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非変性2次元電気泳動と質量分析の結合による高能率タンパク質情報収集システムの構築

研究課題

研究課題/領域番号 18550076
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 分析化学
研究機関愛媛大学

研究代表者

真鍋 敬  愛媛大学, 理工学研究科, 教授 (60094281)

研究分担者 島崎 洋次  愛媛大学, 理工学研究科, 准教授 (80284389)
研究期間 (年度) 2006 – 2007
研究課題ステータス 完了 (2007年度)
配分額 *注記
4,060千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 360千円)
2007年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2006年度: 2,500千円 (直接経費: 2,500千円)
キーワードタンパク質相互作用 / タンパク質複合体 / 非変性 / 2次元電気泳動 / 質量分析 / マイクロ2次元電気泳動 / 血漿タンパク質 / ペプチドマスフィンガープリンティング / ヒト血漿 / 非変性条件 / 2次元ゲル電気泳動 / マイクロ / MALDI-TOF-MS / マイクロゲル / MALDI-TOF MS
研究概要

ヒト血漿タンパク質の非変性条件のマイクロ2次元ゲル電気泳動(ゲル等電点電気泳動とサイズ分離ゲル電気泳動のいずれにも変性剤を用いず、縦横38mm、厚み1mmの平板ゲル上に2次元分離する)によるパターンと、部分的変性条件のマイクロ2次元ゲル電気泳動(非変性条件の等電点電気泳動とSDSゲル電気泳動を組み合わせ、同じマイクロサイズの平板ゲル上に分離する)によるパターンを比較することによって、タンパク質問相互作用の存在を確認した。また、これらパターン上でのタンパク質(非変性条件157スポット、部分的変性条件175スポット)について、網羅的に質量分析による構造解析を行った。質量分析による構造解析には、主としてマトリックス支援レーザー脱離イオン化飛行時間型質量分析計MALDI-TOFMSとデータベース検索によるペプチドマスフィンガープリント法を用いた。これらの構造解析結果を比較した結果、非変性条件の2次元ゲル電気泳動と部分的変性条件の2次元ゲル電気泳動の組み合わせのみによって、ヒト血漿タンパク質の(相互作用による複合体形成状態を含む)存在状態を解析することができることが明らかになった。2次元ゲル電気泳動法は従来完全変性-還元条件で行われてきたが、質量分析によるタンパク質同定法の進歩により、研究代表者らが開発した非変性条件の2次元ゲル電気泳動は、さらにその有用性が高まったと考えられる。

報告書

(3件)
  • 2007 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2006 実績報告書
  • 研究成果

    (38件)

すべて 2008 2007 2006 その他

すべて 雑誌論文 (21件) (うち査読あり 10件) 学会発表 (15件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] Noncovalent interactions in human plasma proteins analyzed by the comparisons of non-denaturing and denaturing micro 2-DE patterns after polypeptide assignment using MALDI-MS and PMF2008

    • 著者名/発表者名
      真鍋 敬
    • 雑誌名

      Electrophoresis 29

      ページ: 2672-2688

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Noncovalent interactions in human plasma proteins analyzed by the comparisons of non-denaturing and denaturing micro 2-DE patterns after polypeptide assignment using MALDI-MS and PMF2008

    • 著者名/発表者名
      Manabe, T., Jin, Y
    • 雑誌名

      Electrophoresis 29(in press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Alkaline extraction of human plasma proteins from nondenaturing micro-2-D gels for protein/polypeptide mass measurement and peptide mass fingerprinting using MALDI-TOF MS2007

    • 著者名/発表者名
      金 亜
    • 雑誌名

      Electrophoresis 28

      ページ: 449-459

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要 2006 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Assignment of human plasma polypeptides on a nondenaturing 2-D gelusing MALDI-MS and PMF and comparisons with the results of intact protein mapping2007

    • 著者名/発表者名
      真鍋 敬
    • 雑誌名

      Electrophoresis 28

      ページ: 843-863

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Analysis of protein/polypeptide interactions in human plasma using non denaturing micro 2-DE followed by 3-D SDS-PAGE and MS.2007

    • 著者名/発表者名
      真鍋 敬
    • 雑誌名

      Electrophoresis 28

      ページ: 2065-2079

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] キャピラリー電気泳動法による生体試料中の過塩素酸塩の定量2007

    • 著者名/発表者名
      加藤 徳雄
    • 雑誌名

      分析化学 56

      ページ: 675-678

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Cleavage of fibrinogen alpha chains during isoelectric focusing of human plasma under non-denaturing conditions analyzed by micro two-dimen sional gel electrophoresis and matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry2007

    • 著者名/発表者名
      真鍋 敬
    • 雑誌名

      J. Electrop. 51

      ページ: 27-34

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Alkaline extraction of human plasma proteins from nondenaturing micro-2-D gels for protein/polypeptide mass measurement and peptide mass fingerprinting using MALDI-TOF MS2007

    • 著者名/発表者名
      Jin, Y., Manabe, T
    • 雑誌名

      Electrophoresis 28

      ページ: 449-459

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Assignment of human plasma polypeptides on a nondenaturing 2-D gel using MALDI-MS and PMF and comparisons with the results of intact protein mapping2007

    • 著者名/発表者名
      Manabe, T., Jin, Y
    • 雑誌名

      Electrophoresis 28

      ページ: 843-863

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Analysis of protein/polypeptide interactions in human plasma using nondenaturing micro 2-DE followed by 3-D SDS-PAGE and MS2007

    • 著者名/発表者名
      Manabe, T., Jin, Y
    • 雑誌名

      Electrophoresis 28

      ページ: 2065-2079

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Determination of perchlorate in biological samples by capillary electrophoresis.(in Japanese)2007

    • 著者名/発表者名
      Kato, N., Morimoto, S., Manabe, T
    • 雑誌名

      Bunseki Kagaku 56

      ページ: 675-678

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Cleavage of fibrinogen alpha chains during isoelectric focusing of human plasma under non-denaturing conditions analyzed by micro two-dimensional gel electrophoresis and matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry2007

    • 著者名/発表者名
      Manabe, T., Jin, Y., Yamaguchi, N., Sugiyama, T., Ikari, K
    • 雑誌名

      J. Electrop 51

      ページ: 27-34

    • NAID

      10020020324

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Analysis of protein/polypeptide interactions in human plasma using nondenaturing micro 2-DE followed by 3-D SDS-PAGE and MS2007

    • 著者名/発表者名
      真鍋 敬
    • 雑誌名

      Electrophoresis 28

      ページ: 2065-2079

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Cleavage of fibrinogen alpha chains during isoelectric focusing of human plasma under non-denaturing conditions analyzed by micro two-dimensional gel electrophoresis and matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry2007

    • 著者名/発表者名
      真鍋 敬
    • 雑誌名

      J.Electrophoresis 51

      ページ: 27-34

    • NAID

      10020020324

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Assignment of human plasma polypeptides on a nondenaturing 2-D gel using MALDI-MS and PMF and comparisons with the results of intact protein mapping2007

    • 著者名/発表者名
      真鍋 敬
    • 雑誌名

      Electrophoresis 28

      ページ: 843-863

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Regulation of IL-27p28 gene by lipopolysaccharide in dendritic DC2.4 cells2006

    • 著者名/発表者名
      鎌倉 真紀
    • 雑誌名

      Biochem. Biophys. Res. Commun. 349

      ページ: 1372-1377

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Analysis of hydrolytic activity of phospholipase Calfa from porcine retina on retinyl ester and phosphatidyl choline using non-denaturing two-dimensional electrophoresis and mass spectrometry2006

    • 著者名/発表者名
      島崎 洋次
    • 雑誌名

      J. Chromatogr. B. 843

      ページ: 42-46

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Regulation of IL-27p28 gene by lipopolysaccharide in dendritic DC2.4 cells2006

    • 著者名/発表者名
      Kamakura, M. Morisawa, K, Komi, H. Tomatani, A, Saito, F. Konishi, Y. Jin, Y. Manabe, T. Kuroda, M. Imai, S. Mizuguchi, H. Taniguchi, T
    • 雑誌名

      Biochem. Biophys. Res. Commun 349

      ページ: 1372-1377

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Analysis of hydrolytic activity of phospholipase Calfa from porcine retina on retinyl ester and phosphatidyl choline using non-denaturing two-dimensional electrophoresis and mass spectrometry2006

    • 著者名/発表者名
      Shimazaki, Y., Kishi, IL, Mori, M., Yasuda, C., Manabe, T
    • 雑誌名

      J. Chromatogr B 843

      ページ: 42-46

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Regulation of IL-27p28 gene by lipopolysaccharide in dendritic DC2.4 cells2006

    • 著者名/発表者名
      鎌倉真紀
    • 雑誌名

      Biochem. Biophys. Res. Commun. 349

      ページ: 1372-1377

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Analysis of hydrolytic activity of phospholipase Calfa from porcine retina on retinyl ester and phosphatidylcholine using non-denaturing two-dimensional electrophoresis and mass spectrometry2006

    • 著者名/発表者名
      島崎 洋次
    • 雑誌名

      J. Chromatogr. B. 843

      ページ: 42-46

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [学会発表] ヒト血漿タンパク質の細管(内径1.4mm)等電点電気泳動におけるアガロースゲルとポリアクリルアミドゲルの性能比較2007

    • 著者名/発表者名
      真鍋 敬
    • 学会等名
      第27回キャピラリー電気泳動シンポジウム
    • 発表場所
      静岡県浜松市
    • 年月日
      2007-11-15
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] アガロースゲルを等電点電気泳動に用いた非変性2次元電気泳動によるヒト血漿中の高分子量タンパク質の解析2007

    • 著者名/発表者名
      真鍋 敬
    • 学会等名
      第27回キャピラリー電気泳動シンポジウム
    • 発表場所
      静岡県浜松市クリエート浜松
    • 年月日
      2007-11-15
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書 2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] ヒト血漿タンパク質の細管(内径1.4mm)等電点電気泳動におけるアガロースゲルとポリアクリルアミドゲルの性能比較2007

    • 著者名/発表者名
      真鍋 敬
    • 学会等名
      第27回キャピラリー電気泳動シンポジウム
    • 発表場所
      静岡県浜松市クリエート浜松
    • 年月日
      2007-11-15
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 非変性条件2次元ゲル電気泳動と質量分析によるヒト血漿タンパク質相互作用の解析2007

    • 著者名/発表者名
      真鍋 敬
    • 学会等名
      第58回日本電気泳動学会総会
    • 発表場所
      山口県宇部市宇部全日空ホテル
    • 年月日
      2007-11-08
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書 2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] 非変性2次元電気泳動と質量分析を用いたヒト血漿タンパク質相互作用の解析法の検討2007

    • 著者名/発表者名
      真鍋 敬
    • 学会等名
      日本分析化学会第56年会
    • 発表場所
      徳島県徳島市徳島大学工学部
    • 年月日
      2007-09-20
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] 非変性条件2次元電気泳動と質量分析を用いたヒト血漿タンパク質相互作用の解析法の検討2007

    • 著者名/発表者名
      真鍋 敬
    • 学会等名
      日本分析化学会第56年会
    • 発表場所
      徳島県徳島市徳島大学工学部
    • 年月日
      2007-09-20
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 非変性2次元電気泳動と質量分析によるヒト血漿タンパク質相互作用の解析2007

    • 著者名/発表者名
      真鍋 敬
    • 学会等名
      日本ヒトプロテオーム機第5回大会
    • 発表場所
      東京都江東区日本科学未来館
    • 年月日
      2007-07-30
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書 2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Assignment of human plasma polypeptides and polypeptide interactions on a non-denmaturing micro 2-D gel using MALDI-MS and peptide mass fingerprinting2006

    • 著者名/発表者名
      真鍋 敬
    • 学会等名
      APCE2006
    • 発表場所
      京都市西京区京都大学桂キャンパス
    • 年月日
      2006-11-14
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Assignment of human plasma polypeptides on a non-denaturing two-dimensional gel using MALDI-MS and peptide mass fingerprinting, compari sons with the results of intact protein mapping.2006

    • 著者名/発表者名
      真鍋 敬
    • 学会等名
      7th Siena Meeting From Genome to Proteome
    • 発表場所
      シエナ(イタリア)
    • 年月日
      2006-09-05
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Direct targeting of human plasma for matrix-assisted laser desorption/ii onization and analysis of plasma proteins by time of flight mass spectr ometry.2006

    • 著者名/発表者名
      真鍋 敬
    • 学会等名
      7th Siena Meeting From Genome to Proteome
    • 発表場所
      シエナ(イタリア)
    • 年月日
      2006-09-05
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Alkaline extraction of human plasma proteins from a non-denaturing micro two-dimensional gel for protein/polypeptide mass measurement and peptide mass fingerprinting using MALDI-TOF MS.2006

    • 著者名/発表者名
      真鍋 敬
    • 学会等名
      7th Siena Meeting From Genome to Proteome
    • 発表場所
      シエナ(イタリア)
    • 年月日
      2006-09-05
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Assignment of human plasma polypeptides and polypeptide interactions on a non-denaturing micro 2-D gel using MALDI-MS and peptide mass fingerprinting2006

    • 著者名/発表者名
      Manabe, T
    • 学会等名
      APCE2006
    • 発表場所
      Kyoto
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Assignment of human plasma polypeptides on a non-denaturing two-dimensional gel using MALDI-MS and peptide mass fingerprinting, comparisons with the results of intact protein mapping2006

    • 著者名/発表者名
      Manabe, T
    • 学会等名
      7th Siena Meeting From Genome to Proteome
    • 発表場所
      Siena (Itary)
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Direct targeting of human plasma for matrix-assisted laser desorption/iionization and analysis of plasma proteins by time of flight mass spectrometry2006

    • 著者名/発表者名
      Manabe, T
    • 学会等名
      7th Siena Meeting From Genome to Proteome
    • 発表場所
      Siena (Itary)
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Alkaline extraction of human plasma proteins from a non-denaturing micro two-dimensional gel for protein/polypeptide mass measurement and peptide mass fingerprinting using MALDI-TOF MS2006

    • 著者名/発表者名
      Manabe, T
    • 学会等名
      7th Siena Meeting From Genome to Proteome
    • 発表場所
      Siena (Itary)
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [備考] 「研究成果報告書概要(和文)」より

    • URL

      http://www.ehime-u.ac.jp/~manabet/home02.htm

    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [備考]

    • URL

      http://www.eime-u.ac.jp/~manabet/home02.htm

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書

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公開日: 2006-04-01   更新日: 2016-04-21  

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