• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

各染色体に存在する反復配列を標的にしたカンジダアルビカンスの株識別

研究課題

研究課題/領域番号 18590418
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 細菌学(含真菌学)
研究機関名古屋大学

研究代表者

神戸 俊夫  名古屋大学, 大学院・医学系研究科, 講師 (50093018)

研究期間 (年度) 2006 – 2007
研究課題ステータス 完了 (2007年度)
配分額 *注記
3,830千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 330千円)
2007年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2006年度: 2,400千円 (直接経費: 2,400千円)
キーワードカンジダ アルビカンス / 分子疫学 / タイピング / 反復配列 / RPS / ALT / マイクロサテライト / カンジダ症 / カンジダアルビカンス / カンジダ・アルビカンス / 株識別
研究概要

Candida albicansは、健康者および易感染者におけるカンジダ症の起因菌として最も高頻度に分離される菌種である。特に、易感染状態にあるヒトにおけるカンジダ症の予防・管理のためにはC.albicansを株レベルで識別することが必要である。本研究では、25S rDNA、RPS領域のALT反復配列を標的としたPCR、およびマイクロサテライトのフラグメント解析によるC.albicansの株レベル識別系の確立を行った。25S rDNAによるタイピングでは、グループAが最も多く(51.3%)、次いでグループC(27.9%)、B(20.8%)の順となった。また、P-IIおよびAS-Iを用いたRPS/ALTのタイピングでは、3、4、3/4、2/3/4、3/4/5などに区別され、50%以上の株がタイプ3であった。アガロースゲル電気泳動パターンから、各RPS/ALTタイプは、さらにサブグループに分類された。CDC3、HIS3、CAI、CAIIIなどのマーカーを用いたマイクロサテライトのフラグメント解析により、P-IIによるAS-I電気泳動パターンの比較では十分な区別が出来ない株を客観的に区別することができた。逆に、RPS/ALTによるタイピングは、フラグメント解析で区別できない株の区別を可能にした。以上の結果から、RPS/ALTとマイクロサテライト領域を標的としたタイピングの組み合わせにより、C.albicansの高精度(DP=99.99)タイピングの系を確立できた。

報告書

(3件)
  • 2007 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2006 実績報告書
  • 研究成果

    (26件)

すべて 2008 2007 2006

すべて 雑誌論文 (14件) (うち査読あり 8件) 学会発表 (12件)

  • [雑誌論文] A case of oral geotrichosis cased by Geotrichum capitatum in an old patient2007

    • 著者名/発表者名
      Hisao Hattori, et. al.
    • 雑誌名

      Jpn J Infect Dis 60

      ページ: 300-301

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Seven different glucose-6-phosphate dehydrogenase variants including anew varient distributed in Lam Dong province in Southern Vietnam.2007

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Matsuoka, et. al.
    • 雑誌名

      Acta Med. Okayama 61

      ページ: 213-219

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A case of oral geotrichosis cased by Geotrichum capitatum in an old patient2007

    • 著者名/発表者名
      Hisao, Hattori, et. al.
    • 雑誌名

      Jpn J Infect Dis 60

      ページ: 300-301

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Seven different glucose-6-phosphate dehydrogenase variants including a new varient distributed in Lam Dong province in Southern Vietnam2007

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi, Matsuoka, et. al.
    • 雑誌名

      Acta Med. Okayama 61

      ページ: 213-219

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] A casc of oral geotrichosis caused by Geotricum capitatum in an old patient.2007

    • 著者名/発表者名
      Hisao Hattori, et. al.
    • 雑誌名

      Jpn. J. Infect Dis. 60

      ページ: 300-301

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Seven ditterent glucose-6-phosphate dehydrogenase variants inducing a new variant distributed in Lam Dong in Southern Vietnam.2007

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Matsuoka, et. al.
    • 雑誌名

      Acta Med. Okayama 61

      ページ: 213-219

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genotyping of Candida albicans on the basis of polymorphisms of ALT repeats in the repetitive sequence(RPS).2006

    • 著者名/発表者名
      Takako Iwata, et. al.
    • 雑誌名

      J Dermatol Sci 41

      ページ: 43-54

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genotype analysis of Candida albicans isolates obtained form different boda locations of patients with superficial candidiasis using PCRs targeting 25S rDNA and ALT repeat sequences of the RPS.2006

    • 著者名/発表者名
      Hisao Hattori, et. al.
    • 雑誌名

      J Dermatol Sci 42

      ページ: 31-46

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Sequence variation in the T-cell epitopes of the Plasmodium falciparum circumsporozoite protein among field isolates Is temporally stable: a 5-year longitudinal study in Southern Vietnam.2006

    • 著者名/発表者名
      Amadu Jalloh, et. al.
    • 雑誌名

      J Clin Microbiol 44

      ページ: 1229-1235

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Further investigations of glucose-6-phosphate dehydrogenase variants in Flores Island, eastern Indonesia.2006

    • 著者名/発表者名
      Fumihiko Kawamoto, et. al.
    • 雑誌名

      J Human Gent 51

      ページ: 952-957

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genotyping of Candida albicans on the basis of polymorphisms of ALT repeats in the repetitive sequence (RPS)2006

    • 著者名/発表者名
      Takako, Iwata, et. al.
    • 雑誌名

      J Dermatol Sci 41

      ページ: 43-54

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Genotype analysis of Candida albicans isolates obtained from different body locations of patients with superficial candidiasis using PCRs targeting 25S rDNA and ALT repeat sequences of the RPS2006

    • 著者名/発表者名
      Hisao, Hattori, et. al.
    • 雑誌名

      J Dermatol Sci 42

      ページ: 31-46

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Sequence variation in the T-cell epitopes of the Plasmodium falciparum circumsporozoite protein among field isolates Is temporally stable : a 5-year longitudinal study in Southern Vietnam2006

    • 著者名/発表者名
      Amadu, Jalloh, et. al.
    • 雑誌名

      J Clin Microbiol 44

      ページ: 1229-1235

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Further investigations of glucose-6-phosphate dehydrogenase variants in Flores Island, eastern Indonesia2006

    • 著者名/発表者名
      Fumihiko, Kawamoto, et. al.
    • 雑誌名

      J Hum Genet 51

      ページ: 952-957

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] RPSとマイクロサテライト領域を利用したCandida albicansのタイピング2008

    • 著者名/発表者名
      服部尚生, 他
    • 学会等名
      第32回東海医真菌懇話会
    • 発表場所
      名古屋(愛知)
    • 年月日
      2008-02-20
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Genotype analysis of Candida albicans based on the repeat sequence of four microsatellites2008

    • 著者名/発表者名
      Hisao, Hattori, et. al.
    • 学会等名
      32nd Tokai Shinkinsho
    • 発表場所
      Nagoya, Aichi
    • 年月日
      2008-02-20
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] RPSとマイクロサテライト領域を利用したCandida albicansのタイピング2008

    • 著者名/発表者名
      服部尚生、田中玲子、知花博治、富田靖、神戸俊夫
    • 学会等名
      第32回東海医真菌症懇話会
    • 発表場所
      名古屋(愛知)
    • 年月日
      2008-02-20
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 反復配列(ALT)を利用したC. albicansとその近縁種の同定とgenotyping2007

    • 著者名/発表者名
      服部尚生, 他
    • 学会等名
      第30回東海医真菌懇話会
    • 発表場所
      名古屋(愛知)
    • 年月日
      2007-02-10
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Identification and genotyping of C. albicans and its related species on the basis of ALT repeat2007

    • 著者名/発表者名
      Hisao, Hattori, et. al.
    • 学会等名
      30th Tokai Shinkinsho
    • 発表場所
      Nagoya, Aichi
    • 年月日
      2007-02-10
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] 2型DNAトポイソメラーゼ遺伝子に基づくSporothrix schenckiiおよびその近縁種の系統関係解析2007

    • 著者名/発表者名
      神戸俊夫, 他
    • 学会等名
      第51回日本医真菌学会総会
    • 発表場所
      高山(岐阜)
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] 反復配列RPSと内部反復配列ALTを標的としたPCRによるカンジダ・アルビカンスのgenotyping2007

    • 著者名/発表者名
      服部尚生, 他
    • 学会等名
      第51回日本医真菌学会総会
    • 発表場所
      高山(岐阜)
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書 2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Phylogenetic relationship of Sporothrix schenckii and its related species based on the DNA topoisomerase H gene2007

    • 著者名/発表者名
      Toshio, Kanbe, et. al.
    • 学会等名
      51st Jpn Soc. Med. Mycol
    • 発表場所
      Takayama, Gifu
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Genotype analysis of Candida albicans by PCR targeting RPS and ALT repeat sequences2007

    • 著者名/発表者名
      Hisao, Hattori, et. al.
    • 学会等名
      51st Jpn Soc. Med. Mycol
    • 発表場所
      Takayama, Gifu
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] 2型DNAとポイソメラーゼ遺伝子に基づくSporothrix schenkiiおよびその近縁種の系統解析2007

    • 著者名/発表者名
      神戸俊夫、中川善之、川崎昌子、望月隆、石崎宏
    • 学会等名
      第51回日本医真菌学会総会
    • 発表場所
      高山(岐阜)
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] RPSに存在する内部反復配列ALTを標的としたCandida albicansの遺伝子解析2006

    • 著者名/発表者名
      服部尚生, 他
    • 学会等名
      第3回分子皮膚科学セミナー
    • 発表場所
      名古屋(愛知)
    • 年月日
      2006-09-08
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Genetic analysis of Candida albicans targeting ALT repeat2006

    • 著者名/発表者名
      Hisao, Hattori, et. al.
    • 学会等名
      3rd Molecular Dermatology
    • 発表場所
      Nagoya, Aichi
    • 年月日
      2006-09-08
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要

URL: 

公開日: 2006-04-01   更新日: 2016-04-21  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi