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コラーゲン超分子構造の発現の解明とモデルペプチドを用いた検証

研究課題

研究課題/領域番号 18054017
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関大阪大学

研究代表者

奥山 健二  大阪大学, 大学院・理学研究科, 教授 (30038020)

研究分担者 川口 辰也  大阪大学, 大学院・理学研究科, 助教 (10314353)
本郷 千鶴  大阪大学, 理学研究科, 特任研究員 (10418767)
研究期間 (年度) 2006 – 2007
研究課題ステータス 完了 (2007年度)
配分額 *注記
6,000千円 (直接経費: 6,000千円)
2007年度: 2,900千円 (直接経費: 2,900千円)
2006年度: 3,100千円 (直接経費: 3,100千円)
キーワードコラーゲン / 繊維形成 / 三重らせん構造 / D-スタッガー / ミクロフィブリル / 超分子構造 / 高次構造
研究概要

コラーゲン分子は会合して繊維を形成する際に、隣の分子と分子軸方向に67nm(D-stagger)だけズレて会合する。このズレは、X線小角回折でも30〜40次の子午線反射として観測されるほど厳密なものである。本研究では、このズレの形成機構をコラーゲンのアミノ酸配列と我々が最近明らかにしたコラーゲン分子の平均構造に基づき解明する。本年度の成果は以下の通りである。
1、ヒトのI,II,III型コラーゲンに対して、アミノ酸配列中の荷電アミノ酸残基(Lys,Arg,Glu,Asp)のCβ炭素上に、対応する電荷(+1 or -1)を与え、我々が提案している7/2-helix構造に基づきCβ炭素の3次元座標を求めた。このようにして作ったコラーゲン分子2つを、平行に揃えた状態から5残基ずつ分子軸方向にずらせながら、各配置における分子間静電相互エネルギーを求めた。その結果、ホモトライマー([α1(I)]_3,[α1(II)]_3,[α1(III)]_3)では、1D(235残基=67nm)の時に最も安定であることを、明確に示すことが出来た。
2、コラーゲン分子間相互作用では疎水相互作用も重要である。Leu側鎖間の疎水相互作用を始めてモデルペプチドの高分解解析から明らかにした。また、コラーゲン分子中で出現頻度の高いLeu-Hyp-Gly配列におけるLeu側鎖は、(+)gauche-trans構造しか取り得ず、棒状のコラーゲン分子からLeu側鎖は突き出ており、分子間相互作用に最適であることを示した。

報告書

(2件)
  • 2007 実績報告書
  • 2006 実績報告書
  • 研究成果

    (12件)

すべて 2008 2007 2006

すべて 雑誌論文 (9件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (3件)

  • [雑誌論文] 7/(2)-helical model for collagen-Evidence from native collagen and model peptides-2008

    • 著者名/発表者名
      Okuyama, K.
    • 雑誌名

      Recent Trends in Collagen 2008

      ページ: 10-19

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [雑誌論文] Revisiting the molecular sturcture of collagen2008

    • 著者名/発表者名
      Okuyama, K.
    • 雑誌名

      Connective Tissue Research (in press)

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Unique side chain conformation of a Leu residue in a triple-helical structure2007

    • 著者名/発表者名
      Okuyama, K., et. al.
    • 雑誌名

      Biopolymers 36

      ページ: 212-221

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Conformation of alloHyp in the Y position in the Host-Guest Peptide with the Pro-Pro-Gly sequence2006

    • 著者名/発表者名
      Jiravanichanum, J., et al.
    • 雑誌名

      Biopolymers 81

      ページ: 225-233

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Threonine in collagen triple-helical structure2006

    • 著者名/発表者名
      Jiravanichanum, J., et al.
    • 雑誌名

      Polymer J. 38

      ページ: 400-403

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Revision of collagen molecular structure2006

    • 著者名/発表者名
      Okuyama, K., et al.
    • 雑誌名

      Biopolymers 84

      ページ: 181-191

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Helical twist of collagen model peptides2006

    • 著者名/発表者名
      Okuyama, K., et al.
    • 雑誌名

      Biopolymers 84

      ページ: 421-432

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] モデルペプチドの高分解能解析から分かった天然コラーゲンの分子構造2006

    • 著者名/発表者名
      奥山健二
    • 雑誌名

      生産と技術 58

      ページ: 51-53

    • NAID

      40007406842

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] コラーゲンの分子構造 -まだ、教科書のRich & Crick構造を信じますか-2006

    • 著者名/発表者名
      奥山健二
    • 雑誌名

      現代化学 8月号

      ページ: 25-30

    • NAID

      40007327489

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [学会発表] Understanding of D-stagger in collagen fibers2007

    • 著者名/発表者名
      Okuyama, K.
    • 学会等名
      7th Pan Connective Tissue Societies Symposium
    • 発表場所
      Shangri-La Resort, Cairns, Australia
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Understanding of D-stagger in collagen fibers based on the 7/2-helical structure and amino acid sequence2007

    • 著者名/発表者名
      Okuyama, K.
    • 学会等名
      The 8th Conference of the Asian Crystallographic Association
    • 発表場所
      Taipei, Taiwan
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] アテロコラーゲンの小角X線回折2007

    • 著者名/発表者名
      金 海哲、奥山健二
    • 学会等名
      日本結晶学会年会
    • 発表場所
      東京工業大学、東京
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書

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公開日: 2006-04-01   更新日: 2018-03-28  

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