研究課題/領域番号 |
18310009
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研究種目 |
基盤研究(B)
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配分区分 | 補助金 |
応募区分 | 一般 |
研究分野 |
環境動態解析
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研究機関 | 横浜国立大学 |
研究代表者 |
伊藤 公紀 横浜国立大学, 大学院・工学研究院, 教授 (40114376)
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研究分担者 |
雨宮 隆 横浜国立大学, 大学院・工学研究院, 准教授 (60344149)
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研究期間 (年度) |
2006 – 2008
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研究課題ステータス |
完了 (2008年度)
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配分額 *注記 |
14,560千円 (直接経費: 12,700千円、間接経費: 1,860千円)
2008年度: 3,120千円 (直接経費: 2,400千円、間接経費: 720千円)
2007年度: 4,940千円 (直接経費: 3,800千円、間接経費: 1,140千円)
2006年度: 6,500千円 (直接経費: 6,500千円)
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キーワード | 環境計測 / 土壌細菌 / 鎖長多形 / DGGE / SSCP / DNA二次元電気泳動 / 生態系 / 湖 / 複雑系 / 食物網 / レジームシフト / 多様性 / 二次元電気泳動 / ランク・アバンダンスプロット / 回復性 |
研究概要 |
環境中で重要な機能を担うにも関わらず、その詳細が不明な土壌細菌群集に関して、実験的・理論的な解析を行った。実験的には、DNA を高い分離能の検出できる二次元電気泳動法と、異なるDNA の集合を全体的に見るための総観的分子分類学に基づいて、新しい評価法を開発した。二次元電気泳動では、それぞれの細菌種を、1 つ1 つのスポットとして得ることができるため、全体の見通しが良い。理論的には、多様性が出現する機構を、「食う・食われる」の関係を表す食物網から検討すると共に、生態系中の非線形な相互作用による動態の解析を行い、典型的な湖汚染であるアオコ(シアノバクテリアの集団)の季節変動や日内変動などの挙動を明らかにした
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