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ヒトFEN1のPCNA結合部位近傍に位置するフレキシブルなヒンジ領域の機能解析

研究課題

研究課題/領域番号 18590046
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 生物系薬学
研究機関熊本大学 (2007)
北海道大学 (2006)

研究代表者

森岡 弘志  熊本大学, 大学院・医学薬学研究部, 教授 (20230097)

研究期間 (年度) 2006 – 2007
研究課題ステータス 完了 (2007年度)
配分額 *注記
4,050千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 450千円)
2007年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
2006年度: 2,100千円 (直接経費: 2,100千円)
キーワードFEN1 / PCNA / DNA複製 / DNA修復 / 5'-flap DNA / 生体分子間相互作用 / ドメイン構造 / Flap構造 / 構造特異的ヌクレアーゼ / 酵素活性促進機構 / 5' Flap DNA / ヒンジ領域 / NaCl濃度依存性
研究概要

Flap endonuclease 1(FEN1)は,二本鎖DNAから一本鎖DNAが枝分かれしたブランチ構造(5'flapDNA)を特異的に認識するエンドヌクレアーゼである.FEN1は,DNA複製およびDNA修復において,重要な役割を果たす酵素として知られている.FEN1のヌクレアーゼ活性は,増殖細胞核抗原(Proliferating Cell Nuclear Antigen;PCNA)との相互作用により大きく促進される.ヒトFEN1/PCNA複合体のX線構造解析の結果,FEN1のヌクレアーゼドメインとPCNA結合領域をつなぐアミノ酸配列(-QGST-)がフレキシブルなヒンジ領域がPCNAによるFEN1のヌクレアーゼ活性の促進に関与していることが示唆された.本研究では,このFEN1ヒンジ領域をターゲットにしたタンパク質工学の実験を進め,5'-flap DNA/PCNA/FEN13つの生体高分子間で起こる相互作用を解析した.その結果,以下に示す1.〜3.のことが明らかとなった.
1.ヒンジ領域にフレキシブルな構造をとる-Gly-Ser-で構成される鎖長4(-GSGS-)から10(-GSGSGSGSGS-)残基の配列を導入した数種のFEN1変異体を用いた解析から,各FEN1変異体単独ではそのヌクレアーゼ活性に差は認められなかったものの,PCNAの存在下ではヒンジ鎖長が重要であることが示された.
2.PCNAのリング構造の内側に存在する酸性残基Asp21やGlul7をAlaや塩基性残基のLysに変えた変異体では,ヌクレアーゼ活性はヒンジ鎖長に影響されないことがわかった.
3.すなわち,D21A PCNAは,5'-flap DNA基質上でPCNAが比較的自由な位置を取ることにより,活性型の3者複合体を形成する可能性が示唆された.

報告書

(3件)
  • 2007 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2006 実績報告書
  • 研究成果

    (11件)

すべて 2008 2007

すべて 雑誌論文 (8件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (3件)

  • [雑誌論文] Crystallization and preliminary crystallographic analysis of the catalytic domain of human flap endonuclease 1 in complex with a nicked DNA product:use of a DPCS kit for efficient protein-DNA complex crystallization2008

    • 著者名/発表者名
      Sakurai, S.
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr.Sect.F Struct.Biol.Cryst.Commun. 64(Pt 1)

      ページ: 39-43

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallization and preliminary crystallographic analysis of the catalytic domain of human flap endonuclease 1 in complex with a nicked DNA product : use of a DPCS kit f6r efficient protein-DNA complex crystallization2008

    • 著者名/発表者名
      Sakurai, S., Kitano, K., Morioka, H., Hakoshima, T
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr. Sect. F Struct. Biol. Cryst. Commun 64 (Pt 1)

      ページ: 39-43

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Biochemical and biological properties of DNA photolyases derived from ultraviolet-sensitive rice cultivars.2008

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto, A.
    • 雑誌名

      Genes Genet. Syst. 82

      ページ: 311-319

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Biochemical and biological properties of DNA photolyases derived from ultraviolet-sensitive rice cultivars2007

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto, A.
    • 雑誌名

      Genes Genet.Syst. 82

      ページ: 311-319

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Molecular docking of porphyrins with cationic limbs on intramolecular G-quadruplex2007

    • 著者名/発表者名
      Ishikawa, Y.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Symp.Ser. 51

      ページ: 247-248

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Biochemical and biological properties of DNA photolyases derived from ultraviolet-sensitive rice cultivars2007

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto, A., Horiuchi, T., Mori, T., Teranishi, M., Hidema, J., Morioka, H., Kumagai, T., Yamamoto, K
    • 雑誌名

      Genes Genet. Syst. 82

      ページ: 311-319

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Molecular docking of porphyrins with cationic limbs on intramolecular G-quadruplex.2007

    • 著者名/発表者名
      Ishikawa, Y., Higashi, E., Morioka, H
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Symp. Ser. 51

      ページ: 247-248

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Molecular Docking of Porphyrins with Cationic Limbs on Intramolecular G-quadruplex.2007

    • 著者名/発表者名
      Ishikawa, Y.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Symp. Ser. 51

      ページ: 247-248

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] ヒトFEN1に存在するヒンジ領域によるヌクレアーゼ活性調節機構の解析2007

    • 著者名/発表者名
      宮川 健治
    • 学会等名
      第80回日本生化学会大会・第30回日本分子生物学会年会合同年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 年月日
      2007-12-11
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Analysis of regulatory mechanisms for nuclease activity by the hinge region of human FEN12007

    • 著者名/発表者名
      Kenji, MIYAKAWA, Makiyo, UCHIDA, Shigeru, SAKURAI, Toshio, HAKOSHIMA, Hiroshi, MORIOKA
    • 学会等名
      Biochemistry and Molecular Biology2007
    • 発表場所
      Yokohama
    • 年月日
      2007-12-11
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] ヒトFEN1に存在するヒンジ領域によるヌクレアーゼ活性調節機構の解析2007

    • 著者名/発表者名
      宮川 健治
    • 学会等名
      第80回日本生化学会大会・第30回日本分子生物学会年会 合同年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 年月日
      2007-12-11
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書

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公開日: 2006-04-01   更新日: 2016-04-21  

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