食品機能のニュートリゲノミクス解析における情報利用の高度化と体系化

• 研究課題/領域番号: 18380077
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 食品科学
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 加藤 久典 東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 准教授 (40211164)
• 研究期間 (年度): 2006 – 2008
• 研究課題ステータス: 完了 (2008年度)
• 配分額: 17,320千円 (直接経費: 14,800千円、間接経費: 2,520千円); 2008年度: 5,460千円 (直接経費: 4,200千円、間接経費: 1,260千円); 2007年度: 5,460千円 (直接経費: 4,200千円、間接経費: 1,260千円); 2006年度: 6,400千円 (直接経費: 6,400千円)
• キーワード: DNAマイクロアレイ / カロリー制限 / タンパク質栄養 / データベース / ニュートリゲノミクス / トランスクリプトミクス / プロテオミクス / 高脂肪食 / 食品機能 / タシパク質栄養 / 皮膚 / アミノ酸 / トランスクリプトーム / プロテオーム / カルニチン / 食の安全性

研究概要

様々なタンパク質栄養条件に応答した肝臓や皮膚での遺伝子発現の網羅的応答を幅広く明らかにした。それらのデータを有効に解析するためのバイオインフォマティクス手法を高度活用し、栄養研究における情報の有効利用を推進した。また、高脂肪食摂食や運動、抗肥満食品因子、マイルドなカロリー制限等に対する網羅的遺伝子発現やタンパク質量の応答に関する情報を蓄積した。従来から構築して維持しているニュートリゲノミクスデータベースを大幅に改良し、世界のニュートリゲノミクス研究を格段に発展させる礎を築いた。

研究成果

• [雑誌論文] Effect of fasting on the peripheral circadian gene expression in rats (2010)
  • 著者名/発表者名: Dong, Y., Wu, T., Ni, Y. H., Kato, H., Fu, Z. W.
  • 雑誌名: Biol. Rhythm Res. 41 ページ: 41-47
  • 査読あり
• [雑誌論文] Regulation of circadian gene expression in the kidney by light and food cues in rats (2010)
  • 著者名/発表者名: Wu, T., Ni, Y., Dong, Y, Kato, H., Fu, Z. W.
  • 雑誌名: Am. J. Physiol. Regul. Integr. Comp. Physiol. 298 ページ: 635-641
  • 査読あり
• [雑誌論文] Effect of mild restriction of food intake on gene expression profile in the liver of young rats : reference data for in vivo nutrigenomics study (2010)
  • 著者名/発表者名: Saito, K., Ohta, Y., Sami, M., Kanda, T., Kato, H.
  • 雑誌名: Brit. J. Nutr. (in press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genes related to the ubiquitin-proteasome system are up-regulated in the brown adipose tissue of 24 h-fasted rats (2008)
  • 著者名/発表者名: Nakai, N., Hashida, H., Kadota, K., Minami, M., Shimizu, K., Matsumoto, I., Kato H., Abe, K.
  • 雑誌名: Biosci. Biotechnol. Biochem 72 ページ: 139-148
  • 査読あり
• [雑誌論文] Opposite effects of PU.1 on mast cell stimulation (2008)
  • 著者名/発表者名: Niwa, Y, Nishiyama, C., Nakano, N., Kamei, A., Kato, H., Kanada, S., Ikeda, S., Ogawa, H., Okumura, K.
  • 雑誌名: Biochem. Biophys. Res. Commun. 375 ページ: 95-100
  • 査読あり
• [雑誌論文] Light and food signals cooperate to entrain the rat pineal circadian system. (2008)
  • 著者名/発表者名: Wu, T., Jin, Y. X., Kato, H., Fu, Z. W
  • 雑誌名: J. Neurosci. Res. 86 ページ: 3246-3255
  • 査読あり
• [雑誌論文] Nutrigenomics : the cutting edge and Asian perspectives. (2008)
  • 著者名/発表者名: Kato, H.
  • 雑誌名: Asia Pac. J. Clin. Nutr. 17 (S1) ページ: 12-15
• [雑誌論文] Effects of light cues on re-entrainment of the food-dominated peripheral clocks in mammals. (2008)
  • 著者名/発表者名: Wu, T., Jin, Y. X., Ni, Y.H., Zhang, D. P., Kato, H. Fu, Z. W.
  • 雑誌名: Gene 419 ページ: 27-34
  • 査読あり
• [雑誌論文] Opposite effects of PU. 1 on mast cell stimulation. (2008)
  • 著者名/発表者名: Niwa, Y., Nishiyama, C., Nakano, N., Kamei, A., Kato, H., 他
  • 雑誌名: Biochelii. Biophys. Res. Commum 357 ページ: 95-100
  • 査読あり
• [雑誌論文] Light and food signals cooperate to entrain the rat pineal circadian system. (2008)
  • 著者名/発表者名: Wu, T., J in, Y. X., Kato, H. and Fu, Z. W.
  • 雑誌名: J. Neurosci. Res. 86 ページ: 3246-3255
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genes related to the ubiquitin-proteasome system are up-regulated in the brown adipose tissue of 24 h-fasted rats (2008)
  • 著者名/発表者名: Nakai, Y.
  • 雑誌名: Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 72 ページ: 139-148
  • 査読あり
• [雑誌論文] Nutrigenomics:the cutting edge and Asian perspectives (2008)
  • 著者名/発表者名: Kato, H.
  • 雑誌名: Asia Pacific Journal of Clinical Nutrition 17 ページ: 12-15
• [雑誌論文] ニユートリゲノミクスの新潮流-テーラーメード栄養を身近なものに (2007)
  • 著者名/発表者名: 加藤久典, 小林進, 勝谷友宏, 三谷康正
  • 雑誌名: バイオサイエンスとインダストリー 65 ページ: 19-23
• [雑誌論文] Safety evalution of hypoallergenic wheat flour using a DNA microarray. (2006)
  • 著者名/発表者名: Narasaka, S., Endo, Y., Fu, ZW., Moriyama, M., Arai, S., Abe, K., Kato, H.
  • 雑誌名: Biosci. Biotechnol. Biochem. 70 ページ: 1464-1470
• [雑誌論文] Gene expression analysis of the anti-obesity effect by apple polyphenols in rats fed a high fat diet or a normal diet. (2006)
  • 著者名/発表者名: Ohta, Y., Sami, M., Kanda, T., Saito, K., Osada, K., Kato, H.
  • 雑誌名: J. Oleo Sci. 55 ページ: 305-314
  • NAID: 130000055561
• [学会発表] Functional study of an amino acid response element of the phosphoenolpyruvate carboxykinase 2 (PEPCK2) gene (2009)
  • 著者名/発表者名: 石井駿介
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフイコ横浜
  • 年月日: 2009-12-12
• [学会発表] Data storage and comparative analysis of gene expression profiles for promotion of nutrigenomics study (2009)
  • 著者名/発表者名: Kenji Saito
  • 学会等名: 19th International Congress of Nutrition
  • 発表場所: Bangkok
  • 年月日: 2009-10-09
• [学会発表] Effect of lysine on lipid metabolism : A nutrigenomics study (2009)
  • 著者名/発表者名: Aya okumura
  • 学会等名: 19th International Congress of Nutrition
  • 発表場所: Bangkok
  • 年月日: 2009-10-09
• [学会発表] Phosphoenolpyruvate carbosykinase2(PEPCK1)遺伝子におけるアミノ酸応答配列の機能解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 石井駿介、小野絢香、斉藤憲司、加藤久典
  • 学会等名: 2009年度日本農芸化学会大会
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2009-03-29
• [学会発表] 卵殻膜摂食が肝機能と皮膚機能に及ぼす影響のトランスクリプトーム解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 斉藤憲司、山根拓実、大石祐一、長谷部由紀夫、加藤久典
  • 学会等名: 2009年度日本農芸化学会大会
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2009-03-28
• [学会発表] 鉄欠乏食がラット肝臓遺伝子発現プロファイルに及ぼす影響 (2009)
  • 著者名/発表者名: 亀井飛鳥、渡部由貴、根元智子、上原万理子、加藤久典、中井雄治、阿部啓子
  • 学会等名: 2009年度日本農芸化学会大会
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2009-03-28
• [学会発表] PEPCK2遺伝子のアミノ酸応答配列近傍領域の機能解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 石井駿介、加藤久典
  • 学会等名: 第2回日本アミノ酸学会大会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2008-10-02
• [学会発表] タンパク質栄養悪化がラット皮膚遺伝子発現プロファイルに及ぼす影響の解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 亀井飛鳥、中井雄治、加藤久典
  • 学会等名: 第2回日本アミノ酸学会大会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2008-10-02
• [学会発表] リジンによる脂質代謝制御機構の解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 奥村亜也、平林由理、趙治嘉、村上仁志、小林久峰、藤條武司、加藤久典
  • 学会等名: 第2回日本アミノ酸学会大会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2008-10-02
• [学会発表] タンパク質栄養悪化がラット皮膚遺伝子発現プロフアイルに及ぼす影響の解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 亀井飛鳥
  • 学会等名: 2008年度日本農芸化学会大会
  • 発表場所: 名城大学
  • 年月日: 2008-03-28
• [学会発表] タンパク質栄養の悪化がラット皮膚遺伝子発現プロファイルに及ぼす影響の解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 亀井 飛鳥
  • 学会等名: 2008年度日本農芸化学会大会
  • 発表場所: 名古屋
  • 年月日: 2008-03-28
• [学会発表] 各分枝鎖アミノ酸単欠乏がHepG2細胞の遺伝子発現プロファイルに及ぼす影響 (2007)
  • 著者名/発表者名: 小野 絢香
  • 学会等名: 2007年度日本アミノ酸学会年次大会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2007-11-22
• [学会発表] Effects of supplemental amino acids on geneexpression of conagen-related genes in healthy rat skin (2007)
  • 著者名/発表者名: Kamei, A.
  • 学会等名: Asian Congress of Nutrition
  • 発表場所: 台湾
  • 年月日: 2007-09-11
• [学会発表] 摂食量・体重の差異がラット遺伝子発現に及ぼす影響の網羅的解析 (2007)
  • 著者名/発表者名: 斉藤憲司
  • 学会等名: 第61回日本栄養・食糧学会大会
  • 発表場所: 京都国際会館
  • 年月日: 2007-05-20
• [学会発表] 各種アミノ酸摂取がラット皮膚遺伝子発現に及ぼす影響の解析 (2007)
  • 著者名/発表者名: 亀井飛鳥
  • 学会等名: 2007年度日本農芸化学会大会
  • 発表場所: 東京農業大学
  • 年月日: 2007-03-26
• [学会発表] タンパク質栄養悪化の影響のプロテオーム解析 (2007)
  • 著者名/発表者名: 加藤裕美
  • 学会等名: 2007年度日本農芸化学会大会
  • 発表場所: 東京農業大学
  • 年月日: 2007-03-25
• [図書] Genomics applied to nutrients and functional foods in Japan : State of the art In : Genomics, proteomics, and metabolomics in nutraceuticals and functional foods. Bagchi, D., Lau, F.C. and Bagchi, M (eds) (2010)
  • 著者名/発表者名: Abe, K., Kato, H., Yasuoka, A., Nakai, Y.
  • 出版者: Wiley-Blackwell
• [図書] ニユートリゲノミクスのアレイ解析「遺伝子医学MOOK (10)、DNAチップ/マイクロアレイ 臨床応用の実際」(油谷浩幸編) (2008)
  • 著者名/発表者名: 加藤久典, 阿部啓子
  • 出版者: メデイカルドゥ
• [図書] 第5章 アミノ酸機能のニユートリゲノミクス解析「アミノ酸の機能特性-ライフサイエンスにおける新しい波-」(日本栄養・食糧学会監修) (2007)
  • 著者名/発表者名: 加藤久典
  • 出版者: 建吊社
• [備考] ニユートリゲノミクスデータベース:
  • URL: http://133.11.220.243/nutdb.html
• [備考] Kgee Overviewer (β版):
  • URL: http://133.11.220.243/cgi-bin/gomi/kegg/kegg_viewer2.cgi
• [備考]
  • URL: http://133.11.220.243/nutdb.html