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マウスES細胞の分化調節機構に関する機能プロテオミクス研究

研究課題

研究課題/領域番号 18201039
研究種目

基盤研究(A)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 応用ゲノム科学
研究機関首都大学東京

研究代表者

礒辺 俊明  首都大学東京, 大学院・理工学研究科, 教授 (70106607)

研究分担者 高橋 信弘  東京農工大学, 共生科学技術研究院, 教授 (80293017)
梶 裕之  産業技術総合研究所, 糖鎖医工学研究センター, 主任研究員 (80214302)
田岡 万悟  首都大学東京, 大学院・理工学研究科, 助教 (60271160)
連携研究者 梶 裕之  (独)産業技術総合研究所, 糖鎖医工学研究センター, 主任研究員 (80214302)
田岡 万悟  首都大学東京, 大学院・理工学研究科, 助教 (60271160)
吉田 陽子  首都大学東京, 大学院・理工学研究科, 特任助教 (00379661)
研究期間 (年度) 2006 – 2008
研究課題ステータス 完了 (2008年度)
配分額 *注記
45,890千円 (直接経費: 35,300千円、間接経費: 10,590千円)
2008年度: 10,920千円 (直接経費: 8,400千円、間接経費: 2,520千円)
2007年度: 14,170千円 (直接経費: 10,900千円、間接経費: 3,270千円)
2006年度: 20,800千円 (直接経費: 16,000千円、間接経費: 4,800千円)
キーワードプロテオーム / 発生・分化 / 幹細胞 / 機能プロテオミクス / バイオテクノロジー
研究概要

本研究では、再生医療や移植医療などへの応用が期待される胚性幹細胞(ES細胞)の特質や分化調節機構についての理解を深める目的で、マウスES細胞のプロテオームを最新のプロテオミクス技術で解析し、分化誘導刺激にともなう約4,000種類のタンパク質の変動を定量的に解析した。また、未分化ES細胞に特異的なタンパク質の細胞機能を解析した。本研究の成果は、ES細胞の基礎研究だけでなく、各種の方法で作成したiPS細胞の比較解析や分化状態を識別するためのバイオマーカー探索のための資源として有用と考えられる。

報告書

(4件)
  • 2008 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2007 実績報告書
  • 2006 実績報告書
  • 研究成果

    (28件)

すべて 2008 2007 2006 その他

すべて 雑誌論文 (12件) (うち査読あり 11件) 学会発表 (8件) 図書 (5件) 備考 (1件) 産業財産権 (2件)

  • [雑誌論文] Cellsurface biomarkers of embryonic stem cells2008

    • 著者名/発表者名
      Nagano K, Yoshida Y, Isobe T.
    • 雑誌名

      Proteomics 8

      ページ: 4025-4035

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Liquid chromatography/mass spectrometry-based glycoproteomics technologies for cancer biomarker discovery2008

    • 著者名/発表者名
      Kaji H, Isobe T.
    • 雑誌名

      Clinical Proteomics DOI 10.1007/s12014-008-9004-1

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Automated SPR-LC-MS/MS system for protein interaction analysis2008

    • 著者名/発表者名
      Hayano T, Yamauchi Y, Asano K, Tsujimura T, Hashimoto S, Isobe T, Takahashi N.
    • 雑誌名

      J. Proteome Res. 9

      ページ: 4183-4190

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Association of human DNA helicase RecQ5beta with RNA polymerase II and its possible role in transcription2008

    • 著者名/発表者名
      Izumikawa K, Yanagida M, Hayano T, Tachikawa H, Komatsu W, Shimamoto A, Futami K, Furuichi Y, Shinkawa T, Yamauchi Y, Isobe T, Takahashi N.
    • 雑誌名

      Biochem. J. 413

      ページ: 505-516

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Cell surface biomarkers of embryonic stem cells2008

    • 著者名/発表者名
      Nagano K.
    • 雑誌名

      Proteomics 8

      ページ: 4025-4035

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Liquid chromatography /mass spectrometry-based glycoproteomics technologies for cancer biomarker discovery.2008

    • 著者名/発表者名
      Kaji H.
    • 雑誌名

      Clinical Proteomics 電子出版

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Automated SPR-LC-MS/MS system for protein interaction analysis.2008

    • 著者名/発表者名
      Hayano T.
    • 雑誌名

      J. Proteome Res. 9

      ページ: 4183-4190

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Cell surface biomarkers of embryonic stem cells2008

    • 著者名/発表者名
      Nagano K, Yoshida Y. Isobe, T.
    • 雑誌名

      Proteomics 8(印刷中)

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Proteomics reveals N-linked glycoprotein diversity in Caenorhabditis elegans and suggests an atypical translocation mechanism for integral membrane proteins2007

    • 著者名/発表者名
      Kaji H, Kamiie J, Kawakami H, Kido K, Yamauchi T, Shinkawa T, Taoka M, Takahashi N, Isobe T.
    • 雑誌名

      Mol. Cell Proteomics

      ページ: 2100-2109

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Proteomics reveals N-linked glycoprotein diversity and suggests an atypical translocation mechanism for integral membrane proteins2007

    • 著者名/発表者名
      Kaji H, Isobe, T., et. al.
    • 雑誌名

      Molecular and Cellular Proteomics 6

      ページ: 2100-2109

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mass spectrometric identification of N-linked glycopeptides using lectin-mediated affinity capture and glycosylation site-specific stable isotope tagging2006

    • 著者名/発表者名
      Kaji H, Yamauchi Y, Takahashi N, Isobe T.
    • 雑誌名

      Nature Protocols 1

      ページ: 3019-3027

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mass spectrometric identification of N-linked glycopeptides using lectin-mediated affinity capture and glycosylation site-specific stable isotope tagging.2006

    • 著者名/発表者名
      Kaji, H., Isobe, T.et al.
    • 雑誌名

      Nature Protocols 1

      ページ: 3019-3027

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [学会発表] 代謝標識法を用いたマウスES細胞クロマチン結合タンパク質の大規模プロテオーム解析2008

    • 著者名/発表者名
      吉田陽子、鷲田元久、新川高志、谷知美、山内芳雄、礒辺俊明
    • 学会等名
      第8回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2008-06-10
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] Proteomic analysis of proteins associated with splicing factor-2 associated protein p32 revealed its possible involvement in human ribosome biogenesis2008

    • 著者名/発表者名
      Yoshikawa H, Kawasaki M, Komatsu W, Yanagida M, Hayano T, Izumikawa K, Ishikawa H, Shinkawa T, Yamauchi Y, Isobe T, Takahashi N.
    • 学会等名
      2nd Pacific Rim Intern. Conf. on Protein Science (PRICPS) and 5th AOHUPO
    • 発表場所
      Cairns, Australia
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 腫瘍バイオマーカー探索のためのグライコプロテオーム解析法2008

    • 著者名/発表者名
      梶裕之、礒辺俊明、成松久
    • 学会等名
      日本ヒトプロテオーム機構第6回大会
    • 発表場所
      大阪
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 代謝標識法を用いたマウスES細胞クロマチン結合タンパク質の大規模プロテオーム解析2008

    • 著者名/発表者名
      吉田陽子, 礒辺俊明ら
    • 学会等名
      第8回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      東京 タワーホール船堀
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 代謝標識法を用いたマウスES細胞分化過程の大規模プロテオーム解析2007

    • 著者名/発表者名
      吉田陽子、鷲田元久、新川高志、清水祐亮、山内芳雄、礒辺俊明
    • 学会等名
      第5回日本ヒトプロテオーム機構大会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] プロテオミクス : タンパク質大規模解析からのアプローチ2007

    • 著者名/発表者名
      礒辺俊明
    • 学会等名
      日本電気泳動学会シンポジウム
    • 発表場所
      横浜
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 代謝標識法を用いたマウスES細胞分化過程の大規模プロテオーム解析2007

    • 著者名/発表者名
      吉田陽子、礒辺俊明, ら
    • 学会等名
      日本ヒトプロテオーム機構第5回大会
    • 発表場所
      東京 日本科学未来館
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] N型糖タンパク質の大規模同定と変動解析法の開発2006

    • 著者名/発表者名
      梶裕之、佐々木明子、山内芳雄、新川高志、礒辺俊明
    • 学会等名
      第6回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      京都
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [図書] Proteomic Biology using LC-MS : Large-scale Analysis of Cellular Dynamics and Function2007

    • 著者名/発表者名
      Takahashi N, Isobe T.
    • 総ページ数
      254
    • 出版者
      Wiley-Interscience
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [図書] 分子間相互作用解析ハンドブック2007

    • 著者名/発表者名
      礒辺俊明、中山敬一、伊藤隆司(編)
    • 総ページ数
      286
    • 出版者
      羊土社
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [図書] Proteomic biology using LC-MS; Large-scale Analysis of Cellular Dynamics and Function2007

    • 著者名/発表者名
      Takahashi N. and Isobe T.
    • 総ページ数
      254
    • 出版者
      Wiley-Interscience
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [図書] プロテオミクスの細胞機能解析への挑戦2006

    • 著者名/発表者名
      礒辺俊明、高橋信弘(編)
    • 総ページ数
      130
    • 出版者
      細胞工学
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [図書] 細胞工学「プロテオミクスの細胞機能解析への挑戦」2006

    • 著者名/発表者名
      磯辺俊明ら(編)
    • 総ページ数
      130
    • 出版者
      秀潤社
    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.sci.metro-u.ac.jp/proteomicslab/

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [産業財産権] 糖ペプチドの糖鎖結合部位特定方法2008

    • 発明者名
      梶裕之、山内芳雄、礒辺俊明
    • 権利者名
      梶裕之、山内芳雄、礒辺俊明
    • 出願年月日
      2008-11-21
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [産業財産権] 糖ペプチドの糖鎖結合部位特定方法2008

    • 発明者名
      梶裕之, 山内芳雄, 礒辺俊明
    • 権利者名
      梶裕之, 山内芳雄, 礒辺俊明
    • 取得年月日
      2008-11-21
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書

URL: 

公開日: 2006-04-01   更新日: 2016-04-21  

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