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ヒト遺伝子破壊株を用いた塩基除去修復と組換え修復の相互作用の遺伝的解析

研究課題

研究課題/領域番号 18570163
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 分子生物学
研究機関横浜市立大学

研究代表者

小山 秀機  横浜市立大学, 国際総合科学研究科, 教授 (40085626)

研究分担者 足立 典隆  横浜市立大学, 国際総合科学研究科, 准教授 (30264675)
研究期間 (年度) 2006 – 2007
研究課題ステータス 完了 (2007年度)
配分額 *注記
3,960千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 360千円)
2007年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2006年度: 2,400千円 (直接経費: 2,400千円)
キーワード遺伝学 / 遺伝子 / がん / ゲノム / 修復 / ヒト細胞 / 遺伝子破壊株 / 塩基除去修復 / 組換え修復 / 遺伝子相互作用 / ゲノム不安定性
研究概要

本研究は、塩基除去修復(BER)に働くDNAポリメラーゼβ(POLβ)、2本鎖切断の相同組換え(HR)修復に働くRAD54、非相同末端連結(NHEJ)修復に働くDNAリガーゼIV(LIG4)の各遺伝子破壊株、およびPOLβとRAD54およびPOLβとLIG4の2重破壊株をヒトNalm-6細胞からジーンターゲティング法により作製し、これら破壊株を用いて、自然ないしアルキル化剤や過酸化水素等の処理によって生じる塩基損傷や1本鎖切断のBERによる修復、また損傷部位が複製フォークに衝突し生じる2本鎖切断のHRおよびNHEJによる修復を解析し、異なる修復経路間の連携と相互作用を細胞レベルで明らかにすることを目的として行った。作製した各遺伝子破壊株について、その増殖能やセルサイクル、染色体異常、SCE、などの比較・解析を行った。また、アルキル化剤であるMMSおよびMNNG、過酸化水素、1本鎖切断を生じるDNAトポイソメラーゼI阻害剤カンプトテシン、紫外線、X線、トポイソメラーゼII阻害剤エトポシドやICRF-193などのDNA傷害剤に対する感受性の解析を行った。また、DNA傷害剤で処理したときに細胞に生じたDNAダメージの程度とその修復過程を解析するとともに、ジーンターゲティング効率の比較を行った。以上の実験から、1本鎖切断に由来する2本鎖切断の修復には翼Rが重要であることがわかった。また、DNAポリメラーゼβとDNAリガーゼIVの問に何らかの遺伝的相互作用があることを初めて明らかにした。

報告書

(3件)
  • 2007 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2006 実績報告書
  • 研究成果

    (47件)

すべて 2008 2007 2006 その他

すべて 雑誌論文 (24件) (うち査読あり 9件) 学会発表 (23件)

  • [雑誌論文] The requirement of Artemis in doubles-trand break repair depends on the type of DNA damage2008

    • 著者名/発表者名
      Kurosawa, A., et. al.
    • 雑誌名

      DNA Cell Biol. 27

      ページ: 55-61

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The requirement of Artemis in double-strand break repair depends on the type of DNA damage2008

    • 著者名/発表者名
      Kurosawa, A., et. al.
    • 雑誌名

      DNA Cell Biol 27

      ページ: 55-61

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] The requirement of Artemis in double-strand break repair depends on the type of DNA damage.2008

    • 著者名/発表者名
      Kurosawa, A., et. al.
    • 雑誌名

      DNA Cell Biol. 27

      ページ: 55-61

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Human Mus81 and FANCB independently contribute to repair of DNA damage during replication2007

    • 著者名/発表者名
      Nomura, Y., et. al.
    • 雑誌名

      Genes Cells 12

      ページ: 1111-1122

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Absence of p53 enhances growth defects and etoposide sensitivity of human cells lacking the Bloom syndrome helicase BLM2007

    • 著者名/発表者名
      So, S., et. al.
    • 雑誌名

      DNA Cell Biol. 26

      ページ: 517-525

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Decreased PARP-1 levels accelerate embryonic lethality but attenuate neuronal apoptosis in DNA polymerase β-deficient mice2007

    • 著者名/発表者名
      Sugo, N., et. al.
    • 雑誌名

      Biochem. Biophys. Res. Commun. 354

      ページ: 656-661

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Absence of p53 enhances growth defects and etoposide sensitivity of human cells lacking the Bloom syndrome helicase BLM.2007

    • 著者名/発表者名
      So, S., et. al.
    • 雑誌名

      DNA Cell Biol 26

      ページ: 517-525

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Absence of p53 enhances growth defects and etoposide sensitivity of human cells lacking the Bloom syndrome helicase BLM.2007

    • 著者名/発表者名
      So, S., et. al.
    • 雑誌名

      DNA Cell Biol. 26

      ページ: 517-525

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Human Mus81 and FANCB independently contribute to repair of DNA damage during replication.2007

    • 著者名/発表者名
      Nomura, Y., et. al.
    • 雑誌名

      Genes Cells 12

      ページ: 1111-1122

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Decreased PARP-1 levels accelerate lethality but attenuate neuronal apoptosis in DNA polymerase beta-deficient mice.2007

    • 著者名/発表者名
      Sugo, N
    • 雑誌名

      Biochem. Biophys. Res. Commun. 354

      ページ: 656-661

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] 53BP1 contributes to survival of cells irradiated with X-ray during G1 without Ku70 or Artemis2006

    • 著者名/発表者名
      Iwabuchi, K., et. al.
    • 雑誌名

      Genes Cells 11

      ページ: 935-948

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Parp-1 protects homologous recombination from interference by Ku and Ligase IV in vertebrate cells2006

    • 著者名/発表者名
      Hochegger, H., et. al.
    • 雑誌名

      EMBO J. 25

      ページ: 1304-1314

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Contribution of the myeloperoxidase-dependent oxidative system to host defence aginst Cryptococcus neofrmans2006

    • 著者名/発表者名
      Aratani, Y.
    • 雑誌名

      J. Med. Microbiol. 55

      ページ: 1291-1299

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Simple, one-week method to construct gene targeting vectors : application to production of human knockout cell lines.2006

    • 著者名/発表者名
      Iiizumi, S.
    • 雑誌名

      BioTechniques. 41

      ページ: 311-316

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] 53BP1 meadiates an alternative DNA double-strand break repair pathway that functions preferentially in G1.2006

    • 著者名/発表者名
      Iwabuchi, K.
    • 雑誌名

      Genes to Cells 11

      ページ: 935-948

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Earlier onset of neutrophil-mediated inflammation in the ultraviolet-exposed skin of mice deficient in myeloperoxidase and NADPH oxidase.2006

    • 著者名/発表者名
      Komatsu, J.
    • 雑誌名

      Inflamm. Res. 55

      ページ: 200-206

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Parp-1 protects homologous recombination from intereference by Ku and ligase IV in vertebrate cells.2006

    • 著者名/発表者名
      Hochegger, H.
    • 雑誌名

      EMBO J. 25

      ページ: 1305-1314

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Enhanced gene targerting efficiency in siRNA that silences the expression of the Bloom syndrome gene in human cells.2006

    • 著者名/発表者名
      So, S.
    • 雑誌名

      Genes to Cells 11

      ページ: 363-371

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Decreased mutant frequency in embryonic brain of DNA polymerase polymerase beta-null mice.2006

    • 著者名/発表者名
      Niimi, N.
    • 雑誌名

      Mutagenesis 21

      ページ: 55-59

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] The human pre-B cell line Nalm-6 in highly proficient in gene targeting by homologous recombination.2006

    • 著者名/発表者名
      Adachi, N.
    • 雑誌名

      DNA Cell Biol. 25

      ページ: 19-24

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Heterozygous disruption of the human KU70 gene does not affect cell growth, DNA double-strand break repair, or genome integrity.2006

    • 著者名/発表者名
      Uegaki, K.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res. 5

      ページ: 303-311

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Decreased PARP-1 levels accelerate embryonic lethality but attenuate neuronal apoptosis in DNA polymerase 8 -deficient mice

    • 著者名/発表者名
      Sugo, N., et. al.
    • 雑誌名

      Biochem. Biophys. Res. Commun 354

      ページ: 656-661

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] A new system for analyzing LINE retrotransposition in the chiken DT40 cell line widly used for reverse genetics.

    • 著者名/発表者名
      Honda, H.
    • 雑誌名

      Gene (In press)

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Absence of p53 enhances growth defects and etoposide sensitivity of human cells lacking the Bloom syndrome helicase BLM.

    • 著者名/発表者名
      So, S.
    • 雑誌名

      DNA Cell Biol. (In press)

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [学会発表] Genetic studies on the repair of topoisomerase-mediated DNA damage using human gene knockout cell lines2007

    • 著者名/発表者名
      Kurosawa, A., et. al.
    • 学会等名
      EMBO Workshop 2007 DNA Supercoiling & Topoi somerases
    • 発表場所
      Frejus, France
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] NK314 is a topoisomerase II a specific inhibitor inducing stable cleavage complex and rapid DNA double-strand breaks2007

    • 著者名/発表者名
      Toyoda, E., et. al.
    • 学会等名
      2007 AACR Annual Meeting
    • 発表場所
      LosAngeles, CA, USA
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Impact of DSB repair deficiency in human cells:NHEJ negatively affects cell survival in the presence of rephcation-associated DNA damage2007

    • 著者名/発表者名
      Kurosawa, A, et. al.
    • 学会等名
      BMB2007
    • 発表場所
      Yokohama
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Human Mus81 and FANCB independently contribute to repair of DNA damage during replication2007

    • 著者名/発表者名
      Nomura, Y., et. al.
    • 学会等名
      BMB2007
    • 発表場所
      Yokohama
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] NK314 is a topoisomerase IIalpha specfic in hibitor forming stable DNA cleavage complex2007

    • 著者名/発表者名
      Toyoda, E., et. al.
    • 学会等名
      The 66th Annual Meeting of the Japanese Cancer Association(JCA2007)
    • 発表場所
      Yokohama
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Genetic studies on the repair of topoisomerase-mediated DNA damage using human gene knockout cell lines2007

    • 著者名/発表者名
      Kurosawa, A., et. al.
    • 学会等名
      The 66th Annual Meeting of the Japanese Cancer Association(JCA2007)
    • 発表場所
      Yokohama
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Gene knockout studies on DNA strand break repair in human cells2007

    • 著者名/発表者名
      Adachi, N., et. al.
    • 学会等名
      日本薬学会第127年会
    • 発表場所
      富山
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Genetic studies on the repair of topoisomerase-mediated DNA damage using human gene knockout cell lines2007

    • 著者名/発表者名
      Kurosawa, A., et. al.
    • 学会等名
      EMBO Workshop 2007 DNA Supercoiling & Topoisomerases
    • 発表場所
      Frejus (France)
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] NK314 is a topoisomerase Ha specific inhibitor inducing stable cleavage complex and rapid DNA double-strand breaks2007

    • 著者名/発表者名
      Toyoda, E., et. al.
    • 学会等名
      2007 AACR Annual Meeting
    • 発表場所
      Los Angeles (USA
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Impact of DSB repair deficiency in human cells: NHEJ negatively affects cell survival in the presence of replication-associated DNA damage2007

    • 著者名/発表者名
      Kurosawa, A., et. al.
    • 学会等名
      BMB2007
    • 発表場所
      Yokohama
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] NK314 is a topoisomerase IIalpha specific inhibitor forming stable DNA cleavage complex2007

    • 著者名/発表者名
      Toyoda, E., et. al.
    • 学会等名
      JCA2007
    • 発表場所
      Yokohama
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Genetic studies on the repair of topoisomerase-mediated DNA damage using human gene knockout cell lines2007

    • 著者名/発表者名
      Kurosawa, A., et. al.
    • 学会等名
      JCA2007
    • 発表場所
      Yokohama
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Gene knockout studies on DNA strand break repair in human cells2007

    • 著者名/発表者名
      Adachi, N., et. al.
    • 学会等名
      127th Annual Meeting of the Pharmaceutical Society of Japan
    • 発表場所
      Toyama
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Impact of DSB repair deficiency on damage sensitivity:NHEJ negatively affects cell survival in the presence of DNA lesions that rely on homologous DNA repair2006

    • 著者名/発表者名
      Adachi, N., et. al.
    • 学会等名
      The Salk/Caltech conference on DNA Replication and Genome Inteerity
    • 発表場所
      La Jolla, CA, USA
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Gene knockout studies on DNA double-strand break repair in human cells2006

    • 著者名/発表者名
      Adachi, N., et. al.
    • 学会等名
      第65回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      横浜
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Nonhomologous end-joining negatively affects cell survival in the resence of DNA lesions that rely on homoloous DNA repair2006

    • 著者名/発表者名
      Adachi, N., et. al.
    • 学会等名
      20th IUBMB Int'l Congress of Biochemistry and Molecular Biology and 11th FAOBMB Congress
    • 発表場所
      Kyoto
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Impact of DNA ligase IV deficiency on random and targeted integration2006

    • 著者名/発表者名
      Iiizumi, S., et. al.
    • 学会等名
      20th IUBMB Int'l Congress of Biochemistry and Molecular Biology and 11th EAOBMB Congress
    • 発表場所
      Kyoto
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Genetic analysis of human Artemis2006

    • 著者名/発表者名
      Kurosawa, A, et. al.
    • 学会等名
      2006年分子生物学フォーラム
    • 発表場所
      名古屋
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Impact of DSB repair deficiency on damage sensitivity: NHEJ negatively affects cell survival in the presence of DNA lesions that rely on homologous DNA repair2006

    • 著者名/発表者名
      Adachi, N., et. al.
    • 学会等名
      The Salk/Caltech conference on DNA. Replication and Genome Integrity
    • 発表場所
      La Jolla (USA)
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Gene knockout studies on DNA double-strand break repair in human cells2006

    • 著者名/発表者名
      Adachi, N., et. al.
    • 学会等名
      JCA2006
    • 発表場所
      Yokohama
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Nonhomologous end-joining negatively affects cell survival in the presence of DNA lesions that rely on homologous DNA repair2006

    • 著者名/発表者名
      Adachi, N., et. al.
    • 学会等名
      20th IUBMB Int'l and llth FAOBMB Congress
    • 発表場所
      Kyoto
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Impact of DNA ligase IV deficiency on random and targeted integration2006

    • 著者名/発表者名
      Iiizumi, S., et. al.
    • 学会等名
      20th IUBMB Int'l and llth FAOBMB Congress
    • 発表場所
      Kyoto
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Genetic analysis of human Artemis2006

    • 著者名/発表者名
      Kurosawa, A., et. al.
    • 学会等名
      2006 Mol. Biol. Forum
    • 発表場所
      Nagoya
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要

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公開日: 2006-04-01   更新日: 2016-04-21  

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