• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

RNAi依存的ヘテロクロマチン形成に重要なnon-coding RNA転写反応

研究課題

研究課題/領域番号 18055019
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関京都大学

研究代表者

村上 洋太  京都大学, ウイルス研究所, 准教授 (20260622)

研究期間 (年度) 2006 – 2007
研究課題ステータス 完了 (2007年度)
配分額 *注記
7,800千円 (直接経費: 7,800千円)
2007年度: 3,600千円 (直接経費: 3,600千円)
2006年度: 4,200千円 (直接経費: 4,200千円)
キーワードヘテロクロマチン / RNAi / non-coding RNA / siRNA / 分裂酵母 / サイレンシンク / RNAポリメラーゼII / 転写
研究概要

分裂酵母のRNAi依存的ヘテロクロマチン形成において、RNAi経路が働く契機となるnon-coding RNAの転写はRNAポリメラーゼIIが行っている。さらにRNAポリメラーゼIIの2番目のサブユニットの変異rpb2-m203により、ncRNAの転写は起こるがその後のsiRNA合成がおきなることから、RNAポリメラーゼIIがRNAiによるncRNAからのsiRNA合成のステップに機能することがわかっていた。siRNA合成のどのステップでRNAポリメラーゼIIが機能するかをrpb2-m203変異株を用いて分子遺伝学的に解析したところ、ncRNAにArgonauteホモログを含むRITS複合体が結合するステップがこの変位により阻害されることがわかった。このことからRNAポリメラーゼIIが転写と共役してRITS複合体をncRNAに結合させていると考えられた。
一方、このncRNAは転写後細胞質に輸送されず、クロマチン領域にとどまってRNAi関連因子群のプラットフォームとして機能することが予想されていたが、その証拠はなかった。ヒストンを標的とするRNA-クロマチン免疫沈降法を使い、実際ncRNAが転写後ヘテロクロマチンに結合していることを示した。この結合活性はヘテロクロマチンに依存せず、ヘテロクロマチン由来のncRNAが本来持つ性質であることが明らかになった。さらにこの結合がncRNAとDNAとのハイブリッド形成によることを示唆する、意外な結果を得ている。

報告書

(2件)
  • 2007 実績報告書
  • 2006 実績報告書
  • 研究成果

    (7件)

すべて 2008 2007 2006

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (1件)

  • [雑誌論文] Schizosaccharomyces pombe Orc5 plays multiple roles in the maintenance of genome stability throughout the cell2008

    • 著者名/発表者名
      Kato H., et. al.
    • 雑誌名

      Cell Cycle (In press)

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Faster and easier chromatin immunoprecipitation assay with high sensitivity.2007

    • 著者名/発表者名
      Kohzaki et al.
    • 雑誌名

      Proteomics 4

      ページ: 10-14

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Transscription factor, Runxl recruits the polyomavirus replication origin to replication factories.2007

    • 著者名/発表者名
      Murakami et al.
    • 雑誌名

      J.Cell.Biochem 100

      ページ: 1313-1323

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] The novel gene mus7+ is involved in the repair of replication-associated DNA damage in fission yeast2007

    • 著者名/発表者名
      Yokoyama et al.
    • 雑誌名

      DNA repair (in press)

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Runx3 expression during mouse tongue and palate development.2006

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto et al.
    • 雑誌名

      Discov Mol Cell Evol Biol. 1

      ページ: 695-699

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] The Cenp-B homolog, Abpl, interacts with the initiation protein Cdc23 and is required for efficient DNA replication in fission yeast.2006

    • 著者名/発表者名
      Locovei, A. et al.
    • 雑誌名

      Cell Division 1

      ページ: 27-27

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [学会発表] Heterochromatin formation that depends on RNAi and non-coding RNA"2007

    • 著者名/発表者名
      村上洋太
    • 学会等名
      Forth International fission yeast meeting
    • 発表場所
      Copenhagen, Denmark
    • 年月日
      2007-06-17
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書

URL: 

公開日: 2006-04-01   更新日: 2018-03-28  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi