烏骨鶏特異的遺伝子領域の探索

• 研究課題/領域番号: 18580291
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 基礎獣医学・基礎畜産学
• 研究機関: 佐賀大学
• 研究代表者: 和田 康彦 佐賀大学, 農学部, 教授 (40325585)
• 研究分担者: 西堀 正英 広島大学, 大学院・生物圏科学研究科, 准教授 (80237718)
• 研究期間 (年度): 2006 – 2007
• 研究課題ステータス: 完了 (2007年度)
• 配分額: 3,560千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 360千円); 2007年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円); 2006年度: 2,000千円 (直接経費: 2,000千円)
• キーワード: 烏骨鶏 / ゲノム解析 / プロラクチン / 産卵率 / DNAマーカー / PCR-RFLP / SNP / 日本在来鶏 / ゲノム / メラニン色素生成 / 就巣性 / チロシナーゼ / ゲノミックサブトラクション / TRP1 / TRP2

研究概要

烏骨鶏は黒色の皮膚や絹糸状の羽を持つなど独特の特徴をもっており、明代にはその肉が漢方薬の材料とされていたが、烏骨鶏の遺伝的な由来や独特の形質の原因遺伝子については全く不明である。そこで、烏骨鶏と白色レグホーンのゲノムDNA間のPCRサブトラクションを実施し、3つのサブトラクションライブラリを構築した。それらのライブラリから178クローンをシーケンスし、86個のユニーククローンを得た。それらのシーケンスをニワトリ全ゲノム配列と比較し、プライマーペアを作成し、PCR-RFLPのシステムを構築した。その結果、13個のPCR-RFLPマーカーにおいて、サブトラクションライブラリに使用した烏骨鶏と白色レグホーンの間で変異が認められた。それらのマーカーについて、烏骨鶏と日本在来鶏、コマーシャル品種について遺伝子型判定を実施した結果、2つのPCR-RFLPマーカーにおいて烏骨鶏と他の品種の鶏の間に遺伝子型頻度に5%水準で有意な違いが認められた。従って、これらのマーカーの近傍を詳細に調べることによって、烏骨鶏の特異的な形質の原因遺伝子を発見できる可能性がある。
また、プロラクチン遺伝子のプロモータ領域に存在する24-bpの挿入の有無について、同様の遺伝子型判定を実施した結果、烏骨鶏と他の品種の鶏の間に遺伝子型頻度において5%水準で有意な違いが認められた。また、この座位については24-bpの挿入をホモで持つ烏骨鶏は1羽も存在しないことが示された。このことより、この座位の近傍に、烏骨鶏の特異的な形質の原因となる遺伝変異が存在するのではないかと考えられた。さらに、烏骨鶏の選抜集団において、この座位の遺伝子型と産卵率との関連性を検討した結果、有意な効果は認められなかったことから、烏骨鶏の産卵率を改良するためには、この24-bpの挿入以外の遺伝変異について検討する必要があることが明らかとなった。

研究成果

• [雑誌論文] Identification of quantitative trait loci afecting shank length, body weight and carcass weight from the Japanese cockfighting chicken breed, Oh-Shamo (Japanese Large Game (2007)
  • 著者名/発表者名: M Tsudzuki, S Onitsuka, R Akiyama, M Iwamizu, N Goto, M Nishibori, H Takahashi, A Ishikawa
  • 雑誌名: Genome Research 86 ページ: 288-295
  • 査読あり
• [雑誌論文] Microsatellite marker analysis for the genetic relationships among Japanese long-tailed chicken breeds (2007)
  • 著者名/発表者名: R Tadano, M Sekino, M Nishibori, M Tsudzuki
  • 雑誌名: Poultry Science 86 ページ: 460-469
  • 査読あり
• [雑誌論文] Gene constitution of native chickens in Southeast Asia,commercial chicken and jungle fowl using four calpain genes polymorphism (2006)
  • 著者名/発表者名: F Okumura, T Shimogiri, K Kawabe, S Okamoto, M Nishibori, Y Yamamoto, Y Maeda
  • 雑誌名: Animal Science Journal 77 ページ: 188-195
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genetic variability and relationships of native Japanese chickens based on microsatellite DNA polymorphisms-Focusing on the natural monuments of Japan (2006)
  • 著者名/発表者名: S. A.-M. Osman, M Sekino, T Kuwayama, K Kinoshita, M Nishibori, Y Yamamoto, M Tsudzuki
  • 雑誌名: Journal of Poultry Science 43 ページ: 12-22
  • NAID: 10017158410
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] The genetic variability and relationships of Japanese and foreign chickens assessed by microsatellite profiling (2006)
  • 著者名/発表者名: S. A.-M. Osman, M Sekino, A Nishihara, Y Kobayashi, W Takenaka, K Kinoshita, T Kuwayama, M Nishiboh, Y Yamamoto, M Tsudzuki
  • 雑誌名: Asian-Australian Journal of Animal Science 19 ページ: 1369-1378
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Gene constitution of native chickens in Southeast Asia, commercial chicken and jungle fowl using four calpain genes polymorphism (2006)
  • 著者名/発表者名: F., Okumura, T., Shimogiri, K., Kawabe, S., Okamoto, M., Nishibori, Y., Yamamoto, Y., Maeda
  • 雑誌名: Animal Science Journal 77 ページ: 188-195
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Genetic variability and relationships of native Japanese chickens based on microsatellite DNA polymorphisms -Focusing on the natural monuments of Japan (2006)
  • 著者名/発表者名: S. A.-M., Osman, M., Sekino, T., Kuwayama, K., Kinoshita, M., Nishibori, Y., Yamamoto, M., Tsudzuki
  • 雑誌名: Journal of Poultry Science 43 ページ: 12-22
  • NAID: 10017158410
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] The genetic variability and relationships of Japanese and foreign chickens assessed by microsatellite profiling (2006)
  • 著者名/発表者名: S. A.-M., Osman, M., Sekino, A., Nishihara, Y., Kobayashi, W., Takenaka, K., Kinoshita, T., Kuwayama, M., Nishibori, Y., Yamamoto, M., Tsudzuki
  • 雑誌名: Asian-Australian Journal of Animal Science 19 ページ: 1369-1378
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Gene constitution of native chickens in Southeast Asia, commercial chicken and jungle fowl using four calpain genes polymorphism. (2006)
  • 著者名/発表者名: F.Okumura et al.
  • 雑誌名: Animal Science Journal 77・2 ページ: 188-195
• [雑誌論文] Genetic variability and relationships of native Japanese chickens based on microsatellite DNA polymorphisms -Hocusing on the natural monuments (2006)
  • 著者名/発表者名: S.A.-M.Osman et al.
  • 雑誌名: Journal of Poultry Science 43・1 ページ: 12-22
• [雑誌論文] The genetic variability and relationships of Japanese and foreign chickens assessed by microsatellite profiling (2006)
  • 著者名/発表者名: S.A.-M.Osman et al.
  • 雑誌名: Asian-Australian Journal of Animal Science 19・10
• [雑誌論文] Population research of genetic polymorphism at amino acid potion 631 in chicken Mx protein with differential activity. (2006)
  • 著者名/発表者名: Seyama T et al.
  • 雑誌名: Biochemical Genetics 44・9-10 ページ: 432-443
• [雑誌論文] 烏骨鶏選抜集団におけるプロラクチン遺伝子プロモーター領域の24-bpの挿入と生産形質との関連性
  • 著者名/発表者名: 和田 康彦・中牟田 裕子・岳 佳〓・松田 莉朋・阿部 正八郎・阿南 加治男
  • 雑誌名: 日本家禽学会誌 (印刷中)
  • NAID: 10024478664
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] 烏骨鶏と他の鶏品種におけるプロラクチン遺伝子のプロモーター領域における24-bp挿入の比較
  • 著者名/発表者名: 和田 康彦, 戸谷 温子, 岳 佳〓, ローシャン・ジャーハン
  • 雑誌名: 西日本畜産学会報 (印刷中)
  • NAID: 130004185309
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Relationship between 24-bp insertion of prolactin promoter region and performance traits in the selected population of Silkie chiken
  • 著者名/発表者名: asuhiko, Wada, Yuko, Nakamuta, Yue, Jiang, Riho, Matsuda, Syohatiro, Abe, Kajio, Anan
  • 雑誌名: Japanese Journal of Poultry Science (submitted)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Sequence Comparison of the Promoter Region of Prolactin Gene between Silkie Fowls and Other Chickens
  • 著者名/発表者名: Yasuhiko, WADA, Atsuko, TOYA, Yue, JIANG, Jahan, ROWSHAN
  • 雑誌名: The West Japan Journal of Animal Science (In Press)
  • NAID: 130004185309
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] 烏骨鶏と他の鶏品種におけるプロラクチン遺伝子のプロモーター領域における24-bp挿入の比較
  • 著者名/発表者名: 和田 康彦, 戸谷 温子, 岳 佳?, ローシャン・ジャーハン
  • 雑誌名: 西日本畜産学会報 (印刷中)
  • NAID: 130004185309
  • 査読あり
• [学会発表] 烏骨鶏選抜集団におけるプロラクチン遺伝子プロモータ領域の1塩基多型と生産形質との関連性 (2008)
  • 著者名/発表者名: 和田 康彦・中牟田 裕子・岳 佳に・阿部 正八郎・阿南 加治男
  • 学会等名: 日本家禽学会
  • 発表場所: 常磐大学
  • 年月日: 2008-03-28
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] Relationship between production traits and the single nucleotide polymorphism of prolactin promoter region in the selected Silkie chicken population (2008)
  • 著者名/発表者名: Yasuhiko, Wada, Yuko, Nakamuta, Yue, Jiang, Shohatiro, Abe, Kajio, Anan
  • 学会等名: Japanese Society of Animal Breeding and Genetics
  • 発表場所: Tokiwa University
  • 年月日: 2008-03-28
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] プロラクチン遺伝子領域における烏骨鶏と他の鶏種の遺伝子頻度の比較 (2007)
  • 著者名/発表者名: 岳 佳〓、ジャーハン・ローシャン、戸谷 温子、和田 康彦
  • 学会等名: 動物遺伝育種学会
  • 発表場所: つくば国際会議場
  • 年月日: 2007-11-24
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] Comparison of gene frequency in the prolactin gene region between Silkie chicken and other breeds (2007)
  • 著者名/発表者名: Yue, Jiang, Jahan, Roshan, Atsuko, Toya, Yasuhiko, Wada
  • 学会等名: Japanese Society of Animal Breeding and Genetics
  • 発表場所: Tsukuba International Congress Center
  • 年月日: 2007-11-24
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] わが国の烏骨鶏集団におけるプロラクチン遺伝子プロモータ領域における遺伝変異 (2007)
  • 著者名/発表者名: 和田 康彦、新田 典之、戸谷 温子、ジャーハン・ローシャン、岳 佳〓
  • 学会等名: 西日本畜産学会
  • 発表場所: 山口大学
  • 年月日: 2007-10-28
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] Genetic variation of the promoter region of prolcatin gene in Japanese Silkie chicken (2007)
  • 著者名/発表者名: Yasuhiko, Wada, Noriyuki, Nitta, Atsuko, Toya, Jahan, Roshan, Yue, Jiang
  • 学会等名: The West Japan Society of Animal Science
  • 発表場所: Yamaguchi University
  • 年月日: 2007-10-28
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] 烏骨鶏選抜集団におけるプロラクチン遺伝子プロモータ領域の1塩基多型と生産形質との関連性 (2007)
  • 著者名/発表者名: 和田 康彦・中牟 田裕子・岳 佳に・阿部 正八郎・阿南 加治男
  • 学会等名: 日本家禽学会
  • 発表場所: 常磐大学
  • 年月日: 2007-03-28