遺伝子コピー数多型に基づく薬物動態関連遺伝子の日本人における個人差解析法の開発

• 研究課題/領域番号: 18590545
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 病態検査学
• 研究機関: 国立医薬品食品衛生研究所
• 研究代表者: 石田 誠一 国立医薬品食品衛生研究所, 薬理部, 室長 (10270505)
• 研究分担者: 小澤 正吾 (小沢 正吾) 岩手医科大学, 薬学部, 教授 (20185581) ; 田辺 秀之 総合研究大学院大学, 先導科学研究科, 准教授 (50261178)
• 連携研究者: 小澤 正吾 岩手医科大学, 薬学部, 教授 (20185581) ; 田辺 秀之 総合研究大学院大学, 先導科学研究科, 准教授 (50261178)
• 研究期間 (年度): 2006 – 2008
• 研究課題ステータス: 完了 (2008年度)
• 配分額: 4,160千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 660千円); 2008年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2007年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2006年度: 1,300千円 (直接経費: 1,300千円)
• キーワード: 遺伝子コピー数多型 / CNV / 遺伝子多型 / 薬物動態関連遺伝子 / gene dosage effect / 網羅的解析 / GeneChip / 薬剤反応性 / ヒトゲノム / コピー数多型

研究概要

薬物代謝酵素の活性の個人差として、従来より大規模に解析されたきた一塩基多型ではなく、研究開始当時報告された遺伝子のコピー数の多型(CNV)に注目し解析法の開発を行った。Real-time PCRによる方法では、各サンプルにつきn=4で測定することでCNVを判的できることを示した。また、GeneChipを用いると、ゲノムDNAだけでなくmRNAを用いてもCNVを検出できる可能性を示唆するデータを得た。

研究成果

• [学会発表] Analysis of Copy Number Variations (CNVs) of Drug Metabolizing Enzyme Related Genes in Japanese (2007)
  • 著者名/発表者名: Ishida S, Tanabe H, Sawada JI, Ozawa S, Nakazawa K.
  • 学会等名: 8th International ISSX Meeting
  • 発表場所: Sendai
  • 年月日: 2007-10-09
• [図書] How DNA microarray technology contributes to the retinoid evaluations. In "Vitamin A : New Research" (Ed. Lossing IT.) (2007)
  • 著者名/発表者名: Ishida S, Tanabe H, Shinozaki Y, Koyano S, Kagechika H, Shudo K, Ozawa S, Sawada JI, Ohno Y, Inoue K.
  • 出版者: Nova Scientific Publishers, Inc.
• [図書] II. 実践編1章(2)「FISH法」In"実験がうまくいく蛍光・発光試薬の選び方と使い方"(三輪佳宏編) (2007)
  • 著者名/発表者名: 田辺秀之
  • 出版者: 羊土社
• [図書] Vitamin A:New Research (2007)
  • 著者名/発表者名: Ingrid T, Loessing, 編
  • 出版者: NOVA Science Publishers,Inc.