腸管の粘膜表層に常在する細菌群のゲノム解析

• 研究課題/領域番号: 18310132
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 基礎ゲノム科学
• 研究機関: 宮崎大学
• 研究代表者: 林 哲也 宮崎大学, フロンテ「ィア科学実験総合センター, 教授 (10173014)
• 研究分担者: 中山 恵介 宮崎大学, 医学部, 助教 (10347057) ; 小椋 義俊 宮崎大学, フロンティア科学総合センター, 助教 (40363585) ; 大岡 唯祐 宮崎大学, 医学部, 助教 (50363594) ; 桑原 知巳 徳島大学, ヘルスバイオサイエンス研究部, 准教授 (60263810) ; 黒川 ケン (黒川 顕) 奈良先端科学技術大学院大学, 情報科学研究科, 准教授 (20343246)
• 研究期間 (年度): 2006 – 2007
• 研究課題ステータス: 完了 (2007年度)
• 配分額: 17,490千円 (直接経費: 15,600千円、間接経費: 1,890千円); 2007年度: 8,190千円 (直接経費: 6,300千円、間接経費: 1,890千円); 2006年度: 9,300千円 (直接経費: 9,300千円)
• キーワード: 遺伝学 / 腸内細菌叢 / ゲノム / メタゲノム / 難培養性細菌 / 難培養性

研究概要

本研究の最終的な目的は、難培養細菌が多数を占める腸内常在菌叢における腸管部位による構成菌種の違いや特徴の解明である。これは糞便のメタゲノム解析では解明困難であり、ヒトでの解析は倫理的・技術的にも難しい。そこで、マウスを材料として、宿主との相互作用という点では最も重要と考えられる粘膜表層、特に離乳期回腸粘膜表層に焦点を絞り、その最優勢菌種であると予想される難培養性細菌Segmented filamentous bacterium(SFB)の全ゲノム解読に取り組んだ。
(1)無菌マウスを用いたSFBの分離:まず、離乳期マウスからマイクロマニピュレーターを用いてSFBを回収し、rolling circle amplification法で増幅を行った後、ショットガンライブラリーを作成した。しかし、本法ではプラスミド配列が優先的に増幅され、全ゲノム解析への応用が難しいことが判明した。そこで、SFBが芽胞形成細菌でクロロホルムに耐性であることを利用し、離乳期マウスから採取した空・回腸部をクロロホルム処理した後、無菌マウスに投与し、その空・回腸部を回収してDNAを抽出した。16S rRNA配列解析の結果、本法によってSFBが分離できることが確認されたため、抽出したDNAを用いてライブラリーを作成した。
(2)SFBのゲノム解析:5万リードのショットガンシーケンスを行った。SFB以外にXanthomonas由来と思われる配列が約半分を占めたが、SFB由来のATリッチな配列のみを用いてPCRによるギャップクローズを進め、約50のスーパーコンティグとなった。そこで、無菌マウスを用いてSFBを再度分離して、フィニッシングのためのBACライブラリーを作成した。今後、BACクローンの両端配列を決定し、この情報を基にフィニッシングを行う予定である。難培養細菌はクローン化できないため、今回の解析は一種のメタゲノム解析である。得られた配列の解析では、複数のクローンが混在していることが明らかになっており、本研究は難培養細菌のゲノム解析のための新しい方法論の開発につながると期待される。

研究成果

• [雑誌論文] Distribution,functional expression genetic organization of Cif,a phage-encoded type III-secreted effector from enteropathogenic and enterohaemorragic Escherichia coli (2008)
  • 著者名/発表者名: Loukiadis E., et. al.
  • 雑誌名: J.Bacteriol. 190(1) ページ: 275-285
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Enteropathogenic Escherichia coli(EPEC)O125:H6 triggers attaching and effacing lesions on human intestinal biopsies independently of Nck (2008)
  • 著者名/発表者名: Bai L., et. al.
  • 雑誌名: Infect.Immun. 76(1) ページ: 361-368
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Global regulation by horizontally transferred regulators establishes the pathogenicity of Escherichia coli (2008)
  • 著者名/発表者名: Abe H., et. al.
  • 雑誌名: DNA Res. 15(1) ページ: 25-38
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genomic comparison of the O-antigen biosynthesis gene clusters of Escherichia coli O55 strains belonging to three distinct lineages (2008)
  • 著者名/発表者名: Iguchi A., et. al.
  • 雑誌名: Microbiology 154(2) ページ: 559-570
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] High-level fluoroquinolone resistance in ophthalmic clinical isolates belonging to the species Corynebacterium macginleyi (2008)
  • 著者名/発表者名: Eguchi H., et. al.
  • 雑誌名: J.Clin.Microbiol. 46(2) ページ: 527-532
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Comparative genomic analysis using microarray demonstrates strong correlation between presence of Vp-PAI and pathogenicity in Kanagawa phenomenon-positive Vibrio parahaemolyticus (2008)
  • 著者名/発表者名: Izutsu, K., et. al.
  • 雑誌名: Infect.Immun. 76(3) ページ: 1016-1023
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Complete DNA sequence and analysis of the transferable multiple drug resistance plasmids(R-plasmids)from Photobacterium damselae subsp.Piscicida isolated in Japan and USA (2008)
  • 著者名/発表者名: Kim MJ, et. al.
  • 雑誌名: Antimicrob.Agents Chemother 52 ページ: 606-611
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] メタゲノム解析-微生物集団のゲノムをまとめて解析するということ (2008)
  • 著者名/発表者名: 林 哲也
  • 雑誌名: 現代化学 444 ページ: 40-42
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Distribution, functional expression genetic organization of Cif, a phage-encoded type III-secreted effector from enteropathogenic and enterohaemorragic Escherichia coli (2008)
  • 著者名/発表者名: Loukiadis, K., Nobe, R., Herold S., Tramuta, C., Ogura, Y., Ooka, T., Morabito, S., Kerouredan, M., Brugere, H., Schmidt, H., Hayashi, T., Oswald, E
  • 雑誌名: J. Bacteriol 190(1) ページ: 275-285
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Enteropathogenic Escherichia coli(EPEC) O125 : H6 triggers attaching and effacing lesions on human intestinal biopsies independently of Nck (2008)
  • 著者名/発表者名: Bai, L., Schukker, S., Whale, A., Mousnier, A., Marches, O., Wang, L., Ooka, X., Heuschkel, R., Kaper, JB., Gomes, TSK., Xu, J., Phillips, AD., Frankel, G
  • 雑誌名: Infect. Immun 76(1) ページ: 361-368
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Global regulation by horizontally transferred regulators establishes the pathogenicity of Escherichia coli (2008)
  • 著者名/発表者名: Abe, H., Miyahara, A., Oshima, T., Tashiro, K., Ogura, Y., Kuhara, S., Ogasawara, N., Hayashi, T., Tobe, T
  • 雑誌名: DNA Res 15(1) ページ: 25-38
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Genomic comparison of the O-antigen biosynthesis gene clusters of Escherichia coli O55 strains belonging to three distinct lineages (2008)
  • 著者名/発表者名: Iguchi, A., Ooka, T., Ogura, Y., Asadulghani, K., Nakayama, G., Frankel, G., Hayashi, T
  • 雑誌名: Microbioloev 154(2) ページ: 559-570
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] High-level fluoroquinolone resistance in ophthalmic clinical isolates belonging to the species Corynebacterium macginleyi (2008)
  • 著者名/発表者名: Eguchi, H., Kuwahara, X., Miyamoto, X., Nakayama-Imaohji, H., Ichimura, M., Hayashi, X., Shiota, H
  • 雑誌名: J. Clin. Microbiol. 46(2) ページ: 527-532
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Comparative genomic analysis using microarray demonstrates strong correlation between presence of Vp-PAI and pathogenicity in Kanagawa phenomenon-positive Vibrio parahaemolyticus (2008)
  • 著者名/発表者名: Izutsu, K., Kurokawa, K., Tashiro, K., Kuhara, S., Hayashi, T., Honda, T., Iida, T
  • 雑誌名: Infect. Immun. 76(3) ページ: 1016-1023
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Complete DNA sequence and analysis of the transferable multiple drug resistance plasmids(R-plasmids) from Photobacterium damselae subsp. Piscicida isolated in Japan and USA (2008)
  • 著者名/発表者名: Kim, MJ., Hirono, I., Kurokawa, K., Maki, T., Hawke, J., Kondo, H., Santos, M., Aoki, T
  • 雑誌名: Antimicrob. Agents Chemother 52 ページ: 606-611
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Distribution, functional expression genetic organization of Cif, aphage-encoded type III-secreted effector from enteropathogenic and enterohaemorragic Escherichia coli. (2008)
  • 著者名/発表者名: Loukiadis E., et. al.
  • 雑誌名: J. Bacteriol. 190(1) ページ: 275-285
  • 査読あり
• [雑誌論文] Enteropathogenic Escherichia coli (EPEC) O125: H6 triggers attaching and effacing lesions on human intestinal biopsies independently of Nck (2008)
  • 著者名/発表者名: Bai L., et. al.
  • 雑誌名: Infect. Immun. 76(1) ページ: 361-368
  • 査読あり
• [雑誌論文] High-level fluoroquinolone resistance in ophthalmic clinical isolates belonging to the species Corynebacterium macginleyi (2008)
  • 著者名/発表者名: Eguchi H., et. al.
  • 雑誌名: J. Clin. Microbiol. 46(2) ページ: 527-532
  • 査読あり
• [雑誌論文] Comparative genomic analysis using microarray demonstrates strong correlation between presence of Vp-PAI and pathogenicity in Kanagawa phenomenon-positive Vibrio parahaemolyticus. (2008)
  • 著者名/発表者名: Izutsu, K., et. al.
  • 雑誌名: Infect. Immum. 76(3) ページ: 1016-1023
  • 査読あり
• [雑誌論文] Complete DNA sequence and analysis of the transferable multiple drug resistance plasmids (R-plasmids) from Photobacterium damselae subsp. Piscicida isolated in Japan and USA. (2008)
  • 著者名/発表者名: Kim MJ, et. al.
  • 雑誌名: Antimicrob. Agents Chemother 52 ページ: 606-611
  • 査読あり
• [雑誌論文] RNA polymerase b-subunit gene(rpoB)sequence analysis for the identification of Bacteroides spp (2007)
  • 著者名/発表者名: Ko K.S., et. al.
  • 雑誌名: Clin.Microbiol.Infect. 13 ページ: 48-54
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] TccP2 of O157:H7 and non-0157 enterohemorrhagic Escherichia coli(EHEC):challenging the dogma of EHEC-induced actin polymerization (2007)
  • 著者名/発表者名: Ogura Y., et. al.
  • 雑誌名: Infect.Immun 75(2) ページ: 604-612
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Characterization of tccP2 carried by atypical ENTEROPATHOGENIC Escherichia colt (2007)
  • 著者名/発表者名: Ooka T., et. al.
  • 雑誌名: FEMS Microbiol.Lett 271 ページ: 126-135
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] TccP2-mediated subversion of actin dynamics by EPEC2 - a distinct evolutionary lineage of ENTEROPATHOGENIC Escherichia coli (2007)
  • 著者名/発表者名: Whale A., et. al.
  • 雑誌名: Microbiology 153 ページ: 1743-1755
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] An improved DNA isolation method for metagenomic analysis of the microbial flora of the human intestine (2007)
  • 著者名/発表者名: Morita H., et. al.
  • 雑誌名: Microbes Environ. 22(3) ページ: 214-222
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Extensive genomic diversity and selective conservation of virulence-determinants in enterohaemorrhagic Escherichia coli strains of O157 and non-O157 serotypes (2007)
  • 著者名/発表者名: Ogura Y., et. al.
  • 雑誌名: Genome Biol. 8(7)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Distribution of stable DnaA-binding sites on the Bacillus Subtilis genome detected using a modified ChIP-chip method (2007)
  • 著者名/発表者名: Ishikawa S., et. al.
  • 雑誌名: DNA Res. 14 ページ: 155-168
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Comparative metagenomics revealed commonly enriched gene sets in human gut microbiomes (2007)
  • 著者名/発表者名: Kurokawa K., et. al.
  • 雑誌名: DNA Res. 14 ページ: 169-181
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Modifying effects of fermented brown rice on fecal microbiota in rats (2007)
  • 著者名/発表者名: Kataoka, K., et. al.
  • 雑誌名: Anaerobe 13 ページ: 220-227
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Vibrionaceae;versatile bacterial family with evolutionary conserved variability (2007)
  • 著者名/発表者名: Dryselius, R., et. al.
  • 雑誌名: Res.Microbiol. 158 ページ: 479-486
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] The entire organization of transcription unites on the Bacillus subtilis genome (2007)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi, H., et. al.
  • 雑誌名: BMC Genomics 8 ページ: 197-201
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Analysis of invariant sequences in 266 complete genomes (2007)
  • 著者名/発表者名: Goto, N., et. al.
  • 雑誌名: Gene 401 ページ: 172-180
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] 微生物における比較ゲノム研究の進展 (2007)
  • 著者名/発表者名: 林 哲也
  • 雑誌名: 実験医学 25(2) ページ: 266-272
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] ヒト腸内細菌叢のゲノムシークエンス (2007)
  • 著者名/発表者名: 服部 正平, 他
  • 雑誌名: 腸内細菌学雑誌 21(3) ページ: 187-197
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] メタゲノミクスのバイオインフォマティクス (2007)
  • 著者名/発表者名: 黒川 顕
  • 雑誌名: 化学と生物 45 ページ: 495-501
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Comparative genomics : genome configuration and the driving forces in the evolution of vibrios (2007)
  • 著者名/発表者名: Iida, T., Kurokawa, K
  • 雑誌名: Clin. Microbiol. Infect 13 ページ: 48-54
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] RNA polymerase b-subunit gene(rpoB) sequence analysis for the identification of Bacteroides spp (2007)
  • 著者名/発表者名: Ko, K.S., Kuwahara, T., Haehwa, L., Yoon, Y.J., Kim, B.J., Lee, H. K, Ohnishi, Y., Kook, Y.H
  • 雑誌名: Infect. Immun 75(2) ページ: 604-612
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] TccP2 of O1 57 : H7 and non-O157 enterohemorrhagic Escherichia coli(EHEC) : challenging the dogma of EHEC-induced actin p ol ymeri zati on (2007)
  • 著者名/発表者名: Ogura, Y., Ooka, T., Whale, A., Garmendia, J., Beutin, L., Tennant, S., Krause, G., Morabito, S., Chinen, I., Tobe, T., Abe, H., Tozzoli, R., Caprioli, A., Rivas, M., Browne, R. R., Hayashi, T., Frankel, G
  • 雑誌名: FEMS Microbiol. Lett 271 ページ: 126-135
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Characterization of tccP2 carried by atypical enteropathogenic Escherichia coli (2007)
  • 著者名/発表者名: Ooka, T., Vieira, MA., Ogura, Y., Beutin, L., Ragione, R. L., van Diemen, P. M., Stevens, M. P., I., Aktan, S., Cawthraw, Best, A., Hemandes, R. T., Krause, G., Gomes, T. A. T, Hayashi, T., Frankel, G
  • 雑誌名: Microbiology 153 ページ: 1743-1755
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] TccP2-mediated subversion of actin dynamics by EPEC 2 - a distinct evolutionary lineage of enteropathogenic Escherichia coli. (2007)
  • 著者名/発表者名: Whale, A., Hernandes, RT., Ooka, T., Krause, G., Schuller, S., Garmendia, J., Crowther, L., Vieira, MA., Ogura, Y., Phillips, AD., Beutin, L., Gomes, TA., Hayashi, T., Frankel, G
  • 雑誌名: Microbes Environ 22(3) ページ: 214-222
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] An improved DNA isolation method for metagenomic analysis of the microbial flora of the human intestine (2007)
  • 著者名/発表者名: Morita, H., Kuwahara, X., Okushima, K., Sasamoto, H., Itoh, K., Hattori, M., Hayashi, X., Takami, H
  • 雑誌名: Genome Biol 8(7)
  • NAID: 110006379878
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Extensive genomic diversity and selective conservation of virulence-determinants in enterohaemorrhagic Escherichia coli strains of O157 and non-O157 serotypes (2007)
  • 著者名/発表者名: Ogura, Y., Ooka Asadulghani., A., Terajima, J, Nougayrede, J-R., Kurokawa, K., Tashiro, K., Tobe, T., Nakayama, K., Kuhara, S., Oswald, E., Watanabe, H., Hayashi, T
  • 雑誌名: DNARes 14 ページ: 155-168
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Distribution of stable DnaA-binding sites on the Bacillus Subtilis genome detected using a modified ChIP-chip method (2007)
  • 著者名/発表者名: Ishikawa, S., Ogura, Y., Yoshimura, M., Okumura, H., Cho, E., Kawai, Y., Kurokawa, K., Oshima, T., Ogasawara, N
  • 雑誌名: DNA Res 14 ページ: 169-181
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Comparative metagenomics revealed commonly enriched gene sets in human gut microbiomes (2007)
  • 著者名/発表者名: Kurokawa, K., Itoh, T., Kuwahara, T., Oshima, K., Toh, H., Toyoda, A., Takami, H., Morita, H., Sharma, VK., Srivastava, TR, Taylor, TD., Noguchi, D., Mori, H., Ogura, Y., Ehrlich, DS., Itoh, K., Takagi, T., Sakaki, Y., Hayashi, T., Hattori, M
  • 雑誌名: Anaerobe 13 ページ: 220-227
  • NAID: 120007121875
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Inhibitory effects of fermented brown rice on induction of acute colitis by dextran sulfate sodium in rats (2007)
  • 著者名/発表者名: Kataoka, K., Ogasa, S., Kuwahara, T., Bando, Y., Hagiwara, M., Arimochi, H., Nakanishi, S., Iwasaki, T., Ohnishi, Y
  • 雑誌名: Dig. Dis. Sci (in press)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Vibrionaceae versatile bacterial family with evolutionary conserved variability (2007)
  • 著者名/発表者名: Dryselius, R., Kurokawa, K., Iida, T.
  • 雑誌名: Res. Microbiol 158 ページ: 479-486
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] The entire organization of transcription unites on the Bacillus subtilis genome (2007)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi, H., Akitomi, J., Fujii, N., Kobayashi, K, Amin, M.A., Kurokawa, K., Ogasawara, N., Kanaya, S
  • 雑誌名: BMC Genomics 8 ページ: 197-201
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Analysis of invariant sequences in 266 complete genomes (2007)
  • 著者名/発表者名: Goto, N., Kurokawa, K., Yasunaga, T
  • 雑誌名: Gene 401 ページ: 172-180
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Genomic vievv on the evolution of enterohemorrhagic Escherichia coli (2007)
  • 著者名/発表者名: Hayashi, T., Ooka, T., Ogura, Y., Asadulghani
  • 雑誌名: Evolutionary Biology of Bacterialand Fungal Pathogens ページ: 407-419
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] TccP2 of O157: H7 and non-O157 enterohemorrhagic Escherichia coli (EHEC): challenging the dogma of EHEC-induced actin olymerization (2007)
  • 著者名/発表者名: Ogura Y., et. al.
  • 雑誌名: Infect. Immun 75(2) ページ: 604-612
  • 査読あり
• [雑誌論文] Characterization of tccP2 carried by atypical enteropathogenic Escherichia coli. (2007)
  • 著者名/発表者名: Ooka T., et. al.
  • 雑誌名: FEMS Microbiol. Lett 271 ページ: 126-135
  • 査読あり
• [雑誌論文] TbcP2-mediated subversion of actin dynamics by EPEC 2-a distinct evolutionary lineage of enteropathogenic Escherichia coli (2007)
  • 著者名/発表者名: Whale A., et. al.
  • 雑誌名: Microbiology 153 ページ: 1743-1755
  • 査読あり
• [雑誌論文] Distribution of stable DnaA-bindingd sites on the Bacillus Subtilis genome detected using a modified ChIP-chip method. (2007)
  • 著者名/発表者名: Ishikawa S., et. al.
  • 雑誌名: DNA Res. 14 ページ: 155-168
  • 査読あり
• [雑誌論文] Comparative metagenomics revealed commonly enriched gene sets in human gut microbiomes. (2007)
  • 著者名/発表者名: Kurokawa K., et. al.
  • 雑誌名: DNA Res. 14 ページ: 169-181
  • 査読あり
• [雑誌論文] Modifying effects of fermented brown rice on fecal microbiota in rats (2007)
  • 著者名/発表者名: Kataoka K., et. al.
  • 雑誌名: Anaerobe 13 ページ: 220-227
  • 査読あり
• [雑誌論文] Vibrionaceae; versatile bacterial family with evolutionary conserved variability. (2007)
  • 著者名/発表者名: Dryselius, R., et. al.
  • 雑誌名: Res. Microbiol. 158 ページ: 479-486
  • 査読あり
• [雑誌論文] The entire organization of transcription unites on the Bacillus subtilisgenome. (2007)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi, H., et. al.
  • 雑誌名: BMC Genomics 8 ページ: 197-201
  • 査読あり
• [雑誌論文] Analysis of invariant sequences in 266 complete genomes. (2007)
  • 著者名/発表者名: Goto, N., et. al.
  • 雑誌名: Gene, 401 ページ: 172-180
  • 査読あり
• [雑誌論文] 微生物における比較ゲノム研究の進展 (2007)
  • 著者名/発表者名: 林哲也
  • 雑誌名: 実験医学 25(2) ページ: 266-272
• [雑誌論文] ヒト腸内細菌叢のゲノムシークエンス (2007)
  • 著者名/発表者名: 服部正平、他
  • 雑誌名: 腸内細菌学雑誌 21(3) ページ: 187-197
• [雑誌論文] メタゲノミクスのバイオインフォマティクス (2007)
  • 著者名/発表者名: 黒川顕
  • 雑誌名: 化学と生物 45 ページ: 495-501
• [雑誌論文] RNA polymerase b-subunit gene (rpoB) sequence analysis for the identification of Bacteroides spp (2007)
  • 著者名/発表者名: K.S.Ko, et al.
  • 雑誌名: Clin. Microbiol. Infect. 13 ページ: 48-54
• [雑誌論文] TccP2 of O157 : H7 and non-O157 enterohemorrhagic Escherichia coli (EHEC) : challenging the dogma of EHEC-induced actin polymerization. (2007)
  • 著者名/発表者名: Y.Ogura, et al.
  • 雑誌名: Infect. Immun. 75(2) ページ: 604-612
• [雑誌論文] Breaking the barrier between commensalism and pathogenicity (2006)
  • 著者名/発表者名: Hayashi T.
  • 雑誌名: Science 313 ページ: 772-773
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] An extensive repertoire of type III secretion effectors in Escherichia coli o157 and the role of lambdoid phages in their dissemination (2006)
  • 著者名/発表者名: Tobe T., et. al.
  • 雑誌名: Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 103 ページ: 14941-14946
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] ppGpp with DksA controls gene expression in the LEE pathogenicity island of enterohaemorrhagic Escherichia coli through activation of two virulence regulatory genes (2006)
  • 著者名/発表者名: Nakanishi N., et. al.
  • 雑誌名: Mol.Microbiol. 61(1) ページ: 194-205
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Complexity of the genomic diversity of enterohaemorrhagic Escherichia coli o157 revealed by the combinational use of the o157 Sakai oligo DNA microarray and the Whole Genome PCR Scanning (2006)
  • 著者名/発表者名: Ogura Y., et. al.
  • 雑誌名: DNA Res. 13 ページ: 3-14
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Suppressive effect of Clostridium perfringens-produced heat-stable substance(s)on proliferation of human colon adenocarcinoma HT29 cells in culture (2006)
  • 著者名/発表者名: Arimochi H., et. al.
  • 雑誌名: Cancer Letter 75(2) ページ: 228-234
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Prediction of protein functions based on protein-protein interaction networks: A min-cut approach (2006)
  • 著者名/発表者名: Altaf-Ul-Amin, et. al.
  • 雑誌名: BMC Bioinfo. 7 ページ: 207-220
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Sperical SOM and arrangement of neurons using herix on sphere (2006)
  • 著者名/発表者名: Nishio H., et. al.
  • 雑誌名: IPSJ Transactions on Mathematical Modeling and Its Applications 47 ページ: 56-60
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] PimE is a polyprenol-phosphate-mannose-dependent mannosyltransferase that transfers the fifth mannose of phosphatidylinositol mannoside in Mycobacteria (2006)
  • 著者名/発表者名: Morita Y., et. al.
  • 雑誌名: J.Biol.Chem. 281 ページ: 25143-25155
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Bioinformatics tool for genomic era; A step towards the in silico experiments-focused on molecular cloning (2006)
  • 著者名/発表者名: Ohyama A., et. al.
  • 雑誌名: J.Comp.Aid.Chem. 102-115 ページ: 102-115
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Elucidating conservation of genes in multiple genomes based on graphs configured by bidirectional best-hit relationships (2006)
  • 著者名/発表者名: Maeno H., et. al.
  • 雑誌名: Trans.Bioinformat. 47 ページ: 1-11
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Comparison of protein complexes predicted from PPI networks by DPClus and Newman clustering algorithms (2006)
  • 著者名/発表者名: Tuji H., et. al.
  • 雑誌名: Trans.Bioinformat. 47 ページ: 31-41
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Escherichia coli histone-like protein H-NS preferentially binds to horizontally acquired DNA in association with RNA polymerase (2006)
  • 著者名/発表者名: Oshima T., et. al.
  • 雑誌名: DNA Res. 13 ページ: 141-153
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] DPCIus:A density-periphery based graph clustering software mainly focused on detection of protein complexes in interaction networks.Polymerization (2006)
  • 著者名/発表者名: Altaf-Ul-Amin, et. al.
  • 雑誌名: J.Comp.Aid.Chem. 7 ページ: 150-156
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] ヒト常在菌を含む環境細菌叢のメタゲノム解析 (2006)
  • 著者名/発表者名: 林哲也, 服部正平
  • 雑誌名: 細胞工学 25(7) ページ: 812-816
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Complexity of the genomic diversity of enterohaemorrhagic Escherichia coli O157 revealed by the combinational use of the O157 Sakai oligo DNA microarray and the Whole Genome PCR Scanning (2006)
  • 著者名/発表者名: Ogura, Y., Kurokawa, K., Ooka, T., Tashiro, K., Tobe, T., Ohnishi, M., Nakayama, K., Morimoto, T., Terajima, J., Watanabe, H., Kuhara, S., Hayashi, T
  • 雑誌名: DNA Res 13 ページ: 3-14
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] ppGpp with DksA controls gene expression in the LEE pathogenicity island of enterohaemorrhagic Escherichia coli through activation of two virulence regulatory genes (2006)
  • 著者名/発表者名: Nakanishi, N., Abe, H., Ogura, Y., Hayashi, T., Tashiro, K., Kuhara, S., Sugimoto, N., Tobe, T
  • 雑誌名: Mol. Microbiol 61(1) ページ: 194-205
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] An extensive repertoire of type III secretion effectors in Escherichia coli 0157 and the role of lambdoid phages in their dissemination (2006)
  • 著者名/発表者名: Tobe, T., Beatson, S. A., Taniguchi, H., Abe, H., Bailey, C. M, Fivian, A., Younis, R., Matthews, S., Marches, O., Frankel, G., Hayashi, T., Pallen, M. J
  • 雑誌名: Proc. Natl. Acad. Sci. USA 103 ページ: 14941-14946
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Breaking the barrier between commensalism and pathogeni city (2006)
  • 著者名/発表者名: Hayashi, T
  • 雑誌名: Science 313 ページ: 772-773
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Suppressive effect of Clostridium perfringens-produced heat-stable substance(s) on proliferation of human colon adenocarcinoma HT29 cells in culture (2006)
  • 著者名/発表者名: Arimochi, H., Morita, K., Kataoka, K., Nakanishi, S., Kuwahara, T., Ohnishi, Y
  • 雑誌名: Cancer Letter 241 ページ: 228-34
  • NAID: 10019924742
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Prediction of protein functions based on protein-protein interaction networks : A min-cut approach (2006)
  • 著者名/発表者名: Altaf-Ul-Amin, M., Koma, T., Kurokawa, K., Kanaya, S
  • 雑誌名: BMC Bioinfo 7 ページ: 207-220
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Sperical SOM and arrangement of neurons using herix on sphere (2006)
  • 著者名/発表者名: Nishio, H., Altaf-Ul-Amin, M., Kurokawa, K., Kanaya, S
  • 雑誌名: IPSJ Transactions on Mathematical Modeling and Its Applications 47, 14 ページ: 56-60
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] PimE is a polyprenol-phosphate-mannose-dependent mannosyltransferase that transfers the fifth mannose of phosphatidylinositol mannoside in Mycobacteria (2006)
  • 著者名/発表者名: Morita, Y., Sena, C., Waller, R., Kurokawa, K., Semee, M., Nakatani, F., Haites, R., Billman-Jacobe, H., McConville, M., Maeda, Y., Kinoshita, T
  • 雑誌名: J. Biol. Chem. 281 ページ: 25143-25155
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Bioinformatics tool for genomic era ; A step towards the in silico experiments - focused on molecular cloning (2006)
  • 著者名/発表者名: Ohyama, A., Kurokawa, K., Enai, K., Saitoh, H., Kanaya, S., Altaf-Ul-Amin, M., Ogasawara, N
  • 雑誌名: J. Comp. Aid. Chem 7 ページ: 102-115
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Elucidating conservation of genes in multiple genomes based on graphs con figured by bidirectional best-hit relationships (2006)
  • 著者名/発表者名: Maeno, H., Altaf-Ul-Amin, M., Shinbo, Y., Kurokawa, K., Ogasawara, N., Kanaya, S
  • 雑誌名: Trans. Bioinformat 47 ページ: 1-11
  • NAID: 110004862622
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Comparison of protein complexes predicted from PPI networks by DPClus and Newman clustering algorithms (2006)
  • 著者名/発表者名: Tuji, H., Altaf-Ul-Amin, M., Arita, M., Nishio, H., Shinbo, Y., Kurokawa, K., Kanaya, S
  • 雑誌名: Trans. Bioinformat 47 ページ: 31-41
  • NAID: 110004862625
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Escherichia coli histone-like protein H-NS preferentially binds to horizontally acquired DNA in association with RNA polymerase (2006)
  • 著者名/発表者名: Oshima, T., Ishikawa, S., Kurokawa, K., Aiba, H., Ogasawara, N
  • 雑誌名: J. Comp. Aid. Chem 7 ページ: 150-156
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] DPClus : A density-periphery based graph clustering software mainly focused on detection of protein complexes in interaction networks (2006)
  • 著者名/発表者名: Altaf-Ul-Amin, M., Tuji, H., Kurokawa, K., Asahi, H., Shnbo, Y., Kanaya, S
  • 雑誌名: The Biology of Vibrios (ASM press)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Modifying effects of fermented brown rice on fecal microbiota in rats (2006)
  • 著者名/発表者名: Kataoka, K., Kibe, R., Kuwahara, T., Hagiwara, M., Arimochi, H., Iwasaki, T., Benno, Y., Ohnishi, Y
  • 雑誌名: DNARes 13 ページ: 141-153
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Breaking the barrier between commensalism and pathogenicity. (2006)
  • 著者名/発表者名: T.Hayashi.
  • 雑誌名: Science 313 ページ: 772-773
• [雑誌論文] An extensive repertoire of type III secretion effectors in Escherichia coli O157 and the role of lambdoid phages in their dessemination. (2006)
  • 著者名/発表者名: T.Tobe, et al.
  • 雑誌名: Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 103 ページ: 14941-14946
• [雑誌論文] ppGpp with DksA controls gene expression in the LEE pathogenicity island of enterohaemorrhagic Escherichia coli through activation of two virulence regulatory genes. (2006)
  • 著者名/発表者名: N.Nakanishi, et al.
  • 雑誌名: Mol. Microbiol. 61(1) ページ: 194-205
• [雑誌論文] Complexity of the genomic diversity of enterohaemorrhagic Escherichia coli O157 revealed by the combinational use of the O157 Sakai oligo DNA microarray and the Whole Genome PCR Scanning. (2006)
  • 著者名/発表者名: Y.Ogura, et al.
  • 雑誌名: DNA Res. 13 ページ: 3-14
• [雑誌論文] Suppressive effect of Clostridium perfringens-produced heat-stable substance(s) on proliferation of colon adenocarcinoma HT29 cells in culture. (2006)
  • 著者名/発表者名: H.Arimochi, et al.
  • 雑誌名: Cancer Letter 75(2) ページ: 228-234
• [雑誌論文] Prediction of protein functions based on protein-protein interaction networks : A min-cut approach. (2006)
  • 著者名/発表者名: Altaf-Ul-Amin, et al.
  • 雑誌名: BMC Bioinfo. 7 ページ: 207-220
• [雑誌論文] Sperical SOM and arrangement of neurons using herix on sphere.. (2006)
  • 著者名/発表者名: H.Nishio, st al.
  • 雑誌名: IPSJ Transactions on Mathematical Modeling and Ist Applications. 47 ページ: 56-60
• [雑誌論文] PimE is a polyprenol-phosphate-mannose-dependent mannosyltransferase that transfers the fifth mannose of phosphatidylinositol mannoside in Mycobacteria. (2006)
  • 著者名/発表者名: Y.Morita, et al.
  • 雑誌名: J. Biol. Chem. 281 ページ: 25143-25155
• [雑誌論文] Bioinfomatics tool for genomic era; A step towards the in silico experiments - focused on molecular cloning. (2006)
  • 著者名/発表者名: A.Ohyama, et al.
  • 雑誌名: J. Comp. Aid. Che. 7 ページ: 102-115
• [雑誌論文] Elucidating conservation of genes in multiple genomes based on graphs configured by bidirectional best-hit relationships. (2006)
  • 著者名/発表者名: H.Maeno, et al.
  • 雑誌名: Trans. Bioinformat. 47 ページ: 1-11
• [雑誌論文] Comparison of protein complexes predicted from PPI networks by DPClus and Newman clustering algorithms. (2006)
  • 著者名/発表者名: H.Tuji, et al.
  • 雑誌名: Trans. Bioinformat. 47 ページ: 31-41
• [雑誌論文] Escherichia coli histone-like protein H-NS preferentially binds to horizontally acquired DNA in association with RNA polymerase. (2006)
  • 著者名/発表者名: T.Oshima, et al.
  • 雑誌名: DNA Res. 13 ページ: 141-153
• [雑誌論文] DPClus : A density-periphery based graph clustering software mainly focused on detection of protein complexes in interaction networks. (2006)
  • 著者名/発表者名: Altaf-Ul-Amin, et al.
  • 雑誌名: J. Comp. Aid. Chem. 7 ページ: 150-156
• [雑誌論文] ヒト常在菌を含む環境細菌叢のメタゲノム解析. (2006)
  • 著者名/発表者名: 林哲也, 服部正平
  • 雑誌名: 細胞工学 25(7) ページ: 812-816
• [雑誌論文] Inhibitory effects of fermented brown rice on induction of acute colitis by dextran sulfate sodium in rats
  • 著者名/発表者名: Kataoka, K., et. al.
  • 雑誌名: Dig.Dis.Sci.
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Inhibitory effects of fermented brown rice on induction of acute colitis by dextran sulfate sodium in rats.
  • 著者名/発表者名: Kataoka K., et. al.
  • 雑誌名: Dig. Dis. Sci. (in press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Characterization of tccP2 carried by atypical enteropathogenic Escherichia coli.
  • 著者名/発表者名: T.Ooka, et al.
  • 雑誌名: FEMS Microbiol. Lett. (in press)
• [雑誌論文] TccP2-mediated subversion of actin dynamics by EPEC2-a distinct evolutionary lineage of enteropathogenic Escherichia coli.
  • 著者名/発表者名: A.Whale, et al.
  • 雑誌名: Microbiology (in press)
• [雑誌論文] An improved DNA isolation method for metagenomic analysis of the microbial flora of the human intestine.
  • 著者名/発表者名: M.Hidetoshi, et al.
  • 雑誌名: Microbes and Environments (in press)
• [学会発表] Comparative genomics of O157 and non-O157 enterohemorrhagic Escherichia coli (2008)
  • 著者名/発表者名: Hayashi T.
  • 学会等名: Invited Seminar(The Wellcome Trust Sanger Institute)
  • 発表場所: Cambridge,UK
  • 年月日: 2008-03-17
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] Comparative genomics of O157 and non-O157 enterohemorrhagic Escherichia coli. (2008)
  • 著者名/発表者名: Hayashi T.
  • 学会等名: Invited Seminar (The Wellcome Trust Sanger Institute)
  • 発表場所: Cambridge, UK
  • 年月日: 2008-03-17
• [学会発表] Comparative genomics of O157 and non-O157 enterohemorrhagic Escherichia coli (2008)
  • 著者名/発表者名: Hayashi T.(Invited Speaker)
  • 学会等名: The 24th RIB International Symposium on The Frontier of Microbiology -Resouces, Environment, and Genome
  • 発表場所: Okayama
  • 年月日: 2008-01-25
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] Comparative genomics of O157 and non-O157 enterohemorrhagic Escherichia coli (2008)
  • 著者名/発表者名: Hayashi T. (Invited Speaker)
  • 学会等名: The 24th RIB International Symposium on The Frontier of Microbiology-Resouces, Environment, and Genome-
  • 発表場所: Okayama
  • 年月日: 2008-01-25
• [学会発表] 腸管出血性大腸菌(O26,O111,O103)の全ゲノム解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 小椋 義俊, その他
  • 学会等名: 第2回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 大阪
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] オリエンチア・ツツガムシ株間における比較ゲノム解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 中山 恵介, その他
  • 学会等名: 第2回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 大阪
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] 大腸菌における0抗原をコードする領域の組換え過程の解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 井口 純, その他
  • 学会等名: 第2回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 大阪
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] 腸営団血性大腸菌Ol57の小規模ゲノム構造多型の形成機i構に関する詳細な解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 大岡 唯祐, その他
  • 学会等名: 第2回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 大阪
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] A genome-wide survey on phage induction and propagation revealed defective prophages spread virulence determinants from Sakai prophage pool (2008)
  • 著者名/発表者名: Asadulghani, et. al.
  • 学会等名: 第2回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 大阪
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] 腸管出血性大腸菌の病原性制御因子による遺伝子発現制御機構 (2008)
  • 著者名/発表者名: 戸辺 亨, その他
  • 学会等名: 第2回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 大阪
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] Porphyromonas gingivalis のtransposable elementsの解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 内藤 真理子, その他
  • 学会等名: 第2回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 大阪
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] ヒト腸内常在大腸菌のゲノム解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 藤 英博, その他
  • 学会等名: 第2回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 大阪
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] ヒト腸内細菌叢のメタゲノム解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 林 哲也(シンポジスト)
  • 学会等名: 第81回日本細菌学会総会
  • 発表場所: 京都
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] 腸管出血性大腸菌の進化におけるファージの役割 (2008)
  • 著者名/発表者名: 小椋 義俊(シンポジスト)
  • 学会等名: 第81回日本細菌学会総会
  • 発表場所: 京都
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] オリエンチア・ツツガムシ株間における比較ゲノム解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 中山 恵介, その他
  • 学会等名: 第81回日本細菌学会総会
  • 発表場所: 京都
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] ウシの趾乳頭腫症病変組織から分離されたTreponema phagedenis近縁種の分子系統解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 山崎 和子, その他
  • 学会等名: 第81回日本細菌学会総会
  • 発表場所: 京都
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] EPEC O55:H7株の溶血活性 (2008)
  • 著者名/発表者名: 村瀬 一典, その他
  • 学会等名: 第81回日本細菌学会総会
  • 発表場所: 京都
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] 大腸菌における0抗原をコードする領域の組換え過程 (2008)
  • 著者名/発表者名: 井口 純, その他
  • 学会等名: 第81回日本細菌学会総会
  • 発表場所: 京都
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] 腸管出血性大腸菌O157の小規模ゲノム構造多型に関する詳細な解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 大岡 唯祐, その他
  • 学会等名: 第81回日本細菌学会総会
  • 発表場所: 京都
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] Lateral transfer of virulence or related genes by defective prophages of Sakai prophage pool (2008)
  • 著者名/発表者名: Asadulghani, et. al.
  • 学会等名: 第81回日本細菌学会総会
  • 発表場所: 京都
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] OspEファミリータンパク質による感染宿主細胞のRhoAシグナル伝達系の制御 (2008)
  • 著者名/発表者名: 三浦 雅史, その他
  • 学会等名: 第81回日本細菌学会総会
  • 発表場所: 京都
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] C型とD型ボツリヌスC2毒素遺伝子をコードするプラスミドの解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 阪口 義彦, その他
  • 学会等名: 第81回日本細菌学会総会
  • 発表場所: 京都
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] 腸管出血性大腸菌の病原性発現調節における核様体構造の役割 (2008)
  • 著者名/発表者名: 戸辺 亨, その他
  • 学会等名: 第81回日本細菌学会総会
  • 発表場所: 京都
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] ウシ趾乳頭腫症病変部より分離されたトレポネーマ分離株の性状および遺伝子型について (2008)
  • 著者名/発表者名: 矢野 貴久, その他
  • 学会等名: 第81回日本細菌学会総会
  • 発表場所: 京都
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] Bacteroides fragilisのSusC/D shuMonにおける多重逆位を制御する部位特異的組換え酵素の同定 (2008)
  • 著者名/発表者名: 今大路 治之, その他
  • 学会等名: 第81回日本細菌学会総会
  • 発表場所: 京都
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] 発酵玄米の摂取が腸内菌叢及び腸内環境におよぼす影響 (2008)
  • 著者名/発表者名: 井形 和枝, その他
  • 学会等名: 第81回日本細菌学会総会
  • 発表場所: 京都
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] 腸管病原性ウェルシュ菌の遺伝学的特徴 (2008)
  • 著者名/発表者名: 出口 安芸, その他
  • 学会等名: 第81回日本細菌学会総会
  • 発表場所: 京都
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] Comparative genomics of O157 and non-O157 enterohemorrhagic Escherichia coli. (2008)
  • 著者名/発表者名: Hayashi, T
  • 学会等名: The 24th RIB International Symposium on The Frontier of Microbiology -Resouces, Environment, and Genome-
  • 発表場所: Okayama(Invited Speaker)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Comparative genomics of O157 and non-O157 enterohemorrhagic Escherichia coli (2008)
  • 著者名/発表者名: Hayashi, T
  • 学会等名: Invited Seminar(The Wellcome Trust Sanger Institute)
  • 発表場所: Cambridge, UK
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] 大腸菌におけるO抗原をコードする領域の組換え過程の解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 井口純、その他
  • 学会等名: 第2回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 大阪
• [学会発表] 腸管出血性大腸菌O157の小規模ゲノム構造多型の形成機構に関する詳細な解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 大岡唯祐, その他
  • 学会等名: 第2回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 大阪
• [学会発表] A genome-wide survey on phage induction and propagation revealed defective prophages spread virulence determinants from Sakaiprophage pool. (2008)
  • 著者名/発表者名: Asadulghani, et. al.
  • 学会等名: 第2回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 大阪
• [学会発表] 大腸菌におけるO抗原をコードする領域の組換え過程 (2008)
  • 著者名/発表者名: 井口純, その他
  • 学会等名: 第81回日本細菌学会総会
  • 発表場所: 京都
• [学会発表] Bacteroides fragilisのsus C/D shufflonにおける多重逆位を制御する部位特異的組換え酵素の同定 (2008)
  • 著者名/発表者名: 今大路治之、その他
  • 学会等名: 第81回日本細菌学会総会
  • 発表場所: 京都
• [学会発表] 発酵玄米の摂取が腸内菌叢及び腸内環境におよぼす影響. (2008)
  • 著者名/発表者名: 井形和枝、その他
  • 学会等名: 第81回日本細菌学会総会
  • 発表場所: 京都
• [学会発表] メタゲノムインフォマティクス (2007)
  • 著者名/発表者名: 黒川 顕
  • 学会等名: 第2回放射線防御研究センターシンポジウム
  • 発表場所: 千葉
  • 年月日: 2007-12-18
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] Comparative metagenomics revealed commonly enriched gene sets in human gut microbiomes (2007)
  • 著者名/発表者名: Kuwahara, T., et. al.
  • 学会等名: The 7th International Workshop on Advanced Genomics
  • 発表場所: Tokyo
  • 年月日: 2007-11-27
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] ヒト腸内フローラのメタゲノム解析 (2007)
  • 著者名/発表者名: 黒川 顕
  • 学会等名: 新化学発展協会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2007-10-23
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] 病原性大腸菌O157-ゲノム解析から見た病原細菌の多様性と適応戦略 (2007)
  • 著者名/発表者名: 林 哲也(シンポジスト)
  • 学会等名: 日本生物科学研究所創立60周年記念シンポジウム「新興・再興するヒトと動物の共通感染症-その現状と対策を探る」
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2007-10-02
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] 病原性大腸菌Ol57-ゲノム解析から見た病原細菌の多様性と適応戦略 (2007)
  • 著者名/発表者名: 林哲也(シンポジスト)
  • 学会等名: 日本生物科学研究所 創立60周年記念シンポジウム「新興・再興するヒトと動物の共通感染症-その現状と対策を探る」
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2007-10-02
• [学会発表] ヒト腸内フローラのメタゲノム解析 (2007)
  • 著者名/発表者名: 黒川 顕
  • 学会等名: 日本乳酸菌学会
  • 発表場所: 相模原
  • 年月日: 2007-07-05
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] Metagenomics of microbial community in human intestine (2007)
  • 著者名/発表者名: Kurokawa, K., et. al.
  • 学会等名: The Biology of Genomes
  • 発表場所: Cold Spring Harbor Laboratory,NY,U.S.A
  • 年月日: 2007-05-07
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] Metagenomics of microbial community in human intestine (2007)
  • 著者名/発表者名: Kurokawa, K., et. al.
  • 学会等名: The Biology of Genomes
  • 発表場所: Cold Spring Harbor Laboratory, NY, U.S.A
  • 年月日: 2007-05-07
• [学会発表] ゲノム解析からメタゲノム解析へ (2007)
  • 著者名/発表者名: 黒川 顕
  • 学会等名: 第3回アグリバイオインフォマティクスシンポジウム
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2007-03-19
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] Phage induction and inter-prophage interaction in the prophage pool of an enterohemorrhagic Escherichia coli O157:H7 genome (2007)
  • 著者名/発表者名: Asadulghani, et. al.
  • 学会等名: 第1回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 木更津
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] 腸管出血性大腸菌ゲノムの比較解析 (2007)
  • 著者名/発表者名: 小椋 義俊, その他
  • 学会等名: 第1回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 木更津
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] 多系統大腸菌に分布する055抗原合成オペロンの解析 (2007)
  • 著者名/発表者名: 井口 純、その他
  • 学会等名: 第1回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 木更津
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] ウシの趾乳頭腫症(PDD)起因菌の解析 (2007)
  • 著者名/発表者名: 山崎 和子, その他
  • 学会等名: 第1回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 木更津
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] 病原性大腸菌におけるRTX様蛋白質の比較解析 (2007)
  • 著者名/発表者名: 村瀬 一典, その他
  • 学会等名: 第1回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 木更津
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] 病原性大腸菌における外来性因子による遺伝子発現制御 (2007)
  • 著者名/発表者名: 戸辺 亨, その他
  • 学会等名: 第1回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 木更津
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] ヒト腸内細菌叢のメタゲノム解析 (2007)
  • 著者名/発表者名: 服部 正平, その他
  • 学会等名: 第1回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 木更津
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] 草菌ゲノム上でのDnaA結合部位の分布 (2007)
  • 著者名/発表者名: 石川 周, その他
  • 学会等名: 第1回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 木更津
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] ヒト腸内常在大腸菌のゲノム解析 (2007)
  • 著者名/発表者名: 大島 健志朗, その他
  • 学会等名: 第1回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 木更津
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] Porphyromonas gingivalis ATCC33277株の全ゲノム塩基配列決定 (2007)
  • 著者名/発表者名: 内藤 真理子, その他
  • 学会等名: 第1回日本ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 木更津
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] ゲノム解析データから見た大腸菌の多様性と菌種内進化 (2007)
  • 著者名/発表者名: 林 哲也(ワークショップ)
  • 学会等名: 第80回日本細菌学会総会
  • 発表場所: 大阪
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] 腸管出血性大腸菌O157:H7のHI型分泌蛋白質NIeHによる免疫応答制御 (2007)
  • 著者名/発表者名: 安倍 裕順, その他(ワークショップ)
  • 学会等名: 第80回日本細菌学会総会
  • 発表場所: 大阪
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] 腸管出血性大腸菌の病原性転写調節因子LerおよびPchによる発現制御ネットワークの構築 (2007)
  • 著者名/発表者名: 戸辺 亨, その他(ワークショップ)
  • 学会等名: 第80回日本細菌学会総会
  • 発表場所: 大阪
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] Porphyromonas gingivalis ATCC33277株の全ゲノム塩基配列決定 (2007)
  • 著者名/発表者名: 内藤 真理子, その他
  • 学会等名: 第80回日本細菌学会総会
  • 発表場所: 大阪
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] 感染宿主細胞の形態維持に関与する病原性因子の機能解析 (2007)
  • 著者名/発表者名: 三浦 雅史, その他
  • 学会等名: 第80回日本細菌学会総会
  • 発表場所: 大阪
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] 大腸菌O55抗原合成オペロンの水平伝播について (2007)
  • 著者名/発表者名: 井口 純, その他
  • 学会等名: 第80回日本細菌学会総会
  • 発表場所: 大阪
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] non-O157EHECゲノムにおけるIS分布の解析 (2007)
  • 著者名/発表者名: 大岡 唯祐, その他
  • 学会等名: 第80回日本細菌学会総会
  • 発表場所: 大阪
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] Phage induction and prophage-prophage interaction in the prophage-po of of O157 Sakai genome (2007)
  • 著者名/発表者名: Asadulghani, et. al.
  • 学会等名: 第80回日本細菌学会総会
  • 発表場所: 大阪
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] EHEC O157とnon-O157 EHEC(O26,O111,O103)の比較ゲノム解析 (2007)
  • 著者名/発表者名: 小椋 義俊, その他
  • 学会等名: 第80回日本細菌学会総会
  • 発表場所: 大阪
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] 病原性大腸菌におけるRTX様蛋白質の解析 (2007)
  • 著者名/発表者名: 村瀬 一典, その他
  • 学会等名: 第80回日本細菌学会総会
  • 発表場所: 大阪
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] 宿主細胞の違いによるオリエンチア・ツツガムシの遺伝子発現パターンの変化 (2007)
  • 著者名/発表者名: 中山 恵介, その他
  • 学会等名: 第80回日本細菌学会総会
  • 発表場所: 大阪
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] C型とD型ボツリヌスC2毒素遺伝子をコードするプラスミドの解析 (2007)
  • 著者名/発表者名: 阪口 義彦, その他
  • 学会等名: 第80回日本細菌学会総会
  • 発表場所: 大阪
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] ウシの趾乳頭腫症(PDD)起因菌の解析 (2007)
  • 著者名/発表者名: 山崎 和子, その他
  • 学会等名: 第80回日本細菌学会総会
  • 発表場所: 大坂
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] 免疫磁気ビーズ法による牛趾乳頭腫症病変部からのTrePOIIemama菌の検出 (2007)
  • 著者名/発表者名: Kyaw Kyaw Moe、その他
  • 学会等名: 第80回日本細菌学会総会
  • 発表場所: 大阪
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] Baclerofdes fragilisのDNA逆位による外膜vesicle形成の制御 (2007)
  • 著者名/発表者名: 今大路 治之, その他
  • 学会等名: 第80回日本細菌学会総会
  • 発表場所: 大阪
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] Genomics of different enterohaemorrhagic E.coli serotypes (2007)
  • 著者名/発表者名: Hayashi, T.(Invited Speaker)
  • 学会等名: Genomics for Animal Health(E. coli and Salmonella workshop)
  • 発表場所: Utrecht
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] 大腸菌におけるO抗原合成遺伝子群を含む水平伝播領域の解析-O5からO157への入れ替わりと055の伝播について (2007)
  • 著者名/発表者名: 井口 純, 他
  • 学会等名: 第11回腸管出血性大腸院感染症シンポジウム
  • 発表場所: 安曇野
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] 病原性大腸菌におけるRTXの保有状況および溶血毒素としての可能性 (2007)
  • 著者名/発表者名: 村瀬 一典, 他
  • 学会等名: 第60回日本細菌学会九州支部総会
  • 発表場所: 長崎
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] 眼結膜由来のコリネバクテリウムにおけるフルオロキノロン耐性 (2007)
  • 著者名/発表者名: 桑原 知巳, 他
  • 学会等名: 第60回日本細菌学会中国・四国支部総会
  • 発表場所: 岡山
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] Bacteroides fragilisのsusC/D shufflonを制御するsite-specificrecombinaseの同定 (2007)
  • 著者名/発表者名: 今大路 治之, 他
  • 学会等名: 第60回日本細菌学会中国・四国支部総会
  • 発表場所: 岡山
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] ゲノム解読による生物学の変貌〜病原細菌の場合 (2007)
  • 著者名/発表者名: 林 哲也(招待講演)
  • 学会等名: 第1回ぜん虫研究会
  • 発表場所: 宮崎
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] Bacteroides fragilisにおける包括的作動性部位特異的組換え酵素による菌体表層構造の可変性 (2007)
  • 著者名/発表者名: 今大路 治之, 他
  • 学会等名: 第30回日本分子生物学会年会第80回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 横浜
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] Metagenomics of microbial community in human intestine (2007)
  • 著者名/発表者名: Kurokawa, K., Oshima, K., Toh, H., Toyoda, A., Itoh, T., Noguchi, H., Yamakura, K., Itoh, T., Kuwahara, H., Morita, H., Takami, T., Hayashi, G., Hattori, M
  • 学会等名: The Biology of Genomes
  • 発表場所: Cold Spring Harbor Laboratory, NY, U.S.
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Genomics of different enterohaemorrhagic E.coli serotyp es (2007)
  • 著者名/発表者名: Hayashi, T
  • 学会等名: Genomics for Animal Health(E. coli and Salmonella workshop)
  • 発表場所: Utrecht(Invited Speaker)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Comparative metagenomics revealed commonly enriched gene sets in human gut microbiomes (2007)
  • 著者名/発表者名: Kuwahara, T., Kurokawa, K., Itoh, T., Oshima, K., Toh, H., Toyoda, A., Takami, H., Morita, H., Sharma, V. K., Srivastava, T.P., Taylor, T. D., Noguchi, H., Mori, H., Ogura, Y., Ehrlich, D. S., Itoh, K., Takagi, T., Sakaki, Y., Hayashi, T., Hattori, M
  • 学会等名: The 7th International Workshop on Advanced Genomics
  • 発表場所: Tpkyo
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Genomics of different enterohaemorrhagic E. coli serotypes (2007)
  • 著者名/発表者名: Hayashi, T. (Invited Speaker)
  • 学会等名: Genomics for Animal Health (E. coli and Salmonella workshop)
  • 発表場所: Utrecht
• [学会発表] 大腸菌におけるO抗原合成遺伝子群を含む水平伝播領域の解析-O55からO157への入れ替わりとO55の伝播について. (2007)
  • 著者名/発表者名: 井口純、他
  • 学会等名: 第11回腸管出血性大腸院感染症シンポジウム
  • 発表場所: 安曇野
• [学会発表] Bacteroides fragilisのsus C/D shufflonを制御するsite-specific recombinaseの同定. (2007)
  • 著者名/発表者名: 今大路治之、他
  • 学会等名: 第60回日本細菌学会中国・四国支部総会
  • 発表場所: 岡山
• [学会発表] Bacteroides fragilisにおける包括的作動性部位特異的組換え酵素による菌体表層構造の可変性 (2007)
  • 著者名/発表者名: 今大路治之、他
  • 学会等名: 第30回日本分子生物学会年会第80回日本生化学会大会合同大会.
  • 発表場所: 横浜
• [学会発表] Genome analysis of O157 EHEC and non-O157 EHEC (2006)
  • 著者名/発表者名: Hayashi T.
  • 学会等名: A meeting of the working group on E.Coli in the frame of WP07(Functional Genome Analyses)of EADGENE.(Invited Speaker)
  • 発表場所: Paris
  • 年月日: 2006-09-29
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] Metagenomics of microbial community in human intestine (2006)
  • 著者名/発表者名: Kurokawa K., et. al.
  • 学会等名: The Biology of Genomes
  • 発表場所: Cold Spring Harbor Laboratory,NY,U.S
  • 年月日: 2006-05-11
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] Comparative genome analysis of O157 and non-O157 enterohemorrhagic Escherichia coli strains using the whole genome PCR scanning and the O157 oligoDNA microarray (2006)
  • 著者名/発表者名: Ogura, Y., et. al.
  • 学会等名: VTEC 2006 Melbourne(6th International Symposium on Shiga Toxin(Verocytotoxin)-Producing Escherichia coli Infections)
  • 発表場所: Melbourne
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] The mechanism of genomic diver E.coli O157:H7 (2006)
  • 著者名/発表者名: Ooka T., et. al.
  • 学会等名: VTEC 2006 Melbourne(6th International Symposium on Shiga Toxin(Verocytotoxin)-Producing Escherichia coli Infections)
  • 発表場所: Melbourne
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] Comparative genome analysis of non-O157 enterohemorrhagic Escherichia coli strains (2006)
  • 著者名/発表者名: Ogura, Y., et. al.
  • 学会等名: The 41<st>Joint Conference US-Japan Cooperative Medical Science Program Cholera Panel
  • 発表場所: Gifu
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] EHECゲノムの比較解析と全ゲノム解読の進捗状況 (2006)
  • 著者名/発表者名: 小椋 義俊(シンポジスト)
  • 学会等名: 第10回腸管出血性大腸菌感染症シンポジウム
  • 発表場所: 東京
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] 腸管出血性大腸菌0157のゲノム多様性獲得メカニズムの解析 (2006)
  • 著者名/発表者名: 大岡 唯祐, 他
  • 学会等名: 第10回腸管出血性大腸菌感染症シンポジウム
  • 発表場所: 東京
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] A genome-wide survey of prophage induction and evaluation of the potentially active nature of Sakai prophage genomes (2006)
  • 著者名/発表者名: Asadulghani, et. al.
  • 学会等名: 第59回日本細菌学会九州支部総会
  • 発表場所: 久留米
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] ゲノム解析から見えてきたこと (2006)
  • 著者名/発表者名: 林 哲也(シンポジスト)
  • 学会等名: 第27回日本食品微生物学会学術総会
  • 発表場所: 大阪
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] Bacteroides fragilisのDNA逆位による線毛様構造物の発現制御 (2006)
  • 著者名/発表者名: 今大路 治之, 他
  • 学会等名: 第59回日本細菌学会中国・四国支部総会
  • 発表場所: 宇部市
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] マイクロマニピュレーターを用いた難培養性細菌 (2006)
  • 著者名/発表者名: 桑原 知巳, 他
  • 学会等名: 第59回日本細菌学会中国・四国支部総会
  • 発表場所: 宇部市
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] Bacteroides fragilisの外膜vesicle形成におけるDNA逆位の関与 (2006)
  • 著者名/発表者名: 今大路 治之, 他
  • 学会等名: 日本分子生物学会2006フォーラム「分子生物学の未来」
  • 発表場所: 名古屋
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] IS分布を利用したマルチプレックスPCRによる0157簡易迅速菌株識別システムの開発 (2006)
  • 著者名/発表者名: 大岡 唯祐
  • 学会等名: 平成18年度九州微生物研究会総会
  • 発表場所: 福岡
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] Metagenomics of microbial community in human intestine (2006)
  • 著者名/発表者名: Kurokawa, K., Oshima, K., Toh, H., Toyoda, A., Itoh, T., Noguchi, H., Yamakura, K., Itoh, K., Kuwahara, T., Morita, H., Takami, H.,Hayashi', T., Hattori., T
  • 学会等名: The Biology of Genomes
  • 発表場所: Cold Spring Harbor Laboratory, NY,U.S.
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Genome analysis of O157 EHEC and non-O157 EHEC (2006)
  • 著者名/発表者名: Hayashi., T
  • 学会等名: A meeting of the working group on E. Coli in the frame of WP07(Functional Genome Analyses) of EADGENE
  • 発表場所: Paris(Invited Speaker)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Comparative genome analysis of O157 and non-O157 enterohemorrhagic Escherichia coli strains using the whole genome PCR scanning and the O157 oligoDNA microarray (2006)
  • 著者名/発表者名: Ogura, Y., Ooka, K., Kurokawa, K., Terajima, J., Nakayama, K., Watanabe, H., Tobe, T., Hayashi., T
  • 学会等名: VTEC 2006 Melbourne(6th International Symposium on Shiga Toxin(Verocyt otoxin)-Producing Escherichia coli Infections)
  • 発表場所: Melbourne
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] The mechanism of genomic diversification in Enterohemorrhagic E. coli O157 : H7 (2006)
  • 著者名/発表者名: Ooka, T, Ogura, Y., Nakayama, K., Kurokawa, K., Ohnishi, M., Terajima, J., Watanabe, H., Hayashi., T
  • 学会等名: VTEC 2006 Melbourne(6th International Symposium on Shiga Toxin(Verocyt otoxin) -Producing Escherichia coli Infections)
  • 発表場所: October, Melbourne.
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Comparative genome analysis of non-O157 enterohemorrhagic Escherichia coli strains (2006)
  • 著者名/発表者名: Ogura, Y., Ooka., T Asadulghani, Iguchi, A., Nakayama, K., Hayashi., T
  • 学会等名: The 41st Joint Conference US-Japan C oop erative Medical Science Program Cholera Panel
  • 発表場所: Gifu.
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [図書] 実験医学4月増刊号「バイオインフォマティクスツールの開発と生命研究への応用の最前線」 (2008)
  • 著者名/発表者名: 黒川顕、服部正平
  • 総ページ数: 226
  • 出版者: 羊土社,東京
• [図書] Evolutionary Biology of Bacterial and Fungal Pathogens (2007)
  • 著者名/発表者名: Hayashi T., et. al.
  • 総ページ数: 622
  • 出版者: ASM Press.Washington,D.C.
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [図書] 細胞工学別冊「比較ゲノム学から読み解く生命システム」 (2007)
  • 著者名/発表者名: 内山 郁夫, 林 哲也
  • 出版者: 秀潤社,東京
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [図書] 細胞工学別冊「比較ゲノム学から読み解く生命システム」 (2007)
  • 著者名/発表者名: 黒川 顕, 服部 正平
  • 出版者: 秀潤社,東京
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [図書] 薬学領域の病原微生物学・感染症学・化学療法学 (2007)
  • 著者名/発表者名: 林 哲也
  • 総ページ数: 575
  • 出版者: 広川書店
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [図書] バイオデータベースとウェブツールの手とり足とり活用法(改訂第2版) (2007)
  • 著者名/発表者名: 黒川 顕
  • 出版者: 羊土社
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [図書] 実験医学4月増刊号「バイオインフォマティクスツールの開発と生命研究への応用の最前線」 (2007)
  • 著者名/発表者名: 黒川 顕, 服部 正平
  • 出版者: 羊土社,東京
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [図書] Evolutionary Biology of Bacterial and Fungal Pathogens (2007)
  • 著者名/発表者名: Hayashi T., et. al.
  • 総ページ数: 622
  • 出版者: ASM Press. Washington, D.C.
• [図書] 細胞工学 別冊「比較ゲノム学から読み解く生命システム」 (2007)
  • 著者名/発表者名: 内山郁夫、林哲也
  • 総ページ数: 196
  • 出版者: 秀潤社,東京
• [図書] 細胞工学 別冊「比較ゲノム学から読み解く生命システム」 (2007)
  • 著者名/発表者名: 黒川顕、服部正平
  • 総ページ数: 196
  • 出版者: 秀潤社,東京
• [図書] 薬学領域の病原微生物学・感染症学・化学療法学 (2007)
  • 著者名/発表者名: 林哲也
  • 総ページ数: 575
  • 出版者: 廣川書店
• [図書] バイオデータベースとウェブツールの手とり足とり活用法(改訂第2版) (2007)
  • 著者名/発表者名: 黒川顕
  • 総ページ数: 254
  • 出版者: 羊土社
• [図書] The Biology of Vibrios (2006)
  • 著者名/発表者名: T. Iida, K. Kurokawa
  • 出版者: ASM Press.Washington,D.C.
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [図書] The Biology of Vibrios. (ASM Press) (2006)
  • 著者名/発表者名: T.Iida, K.Kurokawa
  • 出版者: Comparative genomics : the genome configuration and the driving forces in the evolution of vibrios.
• [産業財産権] 微生物の識別方法、及び該方法に使用するプライマー並びに識別キット (2006)
  • 発明者名: 大岡 唯祐, 林 哲也, 小椋 義俊, 中山 恵介, 黒川 顕, 寺嶋 淳, 渡辺 治雄
  • 権利者名: 大岡 唯祐, 林 哲也
  • 産業財産権番号: 2006-155279
  • 出願年月日: 2006-06-02
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [産業財産権] 微生物の識別方法、及び該方法に使用するプライマー並びに識別キット (2006)
  • 発明者名: 大岡 唯祐, 林 哲也, 小椋 義俊, 中山 恵介, 黒川 顕, 寺嶋 淳, 渡辺 治雄
  • 権利者名: 大岡 唯祐, 林 哲也
  • 産業財産権番号: 2006-155279
  • 取得年月日: 2006-06-13
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [産業財産権] 微生物の識別方法、及び該方法に使用するプライマー並びに識別キット (2006)
  • 発明者名: 大岡唯祐, 林哲也, 小椋義俊, 中山恵介, 黒川顕, 寺嶋淳, 渡邊治雄
  • 権利者名: 大岡唯祐, 林哲也
  • 産業財産権番号: 2006-155279
  • 出願年月日: 2006-06-02
  • 取得年月日: 2006-06-13