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タンパク質リポイル化の分子機構と構成タンパク質の結晶構造解析

研究課題

研究課題/領域番号 18570108
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 構造生物化学
研究機関徳島大学

研究代表者

藤原 和子  徳島大学, 疾患酵素学研究センター, 准教授 (20108880)

研究期間 (年度) 2006 – 2007
研究課題ステータス 完了 (2007年度)
配分額 *注記
3,930千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 330千円)
2007年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2006年度: 2,500千円 (直接経費: 2,500千円)
キーワードリポ酸 / リポ酸転移酵素 / グリシン開裂酵素系 / α-ケト酸脱水素酵素複合体 / X-線結晶構造解析 / ミトコンドリア / X線結晶構造解析 / リポ酸-タンパク質リガーゼ / グリシン開列酵素系
研究概要

リポ酸転移酵素はlipoyl-AMPを基質として,リポ酸依存性のタンパク質にリポ酸を転移する反応を触媒する.その反応機構を明らかにするために,ウシのリポ酸転移酵素(bLT)の結晶構造解析を行った.組換え型bLTには内因性のlipoyl-AMPが結合しており,このことはbLTがlipoyl-AMPに対して非常に高い親和性を持つことを示す.bLT分子はN末端側とC末端側の2つのドメインより成る.
lipoyl-AMPはN末端側ドメインの活性中心において,そのリポイル部分は疎水性ポケットの中で疎水結合によって,一方,AMP部分は別のトンネル様空洞中で多くの水素結合を介してbLTと結合する.bLTのlipoyl-AMPに対する親和性はadenylate-binding loopによって補強される.これらの結合によってlipoyl-AMPのカルボニル基の炭素原子はbLT分子の表面に露出する.Lipoyl-AMPのカルボニル基の酸素原子はbLT中に保存されたLys135と相互作用し,それによってカルボニル基の炭素原子の正電荷は強まる.結果的にリポイル化されるべきアポタンパク質のリシン残基の求核攻撃が促進され,カルボニル基とリン酸基の間の結合が切断してリポイル化されたタンパク質が生成する.我々は,ミトコンドリアから精製したリポ酸転移酵素にも又lipoylmononucleotideが結合しており,ミトコンドリア内に移行してきたアポタンパク質を直ちにリポイル化できる状態で待機していることを証明した.

報告書

(3件)
  • 2007 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2006 実績報告書
  • 研究成果

    (13件)

すべて 2008 2007 その他

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (5件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] Lipoate-Protein Ligase A: Structure and Function2008

    • 著者名/発表者名
      Kazuko Fujiwara
    • 雑誌名

      Lipoic acid: Energy production, Antioxidant Activity and Health Effects, CRC Press, Taylor & Francis Group. Edited by Mulch

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Lipoate-protein ligase A : structure and function in LipoicAcid : Energy Production, Antioxidant Activity and Health Effects2008

    • 著者名/発表者名
      Kazuko, Fujiwara
    • 雑誌名

      CRC press, Taylor and Francis Group 532

      ページ: 217-233

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Lipoate-Protein Ligase A:Structure and Function2008

    • 著者名/発表者名
      Kazuko Fujiwara
    • 雑誌名

      Lipoic acid:Energy production, Antioxidant Activity and Health Effects, CRC Press,Taylor&Francis Group.Edited by Mulchand

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [雑誌論文] Crystal structure of bovine lipoyltransferase in complex with lipoyl-AMP2007

    • 著者名/発表者名
      Kazuko Fujiwara
    • 雑誌名

      J. Mol. Biol. 371

      ページ: 222-234

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of bovine lipoyltransferase in complex with lipoyl-AMP2007

    • 著者名/発表者名
      Kazuko, Fujiwara
    • 雑誌名

      J. Mol. Biol 371

      ページ: 222-234

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Crystal structure of bovine lipoyltransferase in complex with lipoyl-AMP2007

    • 著者名/発表者名
      Kazuko Fujiwara
    • 雑誌名

      J.Mol.Biol. 371

      ページ: 222-234

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] X線結晶構造解析によるリポ酸転移酵素の触媒機構の解明2007

    • 著者名/発表者名
      藤原 和子
    • 学会等名
      BMB2007
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2007-12-11
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書 2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Catalytic mechanism of the lipoyltransferase based on the X-ray crystal structure analysis2007

    • 著者名/発表者名
      Kazuko, Fujiwara
    • 学会等名
      BMB 2007
    • 発表場所
      Yokohama
    • 年月日
      2007-12-11
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Crystal structure of bovine lipoyltransferase with lipoyl-AMP2007

    • 著者名/発表者名
      Makoto Matsuda
    • 学会等名
      The 2007 Meeting of the American Crystallo-graphic Association
    • 発表場所
      Salt Lake City, Utah, U.S.A.
    • 年月日
      2007-07-23
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Crystal structure of bovine lipoyltransferase with lipoy1-AMP2007

    • 著者名/発表者名
      Makoto, Matsuda
    • 学会等名
      The 2007 Meeting of the American Crystallographic Association
    • 発表場所
      Salt Lake City, Utah, U.S.A.
    • 年月日
      2007-07-23
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Crystal structure of bovine lipoyltransferase with lipoyl-AMP2007

    • 著者名/発表者名
      Makoto Matsuda
    • 学会等名
      アメリカ結晶学会
    • 発表場所
      アメリカ,ソルトレークシティー
    • 年月日
      2007-07-23
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [備考] 「研究成果報告書概要(和文)」より

    • URL

      http://pub2.db.tokushima-u.ac.jp/ERD/person/60597/profile-ja.html

    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [備考]

    • URL

      http://pub2.db.tokushima-u.ac.jp/ERD/person/60597/profile-ja.html

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書

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公開日: 2006-04-01   更新日: 2016-04-21  

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