposium on Diffraction Structure Biology 2007
    • 発表場所
      Tower Hall Funabori, Tokyo
    • 年月日
      2007-09-11
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書

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公開日: 2006-04-01   更新日: 2018-03-28  

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