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ゴルジ体サブコンパートメント精製法を用いたペリフェラル膜蛋白質の局在化機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 18580068
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 応用微生物学
研究機関東京大学

研究代表者

野田 陽一  東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 助教 (90282699)

研究期間 (年度) 2006 – 2007
研究課題ステータス 完了 (2007年度)
配分額 *注記
3,890千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 390千円)
2007年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2006年度: 2,200千円 (直接経費: 2,200千円)
キーワードゴルジ体 / 小胞輸送 / 出芽酵母 / 応用微生物 / 蛋白質
研究概要

我々の研究室で開発したゴルジ体のearly, lateのサブコンパートメントを免疫学的に分離して精製する方法が,ペリフェラル膜蛋白質の局在,機能解析に用いることができるか評価するための実験を行ったARFのGDP/GTP Exchan ge Factor (GEF)として機能するGeal, Gea2に関してゴルジ体のサブコンパートメント精製法によりその局在を決定したところ,early Golgiに多く存在し,過去の報告から機能すると推定されていた場所と一致することがわかり,サブコンパートメント精製法がペリフェラル膜蛋白質の局在決定,網羅的な同定に有効であることが明らかとなった.またRabファミリー蛋白質であるYpt1, Ypt31のGEFで複数のサブユニットからなるTRAPPに関して同じ実験を行ったところ,late Golgiに多く存在するという新規の知見を得た.しかしながら,解析を行ったペリフェラル膜蛋白質の多くは,たとえ固定細胞を蛍光顕微鏡観すると強いゴルジ体のドットして観察されるものであっても,細胞を破砕するとゴルジ体膜から遊離してしまい,本研究の免疫学的精製法によりゴルジ体膜各サブコンパートメント画分に回収される蛋白量が非常に少なくなってしまうという現象に遭遇した.ゴルジ体膜に存在するペリフェラル膜蛋白質の網羅的な同定を行うためこれを改善する必要があると考えた.各種の条件検討を行ったところ,細胞の破砕法をlyticaseによる細胞壁を酵素消化する方法から,ガラスビーズによる物理的な破砕法に変更することによりゴルジ体膜画分への収量が劇的に増加することを見いだした.本研究により,ペリフェラル膜蛋白質のゴルジ体サブコンパートメント特異的な局在化の分子機構の詳細な解析と,質量分析計を用いたゴルジ体ペリフェラル膜蛋白質の網羅的な同定のための基盤を確立することに成功した.

報告書

(3件)
  • 2007 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2006 実績報告書
  • 研究成果

    (35件)

すべて 2008 2007 2006 その他

すべて 雑誌論文 (22件) (うち査読あり 11件) 学会発表 (12件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] KEGI/YFRO42w encodes a novel Kre6-binding ER membrane protein responsible for beta -1,6-glucan synthesis in Saccharomyces cerevisiae2007

    • 著者名/発表者名
      Kousuke Nakamata, Tomokazuk Kurita, M. Shah Alam Bhuiyan, Keisuke Sato, Yoichi Noda, and Koji Yoda
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry 282

      ページ: 34315-34324

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Pgal is an essential component of Glycosylphosphatidylinositol-mannosyltransferase II of Saccharomyces cerevisiae.2007

    • 著者名/発表者名
      Keisuke Sato, Yoichi Noda, and Koji Yoda
    • 雑誌名

      Molecular Biology of the Cell 18

      ページ: 3472-3485

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Specific membrane recruitment of Usol protein, the essential endoplasmic reticulum-to-Golgi tethering factor in yeast vesicular transport2007

    • 著者名/発表者名
      Yoichi Noda, Tomoe Yamagishi, Koji Yoda
    • 雑誌名

      Journal of Cellular Biochemistry 101

      ページ: 686-694

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Saccharomyces cerevisiae BOR1p is a boron exporter and a key determinant of boron torelance2007

    • 著者名/発表者名
      Junpei Takano, Masaharu Kobayashi, Yoichi Noda and Toru Fujiwara
    • 雑誌名

      FEMS Microbiology Letters 267

      ページ: 230-235

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Peculiar protein-protein interactions of the novel endoplasmic reticulum membrane protein Rcr1 and ubiquitin ligase Rsp52007

    • 著者名/発表者名
      Keita Imai, Yoichi Noda, Hiroyuki Adachi, Koji Yoda
    • 雑誌名

      Biosci. Biotechnol. Biochem 71

      ページ: 249-252

    • NAID

      10027510698

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Tvp38, Tvp23, Tvp18 and Tvp15: novel membrane proteins in the Tlg2-containing Golgi/endosome compartments of Saccharomyces cerevisiae2007

    • 著者名/発表者名
      Hironori Inadome, Yoichi Noda, Yurika Kamimura, Hiroyuki Adachi, Koji Yoda
    • 雑誌名

      Exp. Cell. Res 313

      ページ: 688-697

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Tvp38, Tvp23, Tvp18 and Tvp15 : novel membrane proteins in the Tlg2-containing Golgi/endosome compartments of Saccharomyces cerevisiae2007

    • 著者名/発表者名
      Hironori Inadome, Yoichi Noda, Yurika Kamimura, Hiroyuki Adachi, Koji Yoda
    • 雑誌名

      Exp. Cell. Res 313(4)

      ページ: 688-697

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Peculiar protein-protein interactions of the novel endoplasmic reticulum membrane protein Rcr1 and ubiquitin ligase Rsp52007

    • 著者名/発表者名
      Keita Imai, Yoichi Noda, Hiroyuki Adachi, Koji Yoda
    • 雑誌名

      Biosci. Biotechnol. Biochem 71(1)

      ページ: 249-252

    • NAID

      10027510698

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Pgal is an essential component of Glycosylphosphatidylinositol-mannosyltransferase II of Saccharomyces cerevisiae2007

    • 著者名/発表者名
      Keisuke Sato, Yoichi Noda, and Koji Yoda
    • 雑誌名

      Mol. Biol. Cell 18(9)

      ページ: 3472-3485

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Specific membrane recruitment of Usol protein, the essential endoplasmic reticulum-to-Golgi tethering factor in yeast vesicular transport2007

    • 著者名/発表者名
      Yoichi Noda, Tomoe Yamagishi, Koji Yoda
    • 雑誌名

      J. Cell. Biochem 101(3)

      ページ: 686-694

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] KEG1/YFR042w encodes a novel Kre6-binding ER membrane protein responsible for beta-1,6-glucan synthesis in Saccharomyces cerevisiae2007

    • 著者名/発表者名
      Kousuke Nakamata, Tomokazu Kurita, M. Shah Alam Bhuiyan, Keisuke Sato, Yoichi Noda, and Koji Yoda
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem 282(47)

      ページ: 34315-34324

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] KEG1/YFRO42w encodes a novel Kre6-binding ER membrane protein responsible for beta-1,6-glucan synthesis in Saccharomyces cerevisiae2007

    • 著者名/発表者名
      Kousuke Nakamata, Tomokazu Kurita, M. Shah Alam Bhuiyan, Keisuke Sato, Yoichi Noda, and Koji Yoda
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry 282

      ページ: 34315-34324

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Pga1 is an essential component of Glycosylphosphatidylinositol-mannosyltransferase II of Saccharomyces cerevisiae.2007

    • 著者名/発表者名
      Keisuke Sato, Yoichi Noda, and Koji Yoda
    • 雑誌名

      Molecular Biology of the Cell 18

      ページ: 3472-3485

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Specific Membrane Recruitment of Uso1 Protein, theEssential Endoplasmic Reticulum-to-Golgi Tethering Factor in Yeast Vesicular Transport2007

    • 著者名/発表者名
      Yoichi Noda, Tomoe Yamagishi, Koji Yoda
    • 雑誌名

      Journal of Cellular Biochemistry (Published on line)

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Saccharomyces cerevisiae Bor1p is a boron exporter and a key determinant of boron tolerance2007

    • 著者名/発表者名
      Junpei Takano, Masaharu Kobayashi, Yoichi Noda, Toru Fujiwara
    • 雑誌名

      FEMS Microbiology Letters 267

      ページ: 230-235

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Peculiar protein-protein interactions of the novel endoplasmic reticulum membrane protein Rcr1 and ubiquitin ligase Rsp52007

    • 著者名/発表者名
      Imai Keita, Yoichi Noda, Hiroyuki Adachi, Koji Yoda
    • 雑誌名

      Biosci. Biotechnol. Biochen. 71

      ページ: 249-252

    • NAID

      10027510698

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Molecular cloning and characterization of a Pichia pastoris ortholog of_the yeast Golgi GDP-mannose transporter gene.2006

    • 著者名/発表者名
      Kumiko Arakawa, Masato Abe, Yoichi Noda, Hiroyuki Adachi and Koji Yoda.
    • 雑誌名

      J. Gen. Appl. Microbiol 52

      ページ: 137-145

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Isolation and structural analysis of efficient autonomously replicating sequences (ARSs) of the yeast Candida utilis2006

    • 著者名/発表者名
      Ryo Iwakiri, Shogo Eguchi, Yoichi Noda, Hiroyuki Adachi, Koji Yoda
    • 雑誌名

      Yeast 23

      ページ: 23-34

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Tvp38, Tvp23, Tvp18 and Tvp15 : Novel membrane proteins in the Tlg2- containing Golgi/endosome compartments of Saccharomyces cerevisiae2006

    • 著者名/発表者名
      Hironori Inadome, Yoichi Noda, Yurika Kamimura, Hiroyuki Adachi, Koji Yoda
    • 雑誌名

      Experimental Cell Research 313

      ページ: 688-697

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] Molecular cloning and characterization of a Pichia pastoris ortholog of the yeast Golgi GDP-mannose transporter gene2006

    • 著者名/発表者名
      Kumiko Arakawa, Masato Abe, Yoichi Noda, Hiroyuki Adachi, Koji Yoda
    • 雑誌名

      J. Gen. Appl. Microbiol. 52

      ページ: 137-145

    • NAID

      130004802064

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [雑誌論文] The Rab GTPase Ypt11 functions in bud-directed transport of the Golgi by linking Myo2 to the coatomer subunit Ret2

    • 著者名/発表者名
      Seisuke Arai, Yoichi Noda, Satoko Kainuma, Ikuo Wada, and Koji Yoda
    • 雑誌名

      Current Biology (In press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The Rab GTPase Ypt11 functions in bud-directed transport of the Golgi by linking Myo2 to the coatomer subunit Ret2

    • 著者名/発表者名
      Seisuke Arai, Yoichi Noda, Satoko Kainuma, Ikuo Wada, and Koji Yoda
    • 雑誌名

      Curr. Biol (in press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Saccharomyces cerevisiaeのβ-1,6-グルカン合成に関わる必須遺伝子KEGIの解析2008

    • 著者名/発表者名
      栗田朋和, 中俣浩介, M. Shah Alam Bhuiyan, 佐藤啓介, 野田陽一, 依田幸司
    • 学会等名
      日本農芸化学会2008年度大会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2008-03-30
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] KEG1/YFR042w encodes a novel Kre6-binding ER membrane protein responsible for beta-1,6-glucan synthesis in Saccharomyces cerevisiae2008

    • 著者名/発表者名
      Tomokazu Kurita, Kousuke Nakamata, M. Shah Alam Bhuiyan, Keisuke Sato, Yoichi Noda, and Koji Yoda
    • 学会等名
      Annual Meeting of Japan Society for Bioscience, Biotechnology, and Agrochemistry
    • 発表場所
      Nagoya
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Pgal is an essential component of Glycosylphosphatidylinositol-mannosyltransferase II of Saccharomyces cerevisiae2007

    • 著者名/発表者名
      Keisuke Sato, Yoichi Noda, and Koji Yoda
    • 学会等名
      XXIIIrd International Conference on Yeast Geneti cs and Molecular Biology
    • 発表場所
      メルボルン
    • 年月日
      2007-07-02
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Pga1 is an essential component of Glycosylphosphatidylinositol-mannosyltransferase II of Saccharomyces cerevisiae.2007

    • 著者名/発表者名
      Keisuke Sato, Yoichi Noda, and Koji Yoda
    • 学会等名
      XXIIIrd International Conference on Yeast Genetics and Molecular Biology
    • 発表場所
      メルボルン
    • 年月日
      2007-07-02
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 出芽酵母ゴルジ体膜タンパク質Svp26はマンノース転移酵素の局在に関与する2007

    • 著者名/発表者名
      野田陽一, 依田幸司
    • 学会等名
      日本農芸化学会2007年度大会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2007-03-30
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] 出芽酵母Ypt11タンパク質のゴルジ体分配における役割2007

    • 著者名/発表者名
      荒井斉祐、野甲陽一、依田幸司
    • 学会等名
      日本農芸化学会2007年度大会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2007-03-30
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Yeast protein Svp26 functions to localize mannosyltransferase to the Golgi2007

    • 著者名/発表者名
      Yoichi Noda and Koji Yoda
    • 学会等名
      Annual Meeting of Japan Society for Bioscience, Biotechnology, and Agrochemistry
    • 発表場所
      Tokyo
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Analysis of Ypt11 function in Golgi inheritance2007

    • 著者名/発表者名
      Seisuke Arai, Yoichi Noda and Koji Yoda
    • 学会等名
      Yeast Genetics Society of Japan, the 39rd meeting
    • 発表場所
      Osaka
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Pga1 is an essential component of Glycosylphosphatidylinositol-Mannosyltransferase II of Saccharomyces cerevisiae2007

    • 著者名/発表者名
      Keisuke Sato, Yoichi Noda, and Koji Yoda
    • 学会等名
      XXIIIrd International Conference on Yeast Genetics and Molecular Biology, Melbourne, Australia
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] 出芽酵母Ypt11タンパク質のゴルジ体分配における機能2006

    • 著者名/発表者名
      荒井斉祐、野田陽一、依田幸司
    • 学会等名
      酵母遺伝学フォーラム
    • 発表場所
      三島
    • 年月日
      2006-07-16
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] 輸送経路で働く新たな膜蛋白質の発見と機能解析2006

    • 著者名/発表者名
      野田陽一
    • 学会等名
      酵母合同シンポジウム
    • 発表場所
      山梨
    • 年月日
      2006-06-01
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Ypt11 functions to deliver the late Golgi to the bud2006

    • 著者名/発表者名
      Seisuke Arai, Yoichi Noda and Koji Yoda
    • 学会等名
      Yeast Genetics Society of Japan, the 39 meeting
    • 発表場所
      Mishima
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [備考] 「研究成果報告書概要(和文)」より

    • URL

      http://park.itc.u-tokyo.ac.jp/molbiotech/

    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要

URL: 

公開日: 2006-04-01   更新日: 2016-04-21  

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