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植物栄養ゲノミクス研究のための転写制御因子の高速探索

研究課題

研究課題/領域番号 18056019
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関独立行政法人理化学研究所

研究代表者

高橋 秀樹  理化学研究所, 基礎代謝研究チーム, チームリーダー (00333302)

研究分担者 鈴木 昭徳  独立行政法人理化学研究所, 基礎代謝研究チーム, リサーチアソシエイト (20415194)
丸山 明子  独立行政法人理化学研究所, 基礎代謝研究チーム, 研究員 (70342855)
研究期間 (年度) 2006 – 2007
研究課題ステータス 完了 (2007年度)
配分額 *注記
4,600千円 (直接経費: 4,600千円)
2007年度: 2,300千円 (直接経費: 2,300千円)
2006年度: 2,300千円 (直接経費: 2,300千円)
キーワード植物 / ゲノム / 環境応答 / 代謝調節 / 転写制御
研究概要

シロイヌナズナのゲノム上には約2000個の転写制御因子が存在する。これらのうち、K,N,P,Sなどの栄養分の吸収を調節する転写制御因子として機能が明らかにされているものはごく一部である。本年度は、窒素栄養および硫黄栄養の吸収過程の制御を中心に研究を進め、特に、窒素栄養応答で重要な役割を果たす新規転写制御因子AGL21について以下に記載する成果を得た。
昨年度、転写制御因子のコード領域または上流・100bpにトランスポゾンの挿入を有する303系統の遺伝子破壊株を用いて、硝酸イオントランスポーターNRT2.1のmRNA発現量が野生株と比較して変化する系統を複数系統単離した。その中で、AGL21遺伝子破壊株(agl21-1)は、低C/N条件でNRT2.1のmRNA発現量が野生株より顕著に増加する破壊株として単離された系統である。AGL21は、硝酸イオンの刺激に応答して側根の伸長を促進するANR1と相同性が高いMADS box型の転写制御因子であった。培地のC/N条件を変化させてagl21-1の表現型を観察した結果、AGL21が低N条件で主根の成長に必須の因子であることが明らかとなった。さらに、硝酸イオンセンサーとしての機能をもつと推定される硝酸イオントランスポーターNRT1.1の遺伝子破壊株(nrt1.1)は、低N条件でagl21-1と同一の表現型を示すことを見出した。この表現型は、高C/N条件で強まる傾向がみられた。野生型(Nossen)、agl21-1、nrt1.1を用いてマイクロアレイ解析を行った結果、agl21-1とnrt1.1において、窒素欠乏に応答する遺伝子群の発現プロファイルに強い相関が認められた。また、AGL21とNRT1.1は互いを制御する関係にはなく、何れかの欠損により、低N条件で主根の成長が抑制されることが明らかとなった。

報告書

(2件)
  • 2007 実績報告書
  • 2006 実績報告書
  • 研究成果

    (22件)

すべて 2008 2007 2006

すべて 雑誌論文 (8件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (14件)

  • [雑誌論文] Molecular biology and functional genomics for identification of regulatory networks of plant sulfate uptake and assimilatory metabolism.2008

    • 著者名/発表者名
      Takahashi, H. and Saito, K.
    • 雑誌名

      Advances in Photosynthesis and Respiration-Sulfur Metabolism in Phototrophic Organisms (Dahl, C., Hell, R., Knaff, D., Leustek, T., eds., Springer)

      ページ: 153-163

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [雑誌論文] 植物のアンモニア態窒素吸収機構の機能分担を解明2008

    • 著者名/発表者名
      小島創一、高橋秀樹
    • 雑誌名

      ブレインテクノニュース 126(印刷中)

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [雑誌論文] The organization of high-affinity ammonium uptake in Arabidopsis rootsdepends on the spatial arrangement and biochemical properties of AMT1-type transporters.2007

    • 著者名/発表者名
      Yuan, L., et. al.
    • 雑誌名

      Plant Cell 19

      ページ: 2636-2652

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Post-transcriptional regulation of high-affinity sulfate transporters in Arabidopsis by sulfur nutrition.2007

    • 著者名/発表者名
      Yoshimoto, N., et. al.
    • 雑誌名

      Plant Physiology 145

      ページ: 378-388

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Arabidopsis SLIM1 is a central transcriptional regulator of plant sulfur response and metabolism.2006

    • 著者名/発表者名
      Maruyama-Nakashita et al.
    • 雑誌名

      Plant Cell 18

      ページ: 3235-3251

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Additive contribution of AMT1;1 and AMT1;3 to ammonium uptake across the plasma membrane of nitrogen-deficient Arabidopsis roots.2006

    • 著者名/発表者名
      Loque et al.
    • 雑誌名

      Plant Journal 48

      ページ: 522-534

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] 硫黄代謝制御因子SLIM1の発見2006

    • 著者名/発表者名
      高橋秀樹, 丸山(仲下)明子
    • 雑誌名

      バイオサイエンスとインダストリー 64

      ページ: 692-694

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] 植物の硫酸イオントランスポーターとその制御2006

    • 著者名/発表者名
      丸山(仲下)明子, 高橋秀樹
    • 雑誌名

      植物の生長調節 41(1)

      ページ: 46-55

    • NAID

      110004749495

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [学会発表] 植物における窒素栄養および硫黄栄養の吸収と制御2008

    • 著者名/発表者名
      高橋秀樹
    • 学会等名
      東京工業大学大学院生命理工学研究科シンポジウム「次世代の植物研究に向けて」
    • 発表場所
      東京工業大学大学すずかけ台キヤンパス(横浜)
    • 年月日
      2008-02-02
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 硫酸イオントランスポーターSULTR1;2の硫黄栄養応答シス配列2007

    • 著者名/発表者名
      丸山明子, 他
    • 学会等名
      日本土壌肥料学会2007年度関東支部大会
    • 発表場所
      日本大学生物資源科学部(藤沢)
    • 年月日
      2007-11-24
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 植物におけるアンモニウム輸送と代謝の分子メカニズム2007

    • 著者名/発表者名
      高橋秀樹
    • 学会等名
      地球温暖化軽減と作物の窒素利用効率向上に向けた作物の生物的硝化抑制作用(BNI)の遺伝育種的利用に関する研究会
    • 発表場所
      横浜市立大学木原生物学研究所(横浜)
    • 年月日
      2007-09-19
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Transcriptional regulation of plant sulfur metabolism: approaches from genetics and functional genomics2007

    • 著者名/発表者名
      Takahashi, H.
    • 学会等名
      BIOTEC-RIKEN Research Forum
    • 発表場所
      タイ バンコク
    • 年月日
      2007-05-23
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Identification of transcription factors regulating sulfate uptake in Arabidopsis2007

    • 著者名/発表者名
      Takahashi, H.
    • 学会等名
      14th international Workshop Plant Membrane Biology
    • 発表場所
      スペイン バレンシア
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Unravelling mechanisms underlying the ammonium-responsive expression of glutamine synthetase 1;2 (GLN1;2) in Arabidopsis roots2007

    • 著者名/発表者名
      Takahashi, H.
    • 学会等名
      Nitrogen2007
    • 発表場所
      イギリス ランカスター
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Transcriptional and post-transcriptional regulation of sulfate uptake in Arabidopsis2007

    • 著者名/発表者名
      Takahashi, H.
    • 学会等名
      2007 Sulphyton Workshop
    • 発表場所
      ドイツ ポツダム
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] An RT-PCR-based knockout screening system for rapid identification of transcription facrors controlling nutrient uptake in Arabidopsis2007

    • 著者名/発表者名
      Suzuki, A., et. al.
    • 学会等名
      18th International Conference on Arabidopsis Research
    • 発表場所
      中国 北京
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] The organization of high-affinity ammonium uptake in Arabidopsis rootsrelies on the isoform-specific localization and biochemical properties of AMT1-type transporters2007

    • 著者名/発表者名
      Yuan, L., et. al.
    • 学会等名
      14th international Workshop Plant Membrane Biology
    • 発表場所
      スペイン バレンシア
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Identification of transcriptional regulators of nitrate uptake system by RT-PCR-based screening of a transcription factor mutant collection in Arabidopsis2007

    • 著者名/発表者名
      Suzuki, A., et. al.
    • 学会等名
      Nitrogen2007
    • 発表場所
      イギリス ランカスター
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 硫酸イオントランスポーターSULTR1;1およびSULTR1;2のタンパク質蓄積量の抑制2007

    • 著者名/発表者名
      吉本尚子 他
    • 学会等名
      第25回日本植物細胞分子生物学会大会・シンポジウム
    • 発表場所
      千葉大学
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 硫酸イオントランスポーターのプロモーターを利用した環境中のクロム酸・セレン酸の検出と測定2007

    • 著者名/発表者名
      丸山明子 他
    • 学会等名
      第25回日本植物細胞分子生物学会大会・シンポジウム
    • 発表場所
      千葉大学
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 高等植物における高親和型尿素トランスポーターの生理機能2007

    • 著者名/発表者名
      小島創一 他
    • 学会等名
      第2回トランスポーター研究会
    • 発表場所
      昭和大学(東京)
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 硫酸イオントランスポーターの硫黄栄養応答を制御するシス因子の解析2007

    • 著者名/発表者名
      丸山明子, 他
    • 学会等名
      第2回トランスポーター研究会
    • 発表場所
      昭和大学(東京)
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書

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公開日: 2006-04-01   更新日: 2018-03-28  

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