イネゲノムDNA変異の大規模解析

• 研究課題/領域番号: 18310136
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 応用ゲノム科学
• 研究機関: 財団法人岩手生物工学研究センター
• 研究代表者: 寺内 良平 財団法人岩手生物工学研究センター, 生命科学研究部, 研究部長 (50236981)
• 研究期間 (年度): 2006 – 2008
• 研究課題ステータス: 完了 (2008年度)
• 配分額: 17,730千円 (直接経費: 15,600千円、間接経費: 2,130千円); 2008年度: 5,460千円 (直接経費: 4,200千円、間接経費: 1,260千円); 2007年度: 3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円); 2006年度: 8,500千円 (直接経費: 8,500千円)
• キーワード: 遺伝学 / ゲノム / 植物 / 進化 / 育種学

研究概要

イネゲノムDNA 変異の大規模解析を実施した。イネ染色体上の22 箇所の領域、計26kb のDNA 配列を、栽培イネOryza sativa とその近縁野生種の30 系統について決定した。DNA 変異の系統解析の結果、日本型イネとインド型イネは、野生種O. rufipogon から独立に起原したことが明らかになった。さらに、品種「ひとめぼれ」において、5000 系統の突然変異系統群を作出した。「ササニシキ」突然変異系統を用いて、いもち病菌真性抵抗性遺伝子Pia を同定した。

研究成果

• [雑誌論文] Association genetics reveals three novel avirulence genes from the rice blast fungal pathogen Magnaportheoryzae (2009)
  • 著者名/発表者名: Yoshida, K., Saitoh, H., Fujisawa, S., Kanzaki, H., Matsumura, H., Yoshida, K., Tosa, Y., Chuma, I., Takano, Y., Win, J., Kamoun, S., Terauchi, R.
  • 雑誌名: Plant Cell (in press)
• [雑誌論文] SuperSAGE : The most advanced transcriptome technology for functional genomics (In : Kahl, G., Meksem, K. eds. The Handbook of Plant Functional Genomics) (2008)
  • 著者名/発表者名: Terauchi Ryohei, et al.
  • 雑誌名: Wiley-VCH ページ: 37-54
• [雑誌論文] SuperSAGE : A modern platform for genome-wide quantitative transcript profiling (2008)
  • 著者名/発表者名: Matsumura, H., Krueger, DH, Kahl, G., Terauchi, R
  • 雑誌名: Current Pharmaceutical Biotechnology 9 ページ: 368-374
  • 査読あり
• [雑誌論文] A multi-faceted genomics approach toward understanding Magnaporthe-rice interactions (2008)
  • 著者名/発表者名: Terauchi Ryohei
  • 雑誌名: Biology of Molecular Plant-Microbe Interactions 6(in press)
• [雑誌論文] Large-scale DNA polymorphism study of Oryza sativa and O. rufipogon reveals the origin and divergence of Asian rice. (2007)
  • 著者名/発表者名: Rakshit, S., Rakshit , A., Matsumura, H., Takahashi, Y., Hasegawa, Y., Ito, A., Ishii, T., Miyashita, N. T., Terauchi, R.
  • 雑誌名: Theoretical and Applied Genetics 114 ページ: 731-743
• [雑誌論文] Large-scale DNA polymorphism study of Oryza sativa and O. rufipogon reveals the origin and divergence of Asian rice. (2007)
  • 著者名/発表者名: Raksit, Sujay
  • 雑誌名: Theoretical and Applied Genetics 114・4 ページ: 731-743
• [学会発表] Genome resequencing and association genetics reveals novel Magnaporthe oryzae avirulence genes. (2008)
  • 著者名/発表者名: Terauchi,R.
  • 学会等名: Biotechnology Havana 2008
  • 発表場所: Havana, Cuba
  • 年月日: 2008-12-02
• [学会発表] Genome resequencing and association genetics reveals novel Magnaporthe oryzae avirulence genes (2008)
  • 著者名/発表者名: 寺内良平
  • 学会等名: Biotechnology Havana2008
  • 発表場所: Havana, Cuba
  • 年月日: 2008-12-01
• [学会発表] Rice-Magnaporthe interactions:a multifaceted genomics approach (2007)
  • 著者名/発表者名: 寺内 良平
  • 学会等名: 5th International Symposium of Rice Functional Genomics
  • 発表場所: つくば市エポカルつくば
  • 年月日: 2007-10-15
• [学会発表] A multi-faceted genomics approach toward understanding Magnaporthe-rice interactions (2007)
  • 著者名/発表者名: 寺内 良平
  • 学会等名: 13th International Congress on Molecular Plant・Microbe Interactions
  • 発表場所: Sorrento,Italy
  • 年月日: 2007-07-25
• [学会発表] Searching for effectors of Magnaporthe oryzae: a multi-faceted genomics approach (2007)
  • 著者名/発表者名: Terauchi,R.
  • 学会等名: 4th International Rice Blast Conference
  • 発表場所: Changsha,China
• [学会発表] Searching for effectors of Magnaporthe oryzae: a multi-faceted genomics approach (2007)
  • 著者名/発表者名: Terauchi,R.
  • 学会等名: 5th International Symposium of Rice Functional Genomics
  • 発表場所: Tsukuba, Japan
• [図書] Use of TILLING for reverse and forward genetics of rice (In : Kahl, G., Meksem, K. eds. The Handbook of Plant Mutation Screening) (2009)
  • 著者名/発表者名: Rakshit S., Terauchi, R
  • 出版者: Wiley-VCH(In press)
• [図書] A multi-faceted genomics approach toward understanding Magnaporthe-rice interactions. In: Biology of Molecular Plant-Microbe Interactions.(Lorito M. ed.) Vol 6. (2008)
  • 著者名/発表者名: Terauchi, R., Win, J., Kamoun, S., et al.
• [図書] SuperSAGE: The most advanced transcriptome technology for functional genomics. In:Handbook of plant functional genomics.(Kahl, G., Meksam, K. eds) (2007)
  • 著者名/発表者名: Terauchi, R., Matsumura, H., Krueger, D. H., Kahl, G.
  • 出版者: Wiley VCH
• [図書] Use of Serial Analysis of Gene Expression in crop Improvement. Genomics-Assisted Crop Improvement.(Varshney and Tuberosa eds) (2007)
  • 著者名/発表者名: Sharma, P.C., Matsumura, H., Terauchi, R.
  • 出版者: Springer
• [図書] Use of TILLING for forward genetics of rice 2009 In:Handbook of plant mutation detection (Kahl, G., Meksam, K. eds)
  • 著者名/発表者名: Rakshit, S., Kanzaki, H., Matsumura H., et al. Terauchi R.
  • 出版者: Wiley VCH (in press)