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タンパク質結晶中の転位の特性

研究課題

研究課題/領域番号 18560648
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 金属物性
研究機関横浜市立大学

研究代表者

小島 謙一  横浜市立大学, 国際総合科学研究科, 教授 (90046095)

研究分担者 橘 勝  横浜市立大学, 国際総合科学研究科, 教授 (80236546)
研究期間 (年度) 2006 – 2007
研究課題ステータス 完了 (2007年度)
配分額 *注記
3,750千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 150千円)
2007年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円)
2006年度: 3,100千円 (直接経費: 3,100千円)
キーワード格子欠陥 / 転位 / X線トポグラフ / タンパク質結晶 / 構造生物学 / X線回折強度曲線 / モザイク構造 / 放射光 / X-線トポグラフ / 放射光トポグラフ / ロッキングカーブ / 結晶成長 / フラットパネルセンサー / X線回析強度曲線
研究概要

平成18年度の科学研究費補助金により購入したフラットパネルセンサーによりタンパク質結晶の欠陥、とくに、転位の研究に大きな貢献をすることができた。
われわれはこれまでに白色放射光トポグラフによってタンパク質結晶中の転位の観察に成功してきた。しかしながら、白色放射光トポグラシでは高次の反射を含み、分解能が十分にあがらず、転位像の巾が広くなり、明確な像を得ることができなかった。また、タンパク質結晶では、反射強度が弱いために、単色放射光トポグラフのラウエ・スポットの特定が難しかった。これを解決するためにフラットパネルセンサーによってラウエ・スポットを探し、確認し、その後にフィルムによって撮影を行うことができるシステムを完成させた。それにより、正方晶、斜方晶、単斜晶リゾチウム結晶中の転位の分布、転位密度、バーガースペクトルの決定を行うことができた。とくに、今まで観察されていなかったループ状の転位や曲線状の転位、またセクターバウンダリーなどが新たに確認された。また、単斜晶リゾチウム結晶では、転位密度も高く、ベルグ効果による表面の粗さが転位の分布と対応していることもわかった。これによりタンパク質結晶の成長機構と転位の分布の因果関係を知ることができるようになった。
さらに、ロッキングカーブの測定では、フラットパネルセンサーとCCDカメラを連動させることによって、今までの結晶全体のロッキングカーブではなく、結晶の任意の位置でのロッキングカーブが観測できるシステムの構築が可能になった。これにより、同一試料によってロッキングカーブの半値巾と転位の歪との一対一の対応が可能になった。
以上のような転位に関する知見は大型のタンパク質単結晶の育成のための基本的なデーターとして重要になり、タンパク質結晶の構造解析に大きく貢献ができるものと考える。

報告書

(3件)
  • 2007 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2006 実績報告書
  • 研究成果

    (47件)

すべて 2008 2007 2006 2005 その他

すべて 雑誌論文 (26件) (うち査読あり 13件) 学会発表 (19件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] Effect of intra-crystalline water on micro-hardness in hen egg- whitelysozyme crystals2008

    • 著者名/発表者名
      H. Koizumi
    • 雑誌名

      J. Phys. D: Appl. Phys. 41

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Dislocation motions in C60 crystals by an indentation test2008

    • 著者名/発表者名
      N. Aota
    • 雑誌名

      J. Phys. D: Appl. Phys. 41

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Effect of intra-crystalline water on micro-hardness in hen-egg- white lysozyme crystals2008

    • 著者名/発表者名
      H. Koizumi M. Tachibana, H. Kawamoto, K. Kojima
    • 雑誌名

      J. Phys. D: Appl. Phys 41

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Dislocation motions in C60 crystals by an indentation test2008

    • 著者名/発表者名
      N. Aota, M. Tachibana, K. Kojima
    • 雑誌名

      J. Phys. D: Appl. Phys 41

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Effects of intra-crystalline water on micro-Vickers hardness in tetragonal hen-egg white lysozyme crystals.2008

    • 著者名/発表者名
      H. Koizumi, H. Kawamoto, M. Tachibana and K. Kojima
    • 雑誌名

      J. of Physics D; Applied Physics 41

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Observation of clear images of dislocations in proteincrystals by synchrotron monochromatic beam X-raytopography2007

    • 著者名/発表者名
      M. Koishi
    • 雑誌名

      J. Crystal Growth and Design 7

      ページ: 2182-2186

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Dislocation structures in tetragonal hen egg-white lysozyme crystalsusing synchrotron white beam topography2007

    • 著者名/発表者名
      H. Koizumi
    • 雑誌名

      Physica B 401-402

      ページ: 691-694

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Charactrerization of dislocations in orthorhombic hen egg-whitelysozyme crystals by synchrotron X-ray topography2007

    • 著者名/発表者名
      H. Koizumi
    • 雑誌名

      Phys. Status Solidi (a) 204

      ページ: 2688-2693

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Observation of clear images of dislocations in protein crystals by synchrotron monochromatic beam X-ray topography2007

    • 著者名/発表者名
      M. Koishi, N. Ohya, Y., Mukoubayashi, H. Kitajima, H.Koizumi, K. Kojima, M. Tachibana
    • 雑誌名

      J. Crystal Growth and Design 7

      ページ: 2182-2186

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Dislocation structures in tetragonal hen egg-white lysozyme crystals using synchrotron white beam topography2007

    • 著者名/発表者名
      H. Koizumi M. Tachibana, K. Kojima, I. Yonenaga
    • 雑誌名

      Physica B 401-402

      ページ: 691-694

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Charactrerization of dislocations in orthorhombic hen egg-white lysozyme crystals by synchrotron X-ray topography2007

    • 著者名/発表者名
      H. Koizumi, M. Shimizu, M. Tachibana, K. Kojima
    • 雑誌名

      Phys. Status Solidi (a) 204

      ページ: 2688-2693

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Observation of clear images of dislocations in protein crystals by synchrotron monochromatic beam X-ray topography.2007

    • 著者名/発表者名
      M. Koishi, K. Kojima, M. Tachibana, et. al.
    • 雑誌名

      J. Crystal Growth and Design 7

      ページ: 2182-2186

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Dislocation structures in tetragonal hen egg-white lysozyme crystals using synchrotron white beam topography2007

    • 著者名/発表者名
      H. Koizumi M. Tachibana, K. Kojima and I. Yonenaga
    • 雑誌名

      Physica B 401-402

      ページ: 691-694

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Characterization of dislocations in orthorhombic hen egg-white lysozyme crystals by synchrotron X-ray topography2007

    • 著者名/発表者名
      H. Koizumi M. Shimizu, M. Tachibana and K. Kojima
    • 雑誌名

      Physica Status Solidi(a), 204

      ページ: 2688-2693

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Charactrerization of dislocations in orthorhombic hen egg-white lysozyme crystals by synchrotron X-ray topography;2007

    • 著者名/発表者名
      H.Koizumi, M.Tachibana, K.Kojima
    • 雑誌名

      Phys. Status Solidi (印刷中)

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] タンパク質結晶品質に及ぼす不純物の影響2006

    • 著者名/発表者名
      吉崎 泉
    • 雑誌名

      結晶成長学会誌 33

      ページ: 359-365

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Observation of all components of elastic constants of tetragonal henegg-white lysozyme crystals dehydrated at 42% relative humidity2006

    • 著者名/発表者名
      H. Koizumi
    • 雑誌名

      Phys.Rev.E 73

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Impurity-induced defect and its effect on protein crystal perfection2006

    • 著者名/発表者名
      I. Yoshizaki
    • 雑誌名

      J.Crystal Growth 290

      ページ: 185-191

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Effects of crystal quality of impurity effects in protein crystals2006

    • 著者名/発表者名
      I. Yoshizaki, S. Fukuyama, H. Koizumi, M. Tachibana, K. Kojima, et. al.
    • 雑誌名

      Bulletin of Japanese Association for Crystal Growth 33

      ページ: 359-365

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Observation of all components of elastic constants of tetragonal hen egg-white lysozyme crystals dehydrated at 42% relative humidity2006

    • 著者名/発表者名
      H. Koizumi, M. Tachibana, K. Kojima
    • 雑誌名

      Phys. Rev. E73

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Impurity-induced defect and its effect on protein crystal perfection2006

    • 著者名/発表者名
      I. Yoshizaki, S. Fukuyama, H. Koizumi, M. Tachibana, K. Kojima, et. al.
    • 雑誌名

      J. Crystal Growth 290

      ページ: 185-191

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] タンパク質結晶品質に及ぼす不純物の影響2006

    • 著者名/発表者名
      吉崎泉, 飯村好和, 福山誠二郎, 門脇昭夫, 小泉晴比古, 橘勝, 小島謙一, 栄龍, 足立聡, 依田真一
    • 雑誌名

      結晶成長学会誌 33

      ページ: 359-365

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Observation of all components of elastic constants of tetragonal hen egg-white lysozyme crystals dehydrated at 42% relative humidity2006

    • 著者名/発表者名
      H.Koizumi, M.Tachibana, K.Kojima
    • 雑誌名

      Phys. Rev. E 73

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Impurity-induced defect and its effect on protein crystal perfection2006

    • 著者名/発表者名
      I.Yoshizaki, S.Fukuyama, H.Koizumi, M.Tachibana, K.Kojima, et al.
    • 雑誌名

      J. Crystal Glowth 290

      ページ: 185-191

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Analysis of dislocation images in X-ray topography of protein crystals:tetragonal hen egg-white lysozyme crystals2005

    • 著者名/発表者名
      H. Koizumi
    • 雑誌名

      Phil.Mag. 85

      ページ: 3709-3717

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Analysis of dislocation images in X-ray topography of protein crystals: tetragonal hen egg-white lysozyme crystals2005

    • 著者名/発表者名
      H. Koizumi, M. Tachibana, K. Kojima
    • 雑誌名

      Phil. Mag. 85

      ページ: 3709-3717

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Crystal growth and dislocations in hen egg-white lysozyme crystals using synchrotron x-ray topography.(invitedtalk)2008

    • 著者名/発表者名
      Kenichi Kojima
    • 学会等名
      The 4-th Asian Conferenceon Crystal Growth and Crystal Technology
    • 発表場所
      東北大学
    • 年月日
      2008-05-23
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Crystal Growth and dislocations in lysozyme crystals using synchrotron-ray.2008

    • 著者名/発表者名
      Kenichi Kojima
    • 学会等名
      Asian Conference on Crystal Growth and Crystal Technology
    • 発表場所
      Tohoku University
    • 年月日
      2008-05-23
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] タンパク質結晶の放射光トポグラフによる結晶の評価2008

    • 著者名/発表者名
      小島 謙一
    • 学会等名
      タンパク質結晶育成研究会
    • 発表場所
      日立シビックセンター
    • 年月日
      2008-03-18
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Crystal growth and dislocations in hen egg-white lysozyme crystals using synchrotron x-ray topography2008

    • 著者名/発表者名
      K. Kojima
    • 学会等名
      The 4-th Asian Conference on Crystal Growth and Crystal Technology, invited talk, Sendai
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] X-ray topographic work on lysozyme crystals grown in ground and space2007

    • 著者名/発表者名
      Kenichi Kojima
    • 学会等名
      ITT2
    • 発表場所
      Nara
    • 年月日
      2007-10-21
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] タンパク質結晶の欠陥の放射光トポグラフによる評価2007

    • 著者名/発表者名
      小島 謙一
    • 学会等名
      平成19年度日本結晶成長学会
    • 発表場所
      北海道大学
    • 年月日
      2007-10-04
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] タンパク質結晶の転位と力学的性質2007

    • 著者名/発表者名
      小島 謙一
    • 学会等名
      平成19年度秋日本物理学会
    • 発表場所
      北海道大学
    • 年月日
      2007-09-24
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Crystal growth and synchrotron x-ray topography of orthorhombic hen egg-white lysozyme crystals2007

    • 著者名/発表者名
      Kenichi Kojima
    • 学会等名
      The 15th International Conference on Crystal Growth
    • 発表場所
      Salt Lake City
    • 年月日
      2007-08-14
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Indentation and dislocations in protein crystals2007

    • 著者名/発表者名
      Kenichi Kojima
    • 学会等名
      International Indentation Workshop 3
    • 発表場所
      Cambridge University
    • 年月日
      2007-07-19
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Indentations and Dislocations in Protein Crystals.(invited talk)2007

    • 著者名/発表者名
      Kenichi Kojima
    • 学会等名
      The third International Work Shop on Indentation
    • 発表場所
      Cambridge(UK)
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] X-ray topographic work on lysozyme crystals grown in space.(invited talk)2007

    • 著者名/発表者名
      Kenichi Kojima
    • 学会等名
      The second International Topic Team Meeting on Crystal Growth
    • 発表場所
      Nara(Japan)
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] タンパク質結晶の転位と力学的性質2007

    • 著者名/発表者名
      小島 謙一
    • 学会等名
      日本物理学会第62回年次大会特別講演
    • 発表場所
      札幌(北海道大学
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Crystal perfection and intra-crystalline water on mechanical property of protein Crystal2007

    • 著者名/発表者名
      K. Kojima
    • 学会等名
      The 15th International Conference on Growth
    • 発表場所
      Salt Lake City
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Mechanical properties and dislocations in protein crystals2007

    • 著者名/発表者名
      K. Kojima
    • 学会等名
      Annual meeting of Physical society of Japan (Invited lecture) Sapporo
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] X-ray topographic work on lysozyme crystals grown in space2007

    • 著者名/発表者名
      K. Kojima
    • 学会等名
      The 2nd International Topic Team Meeting on Crystal Growth, Nara (Japan), invited talk
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Indentations and Dislocations in Protein Crystals2007

    • 著者名/発表者名
      K. Kojima
    • 学会等名
      The third International Work Shop on Indentation, Cambridge (UK), invited talk
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Relationship between elastic constants and intracrystallin water in rotein crystals2006

    • 著者名/発表者名
      Kenichi Kojima
    • 学会等名
      The 11th International Conferenceon Crystallization of BioMacromolecules(ICCBM11)
    • 発表場所
      Quebec(Canada)
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Relationship between elastic constants and intracrystallin water in protein crystals2006

    • 著者名/発表者名
      K. Kojima
    • 学会等名
      The 11th International Conference on Crystallization of Bio-Macromolecules(ICCBM11)
    • 発表場所
      Quebec, Canada
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Double images in X-ray topography of protein crystals2006

    • 著者名/発表者名
      H. Koizumi, M. Tachibana, K. Kojima
    • 学会等名
      8th Biennial Conference on High Resolution X-Ray Diffraction and Imaging (XTOP2006), Baden-Baden
    • 発表場所
      Germany
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [備考] 「研究成果報告書概要(和文)」より

    • URL

      http://nanomate.sci.yokohama-cu.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [備考]

    • URL

      http://nanomate.sci.yokohama-cu.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書

URL: 

公開日: 2006-04-01   更新日: 2016-04-21  

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