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転写制御蛋白質による転写終結領域の構造変化と機能解析

研究課題

研究課題/領域番号 18370073
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 分子生物学
研究機関独立行政法人産業技術総合研究所

研究代表者

PENMETCHA Kumar (KUMAR Penmetcha)  独立行政法人産業技術総合研究所, 生物機能工学研究部門, 主任研究員 (80357938)

連携研究者 SUBASH C.B Gopinath  
研究期間 (年度) 2006 – 2008
研究課題ステータス 完了 (2008年度)
配分額 *注記
18,070千円 (直接経費: 15,100千円、間接経費: 2,970千円)
2008年度: 6,370千円 (直接経費: 4,900千円、間接経費: 1,470千円)
2007年度: 6,500千円 (直接経費: 5,000千円、間接経費: 1,500千円)
2006年度: 5,200千円 (直接経費: 5,200千円)
キーワード核酸 / 生体分子 / 蛋白質 / 発現制御 / 転写制御 / RNA / RMA-タンパク質複合体 / X線解析 / BioXAS吸収スペクトル / 放射光 / Zn / 配位結合 / RNA結合蛋白質 / オペロン / モチーフ配列 / L-ヒスチジン / 発現
研究概要

転写制御蛋白質HutPと標的RNA複合体のX線解析を行った。その結果、HutPは6量体を形成していること、HutPは6量体の両面で、RNAの2個所のUAG繰り返し配列と結合していた。生化学的実験においても、UAG繰り返し配列の重要性が明らかにされた。また、in vivo実験により、活性発現がHutPにより誘導された。以上より、HutPはUAG繰り返し配列と結合し、RNAをステム-ループから3角形様構造に変化させるすることによって、転写終結解除する機構を明らかにした。

報告書

(4件)
  • 2008 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2007 実績報告書
  • 2006 実績報告書
  • 研究成果

    (3件)

すべて 2008

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (1件)

  • [雑誌論文] Insights into antitermination regulation of hut operon in Bacillus subtilis: importance of dual RNA-binding surfaces of HutP2008

    • 著者名/発表者名
      Subash C.B. Gopinath, B. Dhakshnamoorthy, T.S. Kumarevel, Tomoko S. Misono, H. Mizuno and Penmetcha K.R. Kumar
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res 36

      ページ: 3463-3473

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Insights into anti-termination re gulation of the hut operonin BaciUus subtilis:importance of the dual RNA-bindingsurfaces of HutP2008

    • 著者名/発表者名
      Gopinath, SCB., Balasundaresan, D., Kumarevel, T., Misono, TS. Mizuno H. and Kumar, PKR
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research (In press)

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Structure in the local environment of Zn_<2+> ion in the anti-termination protein of Bacillus subtilis2008

    • 著者名/発表者名
      P. Fons, D. Balasundaresan, H. Mizuno, P. K. R. Kumar
    • 学会等名
      IUCr2008国際結晶学会
    • 発表場所
      大阪市
    • 年月日
      2008-08-28
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書

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公開日: 2006-04-01   更新日: 2016-04-21  

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