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進化分子工学と分子動力学計算の併用による脱水素酵素の機能改変

研究課題

研究課題/領域番号 18580093
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 応用生物化学
研究機関島根大学

研究代表者

澤 嘉弘  島根大学, 生物資源科学部, 教授 (70127489)

研究期間 (年度) 2006 – 2007
研究課題ステータス 完了 (2007年度)
配分額 *注記
3,800千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 300千円)
2007年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2006年度: 2,500千円 (直接経費: 2,500千円)
キーワードグルタミン酸脱水素酵素 / アスパラギン酸脱水素酵素 / リンゴ酸脱水素酵素 / 分子動力学計算 / 進化分子工学 / MOE / アスパラギン酸 / 脱水素酵素 / ランダム変異
研究概要

最近、我々は、Bacillus subtilis由来グルタミン酸脱水素酵素(BsGluDH)のG82KおよびM101S変異酵素が、オキサロ酢酸に対して高い活性を示すことを報告している。本研究では、上記同様にすでに報告しているBsGluDH熱安定化変異酵素Q144Rとこれらの変異部位を組み合わせた、二重化変異酵素を作成して、その基質特異性を検討した。その結果、Q144R/G82KとQ144R/M101Sのオキサロ酢酸に対するKcat埴は、1.99,2.14s^<-1>であり、単置換酵素より、いくぶん低下が認められたが、単置換酵素では見られなかったピルビン酸に対して高い活性(5.73and2.69s^<-1>)を示すようになった。さらに進化分子工学を用いて、kcat値の上昇を試みているが、現在までに、オキサロ酢酸、ピルビン酸共に、活性の上昇した変異酵素は得られていない。
リンゴ酸脱水素酵素(MDH)よりアスパラギン酸脱水素酵素(AspDH)が、発散進化により生じたという仮説を立て、各種リンゴ酸脱水素酵素の、L-アスパラギン酸酸化的脱アミノ活性を示すMDHをスクリーニングした。各種MDHの中で、大腸菌由来のMDHのみが、L-アスパラギン酸の酸化的脱アミノ活性をわずかに示した。37-50℃の範囲では、EcMDHの酸化的脱アミノ活性は、アーキアAspDHより高かったが、アスパラギン酸に対する親和性はAfAspDHよりかなり低くなった。そこで、EcMDHのAspDH反応性を改善するために、MOEの分子動力学計算を用いて、活性中心近傍のループ部分の変異酵素を種々設計した(N119S,N119A,A80P,P83V,G84V,D86G,R87G,S222G,V213F,V214F,E215D,E215R)。これらの変異酵素の中で、E215DとE215Rが、野生型酵素のアスパラギン酸酸化的脱アミノ活性よりかなり高い活性を示した。しかしながら、これらの変異酵素は、いずれも、L-アスパラギン酸合成活性、すなわちオキサロ酢酸の還元的アミノ化活性をまったく示さなかった。

報告書

(3件)
  • 2007 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2006 実績報告書
  • 研究成果

    (37件)

すべて 2007 2006

すべて 雑誌論文 (7件) (うち査読あり 4件) 学会発表 (28件) 図書 (2件)

  • [雑誌論文] Temperature-dependent stomatal movement in tulip petals controls water transpiration during flower opening and closing.2007

    • 著者名/発表者名
      A.K.Y. Azad
    • 雑誌名

      Annals of Applied Biology 150

      ページ: 81-81

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification of critical structural determinants responsible for octopamine binding to the alpha-adrenergic-like Bombyx mori octopamine receptor.2007

    • 著者名/発表者名
      J. Huang
    • 雑誌名

      Biochemistry 46

      ページ: 5896-5896

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Temperature-dependent stomatal movement in tulip petals controls water transpiration during flower opening and closing2007

    • 著者名/発表者名
      A.K.Y., Azad, Y., Sawa, T., Ishikawa, H., Shibata
    • 雑誌名

      Annals of Applied Biology 150

      ページ: 81-87

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Identification of critical structural determinants responsible for octopamine binding to the alpha-adrenergic-like Bombyx mori octopamine receptor2007

    • 著者名/発表者名
      J., Huang, T., Hamasaki, F., Ozoe, K., Enomoto, H., Kataoka, Y., Sawa, A., Hirota, Y., Ozoe
    • 雑誌名

      Biochemistry 46

      ページ: 5896-903

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Identification of critical structural determinants responsible for octopamine binding to the alpha-adrenergic-like Bombyx mori octopamine receptor2007

    • 著者名/発表者名
      J. Huang
    • 雑誌名

      Biochemistry 46

      ページ: 5896-5896

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Purification and characterization of protein phosphatase 2A from petals of Tulipa gesnerina.2006

    • 著者名/発表者名
      A.K.Y. Azad
    • 雑誌名

      Journal of Biochemistry and Molecular Biology 39

      ページ: 671-671

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Purification and characterization of protein phosphatase 2A from petals of Tu.Spa gesnerina2006

    • 著者名/発表者名
      A.K.Y., Azad, Y., Sawa, T., Ishikawa, H., SHIBATA
    • 雑誌名

      Journal of. Biochemistry and Molecular Biology 39

      ページ: 671-676

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] アスパラギン酸脱水素酵素及びリンゴ酸脱水素酵素共役反応系によるL-アスパラギン酸合成2007

    • 著者名/発表者名
      川上 矩加
    • 学会等名
      第59回日本生物工学会大会
    • 発表場所
      広島県
    • 年月日
      2007-09-25
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書 2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] L-Aspartate production by aspartate dehydrogenase and malate dehydrogenase2007

    • 著者名/発表者名
      N., Kawakami
    • 学会等名
      The 59th Annual Meeting of the Society for Biotechnology, Japan
    • 発表場所
      Hiroshima
    • 年月日
      2007-09-25
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Catalytic conversion of malate dehydrogenase to aspartate dehydrogenase No.22007

    • 著者名/発表者名
      Yinxia Li
    • 学会等名
      日本農芸化学会中四国・西日本支部合同大会
    • 発表場所
      山口県
    • 年月日
      2007-09-15
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書 2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Catalytic conversion of malate dehydrogenase to aspartate dehydrogenase No.22007

    • 著者名/発表者名
      Yinxia, Li
    • 学会等名
      The Joint Annual Meeting for the Chu-Sikoku and the Nishinihon of JSBBA
    • 発表場所
      Yamaguchi
    • 年月日
      2007-09-15
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] 大腸菌由来リンゴ酸脱水素酵素の触媒性変換2007

    • 著者名/発表者名
      川上 矩加
    • 学会等名
      日本ビタミン学会第59回大会
    • 発表場所
      長崎県
    • 年月日
      2007-05-25
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書 2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Catalytic conversion of E. coli malata dehydrogenase2007

    • 著者名/発表者名
      N., Kawakami
    • 学会等名
      59th Annual Meeting of the Vitamin Society of Japan
    • 発表場所
      Nagasaki
    • 年月日
      2007-05-25
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Catalytic conversion of malate dehydrogenase to aspartate dehydrogenase2007

    • 著者名/発表者名
      Yinxia Li
    • 学会等名
      第49回日本生化学会中国・四国支部例会
    • 発表場所
      高知県
    • 年月日
      2007-05-19
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書 2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Catalytic conversion of malate dehydrogenase to aspartate dehydrogenase2007

    • 著者名/発表者名
      Yinxia, Li
    • 学会等名
      The 48th Annual Meeting for the Chugoku-Sikoku Branch of the JBS
    • 発表場所
      Kochi
    • 年月日
      2007-05-19
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Conversion of a labile glutamate dehydrogenase into stable aspartate dehydro-genases by site directed mutagenesis2007

    • 著者名/発表者名
      Yinxia Li
    • 学会等名
      2007年度日本農芸化学会大会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2007-03-25
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Conversion of a labile glutamate dehydrogenase into stable aspartate dehydrogenases by site directed mutagenesis2007

    • 著者名/発表者名
      Yinxia, Li
    • 学会等名
      Annual Meeting of JSBBA 2007
    • 発表場所
      Tokyo
    • 年月日
      2007-03-25
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Cloning and functional analysis of plasma membrane aquaporins subfamilies of tulip petal2006

    • 著者名/発表者名
      M.A.K. Azad
    • 学会等名
      Joint annual meeting of the American Society of Plant Biologists and the Canadian Society of Plant Biologists
    • 発表場所
      Boston, MA, USA
    • 年月日
      2006-08-07
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Cloning and functional analysis of plasma membrane aquaporins subfamilies of tulip petal2006

    • 著者名/発表者名
      M.A.K., Azad
    • 学会等名
      Annual meeting of the American Society of Plant Biologists
    • 発表場所
      MA, USA
    • 年月日
      2006-08-07
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Reversible phosphorylation of plasma membrane aquaporin regulates temperature-dependent oscillation of tulip petals.2006

    • 著者名/発表者名
      M.A.K. Azad
    • 学会等名
      20th IUBMB International Congress of Biochemistry and Molecular Biology and 11th FAOBMB Congress
    • 発表場所
      Kyoto
    • 年月日
      2006-06-21
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Reversible phosphorylation of plasma membrane aquaporin regulates temperature- dependent oscillation of tulip petals2006

    • 著者名/発表者名
      M.A.K., Azad
    • 学会等名
      20th IUBMB International Congress of Biochemistry and Molecular Biology
    • 発表場所
      Kyoto
    • 年月日
      2006-06-21
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Catalytic mechanism of alanine dehydrogenase from cyanobacterium Phrmidium lapideum.2006

    • 著者名/発表者名
      H. Ashida
    • 学会等名
      20th IUBMB International Congress of Biochemistry and Molecular Biology and 11th FAOBMB Congress
    • 発表場所
      Kyoto
    • 年月日
      2006-06-18
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Functional analysis of glutamine synthetase adenylyltransferase from Escherichiacoli2006

    • 著者名/発表者名
      M. Ishida
    • 学会等名
      20th IUBMB International Congress of Biochemistry and Molecular Biology and 11th FAOBMB Congress
    • 発表場所
      Kyoto
    • 年月日
      2006-06-18
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Catalytic mechanism of alanine dehydrogenase from cyanobacterium Phrmidium lapideum2006

    • 著者名/発表者名
      H., Ashida
    • 学会等名
      20th IUBMB International Congress of Biochemistry and Molecular Biology
    • 発表場所
      Kyoto
    • 年月日
      2006-06-18
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Functional analysis of glutamine synthetase adenylyltransferase from Escherichia coli2006

    • 著者名/発表者名
      M., Ishida
    • 学会等名
      20th IUBMB International Congress of Biochemistry and Molecular Biology
    • 発表場所
      Kyoto
    • 年月日
      2006-06-18
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] 2-ヒドロキシ酸脱水素酵素とアミノ酸脱水素酵素の触媒反応性相互変換2006

    • 著者名/発表者名
      和田 剛
    • 学会等名
      日本ビタミン学会第58回大会
    • 発表場所
      徳島県
    • 年月日
      2006-05-28
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Catalytic inter-conversion between 2-hydorxy-acid dehydrogenase and amino-acid dehydrogenase2006

    • 著者名/発表者名
      T., Wada
    • 学会等名
      The 58th Annual Meeting of the Vitamin Society of Japan
    • 発表場所
      Tokushima
    • 年月日
      2006-05-28
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Tulip plasma membrane intrinsic proteins: Cloning and functional analysis2006

    • 著者名/発表者名
      M.A.K. Azad
    • 学会等名
      第47回日本生化学会中国・四国支部例会
    • 発表場所
      島根県
    • 年月日
      2006-05-13
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Tulip plasma membrane intrinsic proteins : Cloning and functional analysis2006

    • 著者名/発表者名
      M.A.K., Azad
    • 学会等名
      The 47th Annual Meeting for the Chugoku-Sikoku Branch of the JBS
    • 発表場所
      Shimane, Japan
    • 年月日
      2006-05-13
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] ラン藻Synechocystis sp. PCC6803におけるグルタチオン生合成酵素遺伝子の転写調節2006

    • 著者名/発表者名
      芦田裕之
    • 学会等名
      第47回日本生化学会中国・四国支部例会
    • 発表場所
      島根県
    • 年月日
      2006-05-12
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] バクテリア由来リンゴ酸脱水素酵素のアミノ酸脱水素活性2006

    • 著者名/発表者名
      和田 剛
    • 学会等名
      第47回日本生化学会中国・四国支部例会
    • 発表場所
      島根県
    • 年月日
      2006-05-12
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] グルタミン合成酵素アデニリルタランスフェラーゼの構造と機能2006

    • 著者名/発表者名
      西藤 拓
    • 学会等名
      第47回日本生化学会中国・四国支部例会
    • 発表場所
      島根県
    • 年月日
      2006-05-12
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Gene expression for glutathione biosynthetic enzymes in Synechocystis sp. PCC68032006

    • 著者名/発表者名
      H., Asbida
    • 学会等名
      The 47th Annual Meeting for the Chugoku-Sikoku. Branch of the JBS
    • 発表場所
      Shimane
    • 年月日
      2006-05-12
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Side reaction of bacterial malate dehydrogenase2006

    • 著者名/発表者名
      T., Wada
    • 学会等名
      The 47th Annual Meeting for the Chugoku-Sikoku Branch of the JBS
    • 発表場所
      Shimane
    • 年月日
      2006-05-12
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Structure and function of glutamine synthetase adenylyltransferase2006

    • 著者名/発表者名
      T., Nishifuji
    • 学会等名
      The 47th Annual Meeting for the Chugoku-Sikoku Branch of the JBS
    • 発表場所
      Shimane
    • 年月日
      2006-05-12
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [図書] 光合成微生物の機能と応用有効微生物・水生微生物としての光合成微生物2006

    • 著者名/発表者名
      澤 嘉弘
    • 総ページ数
      6
    • 出版者
      シーエムシー出版
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [図書] 光合成徹生物の機能と応用 有効微生物・水生微生物としての光合成微生物2006

    • 著者名/発表者名
      澤 嘉弘
    • 総ページ数
      6
    • 出版者
      シーエムシー出版
    • 関連する報告書
      2006 実績報告書

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公開日: 2006-04-01   更新日: 2016-04-21  

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