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貧栄養環境下でのPCB汚染除去のための新規光合成微生物の創出

研究課題

研究課題/領域番号 18310050
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 環境技術・環境材料
研究機関茨城大学

研究代表者

木村 成伸  茨城大学, 工学部, 教授 (90291608)

研究分担者 千田 俊域 (千田 俊哉)  産業総合研究所, 生物情報解析研究センター, 研究員 (30272868)
菓子野 康浩  兵庫県立大学大学院, 生命理学研究科, 助教 (20221872)
連携研究者 千田 俊哉  産業技術総合研究所, バイオメディシナル情報研究センター, 主任研究員 (30272868)
菓子野 康浩  兵庫県立大学, 大学院・生命理学研究科, 准教授 (20221872)
研究協力者 福田 雅夫  長岡技術科学大学, 工学部, 教授 (20134512)
西澤 明人  茨城大学, 産学連携イノベーション創成機構, 非常勤研究員 (30466643)
研究期間 (年度) 2006 – 2008
研究課題ステータス 完了 (2008年度)
配分額 *注記
16,670千円 (直接経費: 15,500千円、間接経費: 1,170千円)
2008年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2007年度: 3,250千円 (直接経費: 2,500千円、間接経費: 750千円)
2006年度: 11,600千円 (直接経費: 11,600千円)
キーワード環境修復技術 / バイオレメディエーション / PCB / シアノバクテリア / 光合成 / タンパク質工学 / 基質特異性 / X 線結晶構造解析 / 電子伝達系 / フラビン酵素 / X線結晶構造解析 / 反応中間体 / 基質性異性 / 結晶化
研究概要

水や土壌中などに残留するポリ塩化ビフェニル(PCB)の汚染除去には、ビフェニル分解微生物を用いた生物的環境浄化が有効である.本研究では、PCB 分解細菌Pseudomonas sp. KKS102 株の分解酵素系タンパク質BphA1~A4 遺伝子を光合成微生物であるシアノバクテリア(ラン藻)に組み込んで、これまで困難であった貧栄養環境下でも光エネルギーを用いてビフェニル化合物を分解できる新規光合成微生物を創出した.

報告書

(4件)
  • 2008 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2007 実績報告書
  • 2006 実績報告書
  • 研究成果

    (35件)

すべて 2009 2008 2007 2006 その他

すべて 雑誌論文 (15件) (うち査読あり 8件) 学会発表 (16件) 図書 (2件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] Redox control of protein conformation in flavoproteins2009

    • 著者名/発表者名
      Senda, T., Senda, M., Kimura, S., Ishida, T
    • 雑誌名

      Antioxid Redox Signal 11

      ページ: 1741-1766

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 反応中間体構造から明らかになった電子伝達タンパク質間の酸化還元依存的な親和性調節機構2008

    • 著者名/発表者名
      千田美紀, 木村成伸, 福田雅夫, 石田哲夫, 千田俊哉
    • 雑誌名

      日本結晶学会誌 50

      ページ: 341-347

    • NAID

      10023987813

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [雑誌論文] 電子伝達タンパク質間の酸化還元状態依存的親和性調節機構2008

    • 著者名/発表者名
      千田美紀, 木村成伸, 福田雅夫, 石田哲夫, 千田俊哉
    • 雑誌名

      化学と生物 46

      ページ: 689-696

    • NAID

      10024334724

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [雑誌論文] 電子伝達タンパク質間の酸化還元状態依存的親和性調節機構2008

    • 著者名/発表者名
      千田美紀
    • 雑誌名

      化学と生物 46

      ページ: 689-696

    • NAID

      10024334724

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [雑誌論文] 反応中間体構造から明らかになった電子伝達タンパク質間の酸化還元依存的な親和性調節機構2008

    • 著者名/発表者名
      千田美紀
    • 雑誌名

      日本結晶学会誌 50

      ページ: 341-347

    • NAID

      10023987813

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [雑誌論文]2008

    • 著者名/発表者名
      Akito Nishizawa
    • 雑誌名

      Inversion of NADH/NADPH-specificity of BphA4 from Pseudomonas sp. strain KK S102 by substitutions of Glu175 and Gln177. In Flavins and Flavoproteins 2008 (Fargo, S., Gomez-Moreno, C., Medina, M.)(Prensas Universitarias de Zaragoza, Spain)

      ページ: 273-278

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [雑誌論文]2008

    • 著者名/発表者名
      Miki Senda
    • 雑誌名

      Molecular mechanism of the redox-depsndent interaction between NADH-dependent ferredoxin reductase and Rieske-type [2Fe-2S]ferredoxin. In Flavins and Flavooroteins 2008 (Fargo. S., Gomez-Moreno, C., Medina, M.)(Prensas Universitarias de Zaragoza, Spain)

      ページ: 113-118

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [雑誌論文] Molecular mechanism of the redox-dependent interaction between NADH-dependent ferredoxin reductase and Rieske-type [2Fe-2S] ferredoxin2007

    • 著者名/発表者名
      Senda, M., Kishigami, S., Kimura, S., Fukuda, M., Ishida, T., Senda, T
    • 雑誌名

      J.Mol.Biol 373

      ページ: 382-400

    • NAID

      10024334724

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray analysis of the electron-transfer complex of Rieske-type [2Fe-2S] ferredoxin and NADH-dependent ferredoxin reductase derived from Acidovorax sp. Strain KKS1022007

    • 著者名/発表者名
      Senda, M., Kishigami, S., Kimura, S., Senda, T
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr.Sect.F 63

      ページ: 520-523

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray analysis of the reduced Rieske-type [2Fe-2S] ferredoxin derived from Pseudomonas sp. Strain KKS1022007

    • 著者名/発表者名
      Senda, M., Kishigami, S., Kimura, S., Senda, T
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr.Sect.F 63

      ページ: 311-314

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallization and perliminary X-ray analysis of the reduced Rieske-type [2Fe-2S] ferredoxin derived from Pseudomonas sp. strain KKS102.2007

    • 著者名/発表者名
      Miki Senda
    • 雑誌名

      Acta Crystallograph Sect F Struct Biol Cryst Commun. 63

      ページ: 311-314

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray analysis of the electron-transfer complex of Rieske-type [2Fe-2S] ferredoxin and NADH-dependent ferredoxin reductase derived from Acidovorax sp. strain KKS102.2007

    • 著者名/発表者名
      Miki Senda
    • 雑誌名

      Acta Crystallograph Sect F Struct Biol Cryst Commun. 63

      ページ: 520-523

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Molecular mechanism of the redox-dependent interaction between NADH-dependent ferredoxin reductase and Rieske-type [2Fe-2S] ferredoxin.2007

    • 著者名/発表者名
      Miki Senda
    • 雑誌名

      J. Mol. Biol. 373

      ページ: 382-400

    • NAID

      10024334724

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray analysis of the Rieske-type [2Fe-2S] ferredoxin component of biphenyl dioxygenase from Pseudomonas sp. Strain KKS1022006

    • 著者名/発表者名
      Senda, M., Kimura, S., Kishigami, S., Senda, T
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr.Sect.F 62

      ページ: 590-592

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray analysis of the Tieske-type [2Fe-2S] ferredoxin component of biphenyl dioxygenase from Pseudomonas sp. strain KKS102.2006

    • 著者名/発表者名
      Miki Senda
    • 雑誌名

      Acta Crystallograph. Sect F Struct. Biol. Cryst. Commun. 62・6

      ページ: 590-592

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [学会発表] Enzymatic properties of NADH/NADPH-specificity inverted BphA4 mutants from Pseudomonas sp. Strain KKS1022008

    • 著者名/発表者名
      Nishizawa, A., Muramatsu, D., Kishigami, S., Kashino, Y., Senda, M., Senda, T., Fukuda, M., Kimura, S
    • 学会等名
      第31回日本分子生物学会年会 第81回日本生化学会大会 合同大会 (BMB2008)
    • 発表場所
      神戸市神戸ポートアイランド
    • 年月日
      2008-12-12
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 部位特異的ランダム変異導入によるNADPH 依存的BphA4 変異体の作製2008

    • 著者名/発表者名
      森重政, 村松大輔, 西澤明人, 千田美紀, 千田俊哉, 福田雅夫, 木村成伸
    • 学会等名
      第31回日本分子生物学会年会 第81回日本生化学会大会 合同大会 (BMB2008)
    • 発表場所
      神戸市神戸ポートアイランド
    • 年月日
      2008-12-12
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 部位特異的ランダム変異導入によるNADPH依存的BphA4変異体の作製2008

    • 著者名/発表者名
      森重政
    • 学会等名
      第31回日本分子生物学会年会第81回日本生化学会大会合同大会(BMB2008)
    • 発表場所
      兵庫県神戸市神戸ポートアイランド神戸国際展示場
    • 年月日
      2008-12-12
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Enzymatic properties of NADH/NADPH-specicifity inverted BphA4 mutants from Pseudomonas sp. strain KKS1022008

    • 著者名/発表者名
      Nishizawa Akito
    • 学会等名
      第31回日本分子生物学会年会第81回日本生化学会大会合同大会(BMB2008)
    • 発表場所
      兵庫県神戸市神戸ポートアイランド神戸国際展示場
    • 年月日
      2008-12-12
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 電子伝達反応に伴って生じるFAD の構造変化が電子伝達タンパク質間の親和性を調節する2008

    • 著者名/発表者名
      千田美紀, 木村成伸, 福田雅夫, 石田哲夫, 千田俊哉
    • 学会等名
      第31回日本分子生物学会年会 第81回日本生化学会大会 合同大会 (BMB2008)
    • 発表場所
      神戸市神戸ポートアイランド
    • 年月日
      2008-12-11
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 電子伝達反応に伴って生じるFADの構造変化が電子伝達タンパク質間の親和性を調節する2008

    • 著者名/発表者名
      千田美紀
    • 学会等名
      第31回日本分子生物学会年会第81回日本生化学会大会合同大会(BMB2008)
    • 発表場所
      兵庫県神戸市神戸ポートアイランド神戸国際展示場
    • 年月日
      2008-12-11
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Molecular mechanism of the redox-dependent interaction between ferredoxin reductase and ferredoxin2008

    • 著者名/発表者名
      Senda, M., Kimura, S., Fukuda, M., Ishida, T., Senda, T
    • 学会等名
      XXI Congress and Genaral Assenbly of the International Union of Crystallography (IUCr2008)
    • 発表場所
      Grand Cube Osaka, Osaka
    • 年月日
      2008-08-28
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] Molecular mechanism of the redox-dependent interaction between ferredo xin reductase and ferredoxin2008

    • 著者名/発表者名
      Miki Senda
    • 学会等名
      XXI Congress and Genaral Assenbly of the International Union of Cristallography (IUCr2008)
    • 発表場所
      Grand Cube Osaka (Osaka In ternational Convention Center)
    • 年月日
      2008-08-28
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 部位特異的ランダム変異導入によるNADPH 依存的BphA4 の選抜2008

    • 著者名/発表者名
      森重政, 村松大輔, 西澤明人, 千田俊哉, 千田美紀, 福田雅夫, 木村成伸
    • 学会等名
      第8回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      東京都江戸川区タワーホール船堀
    • 年月日
      2008-06-10
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 部位特異的ランダム変異導入によるNADPH依存的BphA4の選抜2008

    • 著者名/発表者名
      森重政
    • 学会等名
      第8回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      東京都江戸川区タワーホール船堀
    • 年月日
      2008-06-10
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Inversion of NADH/NADPH-specificity of BphA4 from Pseudomonas sp. Strain KKS102 by substitutions of Glu175 and Gln1772008

    • 著者名/発表者名
      Nishizawa, A., Muramatsu, D., Kimura, S., Kishigami, S., Senda, M., Senda, T., Fukuda, M
    • 学会等名
      16th Symposium on Flavins and Flavoproteins 2008
    • 発表場所
      Palacio de Congressos, Jaca, Spain
    • 年月日
      2008-06-09
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] Molecular Mechanism of the redox-dependent interaction between NADH-dependent ferredoxin reductase and NADH/NAD^<+>2008

    • 著者名/発表者名
      Senda, M., Kimura, S., Fukuda, M., Ishida, T., Senda, T
    • 学会等名
      16th Symposium on Flavins and Flavoproteins 2008
    • 発表場所
      Palacio de Congressos, Jaca, Spain
    • 年月日
      2008-06-09
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] Molecular Mechanism of the redox-dependent interaction between NADH-de pendent ferredoxin reductase and NADH/NAD^+2008

    • 著者名/発表者名
      Miki Senda
    • 学会等名
      16th Symposium on Flavins and Flavoproteins 2008
    • 発表場所
      Palacio de Congressos, Jaca, Spain
    • 年月日
      2008-06-09
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Inversion of NADH/NADPH-specificity of BphA4 from Pseudomonas sp. stra in KKS102 by substitutions of Glu175 and Gln1772008

    • 著者名/発表者名
      Akito Nishizawa
    • 学会等名
      16th Symposium on Flavins and Flavoproteins 2008
    • 発表場所
      Palacio de Congressos, Jaca, Spain
    • 年月日
      2008-06-09
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Glu^<17>5およびGln^<177> の系統的置換によるPseudomonas sp. KKS102 株由来BphA4 のNADH/NADPH 特異性の逆転2007

    • 著者名/発表者名
      村松大輔, 岸上晋也, 上村卓哉, 千田俊哉, 菓子野康浩, 福田雅夫, 木村成伸
    • 学会等名
      第30回日本分子生物学会年会 第80回日本生化学会大会 合同大会(BMB2007)
    • 発表場所
      横浜市パシフィコ横浜
    • 年月日
      2007-12-15
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] Glu^<175>およびGln^<177>の系統的置換によるPseudomonas sp. KKS102株由来BphA4のNADH/NADPH特異性の逆転2007

    • 著者名/発表者名
      村松大輔
    • 学会等名
      第30回日本分子生物学会年会 第80回日本生化学会大会 合同大会(BMB2007)
    • 発表場所
      横浜市(パシフィコ横浜)
    • 年月日
      2007-12-15
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [図書] Inversion of NADH/NADPH-specificity of BphA4 from Pseudomonas sp. strain KKS102 by substitutions of Glu^<175> and Gln^<177>. in Flavins and Flavoproteins 2008 (Fargo, S., Gomez-Moreno, C., Medina, M. eds)2008

    • 著者名/発表者名
      Nishizawa, A., Muramatsu, D., Kishigami, S., Senda, M., Senda, T., Fukuda, M., and Kimura, S
    • 出版者
      Prensas Universitarias de Zaragoza, Spain
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [図書] Prensas Universitarias de Zaragoza, Spain2008

    • 著者名/発表者名
      Senda, M., Kimura, S., Fukuda, M., Ishida, T., and Senda, T
    • 出版者
      Molecular mechanism of the redox-depsndent interaction between NADH-dependent ferredoxin reductase and Rieske-type [2Fe-2S] ferredoxin. In Flavins and Flavoproteins 2008 (Fargo, S., Gomez-Moreno, C., Medina, M. eds)
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [備考]

    • URL

      http://info.ibaraki.ac.jp/scripts/websearch/index.htm

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [備考] 茨城大学研究者情報総覧

    • URL

      http://info.ibaraki.ac.jp/scripts/websearch/index.htm

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書

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公開日: 2006-04-01   更新日: 2016-04-21  

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