• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

溶液内反応のQM/MM-MCおよびMDシミュレーション

研究課題

研究課題/領域番号 18066012
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 理工系
研究機関広島大学

研究代表者

相田 美砂子  広島大学, 大学院・理学研究科, 教授 (90175159)

研究分担者 松原 世明  広島大学, 大学院・理学研究科, 特任准教授 (60239069)
研究期間 (年度) 2006 – 2009
研究課題ステータス 完了 (2009年度)
配分額 *注記
18,500千円 (直接経費: 18,500千円)
2009年度: 3,400千円 (直接経費: 3,400千円)
2008年度: 5,700千円 (直接経費: 5,700千円)
2007年度: 5,700千円 (直接経費: 5,700千円)
2006年度: 3,700千円 (直接経費: 3,700千円)
キーワードab initio MO / MD / MC / シミュレーション / QM / MM / ONIOM / 溶媒効果 / 分子軌道法 / 分子動力学法 / モンテカルロ法 / 生体高分子 / 水クラスター
研究概要

化学反応の進行には、溶媒分子が直接かかわり重要な役割を果たすことが多い。多くの有機化学反応や生体内反応は溶媒や環境を形成する分子とともに進行する。そこで、本研究では、反応している溶質分子だけでなく、その回りに存在する多数の分子にも注目したシミュレーション手法を発展させた。MO法とMC法を組み合わせ、平衡構造に相当する構造だけでなく、ある温度で溶媒分子がとりうる構造を考慮に入れることにより、反応の進行に伴う溶媒効果の自由エネルギー変化を求めた。MO法とMD法を組み合わせることにより、溶液中や蛋白質中における反応の、時間変化や環境からのゆらぎを考慮に入れることのできる手法を発展させた。

報告書

(6件)
  • 2009 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2008 実績報告書   自己評価報告書 ( PDF )
  • 2007 実績報告書
  • 2006 実績報告書
  • 研究成果

    (106件)

すべて 2010 2009 2008 2007 2006 その他

すべて 雑誌論文 (42件) (うち査読あり 33件) 学会発表 (57件) 図書 (2件) 備考 (5件)

  • [雑誌論文] Structures of Molecules in Ground and Excited Vibrational States from Quasiclassical Direct ab Initio Molecular Dynamics2010

    • 著者名/発表者名
      T. Yamada, M. Aida
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. A (in press)

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Dynamical Behavior of the H2 Molecule of the PtH(H2)[P(t-Bu)3]2+ Complex. A Theory of Chemical Reactivity2009

    • 著者名/発表者名
      T. Matsubara
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. A 113

      ページ: 3227-3236

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] ONIOM Study on the Mechanism of the Enzymatic Hydrolysis of Biodegradable Plastics2009

    • 著者名/発表者名
      Y. Sakae, T. Matsubara, M. Aida, H. Kondo, K. Masaki, H. Iefuji
    • 雑誌名

      Bull. Chem. Soc. Jpn 82

      ページ: 338-346

    • NAID

      10025116578

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Classification of OH Bonds and Infrared Spectra of the Topology-Distinct Protonated Water Clusters H3_O^+(H_2O)_ (n ≤ 7)2009

    • 著者名/発表者名
      M. Jieli, M. Aida
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. A 113

      ページ: 1586-1594

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Chiral Sum Frequency Spectroscopy of Thin Films of Porphyrin J-Aggregates2009

    • 著者名/発表者名
      Tetsuhiko Nagahara, Kenji Kisoda, Hiroshi Harima, Misako Aida, Taka-aki Ishibashi
    • 雑誌名

      The Journal of Physical Chemistry B 113

      ページ: 5098-5103

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Dynamical Behavior of the H2 Molecule of the PtH(H2)[P(t-Bu)3]2+ Complex. A Theory of Chemical Reactivity2009

    • 著者名/発表者名
      Toshiaki Matsubara
    • 雑誌名

      The Journal of Physical Chemistry A 113

      ページ: 3227-3236

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Classification of OH Bonds and Infrared Spectra of the Topology-Distinct Protonated Wate Clusters H_3O^+(H_2O)_n-1 (n_^<7)2009

    • 著者名/発表者名
      Maihemutijiang Jieli, Misako Aida
    • 雑誌名

      The Journal of Physical Chemistry A 113

      ページ: 1586-1594

    • 関連する報告書
      2008 自己評価報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Classification of OH Bonds and Infrared Spectra of the Topology-Distinct Protonated Water Clusters H3O + (H20) n-1 (n≦7)2009

    • 著者名/発表者名
      Maihemutijiang Jieli
    • 雑誌名

      The Journal of Physical Chemistry A 113

      ページ: 1586-1594

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] ONIOM Study on the Mechanism of the Enzymatic Hydrolysis of Biodegradable Plastics2009

    • 著者名/発表者名
      Y. Sakae
    • 雑誌名

      Bulletin of the Chemical Society of Japan 82

      ページ: 338-346

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A Theoretical Insight into the Interaction of Fatty Acids Involved in Royal Jelly with the Human Estrogen Receptorβ2008

    • 著者名/発表者名
      T. Matsubara, H. Sugimoto, M. Aida
    • 雑誌名

      Bull. Chem. Soc. Jpn 81

      ページ: 1258-1266

    • NAID

      10024330884

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] An Insight into the Environmental Effects of the Pocket of the Active Site of the Enzyme. Ab initio ONIOM-Molecular Dynamics (MD) Study on Cytosine Deaminase2008

    • 著者名/発表者名
      T. Matsubara, M. Dupuis, M. Aida
    • 雑誌名

      J. Comput. Chem 29

      ページ: 458-465

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Thermally induced double proton transfer in GG and wobble GT base pairs: A possible origin of the mutagenic guanine2008

    • 著者名/発表者名
      A. Padermshoke, Y. Katsumoto, R. Masaki, M. Aida
    • 雑誌名

      Chem. Phys. Lett 457

      ページ: 232-236

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Fundamental absorption frequencies and mean structures at vibrational ground state from quasi-classical direct ab initio MD: Triatomic molecule2008

    • 著者名/発表者名
      T. Yamada, M. Aida
    • 雑誌名

      Chem. Phys. Lett 452

      ページ: 315-320

    • NAID

      120000876697

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Two-dimensional free-energy surface on the exchange reaction of alkyl chloride/chloride using the QM/MM-MC method2008

    • 著者名/発表者名
      M. Ohisa, H. Yamataka, M. Dupuis, M. Aida
    • 雑誌名

      Phys. Chem. Chem. Phys 10

      ページ: 844-849

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] An Insight into the Environmental Effects of the Pocket of the Active Site of the Enzyme. Ab initio ONIOM-Molecular Dynamics (MD) Study on Cytosine Deaminase2008

    • 著者名/発表者名
      Toshiaki Matsubara, Michel Dupuis, and Misako Aida
    • 雑誌名

      Journal of Computational Chemistry 29

      ページ: 458-465

    • 関連する報告書
      2008 自己評価報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Two-dimensional free-energy surface on the exchange reaction of alkyl chloride/chloride using the QM/MM-MC method2008

    • 著者名/発表者名
      Masayuki Ohisa, Hiroshi Yamataka, Michel Dupuis and Misako Aida
    • 雑誌名

      Physical Chemistry Chemical Physics 10

      ページ: 844-849

    • 関連する報告書
      2008 自己評価報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Thermally induced double proton transfer in GG and wobble GT base pairs : A possible origin of the mutagenic guanine2008

    • 著者名/発表者名
      Adchara Padermshoke
    • 雑誌名

      Chemical Physics Letters 457

      ページ: 232-236

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] An Insight into the Environmental Effects of the Pocket of the Active Site of the Enzyme. Ab initio ONIOM-Molecular Dynamics (MD) Study on Cytosine Deaminase2008

    • 著者名/発表者名
      Toshiaki Matsubara
    • 雑誌名

      Journal of the Computational Chemistry 29

      ページ: 458-465

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A Theoretical Insight into the Interaction of Fatty Acids Involved in Royal Jelly with the Human Estrogen Receptor β2008

    • 著者名/発表者名
      Toshiaki Matsubara
    • 雑誌名

      Bulletin of the Chemical Society of Japan 81

      ページ: 1258-1266

    • NAID

      10024330884

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Two-dimensional free-energy sufface on the exchange reaction of alkyl chloride/chloride using the QM/MM-MC method2008

    • 著者名/発表者名
      Masayuki Ohisa
    • 雑誌名

      Phisical Chemistry Chemical Phisics 10

      ページ: 844-849

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Fundamental absorption frequencies and mean structures at vibrational ground state from quasi-classical direct ab initio MD: Triatomic molecule2008

    • 著者名/発表者名
      Tomonori Yamada
    • 雑誌名

      Chemical Physics Letters 452

      ページ: 315-320

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Enumeration of Topology-Distinct Structures and Possible Stable Structures of Protonated Water Clusters, H_3O^+(H_2O)_(n≤5)2007

    • 著者名/発表者名
      M. Jieli, T. Miyake, M. Aida
    • 雑誌名

      Bull. Chem. Soc. Jpn 80

      ページ: 2131-2136

    • NAID

      10019795012

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Ab initio ONIOM-Molecular dynamics (MD) study on the deamination reaction by cytidine deaminase2007

    • 著者名/発表者名
      T. Matsubara, M. Dupuis, M. Aida
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. B 111

      ページ: 9965-9974

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The ONIOM molecular dynamics method for biochemical applications: cytidine deaminase2007

    • 著者名/発表者名
      T. Matsubara, M. Dupuis, M. Aida
    • 雑誌名

      Chem. Phys. Lett 437

      ページ: 138-142

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Photochemistry of 2-(methylamino)pyridine in a low-temperature argon matrix: Amino-imino tautomerism and rotational isomerism2007

    • 著者名/発表者名
      N. Akai, K. Ohno, M. Aida
    • 雑誌名

      J. Photochem. Photobiol. A: Chemistry 187

      ページ: 113-118

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Kinetic Investigations of the Process of Encapsulation of Small Hydrocarbons into a Cavitand-Porphyrin2007

    • 著者名/発表者名
      J. Nakazawa, Y. Sake, M. Aida, Y Naruta
    • 雑誌名

      J. Org. Chem 72

      ページ: 9448-9455

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] BSSE-corrected Three-body Interaction Energy in the Recognition of GC Base Pair by Asparagine2007

    • 著者名/発表者名
      T. Yoshida, M. Aida
    • 雑誌名

      Chem. Lett 36

      ページ: 124-125

    • NAID

      10018663548

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Ab initio ONIOM-Molecular dynamics (MD) study on the deamination reaction by cytidine deaminase2007

    • 著者名/発表者名
      Toshiaki Matsubara, Michel Dupuis and Misako Aida
    • 雑誌名

      Journal of Physical Chemistry B 111

      ページ: 9965-9974

    • 関連する報告書
      2008 自己評価報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Ab initio ONIOM-Molecular dynamics(MD)Study on the deamination reactionby cytidine deaminase2007

    • 著者名/発表者名
      Toshiaki. Matsubara
    • 雑誌名

      Journal of Physical ChemistryB 111

      ページ: 9965-9974

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Enumeration of Topology-Distinct Structures and Possible Stable Structures of Protonated Water Clusters, H_3O^+(H_O)_<n-1> (n≦5)2007

    • 著者名/発表者名
      Maihemutij iang Jieli
    • 雑誌名

      Bulletin of the Chemical Society of Japan 80

      ページ: 2131-2136

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Photochemistry of 2-(methylamino)pyridine in a low-temperature argon matrix : Amino-imino tautomerism and rotational isomerism2007

    • 著者名/発表者名
      N.Akai
    • 雑誌名

      J. Photochem. Photobiol. A 187・1

      ページ: 113-118

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] BSSE-corrected Three-body Interaction Energy in the Recognition of GC Base Pair by Asparagine2007

    • 著者名/発表者名
      T.Yoshida
    • 雑誌名

      Chemistry Letters 36・1

      ページ: 124-125

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Dimerization and Double Proton Transfer-Induced Tautomerism of 4(3H)-Pyrimidinone in Solution Studied by IR Spectroscopy and Quantum Chemical Calculations2006

    • 著者名/発表者名
      A. Padermshoke, Y. Katsumoto an M. Aida
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. B 110

      ページ: 26388-26395

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Population of 6-Enol Form is Higher in 8-Oxoguanine than in Guanine2006

    • 著者名/発表者名
      T. Yoshida, M. Aida
    • 雑誌名

      Chem. Lett 35

      ページ: 924-925

    • NAID

      10018187900

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] H-bond patterns and structure distributions of water octamer (H2O)8 at finite temperatures2006

    • 著者名/発表者名
      Miyake, M. Aida
    • 雑誌名

      Chem. Phys. Lett 427

      ページ: 215-220

    • NAID

      120000878067

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Photoinduced amino-imino tautomerism : An infrared study of 2-amino-5-methylpyridine in a low-temperature argon matrix2006

    • 著者名/発表者名
      N.Akai
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. A 110

      ページ: 6016-6022

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Dimerization and Double Proton Transfer-Induced Tautomerism of 4(3H)-Pyrimidinone in Solution Studied by IR Spectroscopy and Quantum Chemical Calculations2006

    • 著者名/発表者名
      A.Padermshoke
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. B 110

      ページ: 26388-26395

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] A Quantum Chemical Study of the Catalysis for Cytidine Deaminase : Contribution of the Extra Water Molecule2006

    • 著者名/発表者名
      T.Matsubara
    • 雑誌名

      Journal of Chemical Information and Modeling 46・3

      ページ: 1276-1285

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] H-bond patterns and structure distributions of water octamer (H_2O)_8 at finite temperatures2006

    • 著者名/発表者名
      T.Miyake
    • 雑誌名

      Chemical Physics Letters 427

      ページ: 215-220

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Population of 6-Enol Form is Higher in 8-Oxoguanine than in Guanine2006

    • 著者名/発表者名
      T.Yoshida
    • 雑誌名

      Chemistry Letters 35・8

      ページ: 924-925

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Ruthenium-Catalyzed Addition of Alkynes to Alkynylstannanes with Migration of the Stannyl Group2006

    • 著者名/発表者名
      E.Shirakawa
    • 雑誌名

      Bull. Chem. Soc. Jpn. 79

      ページ: 1963-1976

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] The ONIOM molecular dynamics method for biochemical applications : cytidine deaminase2006

    • 著者名/発表者名
      T.Matsubara
    • 雑誌名

      Chemical Physics Letter 437・1-3

      ページ: 138-142

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [学会発表] 双極子-双極子相互作用に基づく粗視化によるタンパク質のMDシミュレーション2010

    • 著者名/発表者名
      三枝俊亮, 相田美砂子
    • 学会等名
      日本化学会第90春季年会
    • 発表場所
      近畿大学、大阪
    • 年月日
      2010-03-27
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] アミノ酸の水和自由エレルギーについての理論化学的研究2010

    • 著者名/発表者名
      相田美砂子
    • 学会等名
      日本化学会第90春季年会
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      2010-03-26
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] アミノ酸の水和自由エネルギーについての理論化学的研究2010

    • 著者名/発表者名
      宮本秀範, 相田美砂子
    • 学会等名
      日本化学会第90春季年会
    • 発表場所
      近畿大学、大阪
    • 年月日
      2010-03-26
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] H-bond pattern of water octamer at finite temperature2009

    • 著者名/発表者名
      M. Aida
    • 学会等名
      The 6th Nano Bio Info Chemistry Symposium
    • 発表場所
      Higashi-Hiroshima, Japan
    • 年月日
      2009-12-13
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Fundamental frequency from quasi-classical direct ab initio MD : (H_2O)_2 and(H_2O)_2H^+2009

    • 著者名/発表者名
      Tomonori Yamada, Misako Aida
    • 学会等名
      The 6^<th> Nano Bio Info Chemistry Simposium
    • 発表場所
      Hiroshima University, Higashi-Hiroshima, Japan
    • 年月日
      2009-12-12
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] H-bond pattern of water octamer at finite temperature2009

    • 著者名/発表者名
      Dai Akase, Misako Aida
    • 学会等名
      The 6^<th> Nano Bio Info Chemistry Simposium
    • 発表場所
      Hiroshima University, Higashi-Hiroshima, Japan
    • 年月日
      2009-12-12
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Solvation Free Energy Change of Glycine in Aqueous Solution2009

    • 著者名/発表者名
      Hidenori Miyamoto, Misako Aida
    • 学会等名
      The 6^<th> Nano Bio Info Chemistry Simposium
    • 発表場所
      Hiroshima University, Higashi-Hiroshima, Japan
    • 年月日
      2009-12-12
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Study of coarse graining for prediction of interaction between protein and DNA2009

    • 著者名/発表者名
      Shunsuke Mieda, Misako Aida
    • 学会等名
      日本生物物理学会第47回年会
    • 発表場所
      徳島県徳島市
    • 年月日
      2009-11-01
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] QM/MM-MC法によるアミノ酸-水相互作用構造2009

    • 著者名/発表者名
      宮本秀範, 相田美砂子
    • 学会等名
      第32回情報化学討論会
    • 発表場所
      常盤工業会会館(山口県)
    • 年月日
      2009-10-29
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 水クラスターの水素結合パターンと双極子モーメント2009

    • 著者名/発表者名
      赤瀬大, 相田美砂子
    • 学会等名
      第32回情報化学討論会
    • 発表場所
      常盤工業会会館(山口県)
    • 年月日
      2009-10-29
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Observable structures of ground and excited vibrational states from quasi-classical direct ab initio MD : di-and tri-atomic molecules2009

    • 著者名/発表者名
      Tomonori Yamada, Misako Aida
    • 学会等名
      13^<th> International Congress of Quantum Chemistry
    • 発表場所
      University of Helsinki, Helsinki, Finland
    • 年月日
      2009-07-25
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Application of the ONIOM-molecular dynamics method to the chemical reactions. A new theory of chemical reactivity2009

    • 著者名/発表者名
      T. Matsubara
    • 学会等名
      International Symposium on Theory of Molecular Structure, Function and Reactivity、Celebrating Prof. Morokuma's 75th Birthday
    • 発表場所
      Kyoto, Japan
    • 年月日
      2009-07-20
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Study of amino acid models for coarse graining of protein2009

    • 著者名/発表者名
      M. Aida
    • 学会等名
      International Symposium on Theory of Molecular Structure, Function and Reactivity
    • 発表場所
      Kyoto, Japan
    • 年月日
      2009-07-20
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書 2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Application of the ONIOM-molecular dynamics method to the chemical reactions. A new theory of chemical reactivity2009

    • 著者名/発表者名
      Toshiaki Matsubara
    • 学会等名
      International Symposium on Theory of Molecular Structure, Function and Reactivity
    • 発表場所
      Kyoto, Japan
    • 年月日
      2009-07-20
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Observable structure of ground and excited vibrational states from quasi-classical direct ab initio MD: di- and tri-atomic molecules2009

    • 著者名/発表者名
      M. Aida
    • 学会等名
      13th International Congress of Quantum Chemistry
    • 発表場所
      Helsinki, Finland
    • 年月日
      2009-06-25
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Theoretical study on a water distribution along DNA groove2009

    • 著者名/発表者名
      Tomoki Yoshida, Misako Aida
    • 学会等名
      13^<th> International Congress of Quantum Chemistry
    • 発表場所
      University of Helsinki, Helsinki, Finland
    • 年月日
      2009-06-24
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Hydration free engery change and IR spectrum of glycine in aqueous solution2009

    • 著者名/発表者名
      M. Aida
    • 学会等名
      13th International Congress of Quantum Chemistry
    • 発表場所
      Helsinki, Finland
    • 年月日
      2009-06-23
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Hydration free energy change and IR spectrum of glycine in aqueous solution2009

    • 著者名/発表者名
      Hidenori Miyamoto, Misako Aida
    • 学会等名
      13^<th> International Congress of Quantum Chemistry
    • 発表場所
      University of Helsinki, Helsinki, Finland
    • 年月日
      2009-06-23
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] H-bond pattern di water cluster (H2O)n, n≦8 in finite temperature2009

    • 著者名/発表者名
      M. Aida
    • 学会等名
      International Symposium on "Reaction Dynamics of Many-Body Chemical Systems"
    • 発表場所
      Kyoto, Japan
    • 年月日
      2009-06-22
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] H-bond pattern distribution of water cluster(H20)n, n≦8 in finite temperature2009

    • 著者名/発表者名
      Dai Akase, Misako Aida
    • 学会等名
      International Symposium on "Reaction Dynamics of Many-Body Chemical Systems"
    • 発表場所
      Kyoto, Japan
    • 年月日
      2009-06-22
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 水溶液中におけるアミノ酸の分子内水素原子移動についての理論化学的研究2009

    • 著者名/発表者名
      宮本秀範
    • 学会等名
      日本化学会第89春季年会
    • 発表場所
      日本大学理工学部(船橋キャンパス)
    • 年月日
      2009-03-30
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] タンパク質の双極子モーメントによる粗視化2009

    • 著者名/発表者名
      三枝俊亮
    • 学会等名
      日本化学会第89春季年会
    • 発表場所
      日本大学理工学部(船橋キャンパス)
    • 年月日
      2009-03-30
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Enumeration of Structures and Classification of OH bonds of the Topology-distinct Protonated Water Clusters H_3O^+(H_2O)_<n-1> (n≦7)2009

    • 著者名/発表者名
      Maihemutijiang Jieli
    • 学会等名
      The Horiba International Symposium on Simulations and Dynamics for Nanoscale and Biological Systems
    • 発表場所
      東京大学(武田ホール)
    • 年月日
      2009-03-05
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Theoretical study on the base-sequence dependency on ligand distribution along DNA groove2008

    • 著者名/発表者名
      Tomoki Yoshida
    • 学会等名
      The 5th Nano Bio Info Chemistry Symposium
    • 発表場所
      広島大学
    • 年月日
      2008-12-14
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Distribution of H-bond patterns and enhancement of molecular dipolemoment in water clusters2008

    • 著者名/発表者名
      Dai Akase
    • 学会等名
      The 5th Nano Bio Info Chemistry Symposium
    • 発表場所
      広島大学
    • 年月日
      2008-12-13
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Molecular structures in ground and excited vibrational states from quasi-classical direct ab initio MD2008

    • 著者名/発表者名
      Tomonori Yamada
    • 学会等名
      The 5th Nano Bio Info Chemistry Symposium
    • 発表場所
      広島大学
    • 年月日
      2008-12-13
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] IR spectra of five-membered heterocycles by means of quasi-classicaldirect ab initio MD2008

    • 著者名/発表者名
      Shuichi Sakata
    • 学会等名
      The 5th Nano Bio Info Chemistry Symposium
    • 発表場所
      広島大学
    • 年月日
      2008-12-13
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] DNAまわりの水分布の塩基配列依存性に関する理論化学的研究2008

    • 著者名/発表者名
      Tomoki Yoshida
    • 学会等名
      第46回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場
    • 年月日
      2008-12-05
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 量子化学シミュレーション2008

    • 著者名/発表者名
      相田美砂子
    • 学会等名
      2008年日本化学会西日本大会
    • 発表場所
      長崎大学(文教地区キャンパス)
    • 年月日
      2008-11-16
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Direct ab initio MD study on Deuterium Cation (D+) Exchange Reaction of DODOD-2008

    • 著者名/発表者名
      坂宗和明
    • 学会等名
      2008年日本化学会西日本大会
    • 発表場所
      長崎大学(文教地区キャンパス)
    • 年月日
      2008-11-16
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 量子化学シミュレション2008

    • 著者名/発表者名
      相田美砂子
    • 学会等名
      2008日本化学会西日本大会
    • 発表場所
      長崎
    • 年月日
      2008-11-15
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] グリシンの水和自由エネルギーについての理論化学的研究2008

    • 著者名/発表者名
      宮本秀範
    • 学会等名
      2008年日本化学会西日本大会
    • 発表場所
      長崎大学(文教地区キャンパス)
    • 年月日
      2008-11-15
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] QM/MM法による水溶液中アスコルビン酸の構造についての理論化学的研究2008

    • 著者名/発表者名
      岡本拓也
    • 学会等名
      2008年日本化学会西日本大会
    • 発表場所
      長崎大学(文教地区キャンパス)
    • 年月日
      2008-11-15
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 直鎖分子の柔軟性についての理論化学的研究2008

    • 著者名/発表者名
      安藤広司
    • 学会等名
      第31回情報化学討論会
    • 発表場所
      東京大学(山上会館)
    • 年月日
      2008-11-14
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 計算化学の視点から・・・物理と生命のかけ橋2008

    • 著者名/発表者名
      相田美砂子
    • 学会等名
      第18回インテリジェント・システム・シンポジウム
    • 発表場所
      広島県情報プラザ
    • 年月日
      2008-10-23
    • 関連する報告書
      2008 自己評価報告書
  • [学会発表] ONIOM分子動力学法によるPtH(H2)[P(t-Bu)3]2]+錯体の水素分子の動的挙動に関する理論的研究2008

    • 著者名/発表者名
      松原世明
    • 学会等名
      第2回分子科学討論会
    • 発表場所
      福岡国際会議場
    • 年月日
      2008-09-26
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 8-oxoguanineによる突然変異に関する理論化学的研究2008

    • 著者名/発表者名
      吉田智喜
    • 学会等名
      第2回分子科学討論会
    • 発表場所
      福岡国際会議場
    • 年月日
      2008-09-25
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 核酸塩基の異性化過程へのスタッキング相互作用の影響2008

    • 著者名/発表者名
      正木竜太
    • 学会等名
      第2回分子科学討論会
    • 発表場所
      福岡国際会議場
    • 年月日
      2008-09-24
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Free Energy Change of Glycine Tautomerization in Aqueous Solution2008

    • 著者名/発表者名
      Hidenori Miyamoto
    • 学会等名
      WATOC 2008
    • 発表場所
      シドニー(オーストラリア)
    • 年月日
      2008-09-16
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Structures and Infrared Spectra of the Topology-distinct Protonated Water Clusters H_3O^+(H_2O)_<n-1> (n≦6)2008

    • 著者名/発表者名
      Maihemutijiang Jieli
    • 学会等名
      WATOC 2008
    • 発表場所
      シドニー(オーストラリア)
    • 年月日
      2008-09-16
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Structures and infrared spectra of the topology-distinct protonated water clusters, H_3O^+(H_2O)_<n-1> (n≦6)2008

    • 著者名/発表者名
      Maihemutijiang Jieli
    • 学会等名
      Gordon Research Conference on Molecular & Ionic Clusters
    • 発表場所
      CentrePaul Langevin in Aussois (フランス)
    • 年月日
      2008-09-09
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] QM/MM-MC Simulation of Reactions in Aqueous Solution2008

    • 著者名/発表者名
      M. Aida
    • 学会等名
      The 2nd International Symposium on "Molecular Theory for Real Systems"
    • 発表場所
      Okazaki, Japan
    • 年月日
      2008-08-06
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] グリシンの異性化に伴う水和自由エネルギーの変化に関する理論化学的研究2008

    • 著者名/発表者名
      宮本秀範
    • 学会等名
      第11回理論化学討論会
    • 発表場所
      慶應義塾大学理工学部(矢上キャンパス)
    • 年月日
      2008-05-24
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] ONIOM分子動力学法による有機金属錯体反応における環境の動的効果に関する研究2008

    • 著者名/発表者名
      松原世明
    • 学会等名
      第11回理論化学討論会
    • 発表場所
      慶應義塾大学理工学部(矢上キャンパス)
    • 年月日
      2008-05-23
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 水クラスター(H2O)n(=3-6)の水素結合パターンについての理論化学的研究2008

    • 著者名/発表者名
      赤瀬大
    • 学会等名
      第11回理論化学討論会
    • 発表場所
      慶應義塾大学理工学部(矢上キャンパス)
    • 年月日
      2008-05-22
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Quasi-classical direct ab initio MD法による複素五員環のパッカリングに関する理論化学的研究2008

    • 著者名/発表者名
      坂田修一
    • 学会等名
      第11回理論化学討論会
    • 発表場所
      慶應義塾大学理工学部(矢上キャンパス)
    • 年月日
      2008-05-22
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Quantum Chemical Simulation on Reactions in Aqueous Solution2007

    • 著者名/発表者名
      Misako AIDA
    • 学会等名
      Singapore International Chemistry Conference 5
    • 発表場所
      シンガポール
    • 年月日
      2007-12-17
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Molecular Approaches to Complex Liquids System "A theoretical study on alkyl halide/halide exchange reaction path in aqueous solution"2007

    • 著者名/発表者名
      Masayuki OHISA
    • 学会等名
      Joint Conference of JMLG/EMLG Meeting 2007 and 30th Symposium on Solution Chemistry of Japan
    • 発表場所
      福岡大学
    • 年月日
      2007-11-23
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] BSSE-corrected many body interaction energy in the recognition site of DNA by protein2007

    • 著者名/発表者名
      M. Aida
    • 学会等名
      International Symposium on Molecular Theory for Real Systems
    • 発表場所
      Kyoto, Japan
    • 年月日
      2007-11-15
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 水溶液内反応の量子化学シミュレーション2007

    • 著者名/発表者名
      相田美砂子
    • 学会等名
      日本化学会第1回関東支部大会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2007-09-27
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 水溶液内反応の量子化学シミュレーション2007

    • 著者名/発表者名
      相田美砂子
    • 学会等名
      日本化学会第1回関東支部大会
    • 発表場所
      首都大学東京南大沢キャンパス
    • 年月日
      2007-09-27
    • 関連する報告書
      2008 自己評価報告書
  • [学会発表] 水溶液内反応の量子化学シミュレーション2007

    • 著者名/発表者名
      相田 美砂子
    • 学会等名
      日本化学会第1回関東支部大会
    • 発表場所
      首都大学東京(南大沢キャンパス)
    • 年月日
      2007-09-27
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] ONIOM-Molecular Dynamics (MD) Study on the Enzymatic Formation of Anticancer Compounds2007

    • 著者名/発表者名
      Toshiaki MATSUBARA
    • 学会等名
      1st International Symposium on "Molecular Theory for Real Systems"
    • 発表場所
      京都大学(桂キャンパス)
    • 年月日
      2007-07-27
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] QM/MM'-MC法を用いた水溶液中におけるハロゲン求核置換反応の自由エネルギーマップ2007

    • 著者名/発表者名
      大久 真幸
    • 学会等名
      第10回理論化学討論会
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 年月日
      2007-05-15
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Possible stable structures and infrared spectra of protonated water clusters H_3O^+(H_O)_<n-1> (n≦6)2007

    • 著者名/発表者名
      Maihemutij iang JIELI
    • 学会等名
      Asia Pacific Conference on Theoretical and Computation
    • 発表場所
      中国
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Possible stable structures and infrared spectra of protonated water clusters, H_3O^+(H_O)_<n-1> (n≦6)2007

    • 著者名/発表者名
      Masayuki OHISA
    • 学会等名
      Asia Pacific Conference on Theoretical and Computational Chemistry (3rd APCTCC)
    • 発表場所
      中国
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 水8量体の安定構造と自由エネルギー2006

    • 著者名/発表者名
      相田美砂子
    • 学会等名
      氷・水およびクラスレート水和物の物性に関する研究集会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2006-12-15
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [図書] ONIOM and ONIOM-Molecular Dynamics Methods: Principles and Applications2010

    • 著者名/発表者名
      T. Matsubara
    • 出版者
      Nova Science Publishers(印刷中)
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [図書] Handbook of Computational Chemistry Research (Chapter 2; ONIOM and ONIOM-Molecular Dynamics Methods : Principles and Applications)2010

    • 著者名/発表者名
      Toshiaki Matsubara
    • 出版者
      Nova Science Publishers(印刷中)
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://home.horoshima-u.ac.jp/maida

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [備考] 体験実験コーナー「コンピュータで遊ぼう」(「おもしろワクワク化学の世界'08広島化学展」)対象 : 小・中・高校生, 一般 ; 会期 : 2008年7月25日〜27日 ; 場所 : 広島市こども文化科学館))

    • 関連する報告書
      2008 自己評価報告書
  • [備考] 体験実験コーナー「リカだいすき!」)「おもしろワクワク化学の世界'08広島化学展」(対象 : 小・中・高校生, 一般 ; 会期 : 2008年7月25日〜27日 ; 場所 : 広島市こども文化科学館))

    • 関連する報告書
      2008 自己評価報告書
  • [備考] 実習「コンピュータで化学する」(「体験科学講座〜女子高生特別コース〜」(対象 : 高校生 ; 会期 : 2008年8月12日 ; 場所 : 広島大学理学部)

    • 関連する報告書
      2008 自己評価報告書
  • [備考] 個人ホームページ

    • URL

      http://home.hiroshima-u.ac.jp/maida/

    • 関連する報告書
      2008 自己評価報告書

URL: 

公開日: 2006-04-01   更新日: 2018-03-28  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi