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シロイヌナズナにおける新生ペプチドによる制御の分子遺伝学的探索および解析

研究課題

研究課題/領域番号 18570032
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 植物生理・分子
研究機関北海道大学

研究代表者

尾之内 均  北海道大学, 大学院・農学研究院, 准教授 (50322839)

研究期間 (年度) 2006 – 2007
研究課題ステータス 完了 (2007年度)
配分額 *注記
4,150千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 450千円)
2007年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
2006年度: 2,200千円 (直接経費: 2,200千円)
キーワードシロイヌナズナ / 上流ORF / 翻訳制御 / 転写後制御 / リボソーム / 新生ペプチド / 翻訳アレスト
研究概要

新生ペプチドが自身を翻訳したリボソームの機能制御に関与し、それによって遺伝子発現が制御される例がいくつか見つかっている。シロイヌナズナにおいて新生ペプチドにより制御される新たな遺伝子を同定することを目的として、シロイヌナズナの完全長cDNAデータベースから同定した5'非翻訳領域にuORFを含む遺伝子の中から、uORFのアミノ酸配列が下流のORFの発現に影響を与えるものを探索した。その結果、新たに転写因子をコードする遺伝子においてuORFのアミノ酸配列依存的に下流ORFの翻訳が抑制されることを見いだした。この遺伝子のuORFにアミノ酸置換を導入することにより、翻訳抑制に重要なアミノ酸の同定を行った。その結果、C末端側の十数アミノ酸の領域が重要であることが明らかになった。この領域は他の植物におけるオルソログと考えられる遺伝子おいても、アミノ酸配列が保存されている。
新たに同定した遺伝子および以前にuORFのアミノ酸配列が下流ORFに関与することが示されているSAM decarboxylase遺伝子について、試験管内翻訳系を用いてuORFペプチドによる翻訳への影響を解析した。その結果、SAM decarboxylase遺伝子のuORFでは、ポリアミンに応答してuORFペプチドによって終止コドンにおいて翻訳アレストが起こることが示された。また、この翻訳アレストは終止コドンに依存しないことが示された。さらに、形質転換シロイヌナズナを用いた解析から、SAM decarboxylase遺伝子のuORFにおける翻訳アレストと共役してmRNA分解が促進されることが示唆された。

報告書

(3件)
  • 2007 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2006 実績報告書
  • 研究成果

    (15件)

すべて 2008 2007 2006

すべて 雑誌論文 (7件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (8件)

  • [雑誌論文] Nascent Peptide-Mediated Translation Elongation Arrest of Arabidopsis thaliana CGS1 mRNA Occurs Autonomously.2008

    • 著者名/発表者名
      Hitoshi Onouchi
    • 雑誌名

      Plant Cell Physiol. 49

      ページ: 549-556

    • NAID

      10027330256

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書 2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Ribosome stacking defines CGS1 mRNA degradation sites during nascent peptide-mediated translation arrest.2008

    • 著者名/発表者名
      Yuhi Haraguchi
    • 雑誌名

      Plant Cell Physiol. 49

      ページ: 314-323

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書 2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Nascent peptide-mediated translation elongation arrest of Arabidopsis thaliana CGS1 mRNA occurs autonomously.2008

    • 著者名/発表者名
      Onouchi, H., Haraguchi, Y., Nakamoto, M., Kawasaki, D., Nagami-Yamashita, Y., Murota, K., Kezuka-Hosomi, A., Chiba, Y. and Naito, S.
    • 雑誌名

      Plant Cell Physiol 49

      ページ: 549-556

    • NAID

      10027330256

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Ribosome stacking defines CGS1 mRNA degradation sites during nascent peptide-mediated translation arrest.2008

    • 著者名/発表者名
      Haraguchi, Y., Kadokura, Y., Nakamoto, M., Onouchi, H. and Naito, S.
    • 雑誌名

      Plant Cell Physiol 49

      ページ: 314-323

    • NAID

      10027329266

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] 新生ペプチドによるリボソーム機能の制御2007

    • 著者名/発表者名
      尾之内 均
    • 雑誌名

      実験医学 25

      ページ: 25-30

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Nascent peptide-mediated regulation of ribosomal function.2007

    • 著者名/発表者名
      Onouchi, H. and Naito., S
    • 雑誌名

      Jikken Igaku 25

      ページ: 25-30

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] 新生ペプチドによるリボソーム機能の制御2007

    • 著者名/発表者名
      尾之内 均
    • 雑誌名

      実験医学 25・1

      ページ: 25-30

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [学会発表] シスタチオニンγ-シンターゼ遺伝子の転写後制御機構:リボソーム出口トンネルの関与2008

    • 著者名/発表者名
      長谷川傑
    • 学会等名
      第49回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター
    • 年月日
      2008-03-21
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] メチオニン生合成の鍵段階酵素遺伝子における翻訳伸長アレストと共役したmRNA分解制御2007

    • 著者名/発表者名
      尾之内均
    • 学会等名
      第48回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      松山大学
    • 年月日
      2007-03-29
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Translation elongation arrest and coupled mRNA decay mechanisms for regulation of the Arabidopsis CGS1 gene that encodes a key enzyme in methionine biosynthesis.2007

    • 著者名/発表者名
      Onouchi, H., Haraguchi, Y., Nakajima, K., Murota, .K., Kadokura, Y., Kawasaki, D., Hirata, K., Nagami, Y., and Naito, S.
    • 学会等名
      The 48th Annual Meeting of the Japanese Society of Plant Physiologists.
    • 発表場所
      Matsuyama University.
    • 年月日
      2007-03-29
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Post-transcriptional regulation of cystathionine γ-synthase: Analyzing the role of the ribosomal exit tunnel.2007

    • 著者名/発表者名
      Hasegawa, S., Nakajima, K., Murota, .K., Onoue, N., Onouchi, H., and Naito, S.
    • 学会等名
      The 48th Annual Meeting of the Japanese Society of Plant Physiologists.
    • 発表場所
      Sapporo Convention Center.
    • 年月日
      2007-03-21
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] シロイヌナズナのCGS1遺伝子における翻訳伸長アレストと共役したmRNA分解制御2006

    • 著者名/発表者名
      尾之内均
    • 学会等名
      日本分子生物学会年会2006フォーラム
    • 発表場所
      名古屋国際会議場
    • 年月日
      2006-12-08
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] シロイヌナズナ・シスタチオニンγ-シンターゼの新生ペプチドによる翻訳アレスト機構2006

    • 著者名/発表者名
      中嶋一恵
    • 学会等名
      日本分子生物学会年会2006フォーラム
    • 発表場所
      名古屋国際会議場
    • 年月日
      2006-12-08
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Regulation of the Arabidopsis CGS1 mRNA stability coupled with translation elongation arrest.2006

    • 著者名/発表者名
      Onouchi, H., Haraguchi, Y., Nakajima, K., Murota, .K., Kadokura, Y., Kawasaki, D., Hirata, K., Nagami, Y., and Naito, S.
    • 学会等名
      Molecular Biology Society of Japan 2006 Forum.
    • 発表場所
      Nagoya Congress Center
    • 年月日
      2006-12-08
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Mechanism of nascent-peptide-mediated translation arrest of Arabidopsis cystathionine γ-synthase.2006

    • 著者名/発表者名
      Nakajima, K., Onouchi, H., and Naito, S.
    • 学会等名
      Molecular Biology Society of Japan 2006 Forum.
    • 発表場所
      Nagoya Congress Center
    • 年月日
      2006-12-08
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要

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公開日: 2006-04-01   更新日: 2016-04-21  

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