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ホモ接合指紋法によるCOPD感受性遺伝子の検索

研究課題

研究課題/領域番号 18390242
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 呼吸器内科学
研究機関埼玉医科大学

研究代表者

萩原 弘一  埼玉医科大学, 医学部, 教授 (00240705)

研究期間 (年度) 2006 – 2007
研究課題ステータス 完了 (2007年度)
配分額 *注記
16,770千円 (直接経費: 15,300千円、間接経費: 1,470千円)
2007年度: 6,370千円 (直接経費: 4,900千円、間接経費: 1,470千円)
2006年度: 10,400千円 (直接経費: 10,400千円)
キーワードホモ接合指紋法 / 疾患遺伝子解析 / GeneChip / 同祖解析 / 同祖由来染色体断片 / HapMap / 有意水準 / COPD / 疾患感受性遺伝子 / ホモ接合ハプロタイプ / SNP / Marfan症候群 / 単因子疾患 / 多因子疾患 / 共通先祖由来断片
研究概要

多因子疾患原因遺伝子の解明は,困難だが重要なテーマである.現在この分野では全ゲノム関連解析が頻用されているが,疾患頻度の非常に高い疾患にしか適応できず,また再現性に欠けた結果となることが多いことが問題である.我々は多因子疾患原因遺伝子同定の一つの手段として,ホモ接合指紋法を開発した.ホモ接合指紋法は劣性疾患遺伝子を同定するためのノンパラメトリック解析法である。ホモ接合指紋法を用いた際に使用するためのパラメーターを,Haldaneの染色体交叉モデルを使用して決定し,少数の祖先から広く集団内に広がっている劣性疾患遺伝子を同定するための理論的なバックグラウンドを作成した.このパラメーター決定法を使用し,COPDを来す代表的な遺伝疾患であるα1アンチトリプシン欠損症6名の患者を,HapMapプロジェクトで得られた45名の日本人SNPデータをコントロールとして解析した.α1アンチトリプシン欠損症患者の住所は日本各地に散在していたが,本手法により疾患遺伝子であるα1アンチトリプシンの位置を同定し得た.現在利用されている1000K GeneChipを使用すれば,疾患遺伝子を有していた共通先祖が600年前の時代であっても遺伝子存在領域を同定可能と計算される.本手法は,患者集団が複数の遺伝子を原因としている場合でも使用可能であり,他の多因子疾患の疾患遺伝子同定にも有用であると思われる.
ホモ接合指紋法は,すでに特許を取得(特許第4059517)しており,海外への移行を行なっている.

報告書

(3件)
  • 2007 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2006 実績報告書
  • 研究成果

    (9件)

すべて 2007 2006 その他

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 4件) 学会発表 (2件) 産業財産権 (2件)

  • [雑誌論文] Mutanons in the SLC34A2 gene are associated with the pulmonary alveolar microlithiasis.2007

    • 著者名/発表者名
      Huqun, et. al.
    • 雑誌名

      Am J Respir Crit Care Med 175

      ページ: 263-268

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Homozygosity haplotype allows a genomewide search for the autosomal segment shared among patients2007

    • 著者名/発表者名
      Miyazawa, et. al.
    • 雑誌名

      American Journal of Human Genetics 80

      ページ: 1090-1102

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mutations in the SLC34A2 gene are associated with the pulmonary alveolar microlithiasis.2007

    • 著者名/発表者名
      Huqun
    • 雑誌名

      Am J Respir Crit Care Med 175

      ページ: 263-268

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Homozygosity haplotype allows a genomewide search for the autosomalsegment shared among patients2007

    • 著者名/発表者名
      Miyazawa
    • 雑誌名

      American Journal of Human Genetics 80

      ページ: 1090-1102

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The Homozygosity Haplotype allows a genome-wide search for the autosomal segments shared among disease patients

    • 著者名/発表者名
      Miyazawa H
    • 雑誌名

      American Journal of Human Genetics (In press)

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [学会発表] Homozygosity haplotype allows a genomewide search for the autosomal segment shared among patients2007

    • 著者名/発表者名
      Miyazawa, et. al.
    • 学会等名
      アメリカ人類遺伝学会
    • 発表場所
      アメリカSan Diego
    • 年月日
      2007-10-25
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Homozygosity haplotype allows a genomewide search for the autosomalsegment shared among patients.2007

    • 著者名/発表者名
      Miyazawa
    • 学会等名
      アメリカ人類遺伝学会
    • 発表場所
      アメリカSan Diego
    • 年月日
      2007-10-25
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [産業財産権] 特許2007

    • 発明者名
      萩原 弘一
    • 権利者名
      萩原 弘一
    • 取得年月日
      2007-12-28
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [産業財産権] ホモ接合ハプロタイプ法2006

    • 発明者名
      萩原弘一
    • 権利者名
      埼玉医科大学など
    • 産業財産権番号
      2006-214300
    • 出願年月日
      2006-08-07
    • 関連する報告書
      2006 実績報告書

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公開日: 2006-04-01   更新日: 2016-04-21  

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