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滑膜肉腫における転座型融合蛋白SYT-SSXに結合する複合体のプロテオーム解析

研究課題

研究課題/領域番号 18591632
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 整形外科学
研究機関岡山大学

研究代表者

大内田 守  岡山大学, 大学院・医歯薬学総合研究科, 准教授 (80213635)

研究期間 (年度) 2006 – 2007
研究課題ステータス 完了 (2007年度)
配分額 *注記
3,730千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 330千円)
2007年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2006年度: 2,300千円 (直接経費: 2,300千円)
キーワード滑膜肉腫 / 染色体転座 / SYT遺伝子 / SSX遺伝子 / 相互作用
研究概要

本研究では、SYT-SSX蛋白による滑膜肉腫発症機構を明らかにするためにSYT-SSXを介したプロテオーム解を行い、SYT-SSXと相互作用する蛋白群を検討することを目的とした。
(1)SYT蛋白、SSX蛋白、SYT-SSX蛋白と結合する蛋白群の検出
抗体認識用FLAG-TagおよびPull-down用GST蛋白の融合蛋白として発現するSYT,SSX,SYT-SSX cDNAのプラスミドベクターを構築した。ヒト正常腎細胞株HEK293に遺伝子導入し、その細胞質抽出液のFLAG融合蛋白をFLAG抗体ビーズでPull-down後、抗SYT抗体、抗FLAG抗体でウエスタンブロットを行った。SYT蛋白は十分量pull-downされている事を確認したが、SYT-SSX蛋白は収量が微量であった。そこでGST融合蛋白型で行ったところやはりSYT-SSX蛋白は収量が微量であった。これは、蛋白の局剤に依存する結果と考えられた。そこで、核分画を高塩濃度処理することにより核蛋白を抽出後、塩濃度を希釈し細胞質抽出液と混合した。この全細胞抽出液をFLAGビーズでpull-downさせTag融合型SYT-SSX蛋白を精製し、SYO-1滑膜肉腫細胞株の全細胞抽出液と混合し複合体形成をさせた。そのSYT-SSX蛋白複合体をTagビーズで回収し、SYT-SSX複合体蛋白群をSDS-ゲルで分離した。その未知蛋白のバンドは量が少なく質量分析計の解析には十分ではなかった。
(2)各種阻害剤等によるSYT-SSX細胞内局在変化の検討
SYT、SSX、SYT-SSX蛋白の局在を明らかにするために、SYT,SSX,SYT-SSX cDNAを蛍光蛋白標識用の発現ベクターに導入しReverse transfection法により8-wellチャンバーのSYO-1滑膜肉腫細胞にTransfectionを行った。蛍光蛋白GFPの融合型蛋白として発現させた場合、SYT-SSX蛋白は核内にspeckle状に点在することを確認した。GFP融合型蛋白発現系を用いて、ある種の酵素阻害剤の存在下で蛋白局在の変化を検討した。
(3)蛍光蛋白GFPをマーカーとした発現誘導可能なSYT-SSX導入細胞を樹立した。誘導時、非誘導時において、SYT-SSX蛋白により影響を受ける発現変化する遺伝子を解析した。SYT-SSX遺伝子発現誘導により約1.06%の遺伝子が発現減少を示し、約0.56%の遺伝子が増加することが判明した。

報告書

(3件)
  • 2007 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2006 実績報告書
  • 研究成果

    (12件)

すべて 2007 2006

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (9件)

  • [雑誌論文] High frequent allelic loss of chromosome 6q16-23 in osteosarcoma: Involvement of cyclin C in osteosarcoma.2006

    • 著者名/発表者名
      Ohata N, et. al.
    • 雑誌名

      Int J Mol Med. 18

      ページ: 1153-1158

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
    • 査読あり
  • [雑誌論文] High frequent allelic loss of chromosome 6q16-23 in osteosarcoma : Involvement of cyclin C in osteosarcoma2006

    • 著者名/発表者名
      Ohata, N., et. al.
    • 雑誌名

      Int J Mol Med 18

      ページ: 1153-1158

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] High frequent allelic loss of chromosome 6q16-23 in osteosarcoma : Involvement of cyclin C in osteosarcoma.2006

    • 著者名/発表者名
      Ohata N, Ito S, Yoshida A, Kunisada T, Numoto K, Jitsumori Y, Kanzaki H, Ozaki T, Shimizu K, Ouchida M.
    • 雑誌名

      International Journal of Molecular Medicine 18(6)

      ページ: 1153-1158

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [学会発表] High frequent allelic loss of chromosome 6q16-23 in osteosarcoma: Involvement of cyclin C in osteosarcoma2007

    • 著者名/発表者名
      OHATA Norihide, et. al.
    • 学会等名
      66th Annual Meeting of the Japanese Cancer Association
    • 発表場所
      Yokohama
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書 2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] 滑膜肉腫特異的転座型融合蛋白SS18-SSX及びSS18、 SSX蛋白の細胞内局在の解析2007

    • 著者名/発表者名
      米田泰史, 他
    • 学会等名
      第22回日本整形外科学会基礎学術集会
    • 発表場所
      浜松
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] 骨肉腫における染色体6p16-23の高頻度欠失2007

    • 著者名/発表者名
      大内田守, 他
    • 学会等名
      第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会 合同大会
    • 発表場所
      横浜
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書 2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Cellular localization analysis of SS18, SSX, and SS18-SSX fusion protein in Synovial sarcoma cells2007

    • 著者名/発表者名
      Yoneda, Y., et. al.
    • 学会等名
      The 22nd Annual Congress of the Japanese Orthopaedic Association
    • 発表場所
      Hamamatsu, JAPAN
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] High frequent allelic loss of chromosome 6q16-23 in osteosarcoma2007

    • 著者名/発表者名
      Ohata, N., et. al.
    • 学会等名
      66th Annual Meeting of the Japanese Cancer Association
    • 発表場所
      Yokohama, JAPAN
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] High frequent allelic loss of chromosome 6q16-23 in osteosarcoma : Involvement of cyclin C in osteosarcoma2007

    • 著者名/発表者名
      Ouchida, M., et. al.
    • 学会等名
      Biochemistry and Molecular Biology
    • 発表場所
      Yokohama, JAPAN
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] 滑膜肉腫特異的転座型融合蛋白SS18-SSX及びSS18、SSX蛋白の細胞内局在の解析2007

    • 著者名/発表者名
      米田泰史, 他
    • 学会等名
      第22回日本整形外科学会基礎学術集会
    • 発表場所
      浜松
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 滑膜肉腫細胞株におけるFK-228による細胞増殖抑制機構のプロテオーム解析2006

    • 著者名/発表者名
      井谷 智, 他
    • 学会等名
      骨軟部腫瘍セミナー
    • 発表場所
      三重
    • 年月日
      2006-08-26
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要
  • [学会発表] Proteimics analysis of synovial sarcomas in the presence of FK2282006

    • 著者名/発表者名
      Itani, S., et. al.
    • 学会等名
      The bone and soft tissue tumors meeting
    • 発表場所
      Mie, JAPAN
    • 年月日
      2006-08-26
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2007 研究成果報告書概要

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公開日: 2006-04-01   更新日: 2016-04-21  

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