• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

創薬研究を例とした先端的学際的な計算機実習講義と教材の開発

研究課題

研究課題/領域番号 18650234
研究種目

萌芽研究

配分区分補助金
研究分野 科学教育
研究機関広島大学

研究代表者

原田 隆範  広島大学, 大学院・医歯薬学総合研究科, 助手 (30350325)

研究分担者 相田 美砂子  広島大学, 大学院・理学研究科, 教授 (90175159)
榮 慶丈 (榮 憲丈)  広島大学, 大学院・理学研究科, 特任助教 (20397988)
合田 祥子 (日向寺 祥子)  東海大学, 総合情報センター情報処理研究教育施設, 講師 (70317824)
研究期間 (年度) 2006 – 2007
研究課題ステータス 完了 (2007年度)
配分額 *注記
3,300千円 (直接経費: 3,300千円)
2007年度: 1,300千円 (直接経費: 1,300千円)
2006年度: 2,000千円 (直接経費: 2,000千円)
キーワード計算創薬 / 教材開発 / 計算機実習 / SBDD
研究概要

この研究の目的は、現在Academiaに開放されている化合物データベースや計算関連ツールを用いて、理学系大学院レベルの計算創薬入門実習(Structure-Based Drug Design(SBDD)に関する内容)のための教材と計算機環境を構築することにある。目的のSBDD実習は企業内の研究者教育にも使われうる水準を目指しており、このための必要最小限の教材資源を作成することを目標とした。
今年度は、Web上で公開されている化合物データベースやソフトウェアから実習に使用するツールを決定し、医薬品研究開発の中核に位置する「薬分子と受容体との結合解析(Docking Study)」および「計算機を用いた仮想的なスクリーニング(Virtual Screening)」に関する講義録および教材(計算機実習の手順および演習問題)を作成・整理した。これらの教材を前年度整備した計算機環境と併用して、広島大・東海大の両方で集中講義レベル(4日間)の講義実習を実施した。この実習は、(1)タンパク質の構造の観察、(2)タンパク質の構造の構築、(3)リガンド分子の構造の構築、(4)ドッキングシミュレーション、(5)タンパク質-リガンド複合体の量子化学計算による相互作用解析、という流れで行った。
実習には大学院生の他に教官等の参加もあり、結果としては教官が関心を持つような内容にまで仕上げることができた。今回の実習のように、フリーウェアやフリーの化合物データベースを用いることで、多人数向けに基礎的な計算創薬実習を構築・実施することも可能である。このことから、現在では製薬企業においてのみ可能な「計算機を用いた理論創薬研究」を広く大学にも開放することができるものと期待される。

報告書

(2件)
  • 2007 実績報告書
  • 2006 実績報告書
  • 研究成果

    (3件)

すべて 2008 2007

すべて 雑誌論文 (1件) 学会発表 (2件)

  • [雑誌論文] 理学系大学院における計算創薬講義用教材と環境の開発2007

    • 著者名/発表者名
      原田 隆範
    • 雑誌名

      日本化学会第87春季年会講演予稿集 I

      ページ: 584-584

    • 関連する報告書
      2006 実績報告書
  • [学会発表] 受容体全体の分子軌道計算を導入した計算創薬実習法の開発2008

    • 著者名/発表者名
      原田 隆範
    • 学会等名
      日本薬学会第128年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 年月日
      2008-03-26
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Development of Educational Materials and Environment for Computer-aided Drug Discovery Course for Academia2007

    • 著者名/発表者名
      原田 隆範
    • 学会等名
      CBI学会2007年大会
    • 発表場所
      広島大学
    • 年月日
      2007-10-03
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書

URL: 

公開日: 2006-04-01   更新日: 2016-04-21  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi