機能性RNAの生合成過程に関する研究

• 研究課題/領域番号: 18570157
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 分子生物学
• 研究機関: 弘前大学
• 研究代表者: 牛田 千里 弘前大学, 農学生命科学部, 准教授 (50250593)
• 研究期間 (年度): 2006 – 2008
• 研究課題ステータス: 完了 (2008年度)
• 配分額: 4,290千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 690千円); 2008年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円); 2007年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円); 2006年度: 1,300千円 (直接経費: 1,300千円)
• キーワード: 遺伝情報複製 / 転写装置 / 再編 / 制御 / non-coding RNA / ncRNA / 転写 / 線虫 / PSE / ncRNA遺伝子 / プロモーター / イントロン

研究概要

多細胞生物における内在性ncRNAの合成や局在を決定する分子メカニズムの解明、制御機構の理解を目指し、またこれらについての新たなシステムの発見を期待して、線虫(Caenorhabditis elegans)の新規ncRNAの転写や局在を解析した。

研究成果

• [雑誌論文] Distribution of U3 small nucleolar RNA and fibrillarin during early embryogenesis in Caenorhabditis elegans (2008)
  • 著者名/発表者名: Sasano, Y., Hokii, Y., Inoue, K., Sakamoto, H., Ushida, C., Fujiwara, T.
  • 雑誌名: Biochimie 90 ページ: 898-907
  • 査読あり
• [雑誌論文] Distribution of U3 small nucleolar RNA and fibrillarin during early embryogenesis in Caenorhabditis elegans (2008)
  • 著者名/発表者名: Sasano, Y., Hokii, Y., Inoue, K Sakamoto, H., Ushida, C., Fujiwara, T.
  • 雑誌名: Biochimie 90 ページ: 898-907
  • 査読あり
• [雑誌論文] Distribution of U3 small nucleolar RNA and fibrillarin during early embryogenesis in Caenorhabditis elegans (2008)
  • 著者名/発表者名: Sasano, Y., Hokii, Y., Inoue, K., Sakamoto, H., Ushida, C., *Fujiwara, T.
  • 雑誌名: Biochimie (in press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Twelve novel C. elegans RNA candidates isolated by two-dimensional polyacrylamide gel electrophoresis (2005)
  • 著者名/発表者名: Yusuke Hokii, Akiyoshi Kubo, Takahiro Ogasawara, Yuhkou Nogi, Akito Taneda, Risa Arai, Akira Muto, Chisato Ushida.
  • 雑誌名: Gene 365 ページ: 83-87
  • 査読あり
• [学会発表] 線虫pre-rRNAプロセッシングに働く線虫新規ncRNA関連タンパク質の解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 保木井悠介, 笹野有未, 武藤呈, 藤原俊伸, 牛田千里
  • 学会等名: 第3回無細胞生命科学研究会
  • 発表場所: 弘前大学創立50周年記念会館
  • 年月日: 2009-03-16
• [学会発表] C. elegansにおけるsnoRNA結合タンパク質のノックダウンと核内構造体の形成 (2008)
  • 著者名/発表者名: 保木井悠介、菅原由起、笹野有未、藤原俊伸、武藤呈、牛田千里
  • 学会等名: RNAフロンティアミーティング2008
  • 発表場所: 関西セミナーハウス(京都市)
  • 年月日: 2008-06-05
• [学会発表] Expression and localization of C. elegans CeR-5 RNA (2008)
  • 著者名/発表者名: Chisato Ushida, Yuki Sugawara and Yusuke Hokii
  • 学会等名: Keystone symposia RNAi, microRNA, and non-coding RNA
  • 発表場所: Whistler Resort, Whistler
  • 年月日: 2008-03-29
• [学会発表] 核小体局在を示す線虫新規ncRNA (2008)
  • 著者名/発表者名: 保木井悠介、佐藤洋旭、武藤〓、牛田千里
  • 学会等名: 第10回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 札幌コンベンションセンター
• [学会発表] Expression and localization of C (2008)
  • 著者名/発表者名: Chisato Ushida, Yuki Sugawara and Yusuke Hokii
  • 学会等名: elegans CeR-5 RNA. Keystone symposium, RNAi, Micro RNA, and Non-coding RNA
  • 発表場所: Whistler Resort, Whistler, British Columbia, Canada
• [学会発表] 線虫新規低分子ncRNAの局在解析 (2007)
  • 著者名/発表者名: 牛田千里、保木井悠介、菅原由起、遠藤優子、佐藤洋旭、武藤 〓
  • 学会等名: BMB2007(第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会 合同大会)
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2007-12-13
• [学会発表] 線虫snoRNPタンパク質遺伝子ノックダウン株におけるsnoRNAの局在変化 (2007)
  • 著者名/発表者名: 菅原由起、保木井悠介、武藤 〓、牛田千里
  • 学会等名: 第9回 日本RNA学会
  • 発表場所: 名古屋国際会議場
  • 年月日: 2007-07-30
• [学会発表] 受精前後の卵における線虫Caenorhabditis elegans核小体低分子RNAの動態 (2007)
  • 著者名/発表者名: 保木井悠介、笹野有未、藤原俊伸、坂本 博、武藤〓 、牛田千里
  • 学会等名: 第9回 日本RNA学会
  • 発表場所: 名古屋国際会議場
  • 年月日: 2007-07-30
• [学会発表] 線虫の機能RNomics (2007)
  • 著者名/発表者名: 牛田千里、小笠原隆広、天川純一、遠藤優子、菅原由起、武藤 〓、保木井悠介
  • 学会等名: 第40回日本発生生物学会 第59回日本細胞生物学会 合同大会
  • 発表場所: 福岡国際会議場
  • 年月日: 2007-05-29
• [学会発表] 線虫新規低分子ncRNAの局在解析 (2007)
  • 著者名/発表者名: 牛田千里、保木井悠介、菅原由起、遠藤優子、佐藤洋旭、武藤〓
  • 学会等名: 第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
• [学会発表] 線虫snoRNPタンパク質遺伝子ノックダウン株におけるsnoRNAの局在変化 (2007)
  • 著者名/発表者名: 菅原由起、保木井悠介、武藤 〓、牛田千里
  • 学会等名: 第9回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 名古屋国際会議場
• [学会発表] 受精前後の卵における線虫Caenorhabditis elegans核小体低分子RNAの動態 (2007)
  • 著者名/発表者名: 保木井悠介、笹野有未、藤原俊伸、坂本博、武藤 〓、牛田千里
  • 学会等名: 第9回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 名古屋国際会議場
• [学会発表] 線虫の機能Rnomics (2007)
  • 著者名/発表者名: 牛田千里、小笠原隆広、天川純一、遠藤優子、菅原由起、武藤〓、保木井悠介
  • 学会等名: 第40回日本発生生物学会・第59回日本細胞生物学会合同大会
  • 発表場所: 福岡国際会議場
• [学会発表] Spatio temporal distribution patterns of C. elegans small ncRNAs (2006)
  • 著者名/発表者名: Hokii, Y., Sugawara, Y., Endo, Y., Mizuki, Y., Harada, F., Konno, T., Himeno, H., Muto, A., Ushida, C.
  • 学会等名: East Asia C. elegans Meeting
  • 発表場所: Hoam Convention Center, Seoul National University, Seoul, Korea.
• [学会発表] C.elegans 低分子RNACeR-2RNAの細胞内局在と生合成 (2006)
  • 著者名/発表者名: 保木井悠介, 笹野由未, 藤原俊伸, 坂本博, 種田晃人, 武藤〓, 牛田千里
  • 学会等名: 日本RNA学会
  • 発表場所: 淡路夢舞台国際会議場
• [学会発表] Characterization of Cen21/CeR-2 RNA, small ncRNA localized in Caenorhabditis elegans nucleoli (2006)
  • 著者名/発表者名: Yusuke Hokii, Masayoshi Shimoyama, Akira Muto, Chisato Ushida.
  • 学会等名: 20th IUBMB International Congress of Biochemistry and Molecular Biology
  • 発表場所: Kyoto, Japan.
• [学会発表] Expression of C. elegans novel ncRNAs (2006)
  • 著者名/発表者名: Chisato Ushida, Yusuke Hokii, Yuki Sugawara, Yuko Mizuki, Yuko Endo, Akira Muto
  • 学会等名: Regularoty RNAs,the LXXI Cold Spring Harbor Symposium
  • 発表場所: Cold Spring Harbor, New York, U. S. A
• [図書] Isolation and characterization of small RNAs in Caenorhabditis elegans John Rossi and Rajesh K. Gaur eds. Regulation of Gene Expression by Small RNAs (2009)
  • 著者名/発表者名: Chisato Ushida, Yusuke Hokii
  • 出版者: CRC Press, Florida, U. S. A. Chapter 7
• [図書] Isolation and characterization of small RNAs in Caenorhabditis elegans, in Regulation of gene expression by small RNAs. Gaur, R. K. and Rossi, J. J. eds (2009)
  • 著者名/発表者名: Chisato Ushida and Yusuke Hokii
  • 出版者: CRC Press, Florida, U.S.A.
• [図書] 線虫にみるRNA機能の多様性、河合剛太、金井昭夫(編集)、機能性Non-coding RNA、第1部第2章 (2006)
  • 著者名/発表者名: 牛田千里
  • 出版者: クバプロ
• [図書] 機能性Non-coding RNA(河合剛太、金井昭夫編)、線虫に見るRNA機能の多様性 (2006)
  • 著者名/発表者名: 牛田 千里
  • 総ページ数: 255
  • 出版者: クバプロ
• [備考]
  • URL: http://nature.cc.hirosaki-u.ac.jp/kohou2/public/oyo/c.ushida/index.htm
• [備考]
  • URL: http://rna.eit.hirosaki-u.ac.jp/rrc/
• [備考]
  • URL: http://nature.cc.hirosaki-u.ac.jp/kohou2/public/oyo/c.ushida/index.htm