二次共生による葉緑体獲得に伴うクロララクニオン藻の植物への適応進化の研究

• 研究課題/領域番号: 18570084
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 生物多様性・分類
• 研究機関: 筑波大学
• 研究代表者: 石田 健一郎 筑波大学, 大学院・生命環境科学研究科, 准教授 (30282198)
• 研究期間 (年度): 2006 – 2008
• 研究課題ステータス: 完了 (2008年度)
• 配分額: 4,080千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 480千円); 2008年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円); 2007年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円); 2006年度: 2,000千円 (直接経費: 2,000千円)
• キーワード: 進化 / 植物化 / 分類学 / クロララクニオン藻 / 二次共生 / 原生生物 / 藻類 / 生物多様性 / ケルコゾア / 分類 / 分子系統 / プロティスト / 植物 / 生活環 / 微細構造

研究概要

二次共生で葉緑体を獲得したクロララクニオン藻について、核コード18SrRNA遺伝子を用いて系統解析を行ない、群内に7主要系統群の存在を明らかにした。また、知見が不十分な7株について、形態、微細構造、タイムラプスビデオによる生活環の観察を行ない、6株(新属新種2株、新種2株、未記載種2株)が新規分類群であることを見いだした。さらに複数の形質について「植物」としての適応進化を考察した。
本藻群に近縁な無色ケルコゾアの新規培養株も5つ確立し、うち2つが新規分類群であること明らかにし、一方は新種として記載した。

研究成果

• [雑誌論文] Phylogeny of novel naked filose and reticulose cercozoa (2009)
  • 著者名/発表者名: Bass D., Chao E., Nikolaevb S., Yabuki A.,Ishida K., Berney C., Pakzad U., Wyleziche C., and Cavalier-Smith T.
  • 雑誌名: Granofilosea cl. n. Proteomyxidea revised. Protist 160(1) ページ: 75-109
• [雑誌論文] Partenskyella glossopodiagen. et sp. Nov (2009)
  • 著者名/発表者名: Ota S., D Vaulot, Le Gall F, Yabuki A. and Ishida K.
  • 雑誌名: the first report of a chlorarachniophyte that lacks a pyrenoid. Protist 160(1) ページ: 137-150
• [雑誌論文] Lotharella oceanica sp. nov.-a new planktonic chlorarachniophyte studied by light and electron microscopy. (2009)
  • 著者名/発表者名: Ota S., Silver T.D., Archibald J. M. and Ishida K.
  • 雑誌名: Phvcoloaia 48(印刷中)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Partenskyella glossopodia gen. et sp. nov., the first report of achlorarachniophyte that lacks a pyrenoid. (2009)
  • 著者名/発表者名: Ota S., D Vaulot, Le Gall F., Yabuki A. and Ishida K.
  • 雑誌名: Protist 160 ページ: 137-150
  • 査読あり
• [雑誌論文] Phylogeny of novel naked filose and reticulose cercozoa: Granofilosea cL n. and Proteomyxidea revised. (2009)
  • 著者名/発表者名: Bass D., Chao E., Nikolaevb S., Yabuki A., Ishida K., Berney C., Pakzad U., Wyleziche C., and Cavalier-Smith T.
  • 雑誌名: Protist 160 ページ: 75-109
  • 査読あり
• [雑誌論文] Chlorarachniophytes. (2008)
  • 著者名/発表者名: Ota S. and Ishida K.
  • 雑誌名: Encyclopedia of Life Sciences(ELS). John Wiley & Sons, Ltd: Chichester.
• [雑誌論文] Norrisiella sphaerica gen. et sp.Nov., a new coccoid chlorarachniophyte from Baja California (2007)
  • 著者名/発表者名: Ota S., Ueda K. and Ishida K.
  • 雑誌名: Mexico. J. Plant Res 120(6) ページ: 661-670
• [雑誌論文] Taxonomic study of Bigelowiella longifilata sp. nov. (Chlorarachniophyta)and a time lapse video observation on the unique migration manner of amoeboid cells (2007)
  • 著者名/発表者名: Ota S., Ueda K. and Ishida K.
  • 雑誌名: J. Phycol 43 ページ: 333-343
• [雑誌論文] Norrisiella sphaerica gen. et sp. nov., a new coccoid chlorarachniophyte from Baja California, Mexico. (2007)
  • 著者名/発表者名: Ota S., Ueda K. and Ishida K.
  • 雑誌名: Journal of Plant Research 120 ページ: 661-670
  • NAID: 10020010356
  • 査読あり
• [雑誌論文] The chlorarachniophytes: evolution and classification. (2007)
  • 著者名/発表者名: Ishida K., Yabuki A. & Ota S.,
  • 雑誌名: Brodie J. and Lewis J.(eds)Unravelling the Algae: The Past, Present, and Future of Algal Systematics. CRC Press, Boca Raton, FL. ページ: 171-182
• [雑誌論文] Taxonomic study of Bigelowiella longifilata sp. nov. (Chlorarachniophyta) and a time lapse video observation on the unique migration manner of amoeboid cells. (2007)
  • 著者名/発表者名: Shuhei Ota, Kunihiko Ueda, Ken-ichiro Ishida
  • 雑誌名: Journal of Phycology 43 ページ: 333-343
• [雑誌論文] Identification and transcription of transfer RNA genes in dinoflagellate plastid minicircles. (2007)
  • 著者名/発表者名: Martha J.Nelson, Yunkun Dang, Elena Filek, Zhaoduo Zhang, Vionnie Wing Chi Yu, Ken-ichiro Ishida, Beverley R.Green
  • 雑誌名: Gene 392 ページ: 291-298
• [学会発表] 有殻アメーバPaulinella chromatophoraにおける細胞内共生藻遺伝子の宿主核への転移 (2009)
  • 著者名/発表者名: 中山卓郎・石田健一郎
  • 学会等名: 日本藻類学会第33回大会
  • 発表場所: 琉球大学・沖縄
  • 年月日: 2009-03-28
• [学会発表] クロララクニオン藻Partenskyella glossopodiaにおける核分裂の形態学的観察。 (2009)
  • 著者名/発表者名: 選藤寛子・大田修平・石田健一郎
  • 学会等名: 日本藻類学会第33回大会
  • 発表場所: 琉球大学・沖縄
  • 年月日: 2009-03-27
• [学会発表] Several genes for chromatophore proteins are nuclear-encoded in Paulinella chromatomhora. (2008)
  • 著者名/発表者名: Nakayama T. and Ishida K.
  • 学会等名: Protist2008
  • 発表場所: Dalhausie University, NS. Canada
  • 年月日: 2008-07-24
• [学会発表] Chlorarachniophvtes (2008)
  • 著者名/発表者名: Ishida K.
  • 学会等名: Tree of Life Web Project Protist Diversity Workshop
  • 発表場所: Lord Nelson Hotel, Halifax. Nova Scotia, Canada
  • 年月日: 2008-07-20
• [学会発表] クロララクニオン植物Lotharella amoebiformisの細胞周期を通しての微小管の動態 (2008)
  • 著者名/発表者名: 大田修平・長里千香子・本村泰三・石田健一郎
  • 学会等名: 日本藻類学会第32回大会
  • 発表場所: 東京海洋大学・品川、東京
  • 年月日: 2008-03-23
• [学会発表] Chlorarachniophytes. The Tree of Life Web Project Protist Diversity Workshop (2008)
  • 著者名/発表者名: Ishida K.
  • 学会等名: Lord Nelson Hotel, Halifax, Nova Scotia
  • 発表場所: Canada
• [学会発表] クロララクニオン植物CCMP622株の分類学的位置とBigelowiella属の再定義 (2007)
  • 著者名/発表者名: 大田修平・矢吹彬憲・石田健一郎
  • 学会等名: 日本植物学会第71回大会
  • 発表場所: 東京理科大学野田キャンパス,千葉
• [学会発表] パラオ産新規原生生物YPF602株の系統的位置に関する研究 (2007)
  • 著者名/発表者名: 矢吹彬憲・石田健一郎
  • 学会等名: 第3回日本進化原生生物学研究会(JSEP)
  • 発表場所: 海洋開発研究機構横浜研究所(神奈川)
• [学会発表] ピコプランクトンサイズの新規クロララクニオン藻RCC365株の形態、微細構造および分類上の位置 (2007)
  • 著者名/発表者名: 大田修平・石田健一郎
  • 学会等名: 日本藻類学会第31回大会
  • 発表場所: 神戸大学、兵庫
• [学会発表] Phylogeny and classification of chlorarachniophytes (2006)
  • 著者名/発表者名: Yabuki A., Ota S. and Ishida K.
  • 学会等名: 16^<th> Meeting of the International Society for Evolutionary Protistology
  • 発表場所: Wroclaw, Poland
• [学会発表] The evolution and diversity of chlorarachniophytes (2006)
  • 著者名/発表者名: Ishida K., Yabuki A. and Ota S.
  • 学会等名: The symposium on Unravelling the algae-the past, present and future of algal molecular systematics
  • 発表場所: Natural History Museum London, UK
• [図書] Plant Peptide Signals In ENCYCLOPEDIA OF LIFE SCIENCES http://www.els. net/[DOI:10. 1002/9780470015902. a0020110] (2007)
  • 著者名/発表者名: Sakagami, Youji
  • 出版者: John Wiley & Sons, Ltd: Chichester(インターネット出版のため不明)
  • DOI: 10.1002/9780470015902.a0020110
  • URL: http://www.els.net/
• [図書] The chlorarachniophytes : evolution and classification(In Brodie J., Lewis J., eds) (2007)
  • 著者名/発表者名: Ishida K., Yabuki A. and Ota S.
  • 出版者: The Past, Present, and Future of Algal Systematics
• [図書] 細胞工学別冊植物細胞工学シリーズ23「植物の進化」(清水健太郎、長谷部光泰監修)(秀潤社) (2007)
  • 著者名/発表者名: 石田健一郎、小池さやか、平川泰久
  • 出版者: 葉緑体の誕生と水平伝播
• [備考] アウトリーチ : 石田健一郎「へんてこ生物」が人類を救う? 自然に学ぶ循環型社会-藻類編」サイエンスアゴラ2008、国際研究交流大学村、東京(講演)
• [備考]
  • URL: http://homepage.mac.com/ken_ishida/index.html
• [備考]
  • URL: http://homepage.mac.com/ken_ishida/index.html