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水田表面水中のウィルスの生態

研究課題

研究課題/領域番号 18380051
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 植物栄養学・土壌学
研究機関名古屋大学

研究代表者

木村 眞人  名古屋大学, 大学院・生命農学研究科, 教授 (20092190)

研究期間 (年度) 2006 – 2008
研究課題ステータス 完了 (2008年度)
配分額 *注記
17,160千円 (直接経費: 15,000千円、間接経費: 2,160千円)
2008年度: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2007年度: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2006年度: 7,800千円 (直接経費: 7,800千円)
キーワード水田 / ウイルス / ファージ / g23遺伝子 / 季節変動 / Sphingomonas / 透過型電子顕微鏡 / TEM / 細菌 / 表面水 / 感染 / 環境DNA / 死滅 / 田面水 / 蛍光染色 / サイズ分布
研究概要

本研究においては、水田表面水中のウイルスの生態解明を目的とし、1)水田表面水中には細菌数の平均8倍程度多数のウイルスが存在すること、細菌数とウイルス数の間に正の相関がみとめられた。2)表面水から分離した18株の細菌を供試し、これらに感染するバクテリオ数の季節変動と肥料の種類の影響を調査した結果、表面水中のファージ群集は、系統的に広い範囲の細菌に感染するファージから構成されていることが示唆された。3)表面水中に生息する細菌へのウイルスの感染状況を、透過型電子顕微鏡による細菌細胞の観察から推定した結果、平均で2~3%の細菌細胞中にファージの存在が観察され、水田表面水中のファージ群集が細菌群集の死滅を引き起こすとともに、細菌群集の遷移に大きく影響していることを推察した。また、4)藍藻ファージに特異的なプライマーを用いて同ファージの群集構造を評価した結果、水田にはこれまで知られていなかった未知の藍藻ファージの存在が推定された。

報告書

(4件)
  • 2008 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2007 実績報告書
  • 2006 実績報告書
  • 研究成果

    (25件)

すべて 2009 2008 2007 2006

すべて 雑誌論文 (15件) (うち査読あり 15件) 学会発表 (10件)

  • [雑誌論文] Morphology, host range and phylogenetic diversity of Sphingomonas phages in the floodwater of a Japanese paddy field2009

    • 著者名/発表者名
      Natsuko Nakayama, Takashi Tsuge, Susumu Asakawa, and Makoto Kimura
    • 雑誌名

      Soil Sci. Plant Nutr 55(1)

      ページ: 53-64

    • NAID

      110007502707

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Frequency of phage-infected bacterial cells in the floodwater of a Japanese paddy field2009

    • 著者名/発表者名
      Natsuko Nakayama, Susumu Asakawa, and Makoto Kimura
    • 雑誌名

      Soil Biol. Biochem 41(2)

      ページ: 186-191

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Comparison of g23 gene sequence diversity between Novosphingobium and Sphingomonas phages and phage communities in the floodwater of a Japanese paddy field2009

    • 著者名/発表者名
      Natsuko Nakayama, Susumu Asakawa, and Makoto Kimura
    • 雑誌名

      Soil Biol. Biochem 41(2)

      ページ: 179-185

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Diversity of major capsid genes (g23)of T4-type bacteriophages in Japanese paddy field soils.2009

    • 著者名/発表者名
      Guanghua Wang
    • 雑誌名

      Soil Biology and Biochemistry 41

      ページ: 13-20

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Comparison of g23 gene sequence diversity between Novosphingobium and Sphingomonas phages and phage communities in the floodwater of a Japanese paddy field.2009

    • 著者名/発表者名
      Natsuko Nakayama
    • 雑誌名

      Soil Biology and Biochemistry 41

      ページ: 179-185

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Frequency of phage-infected bacterial cells in the floodwater of a Japanese paddy field2009

    • 著者名/発表者名
      Natsuko Nakayama
    • 雑誌名

      Soil Biology and Biochemistry 41

      ページ: 186-191

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Morphology, host range and phylogenetic diversity of Sphingomonas phaees in the floodwater of a Japanese paddy field.2009

    • 著者名/発表者名
      Natsuko Nakayama
    • 雑誌名

      Soil Science and Plant Nutrition 55

      ページ: 53-64

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Survey of major capsid genes (g23)of T4-type bacteriophages in rice fields in Northeast China2009

    • 著者名/発表者名
      Guanghua Wang
    • 雑誌名

      Soil Biology and Biochemistry 41

      ページ: 446-447

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Viral ecology in soil: past, present, and future perspectives.2008

    • 著者名/発表者名
      Makoto Kimura
    • 雑誌名

      Soil Science and Plant Nutrition 40

      ページ: 1-32

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Morphological analysis of viral communities in the floodwater of a Japanese paddy field2007

    • 著者名/発表者名
      Natsuko Nakayama, Mami Okumura, Katsuhiro Inoue, Susumu Asakawa, and Makoto Kimura
    • 雑誌名

      Soil Biol. Biochem 39(12)

      ページ: 3187-3190

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Abundance of bacteriophages of common heterotrophic bacteria in the floodwater of a Japanese paddy field2007

    • 著者名/発表者名
      Natsuko Nakayama, Mami Okumura, Katsuhiro Inoue, Susumu Asakawa, and Makoto Kimura
    • 雑誌名

      Soil Sci. Plant Nutr 53(5)

      ページ: 595-605

    • NAID

      110006532423

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Seasonal variations in abundances of virus-like particles and bacteria in the floodwater of a Japanese paddy field2007

    • 著者名/発表者名
      Natsuko Nakayama, Mami Okumura, Katsuhiro Inoue, Susumu Asakawa, and Makoto Kimura
    • 雑誌名

      Soil Sci. Plant Nutr 53(4)

      ページ: 420-429

    • NAID

      110006532404

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Seasonal variations in abundances of virus-like particles and bacteria in the flood water of a Japanese paddy field2007

    • 著者名/発表者名
      Natsuko Nakayama
    • 雑誌名

      Soil Science and Plant Nutrition 53

      ページ: 420-429

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Morphological analysis of viral communities in the floodwater of a Japanese pad dy field.2007

    • 著者名/発表者名
      Natsuko Nakayama
    • 雑誌名

      Soil Biology and Biochemistry 39

      ページ: 3187-3190

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Phylogenetic distribution of bacteria isolated from the floodwater of a Japanese paddy field2006

    • 著者名/発表者名
      Natsuko Nakayama, Akiko Okabe, Koki Toyota, Makoto Kimura, and Susumu Asakawa
    • 雑誌名

      Soil Sci.Plant Nutr 52(3)

      ページ: 305-312

    • NAID

      110006251033

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 水田表面水におけるファージ群集とNovosphingobiumu/Sphingomonasファージのg23遺伝子の多様性2008

    • 著者名/発表者名
      中山奈津子、浅川晋、木村眞人
    • 学会等名
      日本土壌肥料学会2008年度大会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2008-09-11
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 水田表面水におけるファージ群集とNovosphingobium/Sphingomonasファージのg23遺伝子の多様性2008

    • 著者名/発表者名
      中山奈津子
    • 学会等名
      日本土壌微生物学会2008年度大会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2008-09-11
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Morphology, host range and phylogenetic diversity of Sphingomonas phages belonging to the family of Siphoviridae2008

    • 著者名/発表者名
      Natsuko Nakayama, Susumu Asakawa, Makoto Kimura
    • 学会等名
      International Union of Microbiological Societies[IUMS]World Congresses
    • 発表場所
      イスタンブール・トルコ
    • 年月日
      2008-08-13
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 水田表面水に生息する細菌群集の死滅へのファージの寄与率推定2008

    • 著者名/発表者名
      中山奈津子、浅川晋、木村眞人
    • 学会等名
      日本土壌微生物学会2008年度大会
    • 発表場所
      静岡
    • 年月日
      2008-06-13
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 水田表面水中のSphingomonas sp.に感染する溶菌性ファージの遺伝子解析2007

    • 著者名/発表者名
      中山奈津子
    • 学会等名
      日本土壌肥料学会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2007-08-23
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 水田表面水中のSphingomonas sp. に感染する溶菌性ファージの遺伝子解析2007

    • 著者名/発表者名
      中山奈津子、奥村真未、井上勝弘、浅川晋、木村眞人
    • 学会等名
      日本土壌肥料学会2007年度大会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2007-08-22
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] サイズ分布から見た水田表面水中ウイルスの多様性2007

    • 著者名/発表者名
      中山奈津子
    • 学会等名
      日本土壌微生物学会2007年度天会
    • 発表場所
      千葉県柏
    • 年月日
      2007-06-08
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] サイズ分布から見た水田表面水中ウイルスの多様性2007

    • 著者名/発表者名
      中山奈津子、奥村真未、井上勝弘、浅川晋、木村眞人
    • 学会等名
      日本土壌微生物学会2007年度大会
    • 発表場所
      柏
    • 年月日
      2007-06-07
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 長期肥料連用試験圃場における水田表面水中のバクテリオファージの季節変動2006

    • 著者名/発表者名
      中山奈津子、奥村真未、井上勝弘、浅川晋、木村眞人
    • 学会等名
      日本土壌肥料学会2006年度大会
    • 発表場所
      秋田
    • 年月日
      2006-09-07
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 長期肥料連用試験圃場の水田表面水中におけるウイルス数と細菌数の関係2006

    • 著者名/発表者名
      中山奈津子、奥村真未、井上勝弘、浅川晋、木村眞人
    • 学会等名
      日本土壌微生物学会2006年度大会
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      2006-06-11
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書

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公開日: 2006-04-01   更新日: 2016-04-21  

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