| 研究課題/領域番号 |
18300100
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| 研究種目 |
基盤研究(B)
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 研究分野 |
生体生命情報学
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| 研究機関 | 立命館アジア太平洋大学 |
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研究代表者 |
ローズ ジョン アンソニー (J・A Rose / ROSE John・A) 立命館アジア太平洋大学, アジア太平洋学部, 准教授 (00345125)
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| 研究分担者 |
陶山 明 東京大学, 総合文化研究科, 教授 (90163063)
萩谷 昌己 (萩谷 昌巳) 東京大学, 情報工学(系)研究科, 教授 (30156252)
小宮 健 東京工業大学, 総合理工学研究科, (研究院)助手 (20396790)
GHOTBI Nader 立命館アジア太平洋大学, アジア太平洋学部, 准教授 (90435173)
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| 連携研究者 |
小宮 健 東京工業大学, 総合理工学研究科(研究院), 助手 (20396790)
陶山 明 東京大学, 総合文化研究科, 教授 (90163063)
萩谷 昌巳 東京大学, 情報工学(系)研究科, 教授 (30156252)
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| 研究協力者 |
IBRAHIM Zuwairie University Technology Malaysia, Assistant Professor
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| 研究期間 (年度) |
2006 – 2008
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| 研究課題ステータス |
完了 (2008年度)
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| 配分額 *注記 |
14,610千円 (直接経費: 12,900千円、間接経費: 1,710千円)
2008年度: 3,380千円 (直接経費: 2,600千円、間接経費: 780千円)
2007年度: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2006年度: 7,200千円 (直接経費: 7,200千円)
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| キーワード | DNA Computing / Genetic Program / Whiplash PCR / Displacement Whiplash PCR / Crossover / TAT System / Hybridization Error / Readout method / Efficiency / TAT system / Displacement WPCR / Real Time PCR / Readout / Automation |
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| 研究概要 |
本研究では、DisplacementWPCR(DWPCR)を実験により実証し、WhiplashPCRの等温・高効率プラットホームとして確立した。主な実績には以下が含まれる:(1)ルールプロテクト・バイオステップによるバックハイブリダイゼーション排除効果の実証、(2)マルチステップDWPCRの実行および最適化、(3)ルールスイッチ・バイオステップ実行のためのルールプロテクトの使用-これによりDWPCR ミクスチャの外部制御が可能となり、二次的生物学的・計算プロセスとの直接的統合への道が開かれる、(4)DWPCRクロスオーバー(EvolutionaryWPCR の基本演算)の基本的実行可能性の実証。その他、TaqmanプローブとリアルタイムPCR に基づく改良DNA読み出し法の開発、またDNAシステムをシミュレーションし、ハイファイDNAコード化を進化させるNucleicParkソフトウェアツールの改良も実績に含まれる
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