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体細胞クローンマウスの解析によるゲノム機能単位の探索

研究課題

研究課題/領域番号 18510168
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 基礎ゲノム科学
研究機関東京医科歯科大学

研究代表者

幸田 尚  東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 准教授 (60211893)

研究期間 (年度) 2006 – 2007
研究課題ステータス 完了 (2007年度)
配分額 *注記
3,970千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 270千円)
2007年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2006年度: 2,800千円 (直接経費: 2,800千円)
キーワード体細胞クローン / エピジェネティクス / 染色体ドメイン / 遺伝子発現調節 / ゲノム / ゲノム領域 / 遺伝子発現調節単位 / 胎盤
研究概要

本研究は哺乳類における体細胞クローンにみられる種々の異常の原因と考えられる遺伝子発現調節の変化を検討し、核移植による体細胞クローンの作出における、いわゆるゲノムのエピジェネティックなリプログラミングの特徴を明らかにすること、またマウスゲノムにおけるエピジェネティックな遺伝子発現の調節単位をゲノムワイドに明らかにすることを目的としている。
本研究では新たに、隣接する遺伝子間での遺伝子発現プロフィールからこれら互いのPearson距離を計算してゲノム上にマッピングすることにより、このような遺伝子発現のパターンが共通するドメインを抽出することが可能であることを示し、簡便で汎用性のある新しい手法として提案した。
また、体細胞クローンの異常を詳細に解析するための基礎的な知見として、クローンマウス個体の多くが発生を停止する着床直後の時期の胎盤を中心とした組織学的な解析を行った。その結果、これまで出生時のクローンで観察されていた胎盤の過形成とは逆に、多くの個体で一部の胎盤の成分を欠く異常が高頻度に観察された。
また、核移植によるクローニングにおける遺伝子発現の異常として、出生時の臓器のみならず核移植によって作出された未分化幹細胞においても、インプリンティング遺伝子を含む遺伝子発現に核移植による変化が誘導されていることを示した。

報告書

(3件)
  • 2007 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2006 実績報告書
  • 研究成果

    (11件)

すべて 2008 2007 2006

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (5件)

  • [雑誌論文] Nuclear transfer alters the DNA methylation status of specific genes in fertilized and parthenogenetically activated mouse embryonic stem cells2008

    • 著者名/発表者名
      Hikichi T, Kohda T, Wakayama S, Ishino F, Wakayama T.
    • 雑誌名

      Stem Cells 26

      ページ: 783-788

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 「研究成果報告書概要(欧文)」より2008

    • 著者名/発表者名
      Hikichi T, Kohda T, Wakayama S, Ishino F, Wakayama T.
    • 雑誌名

      Stem Cells. 26

      ページ: 783-788

    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Nuclear transfer alters the DNA methylation status of specific genes in fertilized and parthenogenetically activated mouse embryonic stem cells2008

    • 著者名/発表者名
      Hikichi T, Kohda T, Wakayama S, Ishino F, Wakayama T.
    • 雑誌名

      Stem Cells 26(3)

      ページ: 783-788

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Chorioallantoic placenta defects in cloned mice.2006

    • 著者名/発表者名
      Wakisaka-Saito N, Kohda T, Inoue K, Ogonuki N, Miki H, Hikichi T, Mizutani E, Wakayama T, Kaneko-Ishino T, Ogura A, Ishino F.
    • 雑誌名

      Biochem Biophys Res Commun. 349

      ページ: 106-114

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Chorioallantoic placenta defects in cloned mice2006

    • 著者名/発表者名
      Wakisaka-Saito N, Kohda T, Inoue K, Ogonuki N, Miki H, Hikichi T, Mizutani E, Wakayama T, Kaneko-Ishino T, Ogura A, Ishino F.
    • 雑誌名

      Biochem Biophys Res Commun. 349

      ページ: 106-114

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Chorioallantoic placenta defects in cloned mice.2006

    • 著者名/発表者名
      Wakisaki-Saito N., et al.
    • 雑誌名

      Biochem Biophys Res Commun. 349(1)

      ページ: 106-114

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [学会発表] マウス体細胞クローンのエピジェネティッククな多様性2007

    • 著者名/発表者名
      幸田尚, 岸上哲士, 井上貴美子, 越後貫成美, 三木洋美, 脇阪紀子, 金児石野知子, 小倉淳郎, 若山照彦, 石野史敏
    • 学会等名
      第30回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2007-12-13
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] マウス体細胞クローンのエピジェネティックな多様性2007

    • 著者名/発表者名
      幸田尚・岸上哲士・井上 貴美子・越後貫成美・三木 洋美・脇阪 紀子・引地 貴亮・金児-石野 知子・小倉淳郎・若山照彦・石野 史敏
    • 学会等名
      日本分子生物学会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2007-12-13
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Epigenetic variation in cloned mice.2007

    • 著者名/発表者名
      Kohda T, Kishigami T, Inoue K, Ogonuki N, Miki N, Wakisaka N, Kaneko-Ishino T, Ogura A, Ishino F.
    • 学会等名
      Biochemistry and Molecular Biology 2007
    • 発表場所
      Yokohama
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Variation in gene expression and aberrantly regulated chromosomal regions in cloned mice.2006

    • 著者名/発表者名
      Kohda T, Inoue K, Ogonuki N, Miki N, Kaneko-Ishino T, Ogura A, Ishino F.
    • 学会等名
      20th IUBMB International Congress of Biochemistry and Molecular Biology and 11th FAOBMB Congress
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      2006-06-22
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Variation in gene expression and aberrantly regulated chromosomal regions in cloned mice.2006

    • 著者名/発表者名
      Kohda T, Inoue K, Ogonuki N, Miki N, Kaneko-Ishino T, Ogura A, Ishino F.
    • 学会等名
      20th IUBMB International Congress of Biochemistry and Molecular Biology and 11th FAOBMB Congress
    • 発表場所
      Kyoto
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要

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公開日: 2006-04-01   更新日: 2016-04-21  

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