Operational RNA Codeとリボスイッチから見た遺伝暗号の起源

• 研究課題/領域番号: 18379001
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 進化生物学
• 研究機関: 東京理科大学
• 研究代表者: 田村 浩二 東京理科大学, 基礎工学部, 准教授 (30271547)
• 研究期間 (年度): 2006 – 2009
• 研究課題ステータス: 完了 (2008年度)
• 配分額: 16,600千円 (直接経費: 15,100千円、間接経費: 1,500千円); 2008年度: 3,380千円 (直接経費: 2,600千円、間接経費: 780千円); 2007年度: 3,120千円 (直接経費: 2,400千円、間接経費: 720千円); 2006年度: 10,100千円 (直接経費: 10,100千円)
• キーワード: 生命起源 / 生命の起源 / 遺伝暗号 / 進化

研究概要

本研究は、これまで謎のままとされてきた遺伝暗号の成立過程に果敢にチャレンジするものである。現在の生物系における、tRNAのアミノアシル化とリボスイッチに実際に見られる形態をもとに、そこから過去にさかのぼって、遺伝暗号システムの進化を探る立場を取る。具体的には、(1) Operational RNA Codeとして典型的であるtRNAAlaのAla特異性とG-U塩基対の存在の必然性、および、(2) Glyを認識するリボスイッチをもとにした遺伝暗号システムの進化、をメインに研究を進め、分子認識メカニズムに迫った

研究成果

• [雑誌論文] Role of poly-glycine binding RNA in RNA world (2009)
  • 著者名/発表者名: Kodera, S., Tamura, K.
  • 雑誌名: Viva Origino 37Supplement ページ: 20-20
• [雑誌論文] Recognition mechanism of tRNA^<Gly> by Nanoarchaeota GlyRS : Searching for the origin of the genetic code (2009)
  • 著者名/発表者名: Miyake, H., Tamura, K.
  • 雑誌名: Viva Origino 37Supplement ページ: 21-21
• [雑誌論文] Mechanism of chiral-selective tRNA aminoacylation and the origin of amino acid homochirality (2008)
  • 著者名/発表者名: Tamura, K.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Symp. Ser. 52 ページ: 415-416
• [雑誌論文] Origin of amino acid homochirality : Relationship with the RNA world and origin of tRNA aminoacylation (2008)
  • 著者名/発表者名: Tamura, K.
  • 雑誌名: BioSystems 92 ページ: 91-98
  • 査読あり
• [雑誌論文] The relationship between the origin of the genetic code and riboswitches. (2008)
  • 著者名/発表者名: Yamaji, Y. and Tamura, K.
  • 雑誌名: Viva Origino 36Supplement ページ: 36-36
• [雑誌論文] Stereochemical basis for an operational RNA code. (2008)
  • 著者名/発表者名: Tamura, K.
  • 雑誌名: Viva Origino 36Supplement ページ: 37-37
• [雑誌論文] Origin aminoacylation of tRNA and L-amino acids (2007)
  • 著者名/発表者名: Koji Tamura
  • 雑誌名: Viva Origino 35・1 ページ: 29-29
• [雑誌論文] Chiral-selective aminoacylation of an RNA minihelix : Mechanistic features and chiral suppression (2006)
  • 著者名/発表者名: Tamura, K. and Schimmel, P. R.
  • 雑誌名: Proc. Natl Acad. Sci. U.S.A. 103 ページ: 13750-13752
  • 査読あり
• [雑誌論文] Chiral-selective aminoacylation of an RNA minihelix : Mechanistic features and chiral suppression (2006)
  • 著者名/発表者名: Koji Tamura
  • 雑誌名: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United states of America 103・37 ページ: 13750-13752
• [学会発表] Poly-glycine binding RNAのRNAワールドにおける役割 (2009)
  • 著者名/発表者名: 小寺彰吾, 田村浩二
  • 学会等名: 生命の起原および進化学会第34回学術講演会
  • 発表場所: 京都大学原子炉実験所
  • 年月日: 2009-03-18
• [学会発表] ナノアーキアGlyRSによるtRNA^<Gly>認識機構から遺伝暗号の起源に迫る (2009)
  • 著者名/発表者名: 三宅秀明, 田村浩二
  • 学会等名: 生命の起原および進化学会第34回学術講演会
  • 発表場所: 京都大学原子炉実験所
  • 年月日: 2009-03-18
• [学会発表] Molecular basis for chiral-selective aminoacylation of an RNA minihelix (2008)
  • 著者名/発表者名: Koji Tamura
  • 学会等名: International Meeting on Fluorinated-Peptide Chemistry
  • 発表場所: お茶の水女子大学
  • 年月日: 2008-11-04
• [学会発表] Mechanism of chiral-selective tRNA aminoacylation and the origin of amino acid homochirality (2008)
  • 著者名/発表者名: Tamura, K.
  • 学会等名: Joint Symposium of 18th International Roundtable on Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids (IRTXVIII) and 35^<th> International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
  • 発表場所: 京都大学
  • 年月日: 2008-09-08
• [学会発表] 原始tRNAのキラル選択的アミノアシル化 (2008)
  • 著者名/発表者名: 田村浩二
  • 学会等名: 平成20年度日本生化学会関東支部例会
  • 発表場所: 群馬大学
  • 年月日: 2008-06-21
• [学会発表] オペレーショナルRNAコードの立体化学的基盤 (2008)
  • 著者名/発表者名: 田村浩二
  • 学会等名: 生命の起原および進化学会第33回学術講演会
  • 発表場所: 東京薬科大学
  • 年月日: 2008-03-18
• [学会発表] 遺伝暗号の起源とリボスイッチの関わり (2008)
  • 著者名/発表者名: 山路唯巴、田村浩二
  • 学会等名: 生命の起原および進化学会第33回学術講演会
  • 発表場所: 東京薬科大学
  • 年月日: 2008-03-18
• [学会発表] Mechanism of chiral-selective tRNA aminoacylation and the origin of amino acid homochirality (2008)
  • 著者名/発表者名: Koji Tamura
  • 学会等名: Joint Symposium of 18^<th> International Roundtable on Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids(IRTXVIII)and 35^<th> International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
  • 発表場所: 京都大学
• [学会発表] tRNAのアミノアシル化の起源とアミノ酸のホモキラリティーの誕生 (2007)
  • 著者名/発表者名: 田村浩二
  • 学会等名: 無細胞生命科学研究会第2回研究会
  • 発表場所: 東京大学柏キャンパス
  • 年月日: 2007-10-19
• [学会発表] tRNAのアミノアシル化の起源とアミノ酸のホモキラリティーの誕生 (2007)
  • 著者名/発表者名: 田村浩二
  • 学会等名: 無細胞生命科学研究会 第2回研究会
  • 発表場所: 東京大学柏キャンパス
  • 年月日: 2007-10-19
• [図書] 9月号「RNAワールドから見たアミノ酸のホモキラリティーの誕生」 (2008)
  • 著者名/発表者名: 田村浩二
  • 出版者: 株式会社エヌ・ティー・エス生物の科学遺伝
• [図書] 生物の科学 遺伝 9月号 (2008)
  • 著者名/発表者名: 田村浩二
  • 総ページ数: 5
  • 出版者: 株式会社エヌ・ティー・エス
• [備考]
  • URL: http://www.rs.noda.tus.ac.jp/~biost/OPFU/TAMU/kojitamuralab.html
• [備考]
  • URL: http://www.rs.noda.tus.ac.jp/~biost/OPFU/TAMU/kojitamuralab.html
• [備考]
  • URL: http://www.rs.noda.tus.ac.jp/~biost/OPFU/TAMU/kojitamuralab.html