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高密度マイクロアレイを用いた包括的ゲノム解析による肝細胞癌の発生・再発機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 18590717
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 消化器内科学
研究機関千葉大学 (2008)
東京大学 (2006-2007)

研究代表者

金井 文彦  千葉大学, 医学部附属病院, 講師 (70334399)

研究分担者 田中 康雄  東京大学, 医学部附属病院, 寄付講座教員 (40422290)
研究期間 (年度) 2006 – 2008
研究課題ステータス 完了 (2008年度)
配分額 *注記
4,100千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 600千円)
2008年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2007年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2006年度: 1,500千円 (直接経費: 1,500千円)
キーワードマイクロアレイ / ゲノム / 肝細胞癌 / ダノム / SNP
研究概要

我々は、肝細胞癌の細胞株から抽出したゲノムDNAや、肝細胞癌および非癌部肝組織をレーザーマイクロダイセクションにより切り出し、抽出したゲノムDNAについて、100kまたは500k chipを用いて共通の遺伝子増幅および欠失領域やLOHの有無を解析してきた。肝細胞癌において染色体8q22.3領域が高頻度に遺伝子増幅をおこし、その染色体領域にコードされるGRHL2遺伝子増幅が、肝細胞癌の早期再発に相関していることを見出した。RNAiにより肝癌培養細胞の内在性GRHL2をknock downすると細胞増殖が抑制されることからも、GRHL2の増幅は、肝細胞癌再発の予測因子となる可能性が示唆された。

報告書

(4件)
  • 2008 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2007 実績報告書
  • 2006 実績報告書
  • 研究成果

    (5件)

すべて 2008 2007

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (3件)

  • [雑誌論文] Gain of GRHL2 isassociated with early recurrence of hepatocellular carcinoma2008

    • 著者名/発表者名
      Tanaka Y et.al.
    • 雑誌名

      Journal of Hepatology 49

      ページ: 746-757

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Gain of GRHL2 is associated with early recurrence of hepatocellular carcinoma2008

    • 著者名/発表者名
      Tanaka Y, et al.,
    • 雑誌名

      Journal of Hepatology 49

      ページ: 746-757

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 高密度オリゴヌクレオチドアレイによる肝細胞癌の生物学的特性・再発に関連するゲノム異常解析2008

    • 著者名/発表者名
      田中康雄, ら
    • 学会等名
      日本肝臓学会
    • 発表場所
      愛媛県県民会館
    • 年月日
      2008-06-05
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 高密度オリゴヌクレオチドアレイによる肝細胞癌の生物学的特性・再発に関連するゲノム異常解析2008

    • 著者名/発表者名
      田中康雄
    • 学会等名
      日本肝臓学会
    • 発表場所
      愛媛県県民文化会館
    • 年月日
      2008-06-05
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Copy Number Analysis of Hepatocellular Carcinoma Using Ten Genes Derived from GeneChip Data Set of Hepatoma Cell Lines2007

    • 著者名/発表者名
      Tanaka Y, Kanai F, Tada M, Tateishi R, Shiina S, Kobashi H, Kawabe T, Yokosuka O, Ogawa S, Omata M
    • 学会等名
      AASLD2007
    • 発表場所
      Boston, Massachusetts
    • 年月日
      2007-11-03
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書

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公開日: 2006-04-01   更新日: 2016-04-21  

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